Microbial Biodiversity and Functional Adaptations (BioADAPT)

Team leader : Marie CHARPIN

The homeostasis and the resilience of aquatic ecosystems are dependent, notably, of the ability of microbial communities to adapt to the selective pressures exerted by biotic and/or abiotic factors at different scales of time and space. The originality and ambition of our research project are to bring new knowledge by decrypting at spatial and temporal scales in aquatic ecosystems, the role of (i) the parasitism, (ii) the metabolic and functional diversity, and (iii) the flexibility and metabolic versatility within the general framework of the understanding and prediction of the dynamic properties of an ecosystem in terms of homeostasis (stability), resistance and resilience. Moreover, to understand the dynamics of an aquatic ecosystem, the knowledge of its microbial biodiversity is a key element. So, we will continue to study the existence of atypical viable forms such as femtoplanktonic nanobes as well as the adaptation and the evolution of life in extreme environments such as radioactive mineral springs.

Key words: Resilience, Functional Adaptations, Homeostasis, Ecophysiology, Parasitism, Molecular Dialogues, Metabolism, Metabolic Versatility,
                  Ecological Successions, Mixotrophy, Evolutionary Biology

Animateur de l'équipe: Marie Charpin

L’homéostasie et la résilience des écosystèmes aquatiques résident, notamment, dans la capacité des communautés microbiennes à s’adapter aux pressions sélectives exercées, à différentes échelles de temps et d’espace, par des facteurs déterminants biotiques et/ou abiotiques. L’originalité et l’ambition de notre projet de recherche sont d’apporter des connaissances nouvelles en décryptant, à différentes échelles spatiales et temporelles, dans des écosystèmes aquatiques, le rôle (i) du parasitisme, (ii) de la diversité métabolique et fonctionnelle et (iii) de la flexibilité et de la versatilité métaboliques dans le cadre général de la compréhension et de la prédiction des propriétés dynamiques d’un écosystème en termes d’homéostasie (stabilité), de résistance et de résilience. De plus, pour appréhender la dynamique d’un écosystème aquatique, la connaissance de la biodiversité composant celui-ci est essentielle, par conséquent nous continuerons d’étudier l’existence de formes viables atypiques comme le femtoplancton de type nanobe ainsi que l’adaptation et l’évolution de la vie dans des milieux extrêmes telles les sources minérales radioactives.

Mots clés : Résilience, Adaptations Fonctionnelles, Homéostasie, Ecophysiologie, Parasitisme, Dialogues Moléculaires, Métabolisme, Versatilité
                 Métabolique, Successions Ecologiques, Mixotrophie, Biologie évolutive