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Publications

Publications HAL du labo/EPI LMGE

2021

titre
Prokaryotic and Eukaryotic Fecal Microbiota in Irritable Bowel Syndrome Patients and Healthy Individuals Colonized With Blastocystis
auteur
Céline Nourrisson, Julien Scanzi, Julie Brunet, Frédéric Delbac, Michel Dapoigny, Philippe Poirier
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2021, 12, ⟨10.3389/fmicb.2021.713347⟩
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titre
Potential of preventive bioremediation to reduce environmental contamination by pesticides in an agricultural context: A case study with the herbicide 2,4-D
auteur
Louis Carles, Fabrice Martin-Laurent, Marion Devers, Aymé Spor, Nadine Rouard, Jérémie Beguet, Pascale Besse-Hoggan, Isabelle Batisson
article
Journal of Hazardous Materials, Elsevier, In press, 416, ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.125740⟩
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https://hal.uca.fr/hal-03237156/file/BATISSON_2021_Journal%20of%20hazardous%20materials.pdf BibTex
titre
Genomic analysis of the Bacillus megaterium Mes11: New insights into nitroreductase genes associated with the degradation of mesotrione
auteur
Louis Carles, Florence Donnadieu, Ivan Wawrzyniak, Pascale Besse-Hoggan, Isabelle Batisson
article
International Biodeterioration & Biodegradation, 2021, 162, pp.105254. ⟨10.1016/j.ibiod.2021.105254⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03268521/file/Carles%20et%20al.%2C%20Genomic%20analysis%20of%20the%20Bacillus%20megaterium%20Mes11.pdf BibTex
titre
Antibiotic susceptibility of four Enterobacteriaceae strains (Enterobacter cloacae, Citrobacter freundii, Salmonella typhi and Shigella sonnei) isolated from wastewater, surface water and groundwater in the equatorial zone of Cameroon (Central Africa)
auteur
Awawou Manouore Manouore, Yves Poutoum Yogne, Jean Samuel Eheth, Edith Brunelle Mouafo Tamnou, Claire Stéphane Metsopkeng, Olive Vivien Noah Ewoti, Antoine Tamsa Arfao, Luciane Marlyse Moungang, Paul Alain Nana, Sylvie Chinche Belengfe, Estelle Masseret, Télesphore Sime-Ngando, Moïse Nola
article
World Journal of Advanced Research and Reviews, World Journal of Advanced Research and Reviews, 2021, 11 (1), pp.120 - 137. ⟨10.30574/wjarr.2021.11.1.0303⟩
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https://hal.uca.fr/hal-03323490/file/Manouore%20Njoya%20et%20al.%2C%202021%20%28World%20J%20Adv%20Res%20Rev%29.pdf BibTex
titre
Answer to August 2021 Photo Quiz
auteur
Claudel Catinot Noubam Tchatat, Catherine Godfraind, Laura Montrieul, Nicolas Saroul, Elisa Creuzet, Maxime Moniot, Laurent Gilain, Philippe Poirier, Céline Nourrisson
article
Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2021, 59 (8), pp.e0277020. ⟨10.1128/JCM.02770-20⟩
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titre
Photo Quiz: A Bag of Marbles in the Nose
auteur
Claudel Catinot Noubam Tchatat, Catherine Godfraind, Laura Montrieul, Nicolas Saroul, Elisa Creuzet, Maxime Moniot, Laurent Gilain, Philippe Poirier, Céline Nourrisson
article
Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2021, 59 (8), ⟨10.1128/JCM.02768-20⟩
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titre
Evaluation of Two Commercial Kits on the Automated ELITe InGenius PCR Platform for Molecular Diagnosis of Toxoplasmosis
auteur
Céline Nourrisson, Maxime Moniot, Philippe Poirier, Yvon Sterkers
article
Journal of Molecular Diagnostics, American Society for Investigative Pathology (ASIP), 2021, 23 (7), pp.865-871. ⟨10.1016/j.jmoldx.2021.04.004⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03323951/file/Nourrisson_Tir%C3%A9APart_HAL.pdf BibTex
titre
Physiological effects of the interaction between Nosema ceranae and sequential and overlapping exposure to glyphosate and difenoconazole in the honey bee Apis mellifera
auteur
Hanine Almasri, Daiana Tavares, Marie Diogon, Maryline Pioz, Maryam Alamil, Déborah Sené, Sylvie Tchamitchian, Marianne Cousin, Jean-Luc Brunet, L.P. Belzunces
article
Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2021, 217, pp.112258. ⟨10.1016/j.ecoenv.2021.112258⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03227926/file/2021%20-%20Almasri%20-%20EcotoxEnvSafety.pdf BibTex
titre
From K. pneumoniae Colonization to Dissemination: An Overview of Studies Implementing Murine Models
auteur
Laura Joseph, Thomas Merciecca, Christiane Forestier, Damien Balestrino, Sylvie Miquel
article
Microorganisms, MDPI, 2021, 9 (6), pp.1282. ⟨10.3390/microorganisms9061282⟩
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https://hal.uca.fr/hal-03263532/file/microorganisms-09-01282.pdf BibTex
titre
The TOTUM-63 Supplement and High-Intensity Interval Training Combination Limits Weight Gain, Improves Glycemic Control, and Influences the Composition of Gut Mucosa-Associated Bacteria in Rats on a High Fat Diet
auteur
Marine Dupuit, Vivien Chavanelle, Benoit Chassaing, Fanny Perriere, Monique Etienne, Claire Plissonneau, Audrey Boscaro, Nicolas Barnich, Vincent Pialoux, Thierry Maugard, Florian Le Joubioux, Sébastien Peltier, Pascal Sirvent, Yolanda Otero, Nathalie Boisseau
article
Nutrients, MDPI, 2021, 13 (5), pp.1-24. ⟨10.3390/nu13051569⟩
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https://hal.uca.fr/hal-03220475/file/Dupuit%20et%20al.%202021%20Nutrients.pdf BibTex
titre
Copper-Doped Biphasic Calcium Phosphate Powders: Dopant Release, Cytotoxicity and Antibacterial Properties
auteur
Aurélie Jacobs, Guillaume Renaudin, Nicolas Charbonnel, Jean-Marie Nedelec, Christiane Forestier, Stéphane Descamps
article
Materials, MDPI, 2021, 14 (9), pp.2393. ⟨10.3390/ma14092393⟩
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https://hal.uca.fr/hal-03222652/file/materials-14-02393.pdf BibTex
titre
Assemblages of anoxygenic phototrophic bacteria in tank bromeliads exhibit a host‐specific signature
auteur
Antoine Vergne, Vincent Darbot, Corinne Bardot, François Enault, Anne‐hélène Le Jeune, Jean‐françois Carrias, Bruno Corbara, Régis Céréghino, Céline Leroy, Christian Jeanthon, Eric Giraud, Isabelle Mary, Anne‐catherine Lehours
article
Journal of Ecology, Wiley, 2021, 109 (7), pp.2550-2565. ⟨10.1111/1365-2745.13657⟩
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titre
A prospective study on the pathogenesis of catheter-associated bacteriuria in critically ill patients
auteur
Claire Aumeran, Benoit Mottet-Auselo, Christiane Forestier, Paul-Alain Nana, Claire Hennequin, Frédéric Robin, Bertrand Souweine, Ousmane Traoré, Alexandre Lautrette
article
BMC Microbiology, BioMed Central, 2021, 21 (1), pp.1-10. ⟨10.1186/s12866-021-02147-9⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-03310661/file/s12866-021-02147-9.pdf BibTex
titre
Regards croisés sur les pandémies
auteur
Patricia Gilbert, Estelle Baehrel, David Biron, Chloé Bourmaud, Vincent Dubreuil, David Giron, Sylvie Guillerme, Jean Nicolas Haas, Evelyne Heyer, Philippe Jarne, Didier Jouffre, Bruno Maureille, Laurent Memery, Frédéric Mery, Pierre Moret, Thomas Perrin, Soizic Prado, Geneviève Prevost, Alain Queffelec, Virginie Rougeron, Sabine Sauvage, Marc-André Selosse, Margareta Tengberg, Frédérique Viard
article
Patricia GIBERT. CNRS EDITIONS, 2021, 978-2-271-13665-7
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titre
Lake Sedimentary DNA Research on Past Terrestrial and Aquatic Biodiversity: Overview and Recommendations
auteur
Eric Capo, Charline Giguet-Covex, Alexandra Rouillard, Kevin Nota, Peter Heintzman, Aurèle Vuillemin, Daniel Ariztegui, Fabien Arnaud, Simon Belle, Stefan Bertilsson, Christian Bigler, Richard Bindler, Antony Brown, Charlotte Clarke, Sarah Crump, Didier Debroas, Göran Englund, Gentile Francesco Ficetola, Rebecca Garner, Joanna Gauthier, Irene Gregory-Eaves, Liv Heinecke, Ulrike Herzschuh, Anan Ibrahim, Veljo Kisand, Kurt Kjær, Youri Lammers, Joanne Littlefair, Erwan Messager, Marie-Eve Monchamp, Fredrik Olajos, William Orsi, Mikkel Pedersen, Dilli Rijal, Johan Rydberg, Trisha Spanbauer, Kathleen Stoof-Leichsenring, Pierre Taberlet, Liisi Talas, Camille Thomas, David Walsh, Yucheng Wang, Eske Willerslev, Anne van Woerkom, Heike Zimmermann, Marco Coolen, Laura Epp, Isabelle Domaizon, Inger G. Alsos, Laura Parducci
article
Quaternary, MDPI, 2021, 4 (1), pp.6. ⟨10.3390/quat4010006⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03218984/file/quaternary-04-00006-v2.pdf BibTex
titre
ITS2 Metabarcoding: A promising approach for identification of botanical origin of bee-collected pollen.
auteur
A. Quaresma, J.J.F. van der Steen, J. Amaral, David Biron, R. Brodschneider, V. Brusbardis, N.L. Carreck, M.F. Coffey, G. Formato, D. de Graaf, K. Gratzer, F. Hatjina, O. Kilpinem, A. Keller, D. Laget, M. Pietropaoli, J. Rufino, F. Vejsnaes, M.A. Pinto
article
1st International Online Conference: “Natural Products Application: Health, Cosmetic and Food”, Feb 2021, Bragança, Portugal
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titre
OUP accepted manuscript
auteur
Céline Nourrisson, Solène Le Gal, Maxime Moniot, Frederic Delbac, Jean Pierre Bail, Gilles Nevez, Philippe Poirier
article
Clinical Infectious Diseases, Oxford University Press (OUP), 2021, ⟨10.1093/cid/ciaa563⟩
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titre
Effects of sulfonamide antibiotics on aquatic microbial community composition and functions
auteur
Martin Paumelle, Florence Donnadieu, Muriel Joly, Pascale Besse-Hoggan, Joan Artigas
article
Environment International, Elsevier, 2021, 146, pp.106198. ⟨10.1016/j.envint.2020.106198⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03037638/file/ENVINT-D-20-00962_final%20manuscript.pdf BibTex
titre
Thermo-Mineral Springs, Old and Unique Aquatic Ecosystems to Survey and Preserve
auteur
Aude Beauger, Lory-Anne Baker, Carlos Wetzel, Luc Ector, David Biron
article
Biodiversity Online Journal, Crimson Publishers, 2021, 1 (4)
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03300137/file/BOJ.000519-1_BEAUGER_BIRON.pdf BibTex
titre
Upstream/downstream food quality differences in a Caribbean Island River
auteur
Lou Frotté, Alexandre Bec, Cédric Hubas, Fanny Perrière, Sébastien Cordonnier, Etienne Bezault, Dominique Monti
article
Aquatic Ecology, Springer Verlag, 2021, ⟨10.1007/s10452-021-09887-w⟩
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titre
Quantifying the energetic cost of food quality constraints on resting metabolism to integrate nutritional and metabolic ecology
auteur
Thomas Ruiz, Apostolos‐manuel Koussoroplis, Michael Danger, Jean‐pierre Aguer, Nicole Morel‐desrosiers, Alexandre Bec
article
Ecology Letters, Wiley, 2021, ⟨10.1111/ele.13855⟩
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titre
Rapid responses of pristine marine planktonic communities in experimental approach to diuron and naphthalene (Juan de Nova Island, Western Indian Ocean)
auteur
Marc Bouvy, Christine Dupuy, Patrice Got, Isabelle Domaizon, Claire Carré, Pagano Marc, Didier Debroas, Cécile Roques, Christophe Leboulanger
article
Marine and Freshwater Research, CSIRO Publishing, 2021, ⟨10.1071/MF20276⟩
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titre
Climate influences the response of community functional traits to local conditions in bromeliad invertebrate communities
auteur
Laura Melissa Guzman, M. Kurtis Trzcinski, Ignacio Barberis, Régis Céréghino, Diane Srivastava, Benjamin Gilbert, Valério Pillar, Paula de Omena, Andrew Macdonald, Bruno Corbara, Celine Leroy, Fabiola Ospina Bautista, Gustavo Romero, Pavel Kratina, Vanderlei Debastiani, Ana Gonįalves, Nicholas Marino, Vinicius Farjalla, Barbara Richardson, Michael Richardson, Olivier Dézerald, Gustavo Piccoli, Merlijn Jocqué, Guillermo Montero
article
Ecography, Wiley, 2021, 44 (3), pp.440-452. ⟨10.1111/ecog.05437⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03103974/file/Gutzman_etal_Ecography_.pdf BibTex
titre
In situ resistance, not immigration, supports invertebrate community resilience to drought intensification in a Neotropical ecosystem
auteur
Camille Bonhomme, Régis Céréghino, Jean-Francois Carrias, Arthur Compin, Bruno Corbara, Vincent Jassey, Joséphine Leflaive, Vinicius Farjalla, Nicholas Marino, Thibaut Rota, Diane Srivastava, Celine Leroy
article
Journal of Animal Ecology, Wiley, In press, ⟨10.1111/1365-2656.13392⟩
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titre
A phylogenetic framework to investigate the microsporidian communities through metabarcoding and its application to lake ecosystems
auteur
Aurore Dubuffet, Marina Chauvet, Anne Moné, Didier Debroas, Cécile Lepère
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, In press, ⟨10.1111/1462-2920.15618⟩
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BibTex
titre
High-Intensity interval training and α-linolenic acid supplementation improve DHA conversion and increase the abundance of gut mucosa-associated oscillospira bacteria
auteur
Claire Plissonneau, Frédéric Capel, Benoit Chassaing, Marine Dupuit, Florie Maillard, Ivan Wawrzyniak, Lydie Combaret, Frederic Dutheil, Monique Etienne, Guillaume Mairesse, Guillaume Chesneau, Nicolas Barnich, Nathalie Boisseau
article
Nutrients, MDPI, 2021, 788, 13 (3), pp.1-19. ⟨10.3390/nu13030788⟩
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https://hal.uca.fr/hal-03154591/file/Plissonneau%20et%20al.%20Nutrients%202021.pdf BibTex
titre
Assessment of a Multiplex PCR for the Simultaneous Diagnosis of Intestinal Cryptosporidiosis and Microsporidiosis
auteur
Maxime Moniot, Céline Nourrisson, Charlotte Faure, Frédéric Delbac, Loïc Favennec, Frédéric Dalle, Cyril Garrouste, Philippe Poirier
article
Journal of Molecular Diagnostics, American Society for Investigative Pathology (ASIP), 2021, 23 (4), pp.417-423. ⟨10.1016/j.jmoldx.2020.12.005⟩
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https://hal-normandie-univ.archives-ouvertes.fr/hal-03238779/file/Moniot_JMDI%20%281%29.pdf BibTex

2020

titre
Relationships between Plant Defense Inducer Activities and Molecular Structure of Gallomolecules
auteur
Pascale Goupil, Elodie Peghaire, Razik Benouaret, Claire Richard, Mohamad Sleiman, Hicham El Alaoui, Ayhan Kocer
article
Journal of Agricultural and Food Chemistry, American Chemical Society, 2020, 68 (52), pp.15409-15417. ⟨10.1021/acs.jafc.0c05719⟩
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BibTex
titre
Identification of botanical origin of bee-collected mixed pollen samples: a comparison between palynological and DNA metabarcoding methods
auteur
A. Quaresma, J.J.F. van der Steen, J. Amaral, David Biron, R. Brodschneider, V. Brusbardis, N.L. Carreck, G. Formato, K. Gratzer, F. Hatjina, O. Kilpinen, M. Pietropaoli, J. Rufino, F. Vejsnæs, M.A. Pinto
article
Trends in Biodiversity and Evolution | Metabarcoding and Metagenomics, Dec 2020, CIBIO-InBIO (virtual event), Portugal
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titre
A comprehensive analysis of the global human gut archaeome from a thousand genome catalogue
auteur
Cynthia Maria Chibani, Alexander Mahnert, Guillaume Borrel, Alexandre Almeida, Almut Werner, Jean-François Brugère, Simonetta Gribaldo, Robert Finn, Ruth Schmitz, Christine Moissl-Eichinger
article
2020
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03036323/file/2020_BioRxiv_thousand%20archaeal%20genomes%20from%20the%20human%20gut_2020.11.21.392621v1.full.pdf BibTex
titre
Impact of advance directives on the variability between intensivists in the decisions to forgo life-sustaining treatment
auteur
Margot Smirdec, Mercé Jourdain, Virginie Guastella, Céline Lambert, Jean-Christophe Richard, Laurent Argaud, Samir Jaber, Kada Klouche, Anne Medard, Jean Reignier, Jean-Philippe Rigaud, Jean-Marc Doise, Russell Chabanne, Bertrand Souweine, Jeremy Bourenne, Julie Delmas, Pierre-Marie Bertrand, Philippe Verdier, Jean-Pierre Quenot, Cecile Aubron, Nathanael Eisenmann, Pierre Asfar, Alexandre Fratani, Jean Dellamonica, Nicolas Terzi, Jean-Michel Constantin, Axelle van Lander, Renaud Guerin, Bruno Pereira, Alexandre Lautrette
article
Critical Care, BioMed Central, 2020, 24 (1), pp.672. ⟨10.1186/s13054-020-03402-7⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03040555/file/s13054-020-03402-7.pdf BibTex
titre
Desiccation resistance traits predict freshwater invertebrate survival and community response to drought scenarios in a Neotropical ecosystem
auteur
Régis Céréghino, Léa Françoise, Camille Bonhomme, Jean-Francois Carrias, Arthur Compin, Bruno Corbara, Vincent Jassey, Joséphine Leflaive, Thibaut Rota, Vinicius Farjalla, Céline Leroy
article
Ecological Indicators, Elsevier, 2020, 119, pp.106839. ⟨10.1016/j.ecolind.2020.106839⟩
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BibTex
titre
Mucormycosis in intensive care unit: surgery is a major prognostic factor in patients with hematological malignancy
auteur
Johanna Claustre, R. Larcher, Thomas Jouve, Anne-Sophie Truche, Saad Nseir, Julien Cadiet, Yoann Zerbib, Alexandre Lautrette, Jean-Michel Constantin, Pierre-Emmanuel Charles, Cédric Daubin, Rémi Coudroy, Jean Dellamonica, Laurent Argaud, Pierre Phelouzat, Damien Contou, Juliette Pocquet, Guillaume Voiriot, Jean-Christophe Navellou, Pierre Lavagne, Michel Durand, Muriel Cornet, Carole Schwebel, Nicolas Terzi
article
Annals of Intensive Care, SpringerOpen, 2020, 10 (1), ⟨10.1186/s13613-020-00673-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02863478/file/2020%20Claustre%20et%20al.%2C%20Mucomycosis.pdf BibTex
titre
Protist taxonomic and functional diversity in soil, freshwater and marine ecosystems
auteur
David Singer, Christophe Seppey, Guillaume Lentendu, Micah Dunthorn, David Bass, Lassâad Belbahri, Quentin Blandenier, Didier Debroas, G de Groot, Colomban de Vargas, Isabelle Domaizon, Clément Duckert, Irina Izaguirre, Isabelle Koenig, Gabriela Mataloni, M Schiaffino, Edward Mitchell, Stefan Geisen, Enrique Lara
article
Environment International, Elsevier, 2020, 146, pp.106262. ⟨10.1016/j.envint.2020.106262⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03028115/file/singer%20et%20al%202020.pdf BibTex
titre
Rescoring ensembles of protein-protein docking poses using consensus approaches
auteur
Guillaume Launay, Masahito Ohue, Julia Prieto Santero, Yuri Matsuzaki, Cécile Hilpert, Nobuyuki Uchikoga, Takanori Hayashi, Juliette Martin
article
2020
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02873713/file/2020.04.24.059469v2.full.pdf BibTex
titre
Study of bacterial communities in several naturally radioactive mineral sources in Auvergne (Massif Central, France) and their role in uranium biogeochemistry.
auteur
Guillaume Holub, Claire Sergeant, Marie-Hélène Vesvres, Clarisse Mallet, Lory-Anne Baker, Sofia Kolovi, Aude Beauger, David Biron, Patrick Chardon, Lydia Maigne, Didier Miallier, Hervé Michel, Gilles Montavon, Vincent Breton
article
5éme colloque des Zones Ateliers – CNRS, Nov 2020, En distanciel, cause Covid-19, France
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BibTex
titre
Influence de la radioactivité naturellement renforcée (NOR) sur les peuplements de diatomées actuelles et passées des sources minérales.
auteur
Lory-Anne Baker, Beauger Aude, Sofia Kolovi, Olivier Voldoire, Alain Elisabeth, Jonathan Colombet, Vincent Breton, Patrick Chardon, Didier Miallier, Céline Bailly, Gilles Montavon, Agnes Bouchez, Frédéric Rimet, Cécile Chardon, David Biron
article
5e colloque des Zones Ateliers – CNRS 2000-2020, 20 ans de recherche du Réseau des Zones Ateliers, Nov 2020, Tours, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03018019/file/Poster_Baker_et_al_BIRON_RZA_OCTOBRE_2020.pdf BibTex
titre
A global multinational survey of cefotaxime-resistant coliforms in urban wastewater treatment plants
auteur
Roberto B.M. Marano, Telma Fernandes, Célia Manaia, Olga Nunes, Donald Morrison, Thomas Berendonk, Norbert Kreuzinger, Tanel Telson, Gianluca Corno, Despo Fatta-Kassinos, Christophe Merlin, Edward Topp, Edouard Jurkevitch, Leonie Henn, Andrew Scott, Stefanie Heß, Katarzyna Slipko, Mailis Laht, Veljo Kisand, Andrea Cesare, Popi Karaolia, Stella Michael, Alice Petre, Roberto Rosal, Amy Pruden, Virginia Riquelme, Ana Agüera, Belen Esteban, Aneta Luczkiewicz, Agnieszka Kalinowska, Anne Leonard, William Gaze, Anthony Adegoke, Thor Stenstrom, Alfieri Pollice, Carlo Salerno, Carsten Schwermer, Pawel Krzeminski, Hélène Guilloteau, Erica Donner, Barbara Drigo, Giovanni Libralato, Marco Guida, Helmut Bürgmann, Karin Beck, Hemda Garelick, Marta Tacão, Isabel Henriques, Isabel Martínez-Alcalá, Jose Guillén-Navarro, Magdalena Popowska, Marta Piotrowska, Marcos Quintela-Baluja, Joshua Bunce, Maria Polo-López, Samira Nahim–granados, Marie-Noëlle Pons, Milena Milakovic, Nikolina Udikovic-Kolic, Jérôme Ory, Traore Ousmane, Pilar Caballero, Antoni Oliver, Sara Rodriguez-Mozaz, Jose Balcazar, Thomas Jager, Thomas Schwartz, Ying Yang, Shichun Zou, Yunho Lee, Younggun Yoon, Bastian Herzog, Heidrun Mayrhofer, Om Prakash, Yogesh Nimonkar, Ester Heath, Anna Baraniak, Joana Abreu-Silva, Manika Choudhury, Leonardo Munoz, Stela Krizanovic, Gianluca Brunetti, Ayella Maile-Moskowitz, Connor Brown, Eddie Cytryn
article
Environment International, Elsevier, 2020, 144, pp.106035. ⟨10.1016/j.envint.2020.106035⟩
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-02931405/file/HAL_Marano_2020-1.pdf BibTex
titre
Comparison of DNA extraction methods and real-time PCR assays for the detection of blastocystis sp. in stool specimens
auteur
Céline Nourrisson, Julie Brunet, Pierre Flori, Maxime Moniot, Virginie Bonnin, Frédéric Delbac, Philippe Poirier
article
Microorganisms, MDPI, 2020, 8 (11), pp.1-8. ⟨10.3390/microorganisms8111768⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03255323/file/2020_Nourrisson_Microorganisms.pdf BibTex
titre
A drift‐barrier model drives the genomic landscape of a structured bacterial population
auteur
Hélène Gardon, Corinne Biderre-Petit, Isabelle Jouan-Dufournel, Gisèle Bronner
article
Molecular Ecology, Wiley, 2020, 29 (21), pp.4143-4156. ⟨10.1111/mec.15628⟩
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BibTex
titre
High Prevalence of Headaches During Covid‐19 Infection: A Retrospective Cohort Study
auteur
Louis Poncet‐megemont, Pauline Paris, Amélie Tronchere, Jean‐pascal Salazard, Bruno Pereira, Radhouane Dallel, Claire Aumeran, Jean Beytout, Christine Jacomet, Henri Laurichesse, Olivier Lesens, Natacha Mrozek, Magali Vidal, Xavier Moisset
article
Headache: The Journal of Head and Face Pain, American Headache Society, 2020, 60 (10), pp.2578-2582. ⟨10.1111/head.13923⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-03112413/file/Poncet-Megemont-2020.pdf BibTex
titre
Unveiling Crucivirus Diversity by Mining Metagenomic Data
auteur
Ignacio de la Higuera, George Kasun, Ellis Torrance, Alyssa Pratt, Amberlee Maluenda, Jonathan Colombet, Maxime Bisseux, Viviane Ravet, Anisha Dayaram, Daisy Stainton, Simona Kraberger, Peyman Zawar-Reza, Sharyn Goldstien, James Briskie, Robyn White, Helen Taylor, Christopher Gomez, David Ainley, Jon Harding, Rafaela Fontenele, Joshua Schreck, Simone Ribeiro, Stephen Oswald, Jennifer Arnold, François Enault, Arvind Varsani, Kenneth Stedman
article
mBio, 2020, 11 (5), ⟨10.1128/mBio.01410-20⟩
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BibTex
titre
Nutritional constraints on growth and metabolic rate of an ectotherm consumers (Daphnia magna) in a context of global change : Experimental approach by microcalorimetry
auteur
Thomas Ruiz
article
Ecology, environment. Université Clermont Auvergne, 2020. English. ⟨NNT : 2020CLFAC029⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03071628/file/2020CLFAC029_RUIZ.pdf BibTex
titre
Array of microbial indicators, a promise for a better monitoring of pesticide effects on stream biological quality
auteur
Jeremy Jabiol, Joan Artigas, Jérémie Beguet, Chloé Bonnineau, Eric Chauvet, Marion Devers, François Guérold, Matthieu Le Dréau, Camille Legrand, Christelle Margoum, Fabrice Martin-Laurent, Nicolas Mazzella, Stéphane Pesce, Nadine Rouard, Véronique Gouy
article
EcotoxicoMic 2020, 2nd International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier, France
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BibTex
titre
Bioremediation of agricultural soils: a natural preventive approach to reduce the environmental contamination by pesticides
auteur
L. Carles, A. Wauquier, P. Joly, C. Bardon, B. Combourieu, I. Batisson, Pascale Besse-Hoggan
article
EcotoxicoMic 2020, 2nd International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier, France
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titre
Metabolic response of Microbacterium sp. C448 exposed to environmental and medicinal concentrations of sulfamethazine antibiotic
auteur
Laurianne Paris, Muriel Joly, Marion Devers-Lamrani, Nadine Rouard, Didier Viala, Michel Hébraud, Fabrice Martin-Laurent, Isabelle Batisson, Pascale Besse-Hoggan
article
EcotoxicoMic 2020, 2nd International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier, France
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A combined LC-MS and NMR approach to reveal metabolic changes in the hemolymph of honeybees infected by the gut parasite Nosema ceranae
auteur
Cyril Jousse, Céline Dalle, Angélique Abila, Mounir Traïkia, Marie Diogon, Bernard Lyan, Hicham El Alaoui, Cyril Vidau, Frédéric Delbac
article
Journal of Invertebrate Pathology, Elsevier, 2020, 176, pp.107478. ⟨10.1016/j.jip.2020.107478⟩
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Seasonal microbial food web dynamics in contrasting Southern Ocean productivity regimes
auteur
Urania Chistaki, Audrey Guenegues, Yan Liu, Stéphane Blain, Philippe Catala, Jonathan Colombet, Pavla Debeljak, Ludwig Jardillier, Solène Irion, Frédéric Planchon, Ingrid Sassenhagen, Télesphore Sime-Ngando, Ingrid Obernosterer
article
Limnology and Oceanography, Association for the Sciences of Limnology and Oceanography, 2020, ⟨10.1002/lno.11591⟩
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https://hal-univ-poitiers.archives-ouvertes.fr/hal-03034631/file/Christaki_2020_HAL.pdf BibTex
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Biological properties of copper-doped biomaterials for orthopedic applications: A review of antibacterial, angiogenic and osteogenic aspects
auteur
Aurélie Jacobs, Guillaume Renaudin, Christiane Forestier, J.-M. Nedelec, Stéphane Descamps
article
Acta Biomaterialia, Elsevier, 2020, 117, pp.21-39. ⟨10.1016/j.actbio.2020.09.044⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-02984809/file/Revue_cuivre_Acta%20Bio.pdf BibTex
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Transient Dynamics of Archaea and Bacteria in Sediments and Brine Across a Salinity Gradient in a Solar Saltern of Goa, India
auteur
Kabilan Mani, Najwa Taïb, Mylène Hugoni, Gisèle Bronner, Judith Bragança, Didier Debroas
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2020, 11, pp.1-19. ⟨10.3389/fmicb.2020.01891⟩
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titre
Stable isotopes of fatty acids: current and future perspectives for advancing trophic ecology
auteur
Cornelia Twining, Sami Taipale, Liliane Ruess, Alexandre Bec, Dominik Martin-Creuzburg, Martin Kainz
article
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2020, 375 (1804), pp.20190641. ⟨10.1098/rstb.2019.0641⟩
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titre
A European multicentre evaluation of detection and typing methods for human enteroviruses and parechoviruses using RNA transcripts
auteur
A. Hayes, D. Nguyen, M. Andersson, A. Antón, J.‐l. Bailly, S. Beard, K. Benschop, N. Berginc, S. Blomqvist, E. Cunningham, D. Davis, J. Dembinski, S. Diedrich, S. Dudman, R. Dyrdak, G. Eltringham, S. Gonzales‐goggia, R. Gunson, H. Howson‐wells, A. Jääskeläinen, F. López‐labrador, M. Maier, M. Majumdar, S. Midgley, A. Mirand, U. Morley, S. Nordbø, S. Oikarinen, H. Osman, A. Papa, L. Pellegrinelli, A. Piralla, N. Rabella, J. Richter, M. Smith, A. Söderlund Strand, K. Templeton, B. Vipond, T. Vuorinen, C. Williams, E. Wollants, K. Zakikhany, T. Fischer, H. Harvala, P. Simmonds
article
Journal of Medical Virology, Wiley-Blackwell, 2020, 92 (8), pp.1065-1074. ⟨10.1002/jmv.25659⟩
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titre
The host-associated archaeome
auteur
Guillaume Borrel, Jean-François Brugere, Simonetta Gribaldo, Ruth Schmitz, Christine Moissl-Eichinger
article
Nature Reviews Microbiology, Nature Publishing Group, 2020, ⟨10.1038/s41579-020-0407-y⟩
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https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-02942982/file/2020_Borrel_Nat-Mic-Review.pdf BibTex
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Analysis of bacterial and archaeal communities associated with Fogo volcanic soils of different ages
auteur
Corinne Biderre-Petit, Corentin Hochart, Hélène Gardon, Eric Dugat-Bony, Sébastien Terrat, Isabelle Jouan-Dufournel, Raphael Paris
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2020, 96 (7), ⟨10.1093/femsec/fiaa104⟩
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titre
How does continuous venovenous hemofiltration theoretically expose (ex-vivo models) inpatients to diethylhexyladipate, a plasticizer of PVC medical devices?
auteur
Lise Bernard, Mélanie Bailleau, Teuta Eljezi, Philip Chennell, Bertrand Souweine, Alexandre Lautrette, Valérie Sautou
article
Chemosphere, Elsevier, 2020, 250, pp.126241. ⟨10.1016/j.chemosphere.2020.126241⟩
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titre
Testing markers to characterize microbial communities in food ecosystems using a metagenomics approach
auteur
Claire Vincent, Serge Casaregola, Monika Coton, Céline Delbes, Hugo Devillers, Eric Dugat-Bony, Stephane Guezenec, Kate Howell, Francoise Irlinger, Jean Luc Legras, Valentin Loux, Elisa Michel, Jerome Mounier, Cécile Neuvéglise, Thibault Nidelet, Audrey Pawtowski, Pierre Renault, Delphine Sicard, Monique Zagorec, Olivier Rué
article
JOBIM, Jun 2020, Montpellier, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02914960/file/jobim2020-metabarfood_final.pdf BibTex
titre
The IL-22 pathway as target to relieve visceral pain and animal well-being
auteur
Maeva Meynier, Elodie Baudu, Manon Defaye, Y Wawzyniak, Frederic Delbac, Nicolas Barnich, D Ardid, Philippe Poirier, Romain Villeger, J.M. Chatel, V Livrelli, Mathilde Bonnet, Frederic Carvalho
article
ICTRHN, Jun 2020, Clermont-Ferrand, France
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titre
Trophic conditions influence widespread distribution of Aster-Like nanoparticles within aquatic environments
auteur
Maxime Fuster, Hermine Billard, Marie Mandart, Johannes Steiger, Telesphore Sime-Ngando, Jonathan Colombet
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2020, 80 (4), pp.741-745. ⟨10.1007/s00248-020-01541-6⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03084202/file/Fuster_etal_2020_MECO_pre-print.pdf BibTex
titre
Fecal dysbiosis associated with colonic hypersensitivity and behavioral alterations in chronically Blastocystis-infected rats
auteur
Manon Defaye, Céline Nourrisson, Elodie Baudu, Amandine Lashermes, Maeva Meynier, Mathieu Meleine, Ivan Wawrzyniak, Virginie Bonnin, Julie Barbier, Benoit Chassaing, Catherine Godfraind, Agathe Gelot, Nicolas Barnich, Denis Ardid, Mathilde Bonnet, Frédéric Delbac, Frédéric Antonio Carvalho, Philippe Poirier
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.9146. ⟨10.1038/s41598-020-66156-w⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-02884871/file/s41598-020-66156-w.pdf BibTex
titre
Archaea, specific genetic traits, and development of improved bacterial live biotherapeutic products: another face of next-generation probiotics
auteur
Khaled Fadhlaoui, Marie-Edith Arnal, Matthieu Martineau, Paméla Camponova, Bernard Ollivier, Paul O’toole, Jean-François Brugere
article
Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2020, 104 (11), pp.4705-4716. ⟨10.1007/s00253-020-10599-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02996543/file/2020_AMaB_Archaea-enhancedLBPs.pdf BibTex
titre
Multi‐model assessment of hydrological and environmental impacts on streambed microbes in Mediterranean catchments
auteur
Giulia Gionchetta, Joan Artigas, Rebeca Arias‐real, Francesc Oliva, Anna Maria Romaní
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2020, 22 (6), pp.2213-2229. ⟨10.1111/1462-2920.14990⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02998717/file/Gionchetta%202020%20EMI.pdf BibTex
titre
Epidemiological investigation for grouped cases of Trichosporon asahii using whole genome and IGS1 sequencing
auteur
Marie Desnos-Ollivier, Corinne Maufrais, Marc Pihet, Christine Aznar, Françoise Dromer, N. Brieu, T. Chouaki, S. Bland, V. Blanc, A.P. Bellanger, F. Grenouillet, L. Millon, S. Brun, I. Poilane, F. Gabriel, A.L. Roux, D. Quinio, E. Moalic, J. Bonhomme, P. Poirier, C. Nourrisson, F. Botterel, N. Fauchet, E. Forget, F. Dalle, P. Cahen, C. Lawrence, O. Faure, D. Maubon, M. Cornet, M. Nicolas, M. Demar, C. Nabet, A. Angoulvant, S. Picot, N. Traversier, O. Eloy, B. Sendid, B. Bouteille, F. Persat, M. Wallon, S. Ranque, H. Piarroux, N. Desbois, L. Collet, N. Bourgeois, L. Lachaux, F. Moriot, O. Mouquet, L. Hasseine, M. Gari‐toussaint, M. Sasso, D. Poisson, A. Minoza, C. Kauffman, D. Toubas, J.P. Gangneux, L. Favennec, N. Godineau, H. Rabérin, V. Bru, S. Cassaing, E. Bailly, E. Chachaty, C. Bonnal, A. Paugam, B. Heym, M.‐e. Bougnoux, E. Sitterle, Alexandre Alanio, D. Moissenet, S. Bonacorsi, P. Mariani
article
Mycoses, Wiley, 2020, ⟨10.1111/myc.13126⟩
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titre
Klebsiella pneumoniae survival and regrowth in endoscope channel biofilm exposed to glutaraldehyde and desiccation
auteur
A. Cholley, O. Traoré, C. Hennequin, C. Aumeran
article
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2020, 39 (6), pp.1129-1136. ⟨10.1007/s10096-020-03818-7⟩
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titre
Interaction between glyphosate and dissolved phosphorus on bacterial and eukaryotic communities from river biofilms
auteur
Louis Carles, Joan Artigas
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2020, 719, pp.137463. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.137463⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02998700/file/Revised%20manuscript_Carles%20Artigas%202020_HAL.pdf BibTex
titre
Reconstruction of plasmids by shotgun sequencing from environmental DNA: which bioinformatic workflow?
auteur
Cécile Hilpert, Geneviève Bricheux, Didier Debroas
article
Briefings in Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2020, 2020, pp.1 - 14. ⟨10.1093/bib/bbaa059⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02882372/file/Hilpert%20V%20non%20final.pdf BibTex
titre
Partitioning of microbial cells between clouds and precipitation
auteur
Raphaëlle Péguilhan, Ludovic Besaury, Florent Rossi, Jean-Luc Baray, Thibaud Mas, Laurent Deguillaume, Barbara Ervens, Pierre Amato
article
EGU General Assembly 2020, May 2020, Vienne, Austria. ⟨10.5194/egusphere-egu2020-2876⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03004047/file/Peguilhan%20etal%2C%20EGU2020-2876-print.pdf BibTex
titre
Biofilm interactions can modulate microbial decomposer responses to antibiotics
auteur
Martin Paumelle, Florence Donnadieu, Muriel Joly, Joan Artigas, Pascale Besse-Hoggan
article
30th Annual Meeting SETAC Europe,, May 2020, Dublin, Ireland
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titre
Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018-2019 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee
auteur
Evelien Adriaenssens, Matthew Sullivan, Petar Knezevic, Leonardo van Zyl, B. Sarkar, Bas Dutilh, Poliane Alfenas-Zerbini, Małgorzata Łobocka, Yigang Tong, James Rodney Brister, Andrea Moreno Switt, Jochen Klumpp, Ramy Karam Aziz, Jakub Barylski, Jumpei Uchiyama, Rob Edwards, Andrew Kropinski, Nicola Petty, Martha Clokie, Alla Kushkina, Vera Morozova, Siobain Duffy, Annika Gillis, Janis Rumnieks, İpek Kurtböke, Nina Chanishvili, Lawrence Goodridge, Johannes Wittmann, Rob Lavigne, Ho Bin Jang, David Prangishvili, François Enault, Dann Turner, Minna Poranen, Hanna Oksanen, Mart Krupovic
article
Archives of Virology, Springer Verlag, 2020, 165 (5), pp.1253-1260. ⟨10.1007/s00705-020-04577-8⟩
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titre
Honeybee gut microbiota dysbiosis in pesticide/parasite co-exposures is mainly induced by Nosema ceranae
auteur
Laurianne Paris, Elodie Peghaire, Anne Mone, Marie Diogon, Didier Debroas, Frédéric Delbac, Hicham El Alaoui
article
Journal of Invertebrate Pathology, Elsevier, 2020, 172, pp.107348. ⟨10.1016/j.jip.2020.107348⟩
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titre
Dissolved organic matter does not promote glyphosate degradation in auto-heterotrophic aquatic microbial communities
auteur
Joan Artigas, Isabelle Batisson, Louis Carles
article
Environmental Pollution, Elsevier, 2020, 259, pp.113951. ⟨10.1016/j.envpol.2020.113951⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02998729/file/MS%20ENPO%20113951_Artigas%20et%20al..pdf BibTex
titre
Antifungal susceptibility testing practices in mycology laboratories in France, 2018
auteur
A.-P. Bellanger, F. Persat, F. Foulet, C. Bonnal, I. Accoceberry, C. Angebault, A. Angoulvant, O. Augereau, E. Bailly, F. Bert, J. Bonhomme, J.-P. Bouchara, M.-E. Bougnoux, P. Bourdeau, B. Bouteille, S. Brun, K. Brunet, A.-M. Camin-Ravenne, S. Cassaing, T. Chouaki, M. Cornet, D. Costa, N. Desbois, J. Dorin, A. Fekkar, A. Fiacre, E. Fréalle, J.-P. Gangneux, J. Guillot, J. Guitard, L. Hasseine, A. Huguenin, L. Lachaud, S. Larréché, R.-A. Lavergne, S. Le Gal, Y. Le Govic, V. Letscher-Bru, M. Machouart, E. Mazars, C. Nourrisson, A. Paugam, S. Ranque, V. Risco-Castillo, M. Sasso, M. Sautour, B. Sendid, Y. Senghor, F. Botterel, Eric Dannaoui
article
Journal of Medical Mycology / Journal de Mycologie Médicale, Elsevier Masson, 2020, 30 (2), pp.100970. ⟨10.1016/j.mycmed.2020.100970⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02566987/file/AFST_Practices%20Antifungal%20susceptibility%20testing%20practices%20in%20mycology%20laboratories%20in%20France%2C%202018.pdf BibTex
titre
Aphids in focus: unravelling their complex ecology and evolution using genetic and molecular approaches
auteur
Hugh Loxdale, Adalbert Balog, David Biron
article
Biological Journal of the Linnean Society, Linnean Society of London, 2020, 129 (3), pp.507-531. ⟨10.1093/biolinnean/blz194⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03018009/file/Loxdale%2C%20Balog%20%26%20Biron%20MS%2C%20Aphids%20in%20focus%2C%20BJLS_2020.pdf BibTex
titre
Resource availability drives bacterial succession during leaf-litter decomposition in a bromeliad ecosystem
auteur
Jean-Francois Carrias, Mélanie Gerphagnon, Hector Rodriguez Perez, Guillaume Borrel, Camille Loiseau, Bruno Corbara, Régis Cereghino, Isabelle Mary, Céline Leroy
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2020, 96 (4), pp.fiaa045. ⟨10.1093/femsec/fiaa045⟩
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titre
Role of Biofilms in Contaminant Bioaccumulation and Trophic Transfer in Aquatic Ecosystems: Current State of Knowledge and Future Challenges
auteur
Chloé Bonnineau, Joan Artigas, Betty Chaumet, Aymeric Dabrin, Juliette Fabure, Benoît Ferrari, Jeremie Lebrun, Christelle Margoum, Nicolas Mazzella, Cecile Miege, Soizic Morin, Emmanuelle Uher, Marc Babut, Stéphane Pesce
article
Reviews of Environmental Contamination and Toxicology (Continuation of Residue Reviews), Springer, pp.115 - 153, 2020, ⟨10.1007/398_2019_39⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02734075/file/BonnineauEtAl2020_AuthorVersion.pdf BibTex
titre
The effect of natural radioactivity on diatom communities in mineral springs
auteur
Fanny Millan, Cheilla Izere, Vincent Breton, Olivier Voldoire, David Biron, Carlos Wetzel, Didier Miallier, Elisabeth Allain, Luc Ector, Aude Beauger
article
Botany Letters, Taylor & Francis, 2020, 167, pp.95-113. ⟨10.1080/23818107.2019.1691051⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02396650/file/Millan%20et%20al%20Diatom_Radioactivity_Manuscrt%28accept%C3%A9%29.pdf BibTex
titre
A Pediococcus strain to rescue honeybees by decreasing Nosema ceranae- and pesticide-induced adverse effects
auteur
Elodie Peghaire, Anne Mone, Frédéric Delbac, Didier Debroas, Frédérique Chaucheyras-Durand, Hicham El Alaoui
article
Biology, MDPI 2020, 163, pp.138-146. ⟨10.1016/j.pestbp.2019.11.006⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02935692/file/PEGHAIRE_PesticideBiochemPhysiol_2020.pdf BibTex
titre
AUTOMATIC DETECTION AND CLASSIFICATION OF HONEY BEE COMB CELLS USING DEEP LEARNING
auteur
Thiago Alves, M Pinto, Paulo Ventura, Cátia Neves, David Biron, Arnaldo Junior, Pedro L. de Paula Filho, Pedro Rodrigues
article
Computers and Electronics in Agriculture, Elsevier, 2020
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03017457/file/COMPAG_2020_ACCEPTED_VERSION_BIRON.pdf BibTex
titre
Differential impact of top-down and bottom-up forces in structuring freshwater bacterial communities
auteur
A Pradeep ram, J Keshri, T Sime-Ngando
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2020, 96 (2), ⟨10.1093/femsec/fiaa005⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03037880/file/Accepted-Version-FEMS2020.pdf BibTex
titre
Monitoring of enterovirus diversity in wastewater by ultra-deep sequencing: An effective complementary tool for clinical enterovirus surveillance
auteur
Maxime Bisseux, Didier Debroas, Audrey Mirand, Christine Archimbaud, Hélène Peigue-Lafeuille, Jean-Luc Bailly, Cécile Henquell
article
Water Research, IWA Publishing, 2020, 169, pp.115246. ⟨10.1016/j.watres.2019.115246⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02359343/file/water%20research%20final.pdf BibTex
titre
Freshwater Perkinsea: diversity, ecology and genomic information
auteur
M Jobard, I Wawrzyniak, G Bronner, D Marie, A Vellet, T Sime-Ngando, D Debroas, C Lepère
article
Journal of Plankton Research, Oxford University Press (OUP), 2020, 42 (1), pp.3-17. ⟨10.1093/plankt/fbz068⟩
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titre
Let’s talk about POÆMS !! A story of photosynthetic organisms from atmospheric ecosystem in a multiscale study
auteur
A. Patrigeon, H. Billard, J. Colombet, J.-L. Baray, C. Judon, M. Lagree, B. Dieme, D. Latour, Cyril Jousse
article
Metabomeeting, Jan 2020, Toulouse, France
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titre
L’homme et l'abeille, une histoire des pratiques
auteur
Bruno Corbara, Eric Fayet
article
2020
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https://hal.uca.fr/hal-03136466/file/Bruno_Corbara_BD.mp4 BibTex
titre
Co-circulation of multiple enterovirus D68 subclades, including a novel B3 cluster, across Europe in a season of expected low prevalence, 2019/20
auteur
Sofie Elisabeth Midgley, Kimberley Benschop, Robert Dyrdak, Audrey Mirand, Jean-Luc Bailly, Sibylle Bierbaum, Stefan Buderus, Sindy Böttcher, Anna-Maria Eis-Hübinger, Mario Hönemann, Veronika Vorobieva Jensen, Ulla Birgitte Hartling, Cécile Henquell, Marcus Panning, Marianne Kragh Thomsen, Emma Hodcroft, Adam Meijer
article
Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2020, 25 (2), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2020.25.2.1900749⟩
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titre
Temperature and nutrient effects on the relative importance of brown and green pathways for stream ecosystem functioning: A mesocosm approach
auteur
Alice Gossiaux, Marc Rollin, Francois Guerold, Vincent Felten, Martin Laviale, Quentin Bachelet, Pascal Poupin, Eric Chauvet, Alexandre Bec, Michaël Danger
article
Freshwater Biology, Wiley, 2020, 65 (7), pp.1239-1255. ⟨10.1111/fwb.13474⟩
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-02526210/file/gossiaux_26549-1.pdf BibTex
titre
Analysis of Spounaviruses as a Case Study for the Overdue Reclassification of Tailed Phages
auteur
Jakub Barylski, Francois Enault, Bas Dutilh, Margo Bp Schuller, Robert Edwards, Annika Gillis, Jochen Klumpp, Petar Knezevic, Mart Krupovic, Jens Kuhn, Rob Lavigne, Hanna Oksanen, Matthew Sullivan, Ho Bin Jang, Peter Simmonds, Pakorn Aiewsakun, Johannes Wittmann, Igor Tolstoy, J Rodney Brister, Andrew Kropinski, Evelien Adriaenssens
article
Systematic Biology, Oxford University Press (OUP), 2020, 69 (1), pp.110-123. ⟨10.1093/sysbio/syz036⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02362652/file/barylski_spounaviruses_2019_syz036.pdf BibTex
titre
Shifting levels of ecological network’s analysis reveals different system properties
auteur
N. Niquil, M. Haraldsson, T. Sime-Ngando, P. Huneman, S.R. Borrett
article
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2020, 375 (1796), ⟨10.1098/rstb.2019.0326⟩
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titre
Extreme rainfall events alter the trophic structure in bromeliad tanks across the Neotropics
auteur
Gustavo Romero, Nicholas Marino, A Andrew, M Macdonald, Reǵis Ceŕeǵhino, M Trzcinski, Acosta Mercado, Céline Leroy, Bruno Corbara, Vinicius Farjalla, Ignacio Barberis, Olivier Deźerald, Edd Hammill, Trisha Atwood, Gustavo Piccoli, Fabiola Ospina Bautista, Jean-Francois Carrias, Juliana Leal, Guillermo Montero, Pablo Antiqueira, Rodrigo Freire, Emilio Realpe, Sarah Amundrud, Paula de Omena, Alice Campos, Pavel Kratina, Eoin O'Gorman, Diane Srivastava
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 11 (1), pp.3215. ⟨10.1038/s41467-020-17036-4⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02887639/file/Romero_etal_Nature_Comm_2020_11_1.pdf BibTex
titre
Bioactive polysaccharides from microalgae
auteur
Nastasia Prybylski, Claire Toucheteau, Hicham El Alaoui, Nicolas Bridiau, Thierry Maugard, Slim Abdelkafi, Imen Fendri, Cédric Delattre, Pascal Dubessay, Guillaume Pierre, Philippe Michaud
article
Handbook of Microalgae-Based Processes and Products, Elsevier, pp.533-571, 2020, ⟨10.1016/B978-0-12-818536-0.00020-8⟩
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titre
Identification of sulfur components enhancing the anti-Candida effect of Lactobacillus rhamnosus Lcr35
auteur
Caroline Dausset, Stéphanie Bornes, Sylvie Miquel, Nathalie Kondjoyan, Magaly Angenieux, Laurence Nakusi, Philippe Veisseire, Elina Alaterre, Luis Bermúdez-Humarán, Philippe Langella, Erwan Engel, Christiane Forestier, Adrien Nivoliez
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.17074. ⟨10.1038/s41598-020-74027-7⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02969177/file/Dausset%202020.pdf BibTex
titre
Ecological determinants of community structure across the trophic levels of freshwater food webs: a test using bromeliad phytotelmata
auteur
Régis Cereghino, Bruno Corbara, Céline Leroy, Jean-Francois Carrias
article
Hydrobiologia, Springer, 2020, 847, pp.391 - 402. ⟨10.1007/s10750-019-04100-4⟩
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BibTex
titre
Ecological response to altered rainfall differs across the Neotropics
auteur
Diane S. Srivastava, Régis Cereghino, M. Kurtis Trzcinski, Arthur Andrew M. Macdonald, Nicholas A. C. Marino, Dimaris Acosta Mercado, Céline Leroy, Bruno Corbara, Gustavo Q. Romero, Vinicius F. Farjalla, Ignacio M. Barberis, Olivier Dezerald, Edd Hammill, Trisha B. Atwood, Gustavo C. O. Piccoli, Fabiola Ospina Bautista, Jean-Francois Carrias, Juliana S. Leal, Guillermo Montero, Pablo Antiqueira, Rodrigo Freire, Emilio Realpe, S. Amundrud, Paula de Omena, Alice Campos
article
Ecology, Ecological Society of America, 2020, 101 (4), pp.e02984. ⟨10.1002/ecy.2984⟩
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titre
Species niches, not traits, determine abundance and occupancy patterns: A multi‐site synthesis
auteur
Nicholas A. C. Marino, Régis Cereghino, Benjamin Gilbert, Jana S. Petermann, Diane S. Srivastava, Paula M. Omena, Fabiola Ospina Bautista, Laura Melissa Guzman, Gustavo Q. Romero, M. Kurtis Trzcinski, Ignacio M. Barberis, Bruno Corbara, Vanderlei J. Debastiani, Olivier Dézerald, Pavel Kratina, Céline Leroy, Arthur Andrew M. Macdonald, Guillermo Montero, Valério D. Pillar, Barbara A. Richardson, Michael J. Richardson, Stanislas Talaga, Ana Z. Gonçalves, Gustavo C. O. Piccoli, Merlijn Jocqué, Vinicius F. Farjalla, Jonathan Belmaker
article
Global Ecology and Biogeography, Wiley, 2020, 29 (2), pp.295-308. ⟨10.1111/geb.13029⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02408612/file/487926.pdf BibTex
titre
Assessing the response of micro-eukaryotic diversity to the Great Acceleration using lake sedimentary DNA
auteur
François Keck, Laurent Millet, Didier Debroas, David Etienne, Didier Galop, Damien Rius, Isabelle Domaizon
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 8 p. ⟨10.1038/s41467-020-17682-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02910139/file/Keck_etal_2020_Nature.D%20GALOPpdf.pdf BibTex
titre
Diversity and Structure of the Prokaryotic Communities Indigenous to Two Volcanic Lakes: Nyos and Monoun in Cameroon
auteur
Paul-Alain Nana, Moïse Nola, Geneviève Bricheux, Zéphyrin Fokam, Pierre Ngassam, Dickson Achuo Enah, Jonathan Colombet, Agnès Vellet, Anne Mone, Viviane Ravet, Didier Debroas, Télesphore Sime-Ngando
article
Open Journal of Ecology, SCIRP, 2020, 10 (09), pp.632-650. ⟨10.4236/oje.2020.109039⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02996331/file/Nana%202020%20OJE.pdf BibTex
titre
Ant Gardens
auteur
Bruno Corbara
article
Encyclopedia of Social Insects, Springer International Publishing, pp.1 - 4, 2020, ⟨10.1007/978-3-319-90306-4_7-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02994913/file/ESI%20corrected%20proof%20.pdf BibTex
titre
A mouse ear skin model to study the dynamics of innate immune Running title: Biofilm-dependent modulation of physiological inflammation
auteur
Aizat Abdul Hamid, Laurence Nakusi, Mickael Givskov, Young-Tae Chang, Claire Marquès, Pascale Gueirard
article
BMC Microbiology, BioMed Central, 2020, 20, ⟨10.1186/s12866-019-1635-z⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02361908/file/Hamid%202020%20BMC.pdf BibTex
titre
Contrasting pelagic ecosystem functioning in eastern and western Baffin Bay revealed by trophic network modeling
auteur
Blanche Saint-Béat, Brian Fath, Cyril Aubry, Jonathan Colombet, Julie Dinasquet, Louis Fortier, Virginie Galindo, Pierre-Luc Grondin, Fabien Joux, Catherine Lalande, Mathieu Leblanc, Patrick Raimbault, Télesphore Sime-Ngando, Jean-Eric Tremblay, Daniel Vaulot, Frédéric Maps, Marcel Babin
article
Elementa: Science of the Anthropocene, University of California Press, 2020, 8, ⟨10.1525/elementa.397⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03095448/file/Saint-B%C3%A9at%20et%20al%202020.pdf BibTex
titre
Lyme Snap: a feasibility study of on-line declarations of erythema migrans in a rural area of France
auteur
P. Letertre-Gibert, Gwenaël Vourc'H, Isabelle Lebert, Magalie René-Martellet, V. Corbin-Valdenaire, D. Portal-Martineau, J. Beytout, O. Lesens
article
Ticks and Tick-borne Diseases, Elsevier, 2020, 11, ⟨10.1016/j.ttbdis.2019.101301⟩
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titre
Inducing Plant Defense Reactions in Tobacco Plants with Phenolic-Rich Extracts from Red Maple Leaves: A Characterization of Main Active Ingredients
auteur
Elodie Peghaire, Samar Hamdache, Antonin Galien, Mohamad Sleiman, Alexandra ter Halle, Hicham El Alaoui, Ayhan Kocer, Claire Richard, Pascale Goupil
article
Forests, MDPI, 2020, 11 (6), pp.705. ⟨10.3390/f11060705⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02920408/file/pub168.pdf BibTex
titre
Severe Acute Flaccid Myelitis Associated With Enterovirus in Children: Two Phenotypes for Two Evolution Profiles?
auteur
Melodie Aubart, Cyril Gitiaux, Charles Joris Roux, Raphael Levy, Isabelle Schuffenecker, Audrey Mirand, Nathalie Bach, Florence Moulin, Jean Bergounioux, Marianne Leruez-Ville, Flore Rozenberg, Delphine Sterlin, Lucile Musset, Denise Antona, Nathalie Boddaert, Shen Ying Zhang, Manoelle Kossorotoff, Isabelle Desguerre
article
Frontiers in Neurology, Frontiers, 2020, 11, pp.343. ⟨10.3389/fneur.2020.00343⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02998679/file/fneur-11-00343.pdf BibTex

2019

titre
Distinct responses from bacterial, archaeal and fungal streambed communities to severe hydrological disturbances
auteur
G. Gionchetta, A. Romaní, F. Oliva, J. Artigas
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-49832-4⟩
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titre
Screening of marine microalgae: Investigation of new exopolysaccharide producers
auteur
Clément Gaignard, Céline Laroche, Guillaume Pierre, Pascal Dubessay, Cédric Delattre, Christine Gardarin, Priscilla Gourvil, Ian Probert, Aurore Dubuffet, Philippe Michaud
article
Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, Elsevier, 2019, 44, pp.101711. ⟨10.1016/j.algal.2019.101711⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02364692/file/Gaignard%20et%20al%20-%20revised%20-%20preprint.pdf BibTex
titre
Diagnosis and management of metabolic acidosis: guidelines from a French expert panel
auteur
Boris Jung, Mikaël Martinez, Yann-Erick Claessens, Michaël Darmon, Kada Klouche, Alexandre Lautrette, Jacques Levraut, Eric Maury, Mathieu Oberlin, Nicolas Terzi, Damien Viglino, Youri Yordanov, Pierre-Géraud Claret, Naiké Bigé
article
Annals of Intensive Care, SpringerOpen, 2019, 9 (1), pp.92. ⟨10.1186/s13613-019-0563-2⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02267030/file/2019%20Jung%20et%20al.%2C%20Diagnosis%20and.pdf BibTex
titre
Editorial: Viruses, Genetic Exchange, and the Tree of Life
auteur
Nikos Kyrpides, Simon Roux, Arshan Nasir, Gustavo Caetano-Anollés, Jean-Michel Claverie
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.02782⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02409728/file/fmicb-10-02782.pdf BibTex
titre
Abeilles Une histoire intime avec l’humanité.
auteur
David Biron, Jean-Marc Bonmatin, Dorothée Dussy, Lionel Garnery, Martin Giurfa, Delphine Julien, Martine Regert, Arnaud Zucker
article
Martine REGERT. .Le Cherche-Midi; CNRS, pp.159, 2019, 978-2-7491-6224-9
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titre
Cutting-Edge Evolution of Insects: Factors Governing Ecological Divergence of Natural Populations Assessed Using Molecular and Genetic Markers", A special issue of Insects (ISSN 2075-4450). https://www.mdpi.com/journal/insects/special_issues/cutting_edge#info
auteur
Hugh D Loxdale, Astrid T. Groot, David Biron
article
Insects, 10, 2019, Cutting-Edge Evolution of Insects: Factors Governing Ecological Divergence of Natural Populations Assessed Using Molecular and Genetic Markers
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titre
Viruses as key reservoirs of antibiotic resistance genes in the environment
auteur
Didier Debroas, Cléa Siguret
article
ISME Journal, Nature Publishing Group, 2019, 13 (11), pp.2856-2867. ⟨10.1038/s41396-019-0478-9⟩
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titre
Discovery of High Abundances of Aster-Like Nanoparticles in Pelagic Environments: Characterization and Dynamics
auteur
Jonathan Colombet, Hermine Billard, Bernard Viguès, Stephanie Balor, Christelle Boulé, Lucie Geay, Karim Benzerara, Nicolas Menguy, Guy Ilango, Maxime Fuster, François Enault, Corinne Bardot, Véronique Gautier, Angia Sriram Pradeep Ram, Télesphore Sime-Ngando
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.02376⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02317473/file/Colombet%20et%20al.%202019%20frontiers%20in%20microbiology.pdf BibTex
titre
Podocotyle atomon (Trematoda: Digenea) impacts reproductive behaviour, survival and physiology in Gammarus zaddachi (Amphipoda)
auteur
Katherine L. Arundell, Aurore Dubuffet, Nina Wedell, Jamie Bojko, Martin S. J. Rogers, Alison M. Dunn
article
Diseases of Aquatic Organisms, Inter Research, 2019, 136 (1), pp.51-62. ⟨10.3354/dao03416⟩
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https://hal.uca.fr/hal-02359158/file/Arundell%20et%20al.%20accepted.pdf BibTex
titre
Effect of Postextubation High-Flow Nasal Oxygen With Noninvasive Ventilation vs High-Flow Nasal Oxygen Alone on Reintubation Among Patients at High Risk of Extubation Failure
auteur
Arnaud Thille, Grégoire Muller, Arnaud Gacouin, Rémi Coudroy, Maxens Decavele, Romain Sonneville, Francois Beloncle, Christophe Girault, Laurence Dangers, Alexandre Lautrette, Séverin Cabasson, Anahita Rouzé, Emmanuel Vivier, Anthony Le Meur, Jean-Damien Ricard, Keyvan Razazi, Guillaume Barberet, Christine Lebert, Stephan Ehrmann, Caroline Sabatier, Jeremy Bourenne, Gael Pradel, Pierre Bailly, Nicolas Terzi, Jean Dellamonica, Guillaume Lacave, Pierre-Eric Danin, Hodanou Nanadoumgar, Aude Gibelin, Lassane Zanre, Nicolas Deye, Alexandre Demoule, Adel Maamar, Mai-Anh Nay, René Robert, Stéphanie Ragot, Jean-Pierre Frat
article
JAMA Cardiology, American Medical Association 2019, 322 (15), pp.1465. ⟨10.1001/jama.2019.14901⟩
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titre
Editorial: Host Manipulation by Parasites
auteur
Marta Sánchez, David Biron
article
Frontiers in Ecology and Evolution, Frontiers Media S.A, 2019, 7, ⟨10.3389/fevo.2019.00369⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03015541/file/Sanchez_et_al_BIRON_fevo-07-00369_Octobre_2019.pdf BibTex
titre
Distribution patterns of bacterial communities and their potential link to variable viral lysis in temperate freshwater reservoirs
auteur
Angia Sriram Pradeep Ram, Jitendra Keshri, Télesphore Sime-Ngando
article
Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, Springer Verlag, 2019, 81 (4), ⟨10.1007/s00027-019-0669-5⟩
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titre
Distribution patterns of bacterial communities and their potential link to variable viral lysis in temperate freshwater reservoirs
auteur
Angia Sriram Pradeep Ram, Jitendra Keshri, Télesphore Sime-Ngando
article
Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, Springer Verlag, 2019, 81 (4), ⟨10.1007/s00027-019-0669-5⟩
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titre
Akinetes and ancient DNA reveal toxic cyanobacterial recurrences and their potential for resurrection in a 6700-year-old core from a eutrophic lake
auteur
Benjamin Legrand, Yannick Miras, Aude Beauger, Matthieu Dussauze, Delphine Latour
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2019, 687, pp.1369-1380. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.07.100⟩
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titre
New HIV-1 circulating recombinant form 94: from phylogenetic detection of a large transmission cluster to prevention in the age of geosocial-networking apps in France, 2013 to 2017
auteur
Marc Wirden, Fabienne de Oliveira, Magali Bouvier-Alias, Sidonie Lambert-Niclot, Marie-Laure Chaix, Stéphanie Raymond, Ali Si-Mohammed, Chakib Alloui, Elisabeth André-Garnier, Pantxika Bellecave, Brice Malve, Audrey Mirand, Coralie Pallier, Jean-Dominique Poveda, Theresa Rabenja, Véronique Schneider, Anne Signori-Schmuck, Karl Stefic, Vincent Calvez, Diane Descamps, Jean-Christophe Plantier, Anne-Geneviève Marcelin, Benoit Visseaux
article
Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2019, 24 (39), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2019.24.39.1800658⟩
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titre
An uneasy alliance: a nesting association between aggressive ants and equally fierce social wasps
auteur
Pablo Servigne, Jérôme Orivel, Frédéric Azémar, James Carpenter, Alain Dejean, Bruno Corbara
article
Insect Science, Wiley, 2019, 27 (1), pp.122-132. ⟨10.1111/1744-7917.12597⟩
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titre
Prognostic and Long-term Survival of Immune Thrombotic Thrombocytopenic Purpura in older patients
auteur
Renaud Prevel, Claire Roubaud-Roubaud, Samuel Gourlain, Matthieu Jamme, Karine Pérès, Ygal Benhamou, Lionel Galicier, Elie Azoulay, Pascale Poullin, François Provôt, Eric Maury, Claire Presne, Mohamed Hamidou, Samir Saheb, Alain Wynckel, Aude Servais, Stéphane Girault, Yahsou Delmas, Valérie Châtelet, Jean-François Augusto, Christiane Mousson, Pierre Perez, Jean-Michel Halimi, Tarik Kanouni, Alexandre Lautrette, Anne Charvet Rumpler, Christophe Deligny, Dominique Chauveau, Agnès Veyradier, Paul Coppo
article
Blood, American Society of Hematology, 2019, pp.blood.2019000748. ⟨10.1182/blood.2019000748⟩
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titre
Assessment of the first commercial multiplex PCR kit (ParaGENIE Crypto-Micro Real-Time PCR) for the detection of Cryptosporidium spp., Enterocytozoon bieneusi, and Encephalitozoon intestinalis from fecal samples
auteur
Florent Morio, Philippe Poirier, Yohann Le Govic, Adrien Laude, Stephane Valot, Guillaume Desoubeaux, Nicolas Argy, Céline Nourrisson, Christelle Pomares, Marie Machouart, Frederic Dalle, Françoise Botterel, Nathalie Bourgeois, Estelle Cateau, Marion Leterrier, Jessica Beser, Rose-Anne Lavergne, Patrice Le Pape
article
Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, Elsevier, 2019, 95 (1), pp.34-37. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2019.04.004⟩
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BibTex
titre
Early Recognition of Persistent Acute Kidney Injury
auteur
Michael Darmon, Anne-Sophie Truche, Moustapha Abdel-Nabey, David Schnell, Bertrand Souweine
article
Seminars in Nephrology, WB Saunders, 2019, 39 (5), pp.431-441. ⟨10.1016/j.semnephrol.2019.06.003⟩
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BibTex
titre
Genomic ecology of Marine Group II, the most common marine planktonic Archaea across the surface ocean
auteur
Olivier Pereira, Corentin Hochart, Jean Christophe Auguet, Didier Debroas, Pierre Galand
article
MicrobiologyOpen, Wiley, 2019, 8 (9), pp.e00852. ⟨10.1002/mbo3.852⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02283229/file/Pereira%20MicrobiologyOpen%202019%20Genomic%20ecology%20of%20Marine%20Group%20II%2C%20the%20most%20common%20marine%20planktonic%20Archaea%20across%20the%20surface%20ocean%20%281%29.pdf BibTex
titre
“You helped me keep my head above water”—experience of bereavement research after loss of a loved one in the ICU: insights from the ARREVE study
auteur
A. Laurent, Jean Reignier, Amélie Le Gouge, Alice Cottereau, Melanie Adda, Djillali Annane, Juliette Audibert, François Barbier, Patrick Bardou, Simon Bourcier, Jeremy Bourenne, Alexandre Boyer, François Brenas, Vincent Das, Arnaud Desachy, Jérôme Devaquet, Marc Feissel, Frédérique Ganster, Maïté Garrouste-Orgeas, Guillaume Grillet, Olivier Guisset, Rebecca Hamidfar-Roy, Anne-Claire Hyacinthe, Sebastien Jochmans, Mercé Jourdain, Alexandre Lautrette, Nicolas Lerolle, Olivier Lesieur, Fabien Lion, Philippe Mateu, Bruno Mégarbane, Sybille Merceron, Emmanuelle Mercier, Jonathan Messika, Paul Morin-Longuet, Bénédicte Philippon-Jouve, Jean-Pierre Quenot, Anne Renault, Xavier Repessé, Jean-Philippe Rigaud, Ségolène Robin, Antoine Roquilly, Amélie Seguin, Didier Thevenin, Patrice Tirot, Isabelle Vinatier, Elie Azoulay, René Robert, Nancy Kentish-Barnes
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2019, 45 (9), pp.1252-1261. ⟨10.1007/s00134-019-05722-x⟩
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BibTex
titre
Genotyping Approach for Potential Common Source of Enterocytozoon bieneusi Infection in Hematology Unit
auteur
C. Nourisson, Philippe Poirrier, Guillaume Desoubeaux
article
Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2019, 25 (9), pp.1631-1631. ⟨10.3201/eid2509.ET2509⟩
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BibTex
titre
Distribution patterns of bacterial communities and their potential link to variable viral lysis in temperate freshwater reservoirs
auteur
Angia Sriram Pradeep Ram, Jitendra Keshri, Télesphore Sime-Ngando
article
Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, Springer Verlag, 2019, ⟨10.1007/s00027-019-0669-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03045527/file/Accepted-Version.pdf BibTex
titre
High food quality increases infection of Gammarus pulex (Crustacea: Amphipoda) by the acanthocephalan parasite Pomphorhynchus laevis.
auteur
Kevin Sanchez-Thirion, Michaël Danger, Alexandre Bec, Elise Billoir, Sophie Labaude, Thierry Rigaud, Jean-Nicolas Beisel, Vincent Felten
article
International Journal for Parasitology, Elsevier, 2019, 49 (10), pp.805-817. ⟨10.1016/j.ijpara.2019.05.005⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02281395/file/Sanchez-Thirion%20et%20al%20-%20Manuscript-R1TR.pdf BibTex
titre
Nurses' practices in the preparation and administration of intramuscular injections in mental health: A cross-sectional study
auteur
Guillaume Legrand, Candy Guiguet-Auclair, Hervé Viennet, Claire Aumeran, Dominique Reynaud, Laurence Baldrikian, Anne Debost-Legrand
article
Journal of Clinical Nursing, Wiley, 2019
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BibTex
titre
The Honeybee Gut Microbiota Is Altered after Chronic Exposure to Different Families of Insecticides and Infection by Nosema ceranae
auteur
Régis Rouzé, Anne Moné, Frédéric Delbac, Luc Belzunces, Nicolas Blot
article
Microbes and environments / JSME, Nakanishi Printing Co, 2019, 34 (3), pp.226-233. ⟨10.1264/jsme2.ME18169⟩
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titre
Draft Genome Sequence of Tubulinosema ratisbonensis , a Microsporidian Species Infecting the Model Organism Drosophila melanogaster
auteur
Valérie Polonais, Sebastian Niehus, Ivan Wawrzyniak, Adrien Franchet, Christine Gaspin, Abdel Belkorchia, Matthieu Reichstadt, Caroline Belser, Karine Labadie, Arnaud Couloux, Frédéric Delbac, Eric Peyretaillade, Dominique Ferrandon
article
Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2019, 8 (31), ⟨10.1128/MRA.00077-19⟩
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BibTex
titre
Genome analysis of Marinobacter phage AS1 suggests its close interactions with host Marinobacter sp.
auteur
S Aparna, A Parvathi, As Pradeep Ram, T. Sime-Ngando
article
Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, 2019, 83 (2), pp.119-129. ⟨10.3354/ame01912⟩
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titre
Assessment of the Effect of Light, HgCl2 and Organic Compound on Enterococcus faecalis and Escherichia coli Cells Survive in Aquatic Microcosm
auteur
Pierrette Ngo Bahebeck,, Claire Stephane Metsopkeng, Joelle Signe Mbiada, Chrétien Lontsi Djimeli, Antoine Tamsa Arfao, Paul Alain Nana, Olive Vivien Noah Ewoti, Luciane Marlyse Moungang, Geneviève Bricheux, Télesphore Sime-Ngando, Moïse Nola
article
International Journal of Microbiology and Biotechnology, Science Publishing Group, 2019
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BibTex
titre
Effect of an ICU Diary on Posttraumatic Stress Disorder Symptoms Among Patients Receiving Mechanical Ventilation
auteur
Maïté Garrouste-Orgeas, Cécile Flahault, Isabelle Vinatier, Jean-Philippe Rigaud, Nathalie Thieulot-Rolin, Emmanuelle Mercier, Antoine Rouget, Hubert Grand, Olivier Lesieur, Fabienne Tamion, Rebecca Hamidfar, Anne Renault, Erika Parmentier-Decrucq, Yannick Monseau, Laurent Argaud, Cédric Bretonnière, Alexandre Lautrette, Julio Badie, Eric Boulet, Bernard Floccard, Xavier Forceville, Eric Kipnis, Lilia Soufir, Sandrine Valade, Naïke Bige, Alain Gaffinel, Olfa Hamzaoui, Georges Simon, Marina Thirion, Lila Bouadma, Audrey Large, Jean-Paul Mira, Nora Amdjar-Badidi, Mercé Jourdain, Paul-Henri Jost, Virginie Maxime, François Santoli, Stephane Ruckly, Christel Vioulac, Marie Annick Leborgne, Lucie Bellalou, Léonor Fasse, Benoît Misset, Sébastien Bailly, Jean-François Timsit
article
JAMA Cardiology, American Medical Association 2019, 322 (3), pp.229. ⟨10.1001/jama.2019.9058⟩
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BibTex
titre
Patterning Holocene lake dynamics and detecting early Prehistoric human impacts: targets of an improved integration of multivariate ecological indicators thanks to the data mining approach.
auteur
Yannick Miras, Beauger Aude, Jerry Lonlac, Benjamin Legrand, Delphine Latour, Karen K. Serieyssol, Marlène Lavrieux, Paul M Ledger, Jean-Luc Peiry, Engelbert Mephu Nguifo
article
MEDPALYNO, The Mediterranean Palynological Societies Symposium, Jul 2019, Bordeaux, France
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BibTex
titre
Warming bends the threshold elemental ratio in a homeostatic consumer
auteur
Thomas Ruiz, Michael Danger, Apostolos-Manuel Koussoroplis, Jean-Pierre Aguer, Nicole Morel Desrosier, Alexandre Bec
article
11th Symposium of European Freshwater Sciences, Jun 2019, zagreb, Croatia
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BibTex
titre
Occurrence and ecological determinants of the contamination of floodplain wetlands with Klebsiella pneumoniae and pathogenic or antibiotic-resistant Escherichia coli
auteur
Charles Henriot, Daniel Martak, Quentin Cuenot, Christophe Loup, Hélène Masclaux, François Gillet, Xavier Bertrand, Didier Hocquet, Gudrun Bornette
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2019, 95 (8), ⟨10.1093/femsec/fiz097⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02315686/file/Henriot2019_FEMS.pdf BibTex
titre
Impact of bronchial colonization with Candida spp. on the risk of bacterial ventilator-associated pneumonia in the ICU: the FUNGIBACT prospective cohort study
auteur
Jean-François Timsit, Carole Schwebel, Lenka Styfalova, Muriel Cornet, Philippe Poirier, Christiane Forestier, Stephane Ruckly, Marie-Christine Jacob, Bertrand Souweine
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2019, 45 (6), pp.834-843. ⟨10.1007/s00134-019-05622-0⟩
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BibTex
titre
Novel haloarchaeal viruses from Lake Retba infecting Haloferax and Halorubrum species
auteur
Carolina Mizuno, Bina Prajapati, Soizick Lucas‐staat, Télesphore Sime-Ngando, Patrick Forterre, Dennis Bamford, David Prangishvili, Mart Krupovic, Hanna Oksanen
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, Environmental viruses and their role in shaping ecosystems, 21 (6), pp.2129-2147. ⟨10.1111/1462-2920.14604⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02362650/file/_system_appendPDF_proof_V5.pdf BibTex
titre
Environmental risk assessment of antibiotics in agroecosystems: ecotoxicological effects on aquatic microbial communities and dissemination of antimicrobial resistances and antibiotic biodegradation potential along the soil-water continuum
auteur
Fabrice Martin-Laurent, Edward Topp, Loren Billet, Isabelle Batisson, Cédric Malandain, Pascale Besse-Hoggan, Soizic Morin, Joan Artigas, Chloé Bonnineau, Laura Kergoat, Marion Devers-Lamrani, Stéphane Pesce
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2019, 26 (18), pp.18930-18937. ⟨10.1007/s11356-019-05122-0⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02195477/file/antibiotox_ESPR_2019.pdf BibTex
titre
A De Novo Robust Clustering Approach for Amplicon-Based Sequence Data
auteur
Alexandre Bazin, Didier Debroas, Engelbert Mephu Nguifo
article
Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2019, 26 (6), pp.618-624. ⟨10.1089/cmb.2018.0170⟩
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BibTex
titre
Multirecombinant Enterovirus A71 Subgenogroup C1 Isolates Associated with Neurologic Disease, France, 2016–2017
auteur
Stéphanie Tomba Ngangas, Alexander Lukashev, Gwendoline Jugie, Olga Ivanova, Jean-Michel Mansuy, Catherine Mengelle, Jacques Izopet, Anne-Sophie L’honneur, Flore Rozenberg, David Leyssene, Denise Hecquet, Stéphanie Marque-Juillet, David Boutolleau, Sonia Burrel, Hélène Peigue-Lafeuille, Christine Archimbaud, Kimberley Benschop, Cécile Henquell, Audrey Mirand, Jean-Luc Bailly
article
Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2019, 25 (6), pp.1204-1208. ⟨10.3201/eid2506.181460⟩
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titre
Do the agricultural have any impact on the mi crobial toxicity and biodegradation of the active substance?
auteur
Pascale Besse-Hoggan, M. Youness, C. Descarpentries, M. Sancelme, I. Batisson
article
14th International IUPAC Conference of Crop Protection, May 2019, Gand, Belgium
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A comment on “Variability in plant nutrients reduces insect herbivore performance”
auteur
Apostolos-Manuel Koussoroplis, Toni Klauschies, Sylvain Pincebourde, David Giron, Alexander Wacker
article
Rethinking Ecology, Pensoft, 2019, 4, pp.79-87. ⟨10.3897/rethinkingecology.4.32252⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02133384/file/ReEco_article_32252_en_1.pdf BibTex
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Impact of Leptospermone, a Natural β-Triketone Herbicide, on the Fungal Composition and Diversity of Two Arable Soils
auteur
Clarisse Mallet, Sana Romdhane, Camille Loiseau, Jérémie Béguet, Fabrice Martin-Laurent, Christophe Calvayrac, Lise Barthelmebs
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.01024⟩
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titre
Resistance to integrase inhibitors: a national study in HIV-1-infected treatment-naive and -experienced patients
auteur
Anne-Geneviève Marcelin, Maxime Grude, Charlotte Charpentier, Pantxika Bellecave, Laura Le Guen, Coralie Pallier, Stéphanie Raymond, Audrey Mirand, Laurence Bocket, Djeneba Bocar Fofana, Constance Delaugerre, Thuy Nguyen, Brigitte Montes, Helène Jeulin, Thomas Mourez, Samira Fafi-Kremer, Corinne Amiel, Catherine Roussel, Julia Dina, Mary-Anne Trabaud, Hélène Le Guillou-Guillemette, Sophie Vallet, Anne Signori-Schmuck, Anne Maillard, Virginie Ferré, Diane Descamps, Vincent Calvez, Philippe Flandre
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2019, 74 (5), pp.1368-1375. ⟨10.1093/jac/dkz021⟩
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titre
Glyphosate, but not its metabolite AMPA, alters the honeybee gut microbiota
auteur
Nicolas Blotid, Loïs Veillat, Régis Rouzé, Hélène Delatte
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02356123/file/journal.pone.0215466.pdf BibTex
titre
Interactive Impacts of Silver and Phosphorus on Autotrophic Biofilm Elemental and Biochemical Quality for a Macroinvertebrate Consumer
auteur
Clément Crenier, Kevin Sanchez-Thirion, Alexandre Bec, Vincent Felten, Jessica Ferriol, Aridane González, Joséphine Leflaive, Fanny Perrière, Loïc Ten-Hage, Michaël Danger
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00732⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02319303/file/fmicb-10-00732-1.pdf BibTex
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Temporal covariation of epibacterial community and surface metabolome in the Mediterranean seaweed holobiont Taonia atomaria
auteur
Benoît Paix, Ahlem Othmani, Didier Debroas, Gérald Culioli, Jean-François Briand
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (9), pp.3346-3363. ⟨10.1111/1462-2920.14617⟩
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titre
Immobilisation of bacteria onto magnetic nanoparticles for the decolorisation and degradation of azo dyes
auteur
Ayoub Nadi, Damien Boyer, Nicolas Charbonnel, Aicha Boukhriss, Christiane Forestier, Saïd Gmouh
article
IET Nanobiotechnology, Institution of Engineering and Technology (IET), 2019, 13 (2), pp.144-149. ⟨10.1049/iet-nbt.2018.5026⟩
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titre
Community‐Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems
auteur
Luigi Caputi, Quentin Carradec, Damien Eveillard, Amos Kirilovsky, Eric Pelletier, Juan J Pierella Karlusich, Fabio Rocha Jimenez Vieira, Emilie Villar, Samuel Chaffron, Shruti Malviya, Eleonora Scalco, Silvia Acinas, Adriana Alberti, Jean-Marc Aury, Anne-Sophie Benoiston, Alexis Bertrand, Tristan Biard, Lucie Bittner, Martine Boccara, Jennifer R. Brum, Christophe Brunet, Greta Busseni, Anna Carratalà, Hervé Claustre, Luis Pedro Coelho, Sébastien Colin, Salvatore d'Aniello, Corinne da Silva, Marianna del Core, Hugo Doré, Stéphane Gasparini, Florian Kokoszka, Jean-Louis Jamet, Christophe Lejeusne, Cyrille Lepoivre, Magali Lescot, Gipsi Lima-Mendez, Fabien Lombard, Julius Lukeš, Nicolas Maillet, Mohammed-Amin Madoui, Elodie Martinez, Maria Grazia Mazzocchi, Mario Néou, Javier Paz-Yepes, Julie Poulain, Simon Ramondenc, Jean-Baptiste Romagnan, Simon Roux, Daniela Salvagio Manta, Remo Sanges, Mario Sprovieri, Shinichi Sunagawa, Vincent Taillandier, Atsuko Tanaka, Leila Tirichine, Camille Trottier, Julia Uitz, Alaguraj Veluchamy, Jana Veselá, Flora Vincent, Sheree Yau, Stefanie Kandels-Lewis, Sarah Searson, Céline Dimier, Marc Picheral, Peer Bork, Emmanuel Boss, Colomban de Vargas, Michael Follows, Nigel Grimsley, Lionel Guidi, Pascal Hingamp, Eric Karsenti, Paolo Sordino, Lars Stemmann, Matthew B. Sullivan, Alessandro Tagliabue, Adriana Zingone, Laurence Garczarek, Fabrizio d'Ortenzio, Pierre Testor, Fabrice Not, Maurizio Ribera d'Alcalà, Patrick Wincker, Chris Bowler, Daniele Iudicone, Gabriel Gorsky, Olivier Jaillon, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Hiroyuki Ogata, Stéphane Pesant, Jeroen Raes, Emmanuel Reynaud, Christian Sardet, Mike Sieracki, Sabrina Speich, Didier Velayoudon
article
Global Biogeochemical Cycles, American Geophysical Union, 2019, 3 (33), pp.391-419. ⟨10.1029/2018GB006022⟩
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https://hal-univ-tln.archives-ouvertes.fr/hal-02074931/file/Caputi%20et_al.%202019%2C%20Global%20Biogeochemical%20Cycles.pdf BibTex
titre
High permissiveness for genetic exchanges between enteroviruses of species A, including enterovirus 71, favours evolution through intertypic recombination in Madagascar
auteur
Romain Volle, Richter Razafindratsimandresy, Marie-Line Joffret, Mael Bessaud, Sendraharimanana Rabemanantsoa, Seta Andriamamonjy, Jonhson Raharinantoanina, Bruno Blondel, Jean-Michel Heraud, Jean-Luc Bailly, Francis Delpeyroux
article
Journal of Virology, American Society for Microbiology, 2019, 93 (6), pp.e01667-18. ⟨10.1128/JVI.01667-18⟩
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titre
Thymus-specific serine protease, a protease that shapes the CD4 T cell repertoire
auteur
Sylvie Guerder, Chervin Hassel, Alice Carrier
article
Immunogenetics, Springer Verlag, 2019, 71 (3), pp.223-232. ⟨10.1007/s00251-018-1078-y⟩
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titre
Épidémiologie de l’insuffisance rénale aiguë
auteur
Julien Aniort, Anne-Elisabeth Heng, Patrice Deteix, Bertrand Souweine, Alexandre Lautrette
article
Néphrologie et Thérapeutique, Elsevier Masson, 2019, 15 (1), pp.63-69. ⟨10.1016/j.nephro.2018.11.002⟩
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titre
Less effect of wells physicochemical properties on the antimicrobial susceptibility Pseudomonas aeruginosa isolated in equatorial region of Central Africa
auteur
Jean Samuel Eheth, Chrétien Lontsi Djimeli, Paul Alain Nana, Antoine Tamsa Arfao, Olive Vivien Noah Ewoti, Luciane Marlyse Moungang, Geneviève Bricheux, Télesphore Sime-Ngando, Moïse Nola
article
Applied Water Science, 2019, 9 (2), ⟨10.1007/s13201-019-0909-9⟩
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titre
Meta-analysis of glyphosate contamination in surface waters and dissipation by biofilms
auteur
Louis Carles, Hélène Gardon, Laura Joseph, Josep Sanchís, Marinella Farre, Joan Artigas
article
Environment International, Elsevier, 2019, 124, pp.284-293. ⟨10.1016/j.envint.2018.12.064⟩
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Potential of cyanobacterial akinetes reviviscence through a 6700 years core in a eutrophic lake
auteur
Benjamin Legrand, Yannick Miras, Delphine Latour
article
ASLO 2019 Aquatic Sciences Meeting “PlanetWater Challenges and Successes”, Feb 2019, San Juan, Puerto Rico
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titre
Hygroregulation, a key ability for eusocial insects: Native Western European honeybees as a case study
auteur
Iris Eouzan, Lionel Garnery, M. Alice Pinto, Damien Delalande, Catia Neves, Francis Fabre, Jérôme Lesobre, Sylvie Houte, Andone Estonba, Iratxe Montes, Télesphore Sime-Ngando, David Biron
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2019, 14 (2), pp.e0200048. ⟨10.1371/journal.pone.0200048⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02263651/file/journal.pone.0200048.pdf BibTex
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Amperometric detection of the herbicide mesotrione based on competitive reactions at nitroreductase@layered double hydroxide bioelectrode
auteur
Slim Hidouech, Felipe Bruna, Isabelle Batisson, Pascale Besse-Hoggan, Vanessa Prevot, Christine Mousty
article
Journal of Electroanalytical Chemistry, Elsevier 2019, 835, pp.324-328. ⟨10.1016/j.jelechem.2019.01.054⟩
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titre
Comparison of sterol and fatty acid profiles of chytrids and their hosts reveals trophic upgrading of nutritionally inadequate phytoplankton by fungal parasites
auteur
Mélanie Gerphagnon, Ramsy Agha, Dominik Martin‐creuzburg, Alexandre Bec, Fanny Perriere, Cecilia Rad‐menéndez, Claire M.M. Gachon, Justyna Wolinska
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (3), pp.949-958. ⟨10.1111/1462-2920.14489⟩
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titre
Bacterial anti-adhesion activity based on the electrochemical properties of polymethacrylates bearing ferrocenyl pendant groups
auteur
Ronald Nguema Edzang, The Hy Duong, Jean-François Briand, Marlene Lejars, Jean-Manuel Raimundo, Christine Bressy, Hugues Brisset
article
Biofouling, Taylor & Francis, 2019, 34 (9), pp.1055-1063. ⟨10.1080/08927014.2018.1539165⟩
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titre
Volatolomics in Bacterial Ecotoxicology, A Novel Method for Detecting Signatures of Pesticide Exposure?
auteur
Kévin Hidalgo, Jérémy Ratel, Frédéric Mercier, Benedicte Gauriat, Philippe Bouchard, Erwan Engel
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 9
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titre
Rapid diagnostic tests relying on antigen detection from stool as an efficient point of care testing strategy for giardiasis and cryptosporidiosis? Evaluation of a new immunochromatographic duplex assay
auteur
Adeline Goudal, Adrien Laude, Stéphane Valot, Guillaume Desoubeaux, Nicolas Argy, Céline Nourrisson, Christelle Pomares, Marie Machouart, Yohann Le Govic, Frédéric Dalle, Françoise Botterel, Nathalie Bourgeois, Estelle Cateau, Marion Leterrier, Rose-Anne Lavergne, Jessica Beser, Patrice Le Pape, Florent Morio
article
Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, Elsevier, 2019, 93 (1), pp.33-36. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2018.07.012⟩
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titre
Assembly of nitroreductase and layered double hydroxides toward functional biohybrid materials
auteur
Felipe Bruna, Christine Mousty, Pascale Besse-Hoggan, Isabelle Batisson, Vanessa Prevot
article
Journal of Colloid and Interface Science, Elsevier, 2019, 533, pp.71-81. ⟨10.1016/j.jcis.2018.07.126⟩
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titre
Stimulation or inhibition: Leaf microbial decomposition in streams subjected to complex chemical contamination
auteur
Florent Rossi, Clarisse Mallet, Christophe Portelli, Florence Donnadieu, Frédérique Bonnemoy, Joan Artigas
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2019, 648, pp.1371-1383. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.08.197⟩
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titre
A Comparison of the Mortality Risk Associated With Ventilator-Acquired Bacterial Pneumonia and Nonventilator ICU-Acquired Bacterial Pneumonia
auteur
L. Bouadma, M. Darmon, E. Montmollin, L. Argaud, H. Kallel, M. Garrouste-Orgeas, L. Soufir, C. Schwebel, B. Souweine, D. Glodgran-Toledano, L. Papazian, J. F. Timsit, W. Ibn Saied, B. Mourvillier, Y. Cohen, S. Ruckly, J. Reignier, G. Marcotte, S. Siami
article
Crit Care Med, 2019, 47 (3), pp.345--352. ⟨10.1097/ccm.0000000000003553⟩
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titre
Hydrogenotrophic methanogens of the mammalian gut: Functionally similar, thermodynamically different—A modelling approach
auteur
Rafael Munoz Tamayo, Milka Popova, Maxence Tillier, Diego Morgavi, Jean-Pierre Morel, Gérard Fonty, Nicole Morel-Desrosiers
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2019, 14 (12), pp.e0226243. ⟨10.1371/journal.pone.0226243⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02473686/file/2010_Munoz-Tamayo_Methanogens.pdf BibTex
titre
Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG)
auteur
Simon Roux, Evelien M. Adriaenssens, Bas E. Dutilh, Eugene V. Koonin, Andrew M. Kropinski, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Rob Lavigne, J. Rodney Brister, Arvind Varsani, Clara Amid, Ramy K. Aziz, Seth R. Bordenstein, Peer Bork, Mya Breitbart, Guy R. Cochrane, Rebecca A. Daly, Christelle Desnues, Melissa B. Duhaime, Joanne B. Emerson, François Enault, Jed A. Fuhrman, Pascal Hingamp, Philip Hugenholtz, Bonnie L. Hurwitz, Natalia N. Ivanova, Jessica M. Labonté, Kyung-Bum Lee, Rex R. Malmstrom, Manuel Martinez-Garcia, Ilene Karsch Mizrachi, Hiroyuki Ogata, David Páez-Espino, Marie-Agnès Petit, Catherine Putonti, Thomas Rattei, Alejandro Reyes, Francisco Rodriguez-Valera, Karyna Rosario, Lynn Schriml, Frederik Schulz, Grieg F. Steward, Matthew B. Sullivan, Shinichi Sunagawa, Curtis A. Suttle, Ben Temperton, Susannah G. Tringe, Rebecca Vega Thurber, Nicole S. Webster, Katrine L. Whiteson, Steven W. Wilhelm, K. Eric Wommack, Tanja Woyke, Kelly C. Wrighton, Pelin Yilmaz, Takashi Yoshida, Mark J. Young, Natalya Yutin, Lisa Zeigler Allen, Nikos C. Kyrpides, Emiley A. Eloe-Fadrosh
article
Nature Biotechnology, Nature Publishing Group, 2019, 37 (1), pp.29-37. ⟨10.1038/nbt.4306⟩
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https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-01977322/file/nbt.4306.pdf BibTex
titre
Pneumonia in acute ischemic stroke patients requiring invasive ventilation: Impact on short and long-term outcomes
auteur
J. Bourenne, N. Brule, C. Bretonniere, C. Cheval, J. Carvelli, E. Coupez, M. Cour, L. Dopeux, A. S. Dumenil, C. Dupuis, J. M. Forel, C. Garret, S. Grange, A. Gros, A. Haouache, T. Hissem, V. H. T. Ha, S. Jochmans, J. B. Joffredo, H. Kallel, G. Lacave, A. Lautrette, V. Lemiale, M. Lermuzeaux, J. Lebut, M. Lugosi, E. Magalhaes, S. Merceron, B. Mourvillier, B. Misset, M. Neuville, L. Nicolet, J. Oziel, L. Papazian, B. Planquette, J. P. Quenot, A. Radjou, M. Simon, J. Reignier, B. Souweine, R. Smonig, G. Troche, M. Thuong, G. Thierry, D. Toledano, G. van der Meersch, M. Venot, O. Zambon, J. Fournier, C. Tournegros, S. Bagur, M. Adda, V. Vindrieux, S. Salle, P. Enguerrand, L. Ferrand, V. Gobert, S. Guessens, H. Merle, N. Kaddour, B. Berthe, S. Bekkhouche, K. Mellouk, M. Lebrazic, C. Ouisse, D. Maugars, C. Aparicio, I. Theodose, M. Nouacer, V. Deiler, M. Moussa, A. Mouaci, N. Viguier, F. Lamara, S. Letrou, S. Siami, Outcomerea Study Grp, E. Montmollin, S. Ruckly, C. Schwebel, F. Philippart, C. Adrie, E. Mariotte, G. Marcotte, Y. Cohen, B. Sztrymf, D. Silva, F. Bruneel, M. Gainnier, M. Garrouste-Orgeas, R. Sonneville, J. F. Timsit, E. Azoulay, J. R. Zahar, M. Darmon, C. Clec'H, C. Alberti, A. Francais, A. Vesin, S. Bailly, F. Lecorre, D. Nakache, A. Van-Nieuwenhuyze, R. Hernu, C. Agasse, B. Allaouchiche, O. Andremont, P. Andreu, L. Argaud, C. Ara-Somohano, F. Barbier, D. Boyer, J. P. Bedos, T. Baudry, J. Bedel, J. Bohe, L. Bouadma
article
Journal of Infection, WB Saunders, 2019, 79 (3), pp.220--227. ⟨10.1016/j.jinf.2019.06.012⟩
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titre
Growth of indigenous bacteria Vibrio alginolyticus and Dietzia sp. isolated from the east coast of Algeria in the presence of monoaromatic hydrocarbons
auteur
Nesrine Feknous, Zidane Branes, Isabelle Batisson, Christian Amblard
article
Environment Protection Engineering, Oficyna Wydawnicza Politechniki Wrocławskiej, 2019, 45 (3), ⟨10.5277/epe190309⟩
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https://hal.uca.fr/hal-03237366/file/BATISSON_2019_Environment%20Protection%20Engineering.pdf BibTex
titre
Immunomodulatory effects of Lactobacillus plantarum on inflammatory response induced by Klebsiella pneumoniae
auteur
Marjolaine Vareille-Delarbre, Sylvie Miquel, Sophie Garcin, Thomas Bertran, Damien Balestrino, Bertrand Evrard, Christiane Forestier
article
Infection and Immunity, American Society for Microbiology, 2019, 87 (11), ⟨10.1128/iai.00570-19⟩
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titre
Hepatitis C subtype distribution in chronically infected patients with mild liver fibrosis in France: the GEMHEP study
auteur
T. Semenova, B. Nemoz, V. Thibault, G. Lagathu, G. Duverlie, E. Brochot, P. Trimoulet, C. Payan, S. Vallet, C. Henquell, S. Chevaliez, M. Bouvier-Alias, S. Maylin, A-M. Roque-Afonso, L. Izquierdo, F. Lunel-Fabiani, P. Marcellin, P. Morand, V. Leroy, S. Larrat
article
Epidemiology and Infection, Cambridge University Press (CUP), 2019, 147, ⟨10.1017/S0950268819001225⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02359387/file/S0950268819001225a.pdf BibTex
titre
Dynamical effects of retention structures on the mitigation of lake eutrophication
auteur
A. Caen, D. Latour, Jean-Denis Mathias
article
Environmental Modelling and Software, Elsevier, 2019, 119, pp.309-326. ⟨10.1016/j.envsoft.2019.06.012⟩
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titre
Protective mechanisms of polyphenolic-enriched extract of plants against H2O2-induced oxidative stress in human retinal pigment epithelial cells.
auteur
H. Nezzar, S. Hermitte, P. Goupil, C. Richard, M. Sleiman, E. Peghaire, H. El Alaoui, Niyazi Acar, A. Kocer
article
Annual Meeting of the Association-for-Research-in-Vision-and-Ophthalmology (ARVO), Apr 2019, Vancouver, Canada. 60, ASSOC RESEARCH VISION OPHTHALMOLOGY INC, pp.Meeting Abstract: 5377, 2019
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titre
Diversity, spatial distribution and activity of fungi in freshwater ecosystems
auteur
Cécile Lepère, Isabelle Domaizon, Jean-François Humbert, Ludwig Jardillier, Mylène Hugoni, Didier Debroas
article
PeerJ, PeerJ, 2019, 7, pp.e6247. ⟨10.7717/peerj.6247⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02058841/file/peerj-6247.pdf BibTex
titre
Comparison of microbiological results obtained from per-wound bone biopsies versus transcutaneous bone biopsies in diabetic foot osteomyelitis: a prospective cohort study
auteur
Alice Couturier, Aurore Chabaud, Françoise Desbiez, Stéphane Descamps, Evelina Petrosyan, Paule Letertre-Gilbert, Natacha Mrozek, Magali Vidal, Igor Tauveron, Salwan Maqdasy, Olivier Lesens
article
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2019, 38 (7), pp.1287-1291. ⟨10.1007/s10096-019-03547-6⟩
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BibTex
titre
Biofilms in hospital effluents as a potential crossroads for carbapenemase-encoding strains
auteur
J. Ory, G. Bricheux, F. Robin, Anne Togola, C. Forestier, O. Traore
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2019, 657, pp.7-15. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.11.427⟩
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https://hal.uca.fr/hal-01948443/file/Post-print%20Ory%20STOTEN%202018.pdf BibTex
titre
Antibiotic resilience: a necessary concept to complement antibiotic resistance?
auteur
Gabriel Carvalho, Christiane Forestier, Jean-Denis Mathias
article
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2019, 286 (1916), ⟨10.1098/rspb.2019.2408⟩
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titre
Fosfomycin and Staphylococcus aureus: transcriptomic approach to assess effect on biofilm, and fate of unattached cells
auteur
Claire Marquès, Valérie Collin, Christine Franceschi, Nicolas Charbonnel, Sonia Chatellier, Christiane Forestier
article
Journal of Antibiotics, Nature Publishing Group: Open Access Hybrid Model Option B, In press, ⟨10.1038/s41429-019-0256-y⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02361980/file/Marques%202019.pdf BibTex
titre
Assessing extracellular enzymatic activities of biofilms on natural and standardized organic substrata immersed in a stream
auteur
M. Joly, Clarisse Mallet, J. Artigas
article
Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, In press, ⟨10.3354/ame01914⟩
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BibTex
titre
Volatolomics in bacterial ecotoxicology, A novel method for detecting signatures of pesticide exposure?
auteur
Kévin Hidalgo, Jérémy Ratel, Frederic Mercier, Benedicte Gauriat, Philippe Bouchard, Erwan Engel
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.03113⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02617857/file/2019_Front_Microbiol_1.pdf BibTex
titre
Reducing the ionizing radiation background does not significantly affect the evolution of Escherichia coli populations over 500 generations
auteur
Nathanael Lampe, Pierre Marin, Marianne Coulon, Pierre Micheau, Lydia Maigne, David Sarramia, Fabrice Piquemal, Sébastien Incerti, David Biron, Camille Ghio, Télesphore Sime-Ngando, Thomas Hindré, Vincent Breton
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.14891. ⟨10.1038/s41598-019-51519-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02337251/file/Lampe_et_al_BIRON_SREP_Ocotobre_2019.pdf BibTex
titre
Biotic and abiotic determinants of the formation of ant mosaics in primary Neotropical rainforests
auteur
Alain Dejean, Arthur Compin, Jacques Delabie, Frédéric Azemar, Bruno Corbara, Maurice Leponce
article
Ecological Entomology, Wiley, 2019, 44 (4), pp.560-570. ⟨10.1111/een.12735⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02338140/file/Ant%20mosaic%20Nouragues%20EcolEntomol.pdf BibTex
titre
Consommation et digestion des végétaux : Rôles des microbiotes et fonctions essentielles à la biodiversité
auteur
Gérard Fonty, Annick Bernalier-Donadile, Evelyne Forano, Pascale Mosoni
article
2019
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BibTex
titre
Comparison of sterol and fatty acid profiles of chytrids and their hosts reveals trophic upgrading of nutritionally inadequate phytoplankton by fungal parasites
auteur
Mélanie Gerphagnon, Ramsy Agha, Dominik Martin-Creuzburg, Alexandre Bec, Fanny Perrière, Cecilia Rad-Menéndez, Claire M.M. Gachon, Justyna Wolinska
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, In press
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BibTex
titre
A Pediococcus strain to rescue honeybees by decreasing Nosema ceranae-and pesticide-induced adverse effects
auteur
Elodie Peghaire, Anne Moné, Frédéric Delbac, Didier Debroas, Frédérique Chaucheyras-Durand, Hicham Alaoui
article
Pesticide Biochemistry and Physiology, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.pestbp.2019.11.006⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02359078/file/Peghaire%20et%20al_2019.pdf BibTex
titre
How does environmental inter-annual variability shape aquatic microbial communities? A 40-year annual record of sedimentary DNA from a boreal lake (Nylandssjön, Sweden)
auteur
Eric Capo, Johan Rydberg, Julie Tolu, Isabelle Domaizon, Didier Debroas, Richard Bindler, Christian Bigler
article
Frontiers in Ecology and Evolution, Frontiers Media S.A, 2019, 7, ⟨10.3389/fevo.2019.00245⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02618844/file/2019_Capo_Front_Ecol_Evol_1.pdf BibTex
titre
Tank Bromeliads : aquatic life at the heart of plants
auteur
Bruno Corbara, Camille Bonhomme, Jean-Francois Carrias, Régis Cereghino, Olivier Dézerald, Céline Leroy
article
ESpèces - Revue d’Histoire naturelle , Kyrnos publications, 2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02061029/file/Species.pdf BibTex
titre
Disagreement Between Clinicians and Score in Decision-Making Capacity of Critically Ill Patients
auteur
P. M. Bertrand, B. Pereira, M. Adda, J. F. Timsit, M. Wolff, G. Hilbert, D. Gruson, M. Garrouste-Orgeas, L. Argaud, J. M. Constantin, R. Chabanne, J. P. Quenot, J. Bohe, C. Guerin, L. Papazian, O. Jonquet, K. Klouche, Arnaud Delahaye, B. Riu, L. Zieleskiewicz, M. Darmon, E. Azoulay, B. Souweine, A. Lautrette
article
Crit Care Med, 2019, 47 (3), pp.337--344. ⟨10.1097/ccm.0000000000003550⟩
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titre
Evaluation of the efficacy of an interdialytic "ethanol 40% v/v - enoxaparin 1000 U/mL" lock solution to prevent tunnelled catheter infections in chronic hemodialysis patients: a multi-centre, randomized, single blind, parallel group study
auteur
D. Thibaudin, C. G. Vela, G. Vernin, H. Weclawiak, L. Bernard, A. E. Heng, B. Souweine, J. Aniort, A. Piraud, M. Adda, B. Perreira, M. Bouiller, J. Fourcade, A. Guerraoui, E. Kalbacher, T. Krumel, H. L. Moragues
article
BMC Nephrology, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.149. ⟨10.1186/s12882-019-1338-6⟩
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2018

titre
Optimisation du diagnostic des infections à entérovirus et étude de leur pouvoir pathogène
auteur
Jérémy Lafolie
article
Santé. Université Clermont Auvergne, 2018. Français. ⟨NNT : 2018CLFAS008⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03348936/file/2018CLFAS008_LAFOLIE.pdf BibTex
titre
Nicosulfuron Degradation by an Ascomycete Fungus Isolated From Submerged Alnus Leaf Litter
auteur
Louis Carles, Florent Rossi, Pascale Besse-Hoggan, Christelle Blavignac, Martin Leremboure, Joan Artigas, Isabelle Batisson
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, pp.3167. ⟨10.3389/fmicb.2018.03167⟩
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titre
Performances des trousses Panther/Fusion virus respiratoires (Hologic) chez les enfants de moins de 3 ans
auteur
Adeline Baron, Audrey Mirand, Astrid Vabret, Jean Plantier, Marie Gueudin
article
RICAI, Dec 2018, Paris, France
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https://hal-normandie-univ.archives-ouvertes.fr/hal-02270997/file/RICAI_poster%20Fusion%20vs%20ePlex%20nov%202018.pdf BibTex
titre
Facteurs génétiques, biogéographiques et temporels : quels effets sur la structuration du microbiote de la lignée évolutive M de l'abeille européenne Apis mellifera ?
auteur
Iris Eouzan
article
Ecologie, Environnement. Université Clermont Auvergne, 2018. Français. ⟨NNT : 2018CLFAC073⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02128660/file/2018CLFAC073_EOUZAN.pdf BibTex
titre
Leaf Litter decomposition in streams subjected to global change : the role of heterotrophic microbial communities
auteur
Florent Rossi
article
Ecology, environment. Université Clermont Auvergne, 2018. English. ⟨NNT : 2018CLFAC101⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02895270/file/2018CLFAC0101_ROSSI.pdf BibTex
titre
Mise en place d'un modèle animal d'infection par Blastocystis : répercussion sur la sensibilité colique, le comportement et le microbiote intestinal
auteur
Manon Defaye
article
Microbiologie et Parasitologie. Université Clermont Auvergne, 2018. Français. ⟨NNT : 2018CLFAS019⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02402188/file/2018CLFAS019_DEFAYE.pdf BibTex
titre
A De Novo Robust Clustering Approach for Amplicon-Based Sequence Data
auteur
Alexandre Bazin, Didier Debroas, Engelbert Mephu Nguifo
article
Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2018
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titre
Rediscovering Zygorhizidium affluens Canter: Molecular Taxonomy, Infectious Cycle, and Cryopreservation of a Chytrid Infecting the Bloom-Forming Diatom Asterionella formosa
auteur
Cecilia Rad-Menéndez, Mélanie Gerphagnon, Andrea Garvetto, Paola Arce, Yacine Badis, Télesphore Sime-Ngando, Claire Gachon, Karyn Johnson
article
Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2018, 84 (23)
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titre
How do environment-dependent switching rates between susceptible and persister cells affect the dynamics of biofilms faced with antibiotics?
auteur
Gabriel Carvalho, Damien Balestrino, Christiane Forestier, Jean-Denis Mathias
article
npj Biofilms and Microbiomes, [London?]: Springer Nature published in partnership with Nanyang Technological University, 2018, 4 (1), ⟨10.1038/s41522-018-0049-2⟩
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titre
There's no harm in having too much: A comprehensive toolbox of methods in trophic ecology
auteur
Nabil Majdi, Nicolas Hette-Tronquart, Etienne Auclair, Alexandre Bec, Tiphaine Chouvelon, Bruno Cognie, Michaël Danger, Priscilla Decottignies, Aurélie Dessier, Christian Desvilettes, Stanislas Dubois, Christine Dupuy, Clémentine Fritsch, Cédric Gaucherel, Mickael Hedde, Franck Jabot, Sébastien Lefebvre, Martin Marzloff, Benjamin Pey, Nathalie Peyrard, Thibaut Powolny, Regis Sabbadin, Elisa Thébault, Marie-Elodie Perga
article
Food Webs, Elsevier, 2018, 17, pp.e00100-. ⟨10.1016/j.fooweb.2018.e00100⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01926513/file/FOOWEB_100.pdf BibTex
titre
Single-cell genomics of multiple uncultured stramenopiles reveals underestimated functional diversity across oceans
auteur
Yoann Seeleuthner, Samuel Mondy, Vincent Lombard, Quentin Carradec, Eric Pelletier, Marc Wessner, Jade Leconte, Jean-François Mangot, Julie Poulain, Karine Labadie, Ramiro Logares, Shinichi Sunagawa, Véronique de Berardinis, Marcel Salanoubat, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Sarah Searson, Stéphane Pesant, Nicole Poulton, Ramunas Stepanauskas, Peer Bork, Chris Bowler, Pascal Hingamp, Matthew Sullivan, Daniele Iudicone, Ramon Massana, Jean-Marc Aury, Bernard Henrissat, Eric Karsenti, Olivier Jaillon, Mike Sieracki, Colomban de Vargas, Patrick Wincker, Silvia G. Acinas, Emmanuel Boss, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Nigel Grimsley, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Fabrice Not, Jeroen Raes, Emmanuel G. Reynaud, Christian Sardet, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Jean Weissenbach, Didier Velayoudon
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2018, 9, pp.310. ⟨10.1038/s41467-017-02235-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01771839/file/2018_%20Seeleuthner_Nature%20Communications_1.pdf BibTex
titre
Host–pathogen interactions and prognosis of critically ill immunocompetent patients with pneumococcal pneumonia: the nationwide prospective observational STREPTOGENE study
auteur
Jean-Pierre Bedos, Emmanuelle Varon, Raphaël Porcher, Pierre Asfar, Yves Le Tulzo, Bruno Mégarbane, Armelle Mathonnet, Anthony Dugard, Anne Veinstein, Kader Ouchenir, Shidasp Siami, Jean Reignier, Arnaud Galbois, Joel Cousson, Sébastien Préau, Olivier Baldési, Jean-Philippe Rigaud, Bertrand Souweine, Benoît Misset, Frederic Jacobs, Florent Dewavrin, Jean-Paul Mira
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (12), pp.2162-2173. ⟨10.1007/s00134-018-5444-x⟩
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titre
Histologically proven acute tubular necrosis in a series of 27 ICU patients
auteur
René Robert, Denis Frasca, Bertrand Souweine, Jean-François Augusto, Carole Philipponnet, Florent Joly, Jean-Michel Goujon, Nicolas Lerolle
article
Journal of Critical Care, WB Saunders, 2018, 48, pp.130-134. ⟨10.1016/j.jcrc.2018.08.029⟩
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titre
A microcalorimetric approach for investigating stoichiometric constraints on the standard metabolic rate of a small invertebrate
auteur
Thomas Ruiz, Alexandre Bec, Michael Danger, Apostolos-Manuel Koussoroplis, Jean-Pierre Aguer, Jean-Pierre Morel, Nicole Morel-Desrosiers
article
Ecology Letters, Wiley, 2018, 21 (11), pp.1714 - 1722. ⟨10.1111/ele.13137⟩
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titre
Evaluation of a new multiplex PCR assay (ParaGENIE G-Amoeba Real-Time PCR kit) targeting Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica and Entamoeba dispar/Entamoeba moshkovskii from stool specimens: evidence for the limited performances of microscopy-based approach for amoeba species identification
auteur
F. Morio, S. Valot, A. Laude, G. Desoubeaux, N. Argy, C. Nourrisson, C. Pomares, M. Machouart, Y. Le Govic, F. Dalle, F. Botterel, N. Bourgeois, E. Cateau, M. Leterrier, F. Jeddi, M. Gaboyard, P. Le Pape
article
Clinical Microbiology and Infection, Elsevier for the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2018, 24 (11), pp.1205-1209. ⟨10.1016/j.cmi.2018.02.007⟩
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titre
A European Multi Lake Survey dataset of environmental variables, phytoplankton pigments and cyanotoxins
auteur
Evanthia Mantzouki, James Campbell, Emiel van Loon, Petra Visser, Iosif Konstantinou, Antonio Antoniou, Grégory Giuliani, Daniel Machado-Vieira, Alinne Gurjão de Oliveira, Dubravka Špoljarić Maronić, Filip Stević, Tanja Žuna Pfeiffer, Itana Bokan Vucelić, Petar Žutinić, Marija Gligora Udovič, Anđelka Plenković-Moraj, Nikoletta Tsiarta, Luděk Bláha, Rodan Geriš, Markéta Fránková, Kirsten Seestern Christoffersen, Trine Perlt Warming, Tõnu Feldmann, Alo Laas, Kristel Panksep, Lea Tuvikene, Kersti Kangro, Kerstin Häggqvist, Pauliina Salmi, Lauri Arvola, Jutta Fastner, Dietmar Straile, Karl-Otto Rothhaupt, Jeremy Fonvielle, Hans Grossart, Christos Avagianos, Triantafyllos Kaloudis, Theodoros Triantis, Sevasti-Kiriaki Zervou, Ana Hiskia, Spyros Gkelis, Manthos Panou, Valerie Vale, Victor Perello, Ulrike Obertegger, Adriano Boscaini, Giovanna Flaim, Nico Salmaso, Leonardo Cerasino, Judita Koreivienė, Jūratė Karosienė, Jūratė Kasperovičienė, Ksenija Savadova, Irma Vitonytė, Sigrid Haande, Birger Skjelbred, Magdalena Grabowska, Maciej Karpowicz, Damian Chmura, Lidia Nawrocka, Justyna Kobos, Hanna Mazur-Marzec, Pablo Alcaraz-Párraga, Elżbieta Wilk-Woźniak, Wojciech Krztoń, Edward Walusiak, Ilona Gagala, Joan Mankiewicz-Boczek, Magdalena Toporowska, Barbara Pawlik-Skowronska, Michał Niedźwiecki, Wojciech Pęczuła, Agnieszka Napiórkowska-Krzebietke, Julita Dunalska, Justyna Sieńska, Daniel Szymański, Marek Kruk, Agnieszka Budzyńska, Ryszard Goldyn, Anna Kozak, Joan Rosińska, Elżbieta Szeląg-Wasielewska, Piotr Domek, Natalia Jakubowska-Krepska, Kinga Kwasizur, Beata Messyasz, Aleksandra Pełechata, Mariusz Pełechaty, Mikolaj Kokocinski, Beata Madrecka, Iwona Kostrzewska-Szlakowska, Magdalena Frąk, Agnieszka Bańkowska-Sobczak, Michał Wasilewicz, Agnieszka Ochocka, Agnieszka Pasztaleniec, Iwona Jasser, Ana Antão-Geraldes, Manel Leira, Armand Hernández, Vitor Vasconcelos, João Morais, Micaela Vale, Pedro Raposeiro, Vítor Gonçalves, Boris Aleksovski, Svetislav Krstić, Hana Nemova, Iveta Drastichova, Lucia Chomova, Spela Remec-Rekar, Tina Elersek, Jordi Delgado-Martín, David Garcia, Jose Luís Cereijo, Joan Gomà, Carmen Trapote, Teresa Vegas-Vilarrúbia, Biel Obrador, Ana García-Murcia, Monserrat Real, Elvira Romans, Jordi Noguero-Ribes, David Parreño Duque, Elísabeth Fernández-Morán, Bárbara Úbeda, José Ángel Gálvez, Rafael Marcé, Nuria Catalan, Carmen Pérez-Martínez, Eloísa Rodríguez, Carmen Cillero-Castro, Enrique Moreno-Ostos, José María Blanco, Valeriano Rodríguez, Jorge Juan Montes-Pérez, Roberto Palomino, Estela Rodríguez-Pérez, Rafael Carballeira, Antonio Camacho, Antonio Picazo, Carlos Rochera, Anna Santamans, Carmen Ferriol, Susana Romo, Juan Miguel Soria, Hans Hansson, Pablo Urrutia-Cordero, Arda Özen, Andrea Bravo, Moritz Buck, William Colom-Montero, Kristiina Mustonen, Don Pierson, Yang Yang, Jolanda M. H. Verspagen, Lisette de Senerpont Domis, Laura Seelen, Sven Teurlincx, Yvon Verstijnen, Miquel Lürling, Valentini Maliaka, Elisabeth Faassen, Delphine Latour, Cayelan Carey, Hans W. Paerl, Andrea Torokne, Tünay Karan, Nilsun Demir, Meryem Beklioğlu, Nur Filiz, Eti E. Levi, Uğur Iskin, Gizem Bezirci, Ülkü Nihan Tavşanoğlu, Kemal Çelik, Koray Özhan, Nusret Karakaya, Mehmet Koçer, Mete Yilmaz, Faruk Maraşlıoğlu, Özden Fakioglu, Elif Neyran Soylu, Meral Apaydın Yağcı, Şakir Çınar, Kadir Çapkın, Abdulkadir Yağcı, Mehmet Cesur, Fuat Bilgin, Cafer Bulut, Rahmi Uysal, Latife Köker, Reyhan Akçaalan, Meriç Albay, Mehmet Tahir Alp, Korhan Özkan, Tuğba Ongun Sevindik, Hatice Tunca, Burçin Önem, Jessica Richardson, Christine Edwards, Victoria Bergkemper, Sarah O'Leary, Eilish Beirne, Hannah Cromie, Bastiaan Ibelings
article
Scientific Data , Nature Publishing Group, 2018, 5, ⟨10.1038/sdata.2018.226⟩
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titre
Combining multi-variate palaeoecological indicators and mining closed gradual patterns for refining past lake dynamics and the induced ecological legacies
auteur
Yannick Miras, Beauger Aude, Jerry Lonlac, Benjamin Legrand, Delphine Latour, Karen K. Serieyssol, Marlène Lavrieux, Jean-Luc Peiry, Engelbert Mephu Nguifo
article
International Conference on Ecological Sciences, SFEcologie 2018, Oct 2018, Rennes, France
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titre
Investigating the long-term recurrence of nostocalean cyanobacteria through a 6 700 years core in a eutrophic Lake
auteur
Benjamin Legrand, Aude Beauger, Yannick Miras, Karen K. Serieyssol, Marlène Lavrieux, J. Lesobre, M Dussauze, Delphine Latour
article
International Conference on Ecological Sciences, Sfécologie 2018, Oct 2018, Rennes, France
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titre
Interactive Effects of Pesticides and Nutrients on Microbial Communities Responsible of Litter Decomposition in Streams
auteur
Florent Rossi, Stéphane Pesce, Clarisse Mallet, Christelle Margoum, Arnaud Chaumot, Matthieu Masson, Joan Artigas
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, pp.13. ⟨10.3389/fmicb.2018.02437⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01906322/file/fmicb-09-02437.pdf BibTex
titre
Human intestinal parasites in Mahajanga, Madagascar: The kingdom of the protozoa
auteur
Valentin Greigert, Ahmed Abou-Bacar, Julie Brunet, Céline Nourrisson, Alexander Pfaff, Leila Benarbia, Bruno Pereira, Milijaona Randrianarivelojosia, Jean-Louis Razafindrakoto, Rivo Rakotomalala, Eugène Morel, Ermanno Candolfi, Philippe Poirier
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (10), pp.e0204576. ⟨10.1371/journal.pone.0204576⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02150619/file/2018_Mada.pdf BibTex
titre
Should we expand the indications for the DAIR (debridement, antibiotic therapy, and implant retention) procedure for Staphylococcus aureus prosthetic joint infections? A multicenter retrospective study
auteur
O. Lesens, T. Ferry, E. Forestier, E. Botelho-Nevers, P. Pavese, E. Piet, B. Pereira, E. Montbarbon, B. Boyer, S. Lustig, S. Descamps
article
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2018, 37 (10), pp.1949-1956. ⟨10.1007/s10096-018-3330-7⟩
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titre
Prenatal therapy with pyrimethamine + sulfadiazine vs spiramycin to reduce placental transmission of toxoplasmosis: a multicenter, randomized trial
auteur
Laurent Mandelbrot, Francois Kieffer, Rémi Sitta, Hélène Laurichesse-Delmas, Norbert Winer, Louis Mesnard, Alain Berrebi, Gwenaelle Le Bouar, Jean-Paul Bory, Anne-Gaëlle Cordier, Yves Ville, Franck Perrotin, Jean-Marie Jouannic, Florence Biquard, Claude D’ercole, Véronique Houfflin-Debarge, Isabelle Villena, Rodolphe Thiebaut, Denis Pons, C. Nourrisson, Rose-Anne Lavergne, Judith Fillaux, Corinne Assouline, Florence Robert-Gangneux, Coralie L’ollivier, Florence Bretelle, Béatrice Guidicelli, Patricia Garcia, Alexandra Benachi, Christelle Vauloup-Fellous, Emmanuelle Letamendia, Marie-Elisabeth Bougnoux, Nathalie van Langendonck, Jérôme Potin, Pierre Marty, Christelle Pomares, Cynthia Trastour, Anne Sophie Deleplancque, Jean-Marc Costa, Marie-Thérèse Chève, Yves Col, Bernard Cimon, Y. Sterkers, Laurence Lachaud, Gilles Burlet, Martine Maréchaud, Estelle Perraud, Anne-Gaelle Grébille, Morgane Valentin, Sandrine Houzé, Sophie Omnès, Yvon Chitrit, Christine Boissinot, Hélène Yera, Olivia Anselem, Vassilis Tsatsaris, Marie-Victoire Senat, Florent Fuchs, Adela Angoulvant, Charles Muszynski, Anne Totet, Catherine Noël, Laurent Bidat, Tiphaine Barjat, Pierre Flori, Hervé Pelloux, Pierre Brenier-Pinchart, Catherine Thong-Vanh, Corinne Floch, Lionel Carbillon, Eric Lachassine, Aude Ricbourg, Luc Paris, Marc Dommergues, Thierry Rousseau, Frédéric Dalle, Marie Laure Darde, Véronique Aubard, Camille Olivier, Eric Verspyk, Loïc Favennec
article
American Journal of Obstetrics and Gynecology, Elsevier, 2018, 219 (4), pp.386.e1-386.e9. ⟨10.1016/j.ajog.2018.05.031⟩
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BibTex
titre
A New Freshwater Cyanosiphovirus Harboring Integrase
auteur
Kevin Zhong, Kevin Xu Zhong, Curtis Suttle, Anne-Claire Baudoux, Evelyne Derelle, Jonathan Colombet, Anna Cho, Jessica Caleta, Christophe Six, Stéphan Jacquet
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.02204⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02916338/file/Zhong_FiM_2018.pdf BibTex
titre
On Evidential Clustering with Partial Supervision
auteur
Nicolas Labroche, Antoine Violaine, Kevin Gravouil
article
BELIEF 2018, Sep 2018, Compiègne, France. pp.14-21, ⟨10.1007/978-3-319-99383-6_3⟩
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BibTex
titre
New insights into the pelagic microorganisms involved in the methane cycle in the meromictic Lake Pavin through metagenomics
auteur
Corinne Biderre-Petit, Najwa Taib, Hélène Gardon, Corentin Hochart, Didier Debroas
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2018, ⟨10.1093/femsec/fiy183⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01984730/file/Biderre-Petit%202018%20FEMS.pdf BibTex
titre
Rumen methanogens exhibit specific energetic and growth dynamics: a modelling approach
auteur
Rafael Munoz Tamayo, Milka Popova, Diego Morgavi, Dominique Graviou, Jean Pierre Morel, Gérard Fonty, Nicole Morel-Desrosiers
article
10. International Symposium on the Nutrition of Herbivores (ISNH10), Sep 2018, Clermont-Ferrand, France. Cambridge University Press, Advances in Animal Biosciences, 9 (3), 2018, 10th. International Symposium on the Nutrition of Herbivores (ISNH10)
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BibTex
titre
Human cryptosporidiosis in immunodeficient patients in France (2015–2017)
auteur
Damien Costa, Romy Razakandrainibe, Marc Sautour, Stéphane Valot, Louise Basmaciyan, Gilles Gargala, Loïc Favennec, Frédéric Dalle, Anne Debourgogne, Adela Angoulvant, Patrice Agnamey, Julie Bonhomme, Brigitte Degeilh, Cathy Chemla, Cécile Garnaud, Coralie Lollivier, Cécile Angebault, Pascal Delaunay, Guillaume Desoubeaux, Emilie Frealle, Frédéric Grenouillet, Florent Morio, Françoise Botterel, Ghania Belkadi, Hélène Yera, Gilles Nevez, Xavier Iriart, Isabelle Accoceberry, Julie Brunet, Marc Thellier, Denis Lemeteil, Meja Rabodonirina, Milène Sasso, Charline Miossec, Murielle Nicolas, Nicole Desbois, Philippe Poirier, Christelle Pomares, Sandrine Houzé, Yohann Le Govic, Anne Pauline Bellanger, Franck Labbe, Marie Laure Dardé, Olivier Duquesnoy, Pierre Flori, Patrick Bastien, Thomas Gueudet, Isabelle Villena, Dominique Aubert, Estelle Cateau, Marie-Elisabeth Bougnoux, Nathalie Kapel, Eric Dannaoui, Alexis Valentin, Anne Totet, Jean Menotti, Denis Blanchet, Magalie Demar, Emmanuel Dutoit, Renaud Piarroux, Emilie Sitterlé, Denis Magne, Samsa Hamane, Antoine Berry, Cecile Ramade
article
Experimental Parasitology, Elsevier, 2018, 192, pp.108-112. ⟨10.1016/j.exppara.2018.08.001⟩
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BibTex
titre
One fungus, several microbes
auteur
C. Imbert, C. Hennequin, A. Coste
article
Journal of Medical Mycology / Journal de Mycologie Médicale, Elsevier Masson, 2018, 28 (3), pp.413. ⟨10.1016/j.mycmed.2018.08.001⟩
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BibTex
titre
In-vitro and in-vivo antileishmanial activity of inexpensive Amphotericin B formulations: Heated Amphotericin B and Amphotericin B-loaded microemulsion
auteur
Andreza Rochelle, Vale Morais, André Silva, Andreza Rochelle Do Vale Morais, André Leandro Silva, Sandrine Cojean, Kaluvu Balaraman, Christian Bories, Sébastien Pomel, Gillian Barratt, Eryvaldo Sócrates Tabosa Do Egito, Philippe Loiseau
article
Experimental Parasitology, Elsevier, 2018, 192, pp.85-92. ⟨10.1016/j.exppara.2018.07.017⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02370461/file/Do%20Vale%20Morais%20et%20al%20Experimental%20Parasitology.pdf BibTex
titre
Carbonate Facilitated Mobilization of Uranium from Lacustrine Sediments under Anoxic Conditions
auteur
Marina Seder-Colomina, Arnaud Mangeret, Lucie Stetten, Pauline Merrot, Olivier Diez, Anthony Julien, Evelyne Barker, Antoine Thouvenot, John Bargar, Charlotte Cazala, Guillaume Morin
article
Environmental Science and Technology, American Chemical Society, 2018, 52 (17), pp.9615-9624. ⟨10.1021/acs.est.8b01255⟩
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BibTex
titre
1,2,3-Triazolium-Based Cationic Amphipathic Peptoid Oligomers Mimicking Antimicrobial Helical Peptides
auteur
Radhe Shyam, Nicolas Charbonnel, Aurélie Job, Christelle Blavignac, Christiane Forestier, Claude Taillefumier, Sophie Faure
article
ChemMedChem, Wiley-VCH Verlag, 2018, 13 (15), pp.1513 - 1516. ⟨10.1002/cmdc.201800273⟩
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BibTex
titre
Emerging resistance mutations in PI-naive patients failing an atazanavir-based regimen (ANRS multicentre observational study)
auteur
L Lambert-Niclot, C Grude, L. Chaix, L Charpentier, C Reigadas, L Le Guillou-Guillemette, C Rodallec, Pascale Maillard, C Dufayard, C Mourez, C Mirand, L Guinard, S Montes, L Vallet, Marc Marcelin, L Descamps, C Flandre, L Delaugerre, Chakib Alloui, Diane Descamps, Charlotte Charpentier, Benoit Visseaux, Anne Krivine, Ali Bouviers-Alias, Coralie Pallier, Cathia Soulié, Marc Wirden, Anne Marcelin, Vincent Calvez, Laurence Morand, Sidonie Lambert-Niclot, Djeneba Fofana, Nadia Mahjoub, Constance Delaugerre, Marie Chaix, Corinne Amiel, Veronique Schneider, Catherine Roussel, Hélène Le Guillou-Guillemette, Laurence Courdavault, Sandrine Reigadas, Patricia Recordon-Pinson, Hervé Fleury, Sophie Vallet, Julia Dina, Astrid Vabret, Audrey Mirand, Cécile Henquell, Christelle Auvray, Alexis de Rougemont, Helene Giraudon, Ali Si-Mohammed, Dominique Mathez, Anne Signori-Schmuck, Patrice Morand, Laurence Bocket, Anne Trabaud, Brigitte Montes, Laura Le Guen, Audrey Rodallec, Virginie Ferré, Hélène Jeulin, Evelyne Schvoerer, Jacqueline Dufayard, Annick Allardet-Servent, Marie Carles, Jérôme Guinard, Aurélie Guigon, Genevieve Giraudeau, Agnès Beby-Defaux, Anne Maillard, Jean Christophe Plantier, Marie Leoz, Thomas Mourez, Thomas Bourlet, Samira Fafi-Kremer, Julie Chiabrando, Stéphanie Raymond, Jacques Izopet, Francis Barin, Stéphanie Marque-Juillet, Sabine Yerly
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2018, 73 (8), pp.2147 - 2151. ⟨10.1093/jac/dky142⟩
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titre
Taxonomical Resolution and Distribution of Bacterioplankton Along the Vertical Gradient Reveals Pronounced Spatiotemporal Patterns in Contrasted Temperate Freshwater Lakes
auteur
J. Keshri, A. Pradeep Ram, P. Nana, T. Sime-Ngando
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2018, 76 (2), pp.372-386. ⟨10.1007/s00248-018-1143-y⟩
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titre
Diversity of DHA-1-encoding plasmids in Klebsiella pneumoniae isolates from 16 French hospitals
auteur
Claire Hennequin, Alexandre Chlilek, Racha Beyrouthy, Richard Bonnet, Frédéric Robin
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2018, 73 (11), pp.2981-2989. ⟨10.1093/jac/dky285⟩
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titre
Hordes of Phages in the Gut of the Tilapia Sarotherodon melanotheron
auteur
Yvan Bettarel, Marine Combe, Antoinette Adingra, Awa Ndiaye, Thierry Bouvier, Jacques Panfili, Jean-Dominique Durand
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-29643-9⟩
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Biodiversity and phylogeny of arid-adapted darkling beetle in the subfamily Pimeliinae (Coleoptera: Tenebrionidae)
auteur
P. Bouchard, A.D. Smith, K. Kanda, Monique Kaminski, G. Flores, Gael Kergoat, F.L. Condamine, R. Aalbu, A. Lamb, L. Purchart
article
Canadian Society for Ecology & Evolution Meeting 2018. CSEE 2018, Jul 2018, Guelph, Canada
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Error-prone protein synthesis in parasites with the smallest eukaryotic genome
auteur
Sergey Melnikov, Keith Rivera, Denis Ostapenko, Arthur Makarenko, Neil Sanscrainte, James Becnel, Mark Solomon, Catherine Texier, Darryl Pappin, Dieter Söll
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2018, 115 (27), pp.E6245 - E6253. ⟨10.1073/pnas.1803208115⟩
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Abundance and observations of thermophilic microbial and viral communities in submarine and terrestrial hot fluid systems of the French Southern and Antarctic Lands
auteur
Kaarle Parikka, Stéphan Jacquet, Jonathan Colombet, Damien Guillaume, Marc Le Romancer
article
Polar Biology, Springer Verlag, 2018, 41 (7), pp.1335 - 1352. ⟨10.1007/s00300-018-2288-3⟩
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Biodegradation and toxicity of a maize herbicide mixture: mesotrione, nicosulfuron and S-metolachlor
auteur
Louis Carles, Muriel Joly, Frédérique Bonnemoy, Martin Leremboure, Florence Donnadieu, Isabelle Batisson, Pascale Besse-Hoggan
article
Journal of Hazardous Materials, Elsevier, 2018, 354, pp.42 - 53. ⟨10.1016/j.jhazmat.2018.04.045⟩
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Genetic diversity analysis of Blastocystis subtypes from both symptomatic and asymptomatic subjects using a barcoding region from the 18S rRNA gene
auteur
Tahereh Rezaei Riabi, Hamed Mirjalali, Ali Haghighi, Mohammad Rostami Nejad, Mohammad Pourhoseingholi, Philippe Poirier, Frédéric Delbac, Ivan Wawrzyniak, Mohammad Zali
article
Infection, Genetics and Evolution, Elsevier, 2018, 61, pp.119-126
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Plasmids carrying DHA-1 β-lactamases
auteur
Claire Hennequin, Viviane Ravet, Frédéric Robin
article
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2018, 37 (7), pp.1197 - 1209. ⟨10.1007/s10096-018-3231-9⟩
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Editorial
auteur
A. Coste, C. Imbert, C. Hennequin
article
Journal of Medical Mycology / Journal de Mycologie Médicale, Elsevier Masson, 2018, 28 (2), pp.235. ⟨10.1016/j.mycmed.2018.06.001⟩
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A state of the art review on optimal practices to prevent, recognize, and manage complications associated with intravascular devices in the critically ill
auteur
Jean-Francois Timsit, Mark Rupp, Emilio Bouza, Vineet Chopra, Tarja Kärpänen, Kevin Laupland, Thiago Lisboa, Leonard Mermel, Olivier Mimoz, Jean-Jacques Parienti, Garyphalia Poulakou, Bertrand Souweine, Walter Zingg
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (6), pp.742-759. ⟨10.1007/s00134-018-5212-y⟩
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titre
Cost-effectiveness analysis of chlorhexidine-alcohol versus povidone iodine-alcohol solution in the prevention of intravascular-catheter-related bloodstream infections in France
auteur
Christian Farinetto, Franck Maunoury, Stephane Ruckly, Jeremy Guenezan, Jean-Christophe Lucet, Alain Lepape, Julien Pascal, Bertrand Souweine, Olivier Mimoz, Jean-François Timsit, Iratxe Puebla
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (5), ⟨10.1371/journal.pone.0197747⟩
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ASaiM: a Galaxy-based framework to analyze microbiota data
auteur
Bérénice Batut, Kevin Gravouil, Clemence Defois, Saskia Hiltemann, Jean-François Brugère, Eric Peyretaillade, Pierre Peyret
article
GigaScience, BioMed Central, 2018, 7 (6)
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titre
ASaiM: a Galaxy-based framework to analyze microbiota data
auteur
Bérénice Batut, Kevin Gravouil, Clemence Defois, Saskia Hiltemann, Jean-François Brugère, Eric Peyretaillade, Pierre Peyret
article
GigaScience, BioMed Central, 2018, 7 (6), pp.1-7. ⟨10.1093/gigascience/giy057⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01990448/file/2018_BATUT_GigaScience_1.pdf BibTex
titre
Bioinformatics Meets Virology: The European Virus Bioinformatics Center’s Second Annual Meeting
auteur
Bashar Ibrahim, Ksenia Arkhipova, Arno Andeweg, Susana Posada-Céspedes, François Enault, Arthur Gruber, Eugene Koonin, Anne Kupczok, Philippe Lemey, Alice Mchardy, Dino Mcmahon, Brett Pickett, David Robertson, Richard Scheuermann, Alexandra Zhernakova, Mark Zwart, Alexander Schönhuth, Bas Dutilh, Manja Marz
article
Viruses, MDPI, 2018, 10 (5), pp.256. ⟨10.3390/v10050256⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01964743/file/viruses-10-00256.pdf BibTex
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RSV-hRV co-infection is a risk factor for recurrent bronchial obstruction and early sensitization 3 years after bronchiolitis
auteur
Flore Amat, Chloé Plantard, Aurelien Mulliez, Isabelle Petit, Emmanuelle Rochette, Matthieu Verdan, Cécile Henquell, Guillaume Labbé, Marie Christine Heraud, Bertrand Evrard, André Labbé
article
Journal of Medical Virology, Wiley-Blackwell, 2018, 90 (5), pp.867-872. ⟨10.1002/jmv.25037⟩
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Infection-related ventilator-associated complications in ICU patients colonised with extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae
auteur
François Barbier, Sébastien Bailly, Carole Schwebel, Laurent Papazian, Élie Azoulay, Hatem Kallel, Shidasp Siami, Laurent Argaud, Guillaume Marcotte, Beno\ⁱt Misset, Jean Reignier, Michaël Darmon, Jean-Ralph Zahar, Dany Goldgran-Toledano, Étienne Montmollin, Bertrand Souweine, Bruno Mourvillier, Jean-François Timsit
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (5), pp.616-626. ⟨10.1007/s00134-018-5154-4⟩
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titre
Infection-related ventilator-associated complications in ICU patients colonised with extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae
auteur
François Barbier, Sébastien Bailly, Carole Schwebel, Laurent Papazian, Élie Azoulay, Hatem Kallel, Shidasp Siami, Laurent Argaud, Guillaume Marcotte, Benoît Misset, Jean Reignier, Michaël Darmon, Jean Zahar, Dany Goldgran-Toledano, Etienne de Montmollin, Bertrand Souweine, Bruno Mourvillier, François Timsit
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (5), pp.616-626
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ASSESSMENT OF THE ADSORPTION OF AEROMONAS HYDROPHILA ON POLYTHENE IN SODIUM HYPOCHLORITE AND HYDROGEN PEROXIDE TREATED WATER
auteur
Chrétien Djimeli, Antoine Arfao, O. V. Noah Ewoti, Vivien Rossi, Ernest Lango-Yaya, Vincent Raspal, Moïse Nola, T Sime-Ngando
article
Journal of Water and Environmental Sciences, 2018
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titre
Rumen methanogens display species-specific energetic and growth dynamics: a thermodynamic and kinetic based modelling approach
auteur
Rafael Munoz Tamayo, Milka Popova, Diego Morgavi, Dominique Graviou, Jean-Pierre Morel, Gerard Fonty, Nicole Morel-Desrosiers
article
Journées d'Animation Scientifique du département PHASE, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Apr 2018, Rennes, France
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titre
Phenotypic analysis of HIV-1 E157Q integrase polymorphism and impact on virological outcome in patients initiating an integrase inhibitor-based regimen
auteur
Charlotte Charpentier, Isabelle Malet, Elisabeth André-Garnier, Alexandre Storto, Laurence Bocket, Corinne Amiel, Laurence Morand-Joubert, Camille Tumiotto, Thuy Nguyen, Anne Maillard, Audrey Rodallec, Marie Leoz, Brigitte Montes, Véronique Schneider, Jean-Christophe Plantier, Julia Dina, Coralie Pallier, Audrey Mirand, Catherine Roussel, Anne Signori-Schmuck, Stéphanie Raymond, Vincent Calvez, Constance Delaugerre, Anne Marcelin, Diane Descamps
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2018, 73 (4), pp.1039-1044. ⟨10.1093/jac/dkx511⟩
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Taxonomy of prokaryotic viruses: 2017 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee
auteur
Evelien M. Adriaenssens, Johannes Wittmann, Jens Kuhn, Dann Turner, Matthew Sullivan, Bas Dutilh, Ho Bin Jang, Leonardo van Zyl, Jochen Klumpp, Malgorzata Lobocka, Andrea Moreno Switt, Janis Rumnieks, Rob Edwards, Jumpei Uchiyama, Poliane Alfenas-Zerbini, Nicola Petty, Andrew Kropinski, Jakub Barylski, Annika Gillis, Martha Clokie, David Prangishvili, Rob Lavigne, Ramy Karam Aziz, Siobain Duffy, Mart Krupovic, Minna Poranen, Petar Knezevic, Francois Enault, Yigang Tong, Hanna Oksanen, J. Rodney Brister
article
Archives of Virology, Springer Verlag, 2018, 163 (4), pp.1125-1129. ⟨10.1007/s00705-018-3723-z⟩
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Population Structure of Candida parapsilosis: No Genetic Difference Between French and Uruguayan Isolates Using Microsatellite Length Polymorphism
auteur
Marie Desnos-Ollivier, Victoria Bórmida, Philippe Poirier, Céline Nourrisson, Dinorah Pan, Stéphane Bretagne, Andrès Puime, Françoise Dromer
article
Mycopathologia, Springer Verlag, 2018, 183 (2), pp.381 - 390. ⟨10.1007/s11046-017-0224-7⟩
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titre
Corallivory and the microbial debacle in two branching scleractinians
auteur
Yvan Bettarel, Sebastien Halary, Jean-Christophe Auguet, Thanh Chi Mai, Ngoc Van Bui, Thierry Bouvier, Patrice Got, Corinne Bouvier, Sonia Monteil-Bouchard, Christelle Desnues
article
ISME Journal, Nature Publishing Group, 2018, 12 (4), pp.1109--1126. ⟨10.1038/s41396-017-0033-5⟩
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titre
Recommendations for enterovirus diagnostics and characterisation within and beyond Europe
auteur
Heli Harvala, Eeva Broberg, Kimberley Benschop, Natasa Berginc, Shamez Ladhani, Petri Susi, Claus Christiansen, James Mckenna, David Allen, Phoebe Makiello, Georgina Mcallister, Mirabelli Carmen, Katherina Zakikhany, Robert Dyrdak, Xiaohui Nielsen, Tina Madsen, Joel Paul, Catherine Moore, Karin von Eije, Antonio Piralla, Mieke Carlier, Laura Vanoverschelde, Randy Poelman, Andrés Anton, F. Xavier López-Labrador, Laura Pellegrinelli, Kathrin Keeren, Melanie Maier, Hayley Cassidy, Stavros Derdas, Carita Savolainen-Kopra, Sabine Diedrich, Svein Nordbø, Javier Buesa, Jean-Luc Bailly, Fausto Baldanti, Andrew Macadam, Audrey Mirand, Susanne Dudman, Isabelle Schuffenecker, Seilesh Kadambari, Johan Neyts, Michael Griffiths, Jan Richter, Cristina Margaretto, Sheila Govind, Ursula Morley, Ortwin Adams, Sidsel Krokstad, Jonathan Dean, Margarita Pons-Salort, Birgit Prochazka, Maria Cabrerizo, Manasi Majumdar, Gaia Nebbia, Maryse Wiewel, Simon Cottrell, Peter Coyle, Javier Martin, Catrin Moore, Sofie Midgley, Peter Horby, Katja Wolthers, Peter Simmonds, Hubert Niesters, Thea Fischer
article
Journal of Clinical Virology, Elsevier, 2018, 101, pp.11-17
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titre
Additive effect of calcium depletion and low resource quality on Gammarus fossarum (Crustacea, Amphipoda) life history traits
auteur
Marc Rollin, Romain Coulaud, Michael Danger, Benedicte Sohm, Justine Flayac, Alexandre Bec, Arnaud Chaumot, Geffard Olivier, Vincent Felten
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2018, 25 (12), pp.11264 - 11280. ⟨10.1007/s11356-017-9390-x⟩
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Effects of the gut parasite Nosema ceranae on honey bee physiology and behavior
auteur
Laurianne Paris, Hicham El Alaoui, Frédéric Delbac, Marie Diogon
article
Current Opinion in Insect Science, Elsevier, 2018, 26, pp.149-154
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titre
Differential impact of lytic viruses on prokaryotic morphopopulations in a tropical estuarine system (Cochin estuary, India)
auteur
Vijayan Jasna, Angia Sriram Pradeep Ram, Ammini Parvathi, Télesphore Sime-Ngando, Adelaide Almeida
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (3), pp.e0194020
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titre
Morphology and infraciliature of two new earthworm ciliates, Hoplitophrya polymorphus sp. nov. and Anoplophrya simplex sp. nov. (Ciliophora: Oligohymenophorea: Astomatia)
auteur
Paul Alain Nana, Zéphyrin Fokam, Bernard Vigues, Geneviève Bricheux, GidÉon Ajeagah Aghaindum, Pierre Ngassam, Moïse Nola, Télesphore Sime-Ngando
article
Zootaxa, Magnolia Press, 2018, 4392 (1), ⟨10.11646/zootaxa.4392.1.9⟩
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titre
A mimetic nesting association between a timid social wasp and an aggressive arboreal ant
auteur
Bruno Corbara, Pablo Servigne, Alain Dejean, James Carpenter, Jérôme Orivel
article
Comptes Rendus Biologies, Elsevier Masson, 2018, 341 (3), pp.182-188. ⟨10.1016/j.crvi.2018.01.006⟩
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titre
Method validation of a set of 12 GEM® Premier™ 4000 blood gas analyzers for point-of-care testing in a university teaching hospital
auteur
Damien Bouvier, Thomas Duret, Paul Rouzaire, Matthieu Jabaudon, Marion Rouzaire, Céline Nourrisson, Céline Bourgne, Bruno Pereira, Bertrand Evrard, Vincent Sapin
article
Practical Laboratory Medicine, Elsevier, 2018, 10, pp.21 - 33. ⟨10.1016/j.plabm.2017.12.001⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01919305/file/10.1515%3Acclm-2015-0771.pdf BibTex
titre
Invasive Infections Caused by Nannizziopsis spp. Molds in Immunocompromised Patients
auteur
Céline Nourrisson, Magali Vidal-Roux, Sophie Cayot, Christine Jacomet, Charlotte Bothorel, Albane Ledoux-Pilon, Fanny Anthony-Moumouni, Olivier Lesens, Philippe Poirier
article
Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2018, 24 (3), pp.549-552
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BibTex
titre
Monitoring human enteric viruses in wastewater and relevance to infections encountered in the clinical setting: a one-year experiment in central France, 2014 to 2015
auteur
Maxime Bisseux, Jonathan Colombet, Audrey Mirand, Anne-Marie Roque-Afonso, Florence Legrand-Abravanel, Jacques Izopet, Christine Archimbaud, Hélène Peigue-Lafeuille, Didier Debroas, Jean-Luc Bailly, Cécile Henquell
article
Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2018, 23 (7), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2018.23.7.17-00237⟩
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titre
Diversity of rare and abundant prokaryotic phylotypes in the Prony hydrothermal field and comparison with other serpentinite-hosted ecosystems
auteur
Eléonore Frouin, Méline Bes, Bernard Ollivier, Marianne Quéméneur, Anne Postec, Didier Debroas, Fabrice Armougom, Gaël Erauso
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.00102⟩
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titre
Diel rhythm does not shape the vertical distribution of bacterial and archaeal 16S rRNA transcript diversity in intertidal sediments: a mesocosm study Running title: Diel activities of benthic Bacteria and Archaea
auteur
Céline Lavergne, Mylène Hugoni, Cédric Hubas, Didier Debroas, Christine Dupuy, Hélène Agogué
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2018, 75 (2), pp.364-374. ⟨10.1007/s00248-017-1048-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01573359/file/2-Lavergneetal_2017-MECO%2Cauthorversion%2CHAL.pdf BibTex
titre
Changes in biochemical and sensory parameters in industrial blue-veined cheeses in different packaging
auteur
P. Duval, C. Chatelard-Chauvin, C. Gayard, E. Rifa, P. Bouchard, S. Hulin, Armelle Delile, B. Pollet, C. Montel, D. Picque
article
International Dairy Journal, Elsevier, 2018, 77, pp.89-99. ⟨10.1016/j.idairyj.2016.10.004⟩
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BibTex
titre
Performance of genotypic algorithms for predicting tropism for HIV-1 CRF01_AE recombinant
auteur
C. Soulié, L. Morand-Joubert, J. Cottalorda, C. Charpentier, P. Bellecave, L. Le Guen, S. Yerly, B Montes, S. Fafi-Kremer, J. Dina, V. Avettand-Fenoel, C. Amiel, C. Roussel, C. Pallier, K. Zafilaza, S. Sayon, A. Signori-Schmuck, A. Mirand, A. Trabaud, S. Berger, V. Calvez, A. Marcelin
article
Journal of Clinical Virology, Elsevier, 2018, 99-100, pp.57-60
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BibTex
titre
Characterization of an easy-to-use method for the routine analysis of the central metabolism using an affordable low-resolution GC–MS system: application to Arthrospira platensis
auteur
Myriam Phélippé, Rémy Coat, Camille Le Bras, Lorene Perrochaud, Eric Peyretaillade, Delphine Kucma, Abdellah Arhaliass, Gerald Thouand, Guillaume Cogne, Olivier Gonçalves
article
Analytical and Bioanalytical Chemistry, Springer Verlag, 2018, 410 (4), pp.1341-1361
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BibTex
titre
Diagnosis of Infective Endocarditis After TAVR
auteur
Erwan Salaün, Laura Sportouch, Pierre-Antoine Barral, Sandrine Hubert, Cécile Lavoute, Anne-Claire Casalta, Julie Pradier, Daniel Ouk, Jean-Paul Casalta, Marc Lambert, Frederique Gouriet, Jean-Yves Gaubert, Aurélie Dehaene, Alexis Jacquier, Laetitia Tessonnier, Julie Haentjens, Alexis Theron, Alberto Riberi, Serge Cammilleri, Dominique Grisoli, Nicolas Jaussaud, Frederic Collart, Jean-Louis Bonnet, Laurence Camoin, Sebastien Renard, Thomas Cuisset, Jean-François Avierinos, Hubert Lepidi, Olivier Mundler, Didier Raoult, Gilbert Habib
article
JACC: Cardiovascular Imaging, Elsevier/American College of Cardiology, 2018, 11 (1), pp.143-146. ⟨10.1016/j.jcmg.2017.05.016⟩
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BibTex
titre
Assessment of blood enterovirus PCR testing in paediatric populations with fever without source, sepsis-like disease, or suspected meningitis: a prospective, multicentre, observational cohort study
auteur
Jeremy Lafolie, André Labbé, Anne-Sophie l'Honneur, Fouad Madhi, Bruno Pereira, Marion Decobert, Marie Adam, François Gouraud, Frédéric Faibis, Francois Arditty, Stéphanie Marque-Juillet, Marie Guitteny, Gisèle Lagathu, Matthieu Verdan, Flore Rozenberg, Audrey Mirand, Hélène Peigue-Lafeuille, Cécile Henquell, Jean-Luc Bailly, Christine Archimbaud
article
The Lancet Infectious Diseases, New York, NY : Elsevier Science ; The Lancet Pub. Group, 2001-, 2018, 18 (12), pp.1385-1396. ⟨10.1016/S1473-3099(18)30479-1⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02271158/file/Lafolie%20et%20al.%20-%202018%20-%20Assessment%20of%20blood%20enterovirus%20PCR%20testing%20in%20pae.pdf BibTex
titre
Management and outcomes of acute respiratory distress syndrome patients with and without comorbid conditions
auteur
E. Azoulay, V. Lemiale, B. Mourvillier, M. Garrouste-Orgeas, C. Schwebel, S. Ruckly, Laurent Argaud, Y. Cohen, B. Souweine, L. Papazian, J. Reignier, G. Marcotte, S. Siami, H. Kallel, M. Darmon, J. F. Timsit, Outcomerea Study Grp
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (7), pp.1050--1060
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BibTex
titre
Efficient and reproducible experimental infections of rats with Blastocystis spp.
auteur
Manon Defaye, Céline Nourrisson, Elodie Baudu, Ivan Warwzyniak, Virginie Bonnin, Mathilde Bonnet, Nicolas Barnich, Denis Ardid, Frédéric Delbac, Frédéric Antonio Carvalho, Philippe Poirier
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (11), pp.1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0207669⟩
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https://hal.uca.fr/hal-01931278/file/2018_Delaye_Plos_One.pdf BibTex
titre
Usefulness of Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus (KSHV) DNA Viral Load in Whole Blood for Diagnosis and Monitoring of KSHV-Associated Diseases
auteur
Aude Jary, Valentin Leducq, Romain Palich, Adélie Gothland, Diane Descamps, Véronique Joly, Sidonie Lambert-Niclot, Corinne Amiel, Ana Canestri, Audrey Mirand, Elyanne Gault, Astrid Vabret, Marc-Antoine Valantin, Christine Katlama, Vincent Calvez, Nicolas Dupin, Jean-Philippe Spano, Anne-Geneviève Marcelin
article
Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2018, 56 (6), pp.1-4. ⟨10.1128/JCM.00569-18⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01984174/file/JCM_Jary%202018.pdf BibTex
titre
Biogeographic patterns of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria reveal an ecological consistency of phylogenetic clades in different oceanic biomes
auteur
Anne-Catherine Lehours, Francois Enault, Dominique Boeuf, Christian Jeanthon
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8, pp.4105. ⟨10.1038/s41598-018-22413-7⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01757822/file/s41598-018-22413-7.pdf BibTex
titre
High Incidence of Lysogeny in the Oxygen Minimum Zones of the Arabian Sea (Southwest Coast of India)
auteur
Ammini Parvathi, Vijayan Jasna, Sreekumar Aparna, Angia Pradeep Ram, Vijaya Aswathy, Kizhakkeppat Balachandran, Kallungal Muraleedharan, Dayana Mathew, Télesphore Sime-Ngando
article
Viruses, MDPI, 2018, 10 (11), pp.588
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01981930/file/viruses-10-00588.pdf BibTex
titre
Forces, failles et opportunités de la recherche française en écologie trophique
auteur
Marie-Elodie Perga, Michael Danger, Stanislas Dubois, Clémentine Fritsch, Cedric Gaucherel, Cedric Hubas, Franck Jabot, Gérard Lacroix, Sébastien Lefebvre, Pierre Marmonier, Alexandre Bec
article
Comptes Rendus Biologies, Elsevier Masson, 2018, 341 (6), pp.301-314. ⟨10.1016/j.crvi.2018.05.001⟩
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titre
Bacterial-viral interactions in the sea surface microlayer of a black carbon-dominated tropical coastal ecosystem (Halong Bay, Vietnam)
auteur
A.S. Pradeep Ram, Xavier Mari, J. Brune, J.P. Torréton, V.T. Chu, Patrick Raimbault, J. Niggemann, T. Sime-Ngando
article
Elementa: Science of the Anthropocene, University of California Press, 2018, 6 (1), pp.13. ⟨10.1525/elementa.276⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01718181/file/276-4654-1-PB.pdf BibTex
titre
Ant-plant relationships in the canopy of an Amazonian rainforest: the presence of an ant mosaic
auteur
Alain Dejean, Jérôme Orivel, Maurice Leponce, Arthur Compin, Jacques Delabie H. C, Frédéric Azémar, Bruno Corbara
article
Biological Journal of the Linnean Society, Linnean Society of London, 2018, 125 (2), pp.344-354. ⟨10.1093/biolinnean/bly125⟩
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titre
Ant–plant relationships in the canopy of an Amazonian rainforest: the presence of an ant mosaic
auteur
Alain Dejean, Jérôme Orivel, Maurice Leponce, Arthur Compin, Jacques Delabie, Frédéric Azémar, Bruno Corbara
article
Biological Journal of the Linnean Society, Linnean Society of London, 2018, 125, pp.344 - 354
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titre
Tank bromeliads sustain high secondary production in neotropical forests
auteur
Olivier Dézerald, Céline Leroy, Bruno Corbara, Alain Dejean, Stanislas Talaga, Régis Céréghino
article
Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, Springer Verlag, 2018, 80 (2), ⟨10.1007/s00027-018-0566-3⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01850394/file/D%C3%A9zerald%20et%20al.%202018.pdf BibTex
titre
Constraints on the functional trait space of aquatic invertebrates in bromeliads
auteur
Régis Cereghino, Valério Pillar, Diane Srivastava, Paula de Omena, A. Andrew M. Macdonald, Ignacio Barberis, Bruno Corbara, Laura Guzman, Céline Leroy, Fabiola Ospina Bautista, Gustavo Romero, M. Kurtis Trzcinski, Pavel Kratina, Vanderlei Debastiani, Ana Z. Gonçalves, Nicholas Marino, Vinicius Farjalla, Barbara Richardson, Michael Richardson, Olivier Dézerald, Benjamin Gilbert, Jana Petermann, Stanislas Talaga, Gustavo Piccoli, Merlijn Jocqué, Guillermo Montero
article
Functional Ecology, Wiley, 2018, 32 (10), pp.2435-2447. ⟨10.1111/1365-2435.13141⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02166192/file/C%C3%A9r%C3%A9ghino%20et%20al.%202018.pdf BibTex
titre
Prokaryote/eukaryote dichotomy and bacteria/archaea/eukarya domains : two inseparable concepts
auteur
J.C. Bertrand, Pierre Caumette, P. Normand, Bernard Ollivier, T. Sime-Ngando
article
Bertrand, J.C. (ed.); Normand, P. (ed.); Ollivier, Bernard (ed.); Sime-Ngando, T. (ed.). Prokaryotes and evolution, Springer, p. 1-21, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_1⟩
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titre
Impact of the microsporidian Nosema ceranae on the gut epithelium renewal of the honeybee, Apis mellifera
auteur
Johan Panek, Laurianne Paris, Diane Roriz, Anne Mone, Aurore Dubuffet, Frédéric Delbac, Marie Diogon, Hicham El Alaoui
article
Journal of Invertebrate Pathology, Elsevier, 2018, 159, pp.121-128. ⟨10.1016/j.jip.2018.09.007⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02360067/file/Accepted%20manuscript.pdf BibTex
titre
REPLY: De-Escalation of the P2Y12 Inhibitor After Acute Coronary Syndromes According to On-Treatment Platelet Reactivity A Promising Step of Enormous Magnitude That Should Be Explored
auteur
Pierre Deharo, Laurence Camoin, Jacques Quilici, Jean Louis Bonnet, Thomas Cuisset
article
JACC: Cardiovascular Interventions, Elsevier/American College of Cardiology, 2018, 11 (5), pp.508-509. ⟨10.1016/j.jcin.2018.01.256⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01780667/file/1-s2.0-S1936879818304278-main.pdf BibTex
titre
Microbial parasites make cyanobacteria blooms less of a trophic dead end than commonly assumed
auteur
Matilda Haraldsson, Mélanie Gerphagnon, Pauline Bazin, Jonathan Colombet, Samuele Tecchio, Télesphore Sime-Ngando, Nathalie Niquil
article
ISME Journal, Nature Publishing Group, 2018, 12, pp.1008-1020. ⟨10.1038/s41396-018-0045-9⟩
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titre
Biomorphology of crustaceans in a unpolluted stream in the equatorial forest of Cameroon
auteur
Gideon Aghaindum Ajeagah, Gertrude Estelle Yogback, Siméon Tchakonté, Paul Alain Nana, Geneviève Bricheux, Télesphore Sime-Ngando, Champlain Djieto-Lordon
article
Journal of Water Science / Revue des Sciences de l'Eau, Lavoisier (Hermes Science Publications), 2018, 31 (1), ⟨10.7202/1047051ar⟩
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titre
A New Freshwater Cyanosiphovirus Harboring Integrase
auteur
Kevin Zhong, Curtis A. Suttle, Anne-Claire Baudoux, Evelyne Derelle, Jonathan Colombet, Anna Cho, Jessica Caleta, Christophe Six, Stéphan Jacquet
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, pp.2204. ⟨10.3389/fmicb.2018.02204⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01884603/file/fmicb-09-02204.pdf BibTex
titre
Functional traits and environmental conditions predict community isotopic niches and energy pathways across spatial scales
auteur
Olivier Dézerald, Diane Srivastava, Régis Céréghino, Jean-François Carrias, Bruno Corbara, Vinicius Farjalla, Céline Leroy, Nicholas Marino, Gustavo Piccoli, Barbara Richardson, Michael Richardson, Gustavo Romero, Angélica González
article
Functional Ecology, Wiley, 2018, 32 (10), pp.2423-2434. ⟨10.1111/1365-2435.13142⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02170128/file/D%C3%A9zerald%20et%20al.%202018%282%29.pdf BibTex
titre
Highly modular pattern in ant-plant interactions involving specialized and non-specialized myrmecophytes
auteur
Alain Dejean, Frédéric Azémar, Frédéric Petitclerc, Jacques Delabie, Bruno Corbara, Céline Leroy, Régis Cereghino, Arthur Compin
article
The Science of Nature Naturwissenschaften, Springer Verlag, 2018, 105 (7-8), ⟨10.1007/s00114-018-1570-0⟩
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titre
A strong link between marine microbial community composition and function challenges the idea of functional redundancy
auteur
Pierre E. Galand, Olivier Pereira, Corentin Hochart, J.-C. Auguet, Didier Debroas
article
ISME Journal, Nature Publishing Group, 2018, 12 (10), pp.2470-2478. ⟨10.1038/s41396-018-0158-1⟩
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BibTex
titre
Cellular and non-cellular mineralization of organic carbon in soils with contrasted physicochemical properties
auteur
Benoit Keraval, Sébastien Fontaine, Audrey Lallement, Sandrine Revaillot, Hermine Billard, Gaël Alvarez, Fernando Maestre, Christian Amblard, Anne-Catherine Lehours
article
Soil Biology and Biochemistry, Elsevier, 2018, 125, pp.286-289. ⟨10.1016/j.soilbio.2018.07.023⟩
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BibTex
titre
Hydrogenotrophic methanogens of the mammalian gut: functionally similar, thermodynamically different -A modelling approach
auteur
Rafael Munoz Tamayo, Milka Popova, Maxence Tillier, Diego Morgavi, Gérard Fonty, Nicole Morel-Desrosiers
article
2018
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02369430/file/445171.full.pdf BibTex
titre
Simulated drought regimes reveal community resilience and hydrological thresholds for altered decomposition
auteur
Hector Rodriguez Perez, Guillaume Borrel, Céline Leroy, Jean-Francois Carrias, Bruno Corbara, Diane S. Srivastava, Régis Céréghino
article
Oecologia, Springer Verlag, 2018, 187 (1), pp.267-279. ⟨10.1007/s00442-018-4123-5⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01806866/file/Simulated%20drought%20regimes_accepted.pdf BibTex

2017

titre
Caractérisation des proliférations nostocaléennes anciennes et futures via les akinètes présents dans les sédiments
auteur
Benjamin Legrand
article
Etudes de l'environnement. Université Clermont Auvergne, 2017. Français. ⟨NNT : 2017CLFAC109⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02272749/file/2017CLFAC109_LEGRAND.pdf BibTex
titre
Spatial and temporal changes of parasitic chytrids of cyanobacteria
auteur
Mélanie Gerphagnon, Jonathan Colombet, Delphine Latour, Télesphore Sime-Ngando
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), ⟨10.1038/s41598-017-06273-1⟩
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titre
Plastics in the North Atlantic garbage patch: A boat-microbe for hitchhikers and plastic degraders
auteur
Didier Debroas, Anne Mone, Alexandra ter Halle
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2017, 599-600, pp.1222 - 1232. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.05.059⟩
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titre
To what extent is the DNA of microbial eukaryotes modified during burying into lake sediments? A repeat-coring approach on annually laminated sediments
auteur
Eric Capo, Isabelle Domaizon, Dominique Maier, Didier Debroas, Christian Bigler
article
Journal of Paleolimnology, Springer Verlag, 2017, 58 (4), pp.479 - 495. ⟨10.1007/s10933-017-0005-9⟩
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titre
Cost assessment of a new oral care program in the intensive care unit to prevent ventilator-associated pneumonia
auteur
Jérôme Ory, Charline Mourgues, Evelyne Raybaud, Russell Chabanne, Jean Christophe Jourdy, Fabien Belard, Renaud Guerin, Bernard Cosserant, Jean Sébastien Faure, Laure Calvet, Bruno Pereira, Dominique Guélon, Ousmane Traore, Laurent Gerbaud
article
Clinical Oral Investigations, Springer Verlag, 2017, ⟨10.1007/s00784-017-2289-6⟩
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titre
Volatolomics in microbial ecotoxicology, a pathway for detecting metabolic signatures of exposure to xenobiotics
auteur
Kévin Hidalgo, Erwan Engel, Jean Louis Bonnet, Patrice Bouchard
article
1. International Conference on Microbial Ecotoxicology, Nov 2017, Lyon, France. 2017
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titre
Ecotoxicological impact of leptospermone, a b-triketone bioherbicide, on fungal community of two arable soils
auteur
Clarisse Mallet, Sana Romdhane, Jérémie Béguet, Fabrice Martin-Laurent, Christophe Calvayrac, Cédric Bertrand, Lise Barthelmebs
article
1. International Congress of Microbial Ecotoxicology (1st EcotoxicoMic 2017), Nov 2017, Lyon, France
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https://hal.inrae.fr/hal-02785163/file/2017-141_1.pdf BibTex
titre
Akinetes May Be Representative of Past Nostocalean Blooms: a Case Study of Their Benthic Spatiotemporal Distribution and Potential for Germination in a Eutrophic Lake
auteur
Benjamin Legrand, Anne-Hélène Le Jeune, Jonathan Colombet, Antoine Thouvenot, Delphine Latour, Harold Drake
article
Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2017, 83 (23), ⟨10.1128/AEM.01571-17⟩
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BibTex
titre
Benefit of switching dual antiplatelet therapy after acute coronary syndrome: the TOPIC (timing of platelet inhibition after acute coronary syndrome) randomized study
auteur
Thomas Cuisset, Pierre Deharo, Jacques Quilici, Thomas Johnson, Stéphanie Deffarges, Clémence Bassez, Guillaume Bonnet, Laurent Fourcade, Jean Philippe Mouret, Marc Lambert, Valentine Verdier, Pierre-Emmanuel Morange, Marie-Christine Alessi, Jean Louis Bonnet
article
European Heart Journal, Oxford University Press (OUP): Policy B, 2017, 38 (41), pp.3070 - 3078. ⟨10.1093/eurheartj/ehx175⟩
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BibTex
titre
What drives detrital decomposition in neotropical tank bromeliads?
auteur
Céline Leroy, Bruno Corbara, Olivier Dézerald, M. Kurtis Trzcinski, Jean-François Carrias, Alain Dejean, Régis Cereghino
article
Hydrobiologia, Springer, 2017, 802 (1), pp.85-95
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BibTex
titre
What drives detrital decomposition in neotropical tank bromeliads?
auteur
Céline Leroy, Bruno Corbara, Olivier Dezerald, M. Kurtis Trzcinski, Jean-François Carrias, Alain Dejean, Régis Céréghino
article
Hydrobiologia, Springer, 2017, 802 (1), pp.85-95. ⟨10.1007/s10750-017-3242-z⟩
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titre
Differential impact of lytic viruses on the taxonomical resolution of freshwater bacterioplankton community structure
auteur
Jitendra Keshri, Angia Sriram Pradeep Ram, Jonathan Colombet, Fanny Perrière, Antoine Thouvenot, Télesphore Sime-Ngando
article
Water Research, IWA Publishing, 2017, 124, pp.129 - 138. ⟨10.1016/j.watres.2017.07.053⟩
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titre
Adding Azathioprine to Remission-Induction Glucocorticoids for Eosinophilic Granulomatosis With Polyangiitis (Churg-Strauss), Microscopic Polyangiitis, or Polyarteritis Nodosa Without Poor Prognosis Factors
auteur
Xavier Puechal, Christian Pagnoux, Gabriel Baron, Thomas Quemeneur, Antoine Néel, Christian Agard, François Lifermann, Eric Liozon, Marc Ruivard, Pascal Godmer, Nicolas Limal, Arsène Mekinian, Thomas Papo, Anne Ruppert, Anne Bourgarit, Boris Bienvenu, Loïc Geffray, Luc Saraux, Elisabeth Diot, Bruno Crestani, Xavier Delbrel, Laurent Sailler, Pascal Cohen, Véronique Le Guern, Benjamin Terrier, Matthieu Groh, Claire Le Jeunne, Luc Mouthon, Philippe Ravaud, Loïc Guillevin, Marc Pineton de Chambrun, Charles-Edouard Luyt, Francois Beloncle, Marie Gousseff, Wladimir Mauhin, Laurent Argaud, Stanislas Ledochowski, Anne-Sophie Moreau, Romain Sonneville, Bruno Verdière, Sybille Merceron, Nathalie Zappella, Mickael Landais, Damien Contou, Alexandre Demoule, Sylvie Paulus, Bertrand Souweine, Bernard Lecomte, Antoine Vieillard-Baron, Nicolas Terzi, Elie Azoulay, Raymond Friolet, Marc Puidupin, Jérôme Devaquet, Jean-Marc Mazou, Yannick Fédun, Jean-Paul Mira, Jean-Herlé Raphalen, Alain Combes, Zahir Amoura, Jean-Christophe Lega, Marc Lambert, Sophie Rivière, Antoine Dossier, François Lhote, Gilles Blaison, Laurent Alric, David Saadoun, Julie Graveleau, Martin Soubrier, Marie-Josée Lecomte, Christine Christides, Annick Bosseray, Hervé Lévesque, François Viallard, Nathalie Tieulie, Pierre-Yves Lovey, Sylvie Le Moal, Béatrice Bibes, Giuseppe Malizia, Pierre Abgueguen, François Liferman, Jacques Ninet, Pierre-Yves Hatron, Arnaud Hot, Romain Hernu, Sylvie de la Salle, Thomas Similowski, Julien Haroche, Julien Boileau, Thomas Hanslik, Caroline Bulte, Aline Talasczka, Eric Hachulla, Olivier Decaux, Florent Ibouanga, Bertrand Arnulf, Marc Benedit, Assaad Maalouf, Bruno Moulin, Fleur Cohen-Aubart, Micheline Pha, Georges-Etienne Rivard, Eric Rondeau, Philippe Debourdeau, Claire Presne, Maude Andrieu, Oscar Len Abad, Hervé Devilliers, Alister Rogers, Miguel Hie, Alexis Mathian, Valentine Heidelberger, Saskia Ingen-Housz-Oro, Alicia Marquet, Matthieu Mahevas, Didier Bessis, Laurence Bouillet, Frédéric Caux, Catherine Chapelon-Abric, Sebastien Debarbieux, Emmanuel Delaporte, Anne-Bénédicte Duval-Modeste, Olivier Fain, Pascal Joly, Marc Marchand-Adam, Jean-Benoît Monfort, Nicolas Noel, Thierry Passeron, Françoise Sarrot-Reynauld, Denis Verrot, Diane Bouvry, Laurence Fardet, Olivier Chosidow, Pascal Sève, Dominique Valeyre, Sophie Moreau
article
Arthritis & rheumatology, Wiley, 2017, 69 (11), pp.2175 - 2186. ⟨10.1002/art.40205⟩
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BibTex
titre
Analyse des interactions entre le parasite Nosema ceranae et l'insecticide fipronil chez l'abeille domestique Apis mellifera
auteur
Laurianne Paris
article
Agronomie. Université Clermont Auvergne, 2017. Français. ⟨NNT : 2017CLFAC062⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01764895/file/2017CLFAC062_PARIS.pdf BibTex
titre
Opposing effect of Lactobacillus on in vitro Klebsiella pneumoniae in biofilm and in an in vivo intestinal colonisation model
auteur
R. Lagrafeuille, S. Miquel, D. Balestrino, M. Vareille-Delarbre, F. Chain, P. Langella, C. Forestier
article
Beneficial Microbes, Wageningen Academic Publishers 2017, 9 (1), pp.87-100. ⟨10.3920/BM2017.0002⟩
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BibTex
titre
Effluents hospitaliers : sources de pollution en antibiotiques et de résistances bacériennes potentiellement transmissibles via un biofilm ? : Microbiologie
auteur
Jérôme Ory
article
Biochimie [q-bio.BM]. Université Clermont Auvergne, 2017. Français. ⟨NNT : 2017CLFAC111⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02363339/file/2017CLFAC111_ORY.pdf BibTex
titre
WIsH: who is the host? Predicting prokaryotic hosts from metagenomic phage contigs
auteur
Clovis Galiez, Matthias Siebert, Francois Enault, Jonathan Vincent, Johannes Söding, Inanc Birol
article
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2017, 33 (19), pp.3113-3114. ⟨10.1093/bioinformatics/btx383⟩
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BibTex
titre
Spatio-Temporal Variations of Marine Biofilm Communities Colonizing Artificial Substrata Including Antifouling Coatings in Contrasted French Coastal Environments
auteur
Jean-François Briand, Aude Barani, Cédric Garnier, Karine Rehel, Félix Urvois, Christophe Le Poupon, Agnes Bouchez, Didier Debroas, Christine Bressy
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2017, 74 (3), pp.585 - 598. ⟨10.1007/s00248-017-0966-2⟩
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BibTex
titre
Integrating chytrid fungal parasites into plankton ecology: research gaps and needs
auteur
Thijs Frenken, Elisabet Alacid, Stella A. Berger, Elizabeth C. Bourne, Mélanie Gerphagnon, Hans-Peter Grossart, Alena S. Gsell, Bas W. Ibelings, Maiko Kagami, Frithjof C. Küpper, Peter M. Letcher, Adeline Loyau, Takeshi Miki, Jens C. Nejstgaard, Serena Rasconi, Albert Reñé, Thomas Rohrlack, Keilor Rojas-Jimenez, Dirk S. Schmeller, Bettina Scholz, Kensuke Seto, Télesphore Sime-Ngando, Assaf Sukenik, Dedmer B. van de Waal, Silke van den Wyngaert, Ellen van Donk, Justyna Wolinska, Christian Wurzbacher, Ramsy Agha
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2017, 19 (10), pp.3802 - 3822. ⟨10.1111/1462-2920.13827⟩
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BibTex
titre
Intravenous Immunoglobulins Improve Survival in Monoclonal Gammopathy-Associated Systemic Capillary-Leak Syndrome
auteur
Marc Pineton de Chambrun, Marie Gousseff, Wladimir Mauhin, Jean-Christophe Lega, Marc Lambert, Sophie Rivière, Antoine Dossier, Marc Ruivard, François Lhote, Gilles Blaison, Laurent Alric, Christian Agard, David Saadoun, Julie Graveleau, Martin Soubrier, Marie-Josée Lucchini-Lecomte, Christine Christides, Annick Bosseray, Hervé Lévesque, François Viallard, Nathalie Tieulie, Pierre-Yves Lovey, Sylvie Le Moal, Béatrice Bibes, Giuseppe Malizia, Pierre Abgueguen, François Liferman, Jacques Ninet, Pierre-Yves Hatron, Zahir Amoura, Arnaud Hot, Laurent Argaud, Romain Hernu, Sylvie de la Salle, Stanislas Ledochowski, Sophie Moreau, Thomas Papo, Romain Sonneville, Bruno Verdière, Sybille Merceron, Nathalie Zappella, Mickael Landais, Nicolas Limal, Damien Contou, Thomas Similowski, Alexandre Demoule, Bertrand Souweine, Julien Haroche, Julien Boileau, Bernard Lecomte, Thomas Hanslik, Antoine Vieillard-Baron, Nicolas Terzi, Caroline Bulte, Aline Talasczka, Eric Hachulla, Olivier Decaux, Florent Ibouanga, Bertrand Arnulf, Matthieu Groh, Elie Azoulay, Marc Benedit, Assaad Maalouf, Bruno Moulin, Fleur Cohen-Aubart, Raymond Friolet, Micheline Pha, Georges-Etienne Rivard, Eric Rondeau, Philippe Debourdeau, Marc Puidupin, Francois Beloncle, Jérôme Devaquet, Claire Presne, Jean-Marc Mazou, Maude Andrieu, Sylvie Paulus, Yannick Fédun, Jean-Paul Mira, Jean-Herlé Raphalen, Oscar Len Abad, Hervé Devilliers, Alister Rogers, Pascal Godmer, Charles-Edouard Luyt, Alain Combes, Miguel Hie, Alexis Mathian
article
The American Journal of Medicine, Elsevier [Commercial Publisher] 2017, 130 (10), pp.1219.e19 - 1219.e27. ⟨10.1016/j.amjmed.2017.05.023⟩
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titre
Etude des 6700 ans d’évolution enregistrée dans les sédiments du lac d’Aydat (Massif Central, France) par le couplage des diatomées, pollen, microfossiles non polliniques et akinètes de cyanobactéries.
auteur
Aude Beauger, Karen K. Serieyssol, Benjamin Legrand, Delphine Latour, Marlène Lavrieux, Yannick Miras
article
36ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF)., Sep 2017, Dijon, France
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titre
Étude des 6700 ans d'évolution enregistrés dans les sédiments du lac d'Aydat (Massif central, France) par le couplage des diatomées, pollen, microfossiles non polliniques et akinètes de cyanobactéries
auteur
Beauger Aude, Karen K. Serieyssol, Benjamin Legrand, Delphine Latour, Marlène Lavrieux, Yannick Miras
article
36e Colloque de l’ADLaF, Association des Diatomistes de Langue Française, Sep 2017, Dijon, France
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BibTex
titre
Caractérisations transcriptionnelle et phénotypique de bactéries dispersées de biofilm à Klebsiella pneumoniae
auteur
Cyril Guilhen
article
Médecine humaine et pathologie. Université Clermont Auvergne, 2017. Français. ⟨NNT : 2017CLFAS015⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02886428/file/2017CLFAS015_GUILHEN.pdf BibTex
titre
Phospholipid-bound eicosapentaenoic acid (EPA) supports higher fecundity than free EPA in Daphnia magna
auteur
Clémence Denoux, Dominik Martin-Creuzburg, Apostolos-Manuel Koussoroplis, Fanny Perriere, Christian Desvillettes, Gilles Bourdier, Alexandre Bec
article
Journal of Plankton Research, Oxford University Press (OUP), 2017, 39 (5), pp.843-848. ⟨10.1093/plankt/fbx037⟩
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BibTex
titre
Environmental drivers of community diversity in a neotropical urban landscape: a multi-scale analysis
auteur
Stanislas Talaga, Frédéric Petitclerc, Jean-François Carrias, Olivier Dézerald, Céline Leroy, Régis Cereghino, Alain Dejean
article
Landscape Ecology, Springer Verlag, 2017, 32 (9), pp.1805 - 1818. ⟨10.1007/s10980-017-0542-7⟩
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BibTex
titre
Benthic Archives Reveal Recurrence and Dominance of Toxigenic Cyanobacteria in a Eutrophic Lake over the Last 220 Years
auteur
Benjamin Legrand, Amélie Lamarque, Marion Sabart, Delphine Latour
article
Toxins, MDPI, 2017, 9 (9), ⟨10.3390/toxins9090271⟩
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BibTex
titre
Distinctive Patterns in the Taxonomical Resolution of Bacterioplankton in the Sediment and Pore Waters of Contrasted Freshwater Lakes
auteur
J. Keshri, A. S. Pradeep Ram, T. Sime-Ngando
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2017, ⟨10.1007/s00248-017-1074-z⟩
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BibTex
titre
Doxycycline and its quaternary ammonium derivative for adjuvant therapies of chondrosarcoma
auteur
Imen Miladi, Magali Vivier, Marie-Mélanie Dauplat, Morgane Chatard, Sophie Besse, Aurélien Vidal, Karine Chassain, Betty Jean, Christiane Forestier, Jean-Michel Chezal, Françoise Rédini, Françoise Degoul, Elisabeth Miot-Noirault
article
Cancer Chemotherapy and Pharmacology, Springer Verlag, 2017, 80 (3), pp.517 - 526. ⟨10.1007/s00280-017-3377-7⟩
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BibTex
titre
Mesotrione Herbicide: Efficiency, Effects, and Fate in the Environment after 15 Years of Agricultural Use
auteur
Louis Carles, Muriel Joly, Pierre Joly
article
CLEAN - Soil, Air, Water, Wiley, 2017, 45 (9), pp.1700011. ⟨10.1002/clen.201700011⟩
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BibTex
titre
Active microorganisms thrive among extremely diverse communities in cloud water
auteur
Pierre Amato, Muriel Joly, Ludovic Besaury, Anne Oudart, Najwa Taïb, Anne I. Moné, Laurent Deguillaume, Anne-Marie Delort, Didier Debroas
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (8), ⟨10.1371/journal.pone.0182869⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01598571/file/Amato%20etal2017%2C%20PLOSone.pdf BibTex
titre
Understanding low radiation background biology through controlled evolution experiments
auteur
Nathanael Lampe, Vincent Breton, David Sarramia, Télesphore Sime-Ngando, David G. Biron
article
Evolutionary Applications, Blackwell, 2017, 10 (7), pp.658 - 666. ⟨10.1111/eva.12491⟩
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BibTex
titre
Biofilm dispersal: multiple elaborate strategies for dissemination of bacteria with unique properties
auteur
Cyril Guilhen, Christiane Forestier, Damien Balestrino
article
Molecular Microbiology, Wiley, 2017, 105 (2), pp.188 - 210. ⟨10.1111/mmi.13698⟩
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BibTex
titre
Minor food sources can play a major role in secondary production in detritus-based ecosystems
auteur
Clément Crenier, Julio Arce-Funck, Alexandre Bec, Elise Billoir, Fanny Perrière, Joséphine Leflaive, Francois Guerold, Vincent Felten, Michaël Danger
article
Freshwater Biology, Wiley, 2017, 62 (7), pp.1155-1167. ⟨10.1111/fwb.12933⟩
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BibTex
titre
Tracking a century of changes in microbial eukaryotic diversity in lakes driven by nutrient enrichment and climate warming
auteur
Eric Capo, Didier Debroas, Fabien Arnaud, Marie-Elodie Perga, Cècile Chardon, Isabelle Domaizon
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2017, 19 (7), pp.2873 - 2892. ⟨10.1111/1462-2920.13815⟩
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BibTex
titre
Genomics and metagenomics of trimethylamine-utilizing Archaea in the human gut microbiome
auteur
Guillaume Borrel, Angela Mccann, Jennifer Deane, Marta C Neto, Denise B Lynch, Jean- François Brugère, Paul W O'Toole
article
ISME Journal, Nature Publishing Group, 2017, 11 (9), pp.2059 - 2074. ⟨10.1038/ismej.2017.72⟩
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BibTex
titre
Prevalence of HIV-1 drug resistance in treated patients with viral load >50 copies/mL: a 2014 French nationwide study
auteur
L. Assoumou, C. Charpentier, P. Recordon-Pinson, M. Grude, C. Pallier, L. Morand-Joubert, S. Fafi-Kremer, A. Krivine, B Montes, V. Ferre, M. Bouvier-Alias, C. Plantier, Jacques Izopet, M. Trabaud, S. Yerly, J. Dufayard, C. Alloui, L. Courdavault, H. Le Guillou-Guillemette, A. Maillard, C. Amiel, A. Vabret, C. Roussel, S. Vallet, J. Guinard, A. Mirand, A. Beby-Defaux, F. Barin, A. Allardet-Servent, R. Ait-Namane, M. Wirden, C. Delaugerre, V. Calvez, L. Chaix, D. Descamps, S. Reigadas
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2017, 72 (6), pp.1769-1773. ⟨10.1093/jac/dkx042⟩
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Prevalence of HIV-1 drug resistance in treated patients with viral load >50 copies/mL: a 2014 French nationwide study
auteur
L. Assoumou, C. Charpentier, P. Recordon-Pinson, M. Grude, C. Pallier, L. Morand-Joubert, S. Fafi-Kremer, A. Krivine, B Montes, V. Ferre, M. Bouvier-Alias, C. Plantier, Jacques Izopet, M. Trabaud, S. Yerly, J. Dufayard, C. Alloui, L. Courdavault, H. Le Guillou-Guillemette, A. Maillard, C. Amiel, A. Vabret, C. Roussel, S. Vallet, J. Guinard, A. Mirand, A. Beby-Defaux, F. Barin, A. Allardet-Servent, R. Ait-Namane, M. Wirden, C. Delaugerre, V. Calvez, M.-L. Chaix, D. Descamps, S. Reigadas
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2017, 72 (6), pp.1769 - 1773. ⟨10.1093/jac/dkx042⟩
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Temporal and spatial variations in the composition of freshwater photosynthetic picoeukaryotes revealed by MiSeq sequencing from flow cytometry sorted samples
auteur
Shengnan Li, Gisèle Bronner, Cécile Lepère, Fanxiang Kong, Xiaoli Shi
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2017, 19 (6), pp.2286 - 2300. ⟨10.1111/1462-2920.13724⟩
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Viral-Induced Mortality of Prokaryotes in a Tropical Monsoonal Estuary
auteur
Vijayan Jasna, Ammini Parvathi, Angia Sriram Pradeep Ram, Kizhekkapat K. Balachandran, Nikathil V. Madhu, Maheswari Nair, Retnamma Jyothibabu, K. Veeraraghava Jayalakshmy, Chenicherry Revichandran, Télesphore Sime-Ngando
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, ⟨10.3389/fmicb.2017.00895⟩
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A De Novo Robust Clustering Approach for Amplicon-Based Sequence Data
auteur
Alexandre Bazin, Didier Debroas, Engelbert Mephu Nguifo
article
2017
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https://hal.uca.fr/hal-01447699/file/ArticleECCB.pdf BibTex
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Study of fused- chitinase-glucuronan lyase enzymes with antifungal potential
auteur
Nastasia Prybylski, Cédric Delattre, Guillaume Pierre, Céline Laroche, Philippe Michaud, Pascal Dubessay
article
International Bioprocessing Association-7th International Forum on Industrial Bioprocesses, May 2017, Wuxi, China
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Thermothelomyces thermophila human infections
auteur
C. Nourrisson, D. Garcia-Hermoso, F. Morio, C. Kauffmann-Lacroix, N. Berrette, J. Bonhomme, P. Poirier, O. Lortholary, French Mycosis Study Group
article
Clinical Microbiology and Infection, Elsevier for the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2017, 23 (5), pp.338 - 341. ⟨10.1016/j.cmi.2016.10.025⟩
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Revisiting Previously Investigated Plants: A Molecular Networking-Based Study of Geissospermum laeve
auteur
Alexander Fox Ramos, Charlotte Alcover, Laurent Evanno, Alexandre Maciuk, Marc Litaudon, Christophe Duplais, Guillaume Bernadat, Jean-François Gallard, Christophe Jullian, Elisabeth Mouray, Philippe Grellier, Philippe Loiseau, Sébastien Pomel, Erwan Poupon, Pierre Champy, Mehdi Beniddir
article
Journal of Natural Products, American Chemical Society, 2017, 80 (4), pp.1007-1014. ⟨10.1021/acs.jnatprod.6b01013⟩
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P-gp expression levels in the erythrocytes of brown trout: a new tool for aquatic sentinel biomarker development
auteur
Emeline Valton, Ivan Wawrzyniak, Christian Amblard, Bruno Combourieu, Marie-Laure Bayle, François Desmolles, Fabrice Kwiatkowski, Frédérique Penault-Llorca, Mahchid Bamdad
article
Biomarkers, Taylor & Francis, 2017, 22 (6), pp.566 - 574. ⟨10.1080/1354750X.2017.1338314⟩
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Sensitivity of laccase activity to the fungicide tebuconazole in decomposing litter
auteur
J. Artigas, M. Gerphagnon, Florent Rossi, Clarisse Mallet
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2017, 584-585, pp.1084 - 1092. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.01.167⟩
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Taxonomy of prokaryotic viruses: 2016 update from the ICTV bacterial and archaeal viruses subcommittee.
auteur
Evelien M Adriaenssens, Mart Krupovic, Petar Knezevic, Hans-Wolfgang Ackermann, Jakub Barylski, J Rodney Brister, Martha R C Clokie, Siobain Duffy, Bas E Dutilh, Rob Edwards, Francois Enault, Ho Bin Jang, Jochen Klumpp, Andrew M Kropinski, Rob Lavigne, Minna M Poranen, David Prangishvili, Janis Rumnieks, Matthew B Sullivan, Johannes Wittmann, Hanna M Oksanen, Annika Gillis, Jens H Kuhn
article
Archives of Virology, Springer Verlag, 2017, 162 (4), pp.1153-1157. ⟨10.1007/s00705-016-3173-4⟩
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Correlation between some environmental variables and abundance of Almophrya mediovacuolata (Ciliophora: Anoplophryidae) endocommensal ciliate of an anecic earthworms (Oligochaeta: Annelida) in Bambui (North-West Cameroon)
auteur
Z. Fokam, P Nana, B Bricheux, B Vigues, P. Bouchard, P. Ngassam, T. Sime-Ngando
article
International Journal of Biological and Chemical Sciences, International Formulae Group (IFG), 2017, 10 (5), ⟨10.4314/ijbcs.v10i5.4⟩
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Overview of freshwater microbial eukaryotes diversity: a first analysis of publicly available metabarcoding data
auteur
Didier Debroas, Isabelle Domaizon, Jean-François Humbert, Ludwig Jardillier, Cécile Lepère, Anne Oudart, Najwa Taïb
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2017, 93 (4), pp.1-14. ⟨10.1093/femsec/fix023⟩
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Genotypic, size and morphological diversity of virioplankton in a deep oligomesotrophic freshwater lake (Lac Pavin, France)
auteur
Jonathan Colombet, Agnès Robin, Télesphore Sime-Ngando
article
Journal of Environmental Sciences, Elsevier, 2017, 53, pp.48 - 59. ⟨10.1016/j.jes.2016.05.016⟩
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Mixotrophy everywhere on land and in water: the grand écart hypothesis
auteur
Marc-André Selosse, Marie Charpin, Fabrice Not, Punidan Jeyasingh
article
Ecology Letters, Wiley, 2017, 20 (2), pp.246 - 263. ⟨10.1111/ele.12714⟩
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Inhibitory effects of sodium azide on microbial growth in experimental resuspension of marine sediment
auteur
Léa Cabrol, Marianne Quemeneur, Benjamin Misson
article
Journal of Microbiological Methods, Elsevier, 2017, 133, pp.62 - 65. ⟨10.1016/j.mimet.2016.12.021⟩
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Microbial metacommunity: a METABAR coding approach
auteur
Marc Buee, Matthieu Barret, Maria Bernard, Didier Debroas, Isabelle Domaizon, Laure Fauchery, Claude Husson, Valerie Laval, Géraldine Pascal, Charlie Pauvert, Christophe Mougel, Thomas Pommier, Dirk Redecker, Aymé Spor, Sébastien Terrat, Veronique Edel-Hermann, Corinne Vacher
article
2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France
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Population pharmacokinetics of micafungin in ICU patients with sepsis and mechanical ventilation
auteur
Vincent Jullien, Elie Azoulay, Carole Schwebel, Thomas Le Saux, Pierre Emmanuel Charles, Muriel Cornet, Bertrand Souweine, Kadda Klouche, Samir Jaber, Jean-Louis Trouillet, Fabrice Bruneel, Martin Cour, Joel Cousson, Ferhat Meziani, Didier Gruson, Adeline Paris, Michael Darmon, Maité Garrouste-Orgeas, Jean-Christophe Navellou, Arnaud Foucrier, Bernard Allaouchiche, Vincent Das, Jean-Pierre Gangneux, Stéphane Ruckly, Michel Wolff, Jean-François Timsit
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2017, 72 (1), pp.181 - 189. ⟨10.1093/jac/dkw352⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01470808/file/2017%20Julien%20et%20al.%2C%20Population%20pharmacokinetics.pdf BibTex
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Unveiling and Characterizing Early Bilateral Interactions between Biofilm and the Mouse Innate Immune System
auteur
Christiane Forestier, Elisabeth Billard, Geneviève Milon, Pascale Gueirard
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, pp.2309. ⟨10.3389/fmicb.2017.02309⟩
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https://hal.uca.fr/hal-01681274/file/fmicb-08-02309.pdf BibTex
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Molecular Epidemiology of Blastocystis sp. in Various Animal Groups from Two French Zoos and Evaluation of Potential Zoonotic Risk
auteur
Amandine Cian, Dima El Safadi, Marwan Osman, Romain Moriniere, Nausicaa Gantois, Sadia Benamrouz-Vanneste, Pilar Delgado-Viscogliosi, Karine Guyot, Luen-Luen Li, Sébastien Monchy, Christophe Noël, Philippe Poirier, Céline Nourrisson, Ivan Wawrzyniak, Frédéric Delbac, Stéphanie Bosc, Magali Chabé, Thierry Petit, Gabriela Certad, Eric Viscogliosi
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (1), pp.e0169659. ⟨10.1371/journal.pone.0169659⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01572015/file/Molecular_epidemiology_of_blastocystis_in_various_animal_groups.pdf BibTex
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Fate and ecotoxicological impact of new generation herbicides from the triketone family: An overview to assess the environmental risks
auteur
E. Dumas, M. Giraudo, Eric Goujon, M. Halma, E. Knhili, M. Stauffert, I. Batisson, Pascale Besse-Hoggan, J. T. Bohatier, P. Bouchard, Hélène Celle-Jeanton, M. Costa Gomes, F. Delbac, C. Forano, Pascale Goupil, Noëlle Guix, P. Husson, Gérard Ledoigt, C. Mallet, C. Mousty, V. Prevot, C. Richard, S. Sarraute
article
Journal of Hazardous Materials, Elsevier, 2017, 325, pp.136-156. ⟨10.1016/j.jhazmat.2016.11.059⟩
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Deciphering biodiversity and interactions between bacteria and microeukaryotes within epilithic biofilms from the Loue River, France
auteur
Anouk Zancarini, Isidora Echenique-Subiabre, Didier Debroas, Najwa Taïb, Catherine Quiblier, Jean-François Humbert
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.4344. ⟨10.1038/s41598-017-04016-w⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01599307/file/s41598-017-04016-w.pdf BibTex
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Décès d’un nourrisson dans un contexte de syndrome pieds-mains-bouche associé à l’entérovirus A71
auteur
V. Corvest, C. Archimbaud, A-S L’honneur, C. Henquell, H. Peigue-Lafeuille, M. Decobert, A. Mirand
article
Archives de Pédiatrie, Elsevier, 2017, 24 (12), pp.1253-1258. ⟨10.1016/j.arcped.2017.09.010⟩
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Understanding and predicting physiological performance of organisms in fluctuating and multifactorial environments
auteur
Apostolos-Manuel Koussoroplis, Sylvain Pincebourde, Alexander Wacker
article
Ecological monographs, Ecological Society of America, 2017, 87 (2), pp.178-197. ⟨10.1002/ecm.1247⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01693385/file/Koussoroplis%20et%20al_2017_Ecological%20Monographs.pdf BibTex
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The Clinical Picture of Severe Systemic Capillary-Leak Syndrome Episodes Requiring ICU Admission
auteur
Marc Ruivard, Marc Pineton de Chambrun, Charles-Edouard Luyt, Francois Beloncle, Marie Gousseff, Wladimir Mauhin, Laurent Argaud, Stanislas Ledochowski, Anne-Sophie Moreau, Romain Sonneville, Bruno Verdière, Sybille Merceron, Nathalie Zappella, Mickael Landais, Damien Contou, Alexandre Demoule, Sylvie Paulus, Bertrand Souweine, Bernard Lecomte, Antoine Vieillard-Baron, Nicolas Terzi, Elie Azoulay, Raymond Friolet, Marc Puidupin, Jérôme Devaquet, Jean-Marc Mazou, Yannick Fédun, Jean-Paul Mira, Jean-Herlé Raphalen, Alain Combes, Zahir Amoura
article
Critical Care Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2017, 45 (7), pp.1216 - 1223. ⟨10.1097/CCM.0000000000002496⟩
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Biotransformation of herbicides by aquatic microbial communities associated to submerged leaves.
auteur
Louis Carles, Florent Rossi, Muriel Joly, Pascale Besse-Hoggan, Isabelle Batisson, Joan Artigas
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2017, 24, pp.3664-3674. ⟨10.1007/s11356-016-8035-9⟩
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Relating switching rates between normal and persister cells to substrate and antibiotic concentrations: a mathematical modelling approach supported by experiments
auteur
G. Carvalho, C. Guilhen, D. Balestrino, C. Forestier, Jean-Denis Mathias
article
Microbial Biotechnology, Wiley, 2017, 10 (6), pp.1616-1627. ⟨10.1111/1751-7915.12739⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01779031/file/cf2017-pub00056700.pdf BibTex
titre
Proteomics and host-pathogen interactions: A bright future?
auteur
D. G. Biron, D. Nedelkov, Dorothée Missé, Philippe Holzmuller
article
Genetics and Evolution of Infectious Diseases, ELSEVIER SCIENCE BV, 2017, 978-0-12-800153-0; 978-0-12-799942-5. ⟨10.1016/B978-0-12-799942-5.00011-1⟩
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Natural non-homologous recombination led to the emergence of a duplicated V3-NS5A region in HCV-1b strains associated with hepatocellular carcinoma
auteur
Hélène Le Guillou-Guillemette, Adeline Pivert, Elise Bouthry, Cécile Henquell, Odile Petsaris, Alexandra Ducancelle, Pascal Veillon, Sophie Vallet, Sophie Alain, Vincent Thibault, Florence Legrand-Abravanel, Arielle Rosenberg, Elisabeth André-Garnier, Jean-Baptiste Bour, Yazid Baazia, Pascale Trimoulet, Patrice André, Catherine Gaudy-Graffin, Dominique Bettinger, Sylvie Larrat, Anne Signori-Schmuck, Henia Saoudin, Bruno Pozzetto, Gisèle Lagathu, Sophie Minjolle-Cha, Françoise Stoll-Keller, Jean-Michel Pawlotsky, Jacques Izopet, Christophe Payan, Françoise Lunel-Fabiani, Christophe Lemaire
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (4), pp.e0174651. ⟨10.1371/journal.pone.0174651⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01882310/file/Le%20Guillou-Guillemette-2017-Natural-non-homologous-recombinatio.pdf BibTex
titre
Litter-dwelling ants as bioindicators to gauge the sustainability of small arboreal monocultures embedded in the Amazonian rainforest
auteur
Sarah Groc, Jacques H. C. Delabie, Fernando Fernandez, Frédéric Petitclerc, Bruno Corbara, Maurice Leponce, Régis Cereghino, Alain Dejean
article
Ecological Indicators, Elsevier, 2017, 82, pp.43-49. ⟨10.1016/j.ecolind.2017.06.026⟩
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titre
Hollow Internodes Permit a Neotropical Understory Plant to Shelter Multiple Mutualistic Ant Species, Obtaining Protection and Nutrient Provisioning (Myrmecotrophy)
auteur
Alain Dejean, Frédéric Petitclerc, Arthur Compin, Frédéric Azémar, Bruno Corbara, Jacques Delabie, Céline Leroy
article
American Naturalist, University of Chicago Press, 2017, 190 (5), pp.E124 - E131. ⟨10.1086/693782⟩
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Urbanization impacts the taxonomic and functional structure of aquatic macroinvertebrate communities in a small Neotropical city
auteur
Stanislas Talaga, Olivier Dézerald, Alexis Carteron, Céline Leroy, Jean-François Carrias, Régis Céréghino, Alain Dejean
article
Urban Ecosystems, Springer Verlag, 2017, 20 (5), pp.1001-1009. ⟨10.1007/s11252-017-0653-6⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02163968/file/Talaga%20et%20al.%202017_1.pdf BibTex
titre
Symptomatologie et évolution de la maladie « pieds-mains-bouche »
auteur
A. Mirand, H. Peigue-Lafeuille
article
Archives de Pédiatrie, Elsevier, 2017, 24 (10), pp.1036-1046. ⟨10.1016/j.arcped.2017.08.001⟩
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titre
Influence of Anthropogenic Pollution on the Abundance Dynamics of Some Freshwater Invertebrates in the Coastal Area of Cameroon
auteur
E. Koji, O. V. Noah Ewoti, M. Onana, S. Tchakonté, C. Lontsi Djimeli, A. Tamsa Arfao, G. Bricheux, T. Sime-Ngando, M. Nola
article
Journal of Environmental Protection, Scientific Research Publishing, 2017, 08 (07), pp.810-829. ⟨10.4236/jep.2017.87051⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01626980/file/JEP_2017063015014397.pdf BibTex
titre
Taxonomical resolution and distribution of bacterioplankton along the vertical gradient reveals pronounced spatio-temporal patterns in contrasted temperate freshwater Lakes.
auteur
Angia Sriram Pradeep Ram, Jitendra Keshri, Paul Alain Nana, Telesphore Sime-Ngando
article
Water Research, IWA Publishing, 2017
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titre
Large-scale HFMD epidemics caused by Coxsackievirus A16 in Bangalore, India during 2013 and 2015
auteur
Durga Rao, Jagadeesh Naidu, Padmanabha Maiya, Ananda Babu, Jean-Luc Bailly
article
Infection, Genetics and Evolution, Elsevier, 2017, 55, pp.228-235. ⟨10.1016/j.meegid.2017.08.030⟩
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titre
Proteomics and host-pathogen interactions: a bright future?
auteur
David Georges Biron, D Nedelkov, D Missée, P Holzmuller
article
Genetics and Evolution of Infectious Diseases, Second Edition, M. Tibayrenc (ed), Chapter 11, pp. 227-255, 2017
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titre
Nosema ceranae, Fipronil and their combination compromise honey bee reproduction via changes in male physiology
auteur
Guillaume Kairo, David G. Biron, Faten Ben Abdelkader, Marc Bonnet, Sylvie Tchamitchian, Marianne Cousin, Claudia Dussaubat, Boris Benoit, Andre Kretzschmar, Luc Belzunces, Jean-Luc Brunet
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7, 14 p. ⟨10.1038/s41598-017-08380-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01605612/file/Kairo%202017%20Fipronil-Nosema%20Drone%20physiology_1.pdf BibTex
titre
Structural and functional responses of leaf-associated fungal communities to chemical pollution in streams
auteur
Florent Rossi, Joan Artigas, Clarisse Mallet
article
Freshwater Biology, Wiley, 2017, 62 (7), pp.1207-1219. ⟨10.1111/fwb.12937⟩
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https://hal.uca.fr/hal-01808289/file/MS%20Rossi%20et%20al%2C%20Structural%20and%20functional%20responses%20of%20leaf-associated%20fungal%20communities%20to%20chemical%20pollution%20in%20streams.pdf BibTex
titre
PanGeneHome : A Web Interface to Analyze Microbial Pangenomes
auteur
Camille Loiseau, Victor Hatte, Charlotte Andrieu, Loic Barlet, Audric Cologne, Romain de Oliveira, Lionel Ferrato-Berberian, Hélène Gardon, Damien Lauber, Mélanie Molinier, Stéphanie Monnerie, Kissi N 'Gou, Benjamin Penaud, Olivier Pereira, Justine Picarle, Amandine Septier, Antoine Mahul, Jean-Christophe Charvy, François Enault
article
Journal of Bioinformatics, Computational and Systems Biology, Elyns Group, 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01786921/file/Loiseau_PanGeneHome_JBCS_2017.pdf BibTex
titre
Interactions entre parasites et pollution dans un monde en mutation
auteur
Sanchez Mi, Iris Eouzan, Pais-Costa Aj, David Georges Biron
article
Ecotoxicologie des communautés et impacts sur les fonctions des écosystèmes. Eds Bernard C, Mougin C, Pery A, ISTE Editions, Paris., 2017
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titre
Unique and highly variable bacterial communities inhabiting the surface microlayer of an oligotrophic lake
auteur
Mylène Hugoni, Agnes Vellet, Didier Debroas
article
Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, 2017, 79 (2), pp.115-125. ⟨10.3354/ame01825⟩
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titre
Les pesticides, la cause du déclin de l’abeille domestique ?
auteur
Iris Eouzan, L Garnery, Telesphore Sime-Ngando, David Georges Biron
article
Ecotoxicologie des communautés et impacts sur les fonctions des écosystèmes. Eds Bernard C, Mougin C, Pery A, ISTE Editions, Paris., 2017
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titre
Phylogeography of Coxsackievirus A16 Reveals Global Transmission Pathways and Recent Emergence and Spread of a Recombinant Genogroup
auteur
Chervin Hassel, Audrey Mirand, Agnes Farkas, Sabine Diedrich, Hartwig Huemer, Hélène Peigue-Lafeuille, Christine Archimbaud, Cécile Henquell, Jean-Luc Bailly
article
Journal of Virology, American Society for Microbiology, 2017, 91 (18), pp.e00630. ⟨10.1128/jvi.00630-17⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01882287/file/e00630-17.full.pdf BibTex
titre
Identification of sulfonylurea biodegradation pathways enabled by a novel nicosulfuron-transforming strain Pseudomonas fluorescens SG-1: toxicity assessment and effect of formulation.
auteur
Louis Carles, Muriel Joly, Frédérique Bonnemoy, Martin Leremboure, Isabelle Batisson, Pascale Besse-Hoggan
article
Journal of Hazardous Materials, Elsevier, 2017, 324, pp.184-193. ⟨10.1016/j.jhazmat.2016.10.048⟩
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titre
Carbon and nutrients of indigestible pollen are transferred to zooplankton by chytrid fungi
auteur
Maiko Kagami, Yasumichi Motoki, Hélène Masclaux, Alexandre Bec
article
Freshwater Biology, Wiley, 2017
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Plants against Malaria and Mosquitoes in Sahel region of Burkina Faso: An Ethno-botanical survey
auteur
Rakiswendé Yerbanga, Jean Ouédraogo, Roch Kounbobr, Correspondence Rakiswendé, Léa Bonkian, Serge Yerbanga, Maminata Traoré, / Coulibaly, Thierry Lefèvre, Ibrahim Sangaré, Théophile Ouédraogo, Ousmane Traore, Jean Bosco Ouédraogo, Tinga Guiguemde, Kounbobr Dabiré
article
International Journal of Herbal Medicine, AkiNik Publications 2017, 5
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titre
Plants against Malaria and Mosquitoes in Sahel region of Burkina Faso: An Ethno-botanical survey
auteur
Léa Bonkian, Rakiswendé Yerbanga, Maminata Traoré Coulibaly, Thierry Lefèvre, Ibrahim Sangaré, Théophile Ouédraogo, Ousmane Traore, Jean Ouédraogo, Tinga Guiguemde, Kounbobr Dabiré
article
International Journal of Herbal Medicine, AkiNik Publications 2017, 5
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02411013/file/Bonkian%20et%20al%202017%20International%20Journal%20of%20Herbal%20Medicine.pdf BibTex
titre
Comparative genomics of microsporidian genomes reveals a minimal non-coding RNA set and new insights for transcription in minimal eukaryotic genomes
auteur
Abdel Belkorchia, Jean-François Pombert, Valérie Polonais, Nicolas Parisot, Frédéric Delbac, Jean François Brugere, Pierre Peyret, Christine Gaspin, Eric Peyretaillade
article
DNA Research, Oxford University Press (OUP), 2017, 24 (3), pp.251-260. ⟨10.1093/dnares/dsx002⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01594835/file/2017_Belkorchia_DNA%20Res_%7B1634811D-FB04-494B-BFBC-3A2E657D8B56%7D.pdf BibTex
titre
Using murine colitis models to analyze probiotics–host interactions
auteur
Rebeca Martin Rosique, Florian Chain, Sylvie Miquel, Jean-Paul Motta, Nathalie Vergnolle, Harry Sokol, Philippe Langella
article
FEMS Microbiology Reviews, Wiley-Blackwell, 2017, 41 (Supp_1), pp.S49-S70. ⟨10.1093/femsre/fux035⟩
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titre
New Insights into the Diversity of the Genus Faecalibacterium
auteur
Leandro Benevides, Sriti Burman, Rebeca Martin, Véronique Robert, Muriel Thomas, Sylvie Miquel, Florian Chain, Harry Sokol, Luis G. Bermudez-Humaran, Mark Morrison, Philippe Langella, Vasco A. Azevedo, Jean-Marc Chatel, Siomar Soares
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, pp.1790. ⟨10.3389/fmicb.2017.01790⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01617957/file/fmicb-08-01790.pdf BibTex
titre
Phages rarely encode antibiotic resistance genes: a cautionary tale for virome analyses.
auteur
F Enault, A Briet, L Bouteille, S Roux, Mb Sullivan, Ma Petit
article
ISME Journal, Nature Publishing Group, 2017, 11 (1), pp.237-247. ⟨10.1038/ismej.2016.90⟩
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titre
The influence of light, substrate and seed origin on the germination and establishment of an ant-garden bromeliad
auteur
Céline Leroy, Frédéric Petitclerc, Jérôme Orivel, B. Corbara, J.-F. Carrias, Alain Dejean, R. Céréghino
article
Plant Biology, Wiley, 2017, 19 (1), pp.70-78. ⟨10.1111/plb.12452⟩
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titre
Respective impact of implementation of prevention strategies, colonization with multiresistant bacteria and antimicrobial use on the risk of early- and late-onset VAP: An analysis of the OUTCOMEREA network
auteur
Wafa Ibn Saied, Bertrand Souweine, Maite Garrouste-Orgeas, Stephane Ruckly, Michael Darmon, Sebastien Bailly, Yves Cohen, Elie Azoulay, Carole Schwebel, Aguila Radjou, Hatem Kallel, Christophe Adrie, Anne-Sylvie Dumenil, Laurent Argaud, Guillaume Marcotte, Samir Jamali, Laurent Papazian, Dany Goldgran-Toledano, Lila Bouadma, Jean-Francois Timsit
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (11), pp.e0187791. ⟨10.1371/journal.pone.0187791⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01729757/file/journal.pone.0187791.pdf BibTex
titre
The predatory behavior of the Neotropical social wasp Polybia rejecta
auteur
Alain Dejean, Hector Rodriguez-Perez, James M. Carpenter, Frédéric Azémar, Bruno Corbara
article
Behavioural Processes, Elsevier, 2017, 140, pp.161-168. ⟨10.1016/j.beproc.2017.05.011⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01533217/file/Dejean%20et%20al.%20-%20The%20predatory%20behavior%20of%20the%20Neotropical%20social%20w.pdf BibTex

2016

titre
Influence des fillers du sable recyclé sur les propriétés des mortiers de ciment
auteur
Layachi Berredjem, Laurent Molez, Hocine Hadidane, Ahmed Naha, Nourredine Arabi
article
Innovation et valorisation en génie civil et matériaux de construction - INVACO2016, Dec 2016, Hammamet, Tunisie
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titre
Assessing Vacuolar Escape of Listeria Monocytogenes.
auteur
Juan J Quereda, Martin Sachse, Damien Balestrino, Théodore Grenier, Jennifer Fredlund, Anne Danckaert, Nathalie Aulner, Spencer Shorte, Jost Enninga, Pascale Cossart, Javier Pizarro-Cerdá
article
Collin M. Bacterial Pathogenesis, 1535, Humana Press, New York, NY, pp.173-195, 2016, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-6671-4. ⟨10.1007/978-1-4939-6673-8_11⟩
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https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-01574133/file/Quereda%20et%20al._editor%20JPC.pdf BibTex
titre
Devenir de mélanges de pesticides : étude des voies de biodégradation et développement d'une méthode préventive de bioremédiation
auteur
Louis Carles
article
Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2016. Français. ⟨NNT : 2016CLF22759⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01544582/file/CARLES_2016CLF22759.pdf BibTex
titre
The hide and seek of Plasmodium vivax in West Africa: report from a large-scale study in Beninese asymptomatic subjects
auteur
Philippe Poirier, Cécile Doderer-Lang, Pascal Atchade, Marie-Louise Coquelin de L’isle, Ahmed Abou-Bacar, Alexander Pfaff, Julie Brunet, Lydia Arnoux, Elodie Haar, Denis Filisetti, Sylvie Perrotey, Nicodème Chabi, Casimir Akpovi, Ludovic Anani, André Bigot, Ambaliou Sanni, Ermanno Candolfi, Jean-Philippe Lemoine
article
Malaria Journal, BioMed Central, 2016, 15 (1), ⟨10.1186/s12936-016-1620-z⟩
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titre
Accelerated craniofacial bone regeneration through dense collagen gel scaffolds seeded with dental pulp stem cells
auteur
Frédéric Chamieh, Anne-Margaux Collignon, Benjamin R. Coyac, Julie Lesieur, Sandy Ribes, Jérémy Sadoine, Annie Llorens, Antonino Nicoletti, Didier Letourneur, Marie-Laure Colombier, Showan N. Nazhat, Philippe Bouchard, Catherine Chaussain, Gaël Y. Rochefort
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6 (1), ⟨10.1038/srep38814⟩
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titre
Subtelomere organization in the genome of the microsporidian Encephalitozoon cuniculi: patterns of repeated sequences and physicochemical signatures
auteur
Ndongo Dia, Laurence Lavie, Ngor Faye, Guy Méténier, Edouard Yeramian, Christophe Duroure, Bhen Toguebaye, Roger Frutos, Mbayame Niang, Christian Vivarès, Choukri Ben Mamoun, Emmanuel Cornillot
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2016, 17 (1), pp.34. ⟨10.1186/s12864-015-1920-7⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01983985/file/Dia_2016_BMC_genomics.pdf BibTex
titre
Gaia Data Release 1. Summary of the astrometric, photometric, and survey properties
auteur
A. Brown, A. Vallenari, T. Prusti, H. de Bruijne, F. Mignard, R. Drimmel, C. Babusiaux, L. Bailer-Jones, U. Bastian, M. Biermann, W. Evans, L. Eyer, F. Jansen, C. Jordi, D. Katz, S. Klioner, U. Lammers, L. Lindegren, X. Luri, W. O’mullane, C. Panem, D. Pourbaix, S. Randich, P. Sartoretti, H. Siddiqui, C. Soubiran, V. Valette, F. van Leeuwen, A. Walton, C. Aerts, F. Arenou, M. Cropper, E. Høg, M. Lattanzi, E. Grebel, D. Holland, C. Huc, X. Passot, M. Perryman, L. Bramante, C. Cacciari, J. Castañeda, L. Chaoul, N. Cheek, F. de Angeli, C. Fabricius, R. Guerra, J. Hernández, A. Jean-Antoine-Piccolo, E. Masana, R. Messineo, N. Mowlavi, K. Nienartowicz, D. Ordóñez-Blanco, P. Panuzzo, J. Portell, J. Richards, M. Riello, M. Seabroke, P. Tanga, F. Thévenin, J. Torra, S. Els, G. Gracia-Abril, G. Comoretto, M. Garcia-Reinaldos, T. Lock, E. Mercier, M. Altmann, R. Andrae, L. Astraatmadja, I. Bellas-Velidis, K. Benson, J. Berthier, R. Blomme, G. Busso, B. Carry, A. Cellino, G. Clementini, S. Cowell, O. Creevey, J. Cuypers, M. David, J. de Ridder, A. de Torres, L. Delchambre, A. Dell’oro, C. Ducourant, Y. Frémat, M. García-Torres, E. Gosset, J. Halbwachs, C. Hambly, L. Harrison, M. Hauser, D. Hestroffer, S. Hodgkin, H. Huckle, A. Hutton, Gérard Jasniewicz, S. Jordan, M. Kontizas, J. Korn, C. Lanza, M. Manteiga, A. Moitinho, K. Muinonen, J. Osinde, E. Pancino, T. Pauwels, J.-M. Petit, A. Recio-Blanco, C. Robin, L. Sarro, C. Siopis, M. Smith, W. Smith, A. Sozzetti, W. Thuillot, W. van Reeven, Y. Viala, U. Abbas, A. Abreu Aramburu, S. Accart, J. Aguado, P. Allan, W. Allasia, G. Altavilla, M. Álvarez, J. Alves, R. Anderson, H. Andrei, E. Anglada Varela, E. Antiche, T. Antoja, S. Antón, B. Arcay, N. Bach, S. Baker, L. Balaguer-Núñez, C. Barache, C. Barata, A. Barbier, F. Barblan, D. Barrado y Navascués, M. Barros, M. Barstow, U. Becciani, M. Bellazzini, A. Bello García, V. Belokurov, P. Bendjoya, A. Berihuete, L. Bianchi, O. Bienaymé, F. Billebaud, N. Blagorodnova, S. Blanco-Cuaresma, T. Boch, A. Bombrun, R. Borrachero, S. Bouquillon, G. Bourda, H. Bouy, A. Bragaglia, M. Breddels, N. Brouillet, T. Brüsemeister, B. Bucciarelli, P. Burgess, R. Burgon, A. Burlacu, D. Busonero, R. Buzzi, E. Caffau, J. Cambras, H. Campbell, R. Cancelliere, T. Cantat-Gaudin, T. Carlucci, J. Carrasco, M. Castellani, P. Charlot, J. Charnas, A. Chiavassa, M. Clotet, G. Cocozza, S. Collins, G. Costigan, F. Crifo, J. Cross, M. Crosta, C. Crowley, C. Dafonte, Y. Damerdji, A. Dapergolas, P. David, P. de Cat, F. de Felice, P. de Laverny, F. de Luise, R. de March, D. Martino, R. de Souza, J. Debosscher, E. del Pozo, M. Delbo, A. Delgado, H. Delgado, P. Di Matteo, S. Diakite, E. Distefano, C. Dolding, S. dos Anjos, P. Drazinos, J. Duran, Y. Dzigan, B. Edvardsson, H. Enke, G. Eynard Bontemps, C. Fabre, M. Fabrizio, S. Faigler, J. Falcão, M. Farràs Casas, L. Federici, G. Fedorets, J. Fernández-Hernández, P. Fernique, A. Fienga, F. Figueras, F. Filippi, K. Findeisen, A. Fonti, M. Fouesneau, E. Fraile, M. Fraser, J. Fuchs, M. Gai, S. Galleti, L. Galluccio, D. Garabato, F. García-Sedano, A. Garofalo, N. Garralda, P. Gavras, J. Gerssen, R. Geyer, G. Gilmore, S. Girona, G. Giuffrida, M. Gomes, A. González-Marcos, J. González-Núñez, J. González-Vidal, M. Granvik, A. Guerrier, P. Guillout, J. Guiraud, A. Gúrpide, R. Gutiérrez-Sánchez, L. Guy, R. Haigron, D. Hatzidimitriou, M. Haywood, U. Heiter, A. Helmi, D. Hobbs, W. Hofmann, B. Holl, G. Holland, S. Hunt, A. Hypki, V. Icardi, M. Irwin, G. Jevardat de Fombelle, P. Jofré, P. Jonker, A. Jorissen, F. Julbe, A. Karampelas, A. Kochoska, R. Kohley, K. Kolenberg, E. Kontizas, S. Koposov, G. Kordopatis, P. Koubsky, A. Krone-Martins, M. Kudryashova, I. Kull, R. Bachchan, F. Lacoste-Seris, F. Lanza, J. Lavigne, C. Le Poncin-Lafitte, Y. Lebreton, T. Lebzelter, S. Leccia, N. Leclerc, I. Lecoeur-Taibi, V. Lemaitre, H. Lenhardt, F. Leroux, S. Liao, E. Licata, H. Lindstrøm, A. Lister, E. Livanou, A. Lobel, W. Löffler, M. López, D. Lorenz, I. Macdonald, T. Magalhães Fernandes, S. Managau, R. Mann, G. Mantelet, O. Marchal, J. Marchant, M. Marconi, S. Marinoni, P. Marrese, G. Marschalkó, J. Marshall, J. Martín-Fleitas, M. Martino, N. Mary, G. Matijevič, T. Mazeh, J. Mcmillan, S. Messina, D. Michalik, R. Millar, H. Miranda, D. Molina, R. Molinaro, M. Molinaro, L. Molnár, M. Moniez, P. Montegriffo, R. Mor, A. Mora, R. Morbidelli, T. Morel, S. Morgenthaler, D. Morris, F. Mulone, T. Muraveva, I. Musella, J. Narbonne, G. Nelemans, L. Nicastro, L. Noval, C. Ordénovic, J. Ordieres-Meré, P. Osborne, C. Pagani, I. Pagano, F. Pailler, H. Palacin, L. Palaversa, P. Parsons, M. Pecoraro, R. Pedrosa, H. Pentikäinen, B. Pichon, M. Piersimoni, F. Pineau, E. Plachy, G. Plum, E. Poujoulet, A. Prša, L. Pulone, S. Ragaini, S. Rago, N. Rambaux, M. Ramos-Lerate, P. Ranalli, G. Rauw, A. Read, S. Regibo, C. Reylé, R. Ribeiro, L. Rimoldini, V. Ripepi, A. Riva, G. Rixon, M. Roelens, M. Gómez, N. Rowell, F. Royer, L. Ruiz-Dern, G. Sadowski, T. Sagristà Sellés, J. Sahlmann, J. Salgado, E. Salguero, M. Sarasso, H. Savietto, M. Schultheis, E. Sciacca, M. Segol, J. Segovia, D. Segransan, C. Shih, R. Smareglia, R. Smart, E. Solano, F. Solitro, R. Sordo, S. Soria Nieto, J. Souchay, A. Spagna, F. Spoto, U. Stampa, A. Steele, H. Steidelmüller, C. Stephenson, H. Stoev, F. Suess, M. Süveges, J. Surdej, L. Szabados, E. Szegedi-Elek, D. Tapiador, F. Taris, G. Tauran, M. Taylor, R. Teixeira, D. Terrett, B. Tingley, S. Trager, C. Turon, A. Ulla, E. Utrilla, G. Valentini, A. van Elteren, E. van Hemelryck, M. van Leeuwen, M. Varadi, A. Vecchiato, J. Veljanoski, T. Via, D. Vicente, S. Vogt, H. Voss, V. Votruba, S. Voutsinas, G. Walmsley, M. Weiler, K. Weingrill, T. Wevers, Ł. Wyrzykowski, A. Yoldas, M. Žerjal, S. Zucker, C. Zurbach, T. Zwitter, A. Alecu, M. Allen, C. Allende Prieto, A. Amorim, G. Anglada-Escudé, V. Arsenijevic, S. Azaz, P. Balm, M. Beck, H. Bernstein, L. Bigot, A. Bijaoui, C. Blasco, M. Bonfigli, G. Bono, S. Boudreault, A. Bressan, S. Brown, P. Brunet, P. Bunclark, R. Buonanno, A. Butkevich, C. Carret, Claire Carrion, L. Chemin, F. Chéreau, L. Corcione, E. Darmigny, S. de Boer, P. de Teodoro, P. de Zeeuw, C. Delle Luche, D. Domingues, P. Dubath, F. Fodor, B. Frézouls, A. Fries, D. Fustes, D. Fyfe, E. Gallardo, J. Gallegos, D. Gardiol, M. Gebran, A. Gomboc, A. Gómez, E. Grux, A. Gueguen, A. Heyrovsky, J. Hoar, G. Iannicola, Y. Isasi Parache, M. Janotto, E. Joliet, A. Jonckheere, R. Keil, W. Kim, P. Klagyivik, J. Klar, J. Knude, O. Kochukhov, I. Kolka, J. Kos, A. Kutka, V. Lainey, D. Lebouquin, C. Liu, D. Loreggia, V. Makarov, M. Marseille, C. Martayan, O. Martinez-Rubi, B. Massart, F. Meynadier, S. Mignot, U. Munari, A. Nguyen, T. Nordlander, P. Ocvirk, S. O’flaherty, A. Olias Sanz, P. Ortiz, J. Osorio, D. Oszkiewicz, A. Ouzounis, M. Palmer, P. Park, E. Pasquato, C. Peltzer, J. Peralta, F. Péturaud, T. Pieniluoma, E. Pigozzi, J. Poels, G. Prat, T. Prod’homme, F. Raison, J. Rebordao, D. Risquez, B. Rocca-Volmerange, S. Rosen, M. I. Ruiz-Fuertes, F. Russo, S. Sembay, I. Serraller Vizcaino, A. Short, A. Siebert, H. Silva, D. Sinachopoulos, E. Slezak, M. Soffel, D. Sosnowska, V. Straižys, M. ter Linden, D. Terrell, S. Theil, C. Tiede, L. Troisi, P. Tsalmantza, D. Tur, M. Vaccari, F. Vachier, P. Valles, W. van Hamme, L. Veltz, J. Virtanen, J.-M. Wallut, R. Wichmann, M. I. Wilkinson, H. Ziaeepour, S. Zschocke
article
Astronomy and Astrophysics - A&A, EDP Sciences, 2016, 595, pp.id.A2. ⟨10.1051/0004-6361/201629512⟩
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https://arxiv.org/pdf/1609.04172 BibTex
titre
Severe paediatric conditions linked with EV-A71 and EV-D68, France, May to October 2016
auteur
Denise Antona, Manoëlle Kossorotoff, Isabelle Schuffenecker, Audrey Mirand, Marianne Leruez-Ville, Clément Bassi, Mélodie Aubart, Florence Moulin, Daniel Lévy-Bruhl, Cécile Henquell, Bruno Lina, Isabelle Desguerre
article
Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2016, 21 (46), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2016.21.46.30402⟩
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BibTex
titre
Simulating the Impact of the Natural Radiation Background on Bacterial Systems: Implications for Very Low Radiation Biological Experiments
auteur
Nathanael Lampe, David Biron, Jeremy M. C. Brown, Sébastien Incerti, Pierre Marin, Lydia Maigne, David Sarramia, Hervé Seznec, Vincent Breton
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (11), pp.e0166364. ⟨10.1371/journal.pone.0166364⟩
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BibTex
titre
Severe Pneumonia Associated with Adenovirus Type 55 Infection, France, 2014
auteur
Jeremy Lafolie, Audrey Mirand, Maud Salmona, Alexandre Lautrette, Christine Archimbaud, Amélie Brebion, Christel Regagnon, Martine Chambon, Séverine Mercier-Delarue, Jérôme Le Goff, Cécile Henquell
article
Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2016, 22 (11), pp.2012-2014. ⟨10.3201/eid2211.160728⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01883168/file/16-0728.pdf BibTex
titre
Characterization of akinetes from cyanobacterial strains and lake sediment: A study of their resistance and toxic potential
auteur
Benjamin Legrand, Amélie Lamarque, Marion Sabart, Delphine Latour
article
Harmful Algae, Elsevier, 2016, 59, pp.42 - 50. ⟨10.1016/j.hal.2016.09.003⟩
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BibTex
titre
Les métabolismes oxydatifs extracellulaires : une nouvelle vision des processus de minéralisation du carbone organique du sol
auteur
Benoît Keraval
article
Biodiversité et Ecologie. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2016. Français. ⟨NNT : 2016CLF22740⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01882691/file/KERAVAL_2016CLF22740.pdf BibTex
titre
Unexpectedly high bacteriochlorophyll a concentrations in neotropical tank bromeliads
auteur
Anne-Catherine Lehours, Anne-Hélène Le Jeune, Jean-Pierre Aguer, Régis Céréghino, Bruno Corbara, Benoit Keraval, Céline Leroy, Fanny Perrière, Christian Jeanthon, Jean-François Carrias
article
Environmental Microbiology Reports, Wiley, 2016, 8 (5), pp.689 - 698. ⟨10.1111/1758-2229.12426⟩
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BibTex
titre
Prevalence of aortic valve dystrophy and insufficiency in a cohort of 255 HIV-positive patients followed-up in a cardiology department between 2012 and 2014
auteur
C. Jacomet, G. Illes, F. Kwiatkowski, M. Vidal, N. Mrozek, C. Aumeran, V. Corbin, O. Lesens, H. Laurichesse, P. Bailly
article
International Journal of Cardiology, Elsevier, 2016, 220, pp.82 - 86. ⟨10.1016/j.ijcard.2016.06.237⟩
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BibTex
titre
Activités anti-biofilm de Lactobacillus vis-à-vis de Klebsiella Pneumoniae
auteur
Rosyne Lagrafeuille
article
Médecine humaine et pathologie. Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I, 2016. Français. ⟨NNT : 2016CLF1PP03⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01661354/file/2016CLF1PP03_LAGRAFEUILLE.pdf BibTex
titre
Crystallographic substrate binding studies of Leishmania mexicana SCP2-thiolase (type-2): unique features of oxyanion hole-1
auteur
Rajesh Harijan, Tiila-Riikka Kiema, Shahan Syed, Imran Qadir, Muriel Mazet, Frédéric Bringaud, Paul A.M. Michels, Rik Wierenga
article
Protein Engineering, Design and Selection, Oxford University Press (OUP), 2016, ⟨10.1093/protein/gzw080⟩
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BibTex
titre
Horizontal distribution of the cell abundance and toxicity of Microcystis in a hypereutrophic Moroccan reservoir
auteur
S. Samoudi, D. Latour, J. Robin, M. Sabart, Benjamin Misson, H. Ait Hammou, Kh. Mouhri, M. Loudiki
article
Contemporary Problems of Ecology, 2016, 9 (5), pp.554 - 562. ⟨10.1134/S1995425516050139⟩
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titre
Differential localization and functional specialization of centrin analogs in the parasitic ciliate Trichodina pediculus
auteur
Bernard Vigues, Jonathan Colombet, Raghida Damaj
article
Protoplasma, Springer Verlag, 2016, 253 (5), pp.1385-1388
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BibTex
titre
Molecular tools to detect anatoxin-a genes in aquatic ecosystems: Toward a new nested PCR-based method
auteur
Benjamin Legrand, Jerome Lesobre, Jonathan Colombet, Delphine Latour, Marion Sabart
article
Harmful Algae, Elsevier, 2016, 58, ⟨10.1016/j.hal.2016.07.002⟩
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titre
Prevalence, risk factors for infection and subtype distribution of the intestinal parasite Blastocystis sp. from a large-scale multi-center study in France
auteur
Dima El Safadi, Amandine Cian, Céline Nourrisson, Bruno Pereira, Christelle Morelle, Patrick Bastien, Anne-Pauline Bellanger, Françoise Botterel, Ermanno Candolfi, Guillaume Desoubeaux, Laurence Lachaud, Florent Morio, Christelle Pomares, Meja Rabodonirina, Ivan Wawrzyniak, Frédéric Delbac, Nausicaa Gantois, Gabriela Certad, Laurence Delhaes, Philippe Poirier, Eric Viscogliosi
article
BMC Infectious Diseases, BioMed Central, 2016, 16 (1), pp.451. ⟨10.1186/s12879-016-1776-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01368323/file/s12879-016-1776-8.pdf BibTex
titre
Unexpected predominance of photosynthetic picoeukaryotes in shallow eutrophic lakes
auteur
Shengnan Li, Xiaoli Shi, Cécile Lepère, Mixue Li, Xiujuan Wang, Fanxiang Kong
article
Journal of Plankton Research, Oxford University Press (OUP), 2016, 38 (4), pp.830-842. ⟨10.1093/plankt/fbw042⟩
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BibTex
titre
Chronic Polyaromatic Hydrocarbon (PAH) Contamination Is a Marginal Driver for Community Diversity and Prokaryotic Predicted Functioning in Coastal Sediments
auteur
Mathilde Jeanbille, Jérôme Gury, Robert Duran, Jacek Tronczynski, Jean-François Ghiglione, Hélène Agogué, Olfa Ben Saïd, Najwa Taïb, Didier Debroas, Cédric Garnier, Jean-Christophe Auguet
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.1303. ⟨10.3389/fmicb.2016.01303⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01599382/file/fmicb-07-01303.pdf BibTex
titre
The dynamics of ant mosaics in tropical rainforests characterized using the Self-Organizing Map algorithm
auteur
Alain Dejean, Frédéric Azemar, Régis Céréghino, Maurice Leponce, Bruno Corbara, Jérôme Orivel, Arthur Compin
article
Insect Science, Wiley, 2016, 23 (4), pp.630-637
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titre
Functional Responses of Bacterioplankton Diversity and Metabolism to Experimental Bottom-Up and Top-Down Forcings
auteur
S. Pradeep Ram, S. Chaibi-Slouma, J. Keshri, J. Colombet, T. Sime-Ngando
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2016, 72 (2), pp.347 - 358. ⟨10.1007/s00248-016-0782-0⟩
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titre
Compatibility of Injectable Anticoagulant Agents in Ethanol; In Vitro Antibiofilm Activity and Impact on Polyurethane Catheters of Enoxaparin 400 U/mL in 40% v/v Ethanol
auteur
Damien Balestrino, Mercédès Quintana, Nicolas Charbonnel, Christiane Forestier, Claire Lartigue, Bertrand Souweine
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (7), ⟨10.1371/journal.pone.0159475⟩
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titre
Varicella outbreak in Sudanese refugees from Calais
auteur
O. Lesens, O Baud, C. Henquell, A Lhermet, Nurse, J. Beytout
article
Journal of Travel Medicine, Wiley-Blackwell, 2016, 23 (5), ⟨10.1093/jtm/taw042⟩
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titre
Ciprofloxacin residue and antibiotic-resistant biofilm bacteria in hospital effluent
auteur
Jérôme Ory, Geneviève Bricheux, Anne Togola, Jean Louis Bonnet, Florence Donnadieu-Bernard, Laurence Nakusi, Christiane Forestier, Ousmane Traore
article
Environmental Pollution (1970), Elsevier Science, 2016, 214, ⟨10.1016/j.envpol.2016.04.033⟩
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titre
Ecologie de la santé humaine : contribution à l'étude et à la surveillance des épidémies de gastro-entérite aigüe d'origine hydrique
auteur
Damien Mouly
article
Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2016. Français. ⟨NNT : 2016CLF22706⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01479931/file/MOULY_2016CLF22706.pdf BibTex
titre
Rumen methanogens display species-specific methane production kinetics
auteur
Milka Popova, Maxence Tillier, Dominique Graviou, Diego Morgavi, Gérard Fonty, Jean Pierre Morel, Nicole Morel Desrosier
article
10. Joint Symposium Inra Rowett, Jun 2016, Clermont-Ferrand, France. 2016
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https://hal.inrae.fr/hal-02742850/file/Popova_Milka_1.pdf BibTex
titre
Lethal Effects of Microwave Exposures on Eggs and Pupae of the Cabbage Maggot and Cabbage Plants
auteur
David Biron, M. Giroux, A. Maire, Vincent Charles
article
Journal of Microwave Power and Electromagnetic Energy, International Microwave Power Institute, 2016, 31 (4), pp.228-237. ⟨10.1080/08327823.1996.11688314⟩
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titre
Molecular diversity studies in Lake Pavin reveal the ecological importance of parasitic true fungi in the plankton
auteur
Telesphore Sime-Ngando, Mélanie Gerphagnon, Jonathan Colombet, Marlène Jobard, Emilie Lefèvre, Sébastien Monchy, Serena Rasconi, Delphine Latour, Jean-François Carrias, Christian Amblard
article
Lac Pavin - History, geology, biogeochemistry, and sedimentology of a deep meromictic maar lake, 2016
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titre
Anaerobic microbial communities and processes involved in the methane cycle in freshwater lakes - a focus on lake Pavin.
auteur
Anne Catherine Lehours, Guillaume Borrel, Nicole Morel-Desrosiers, Corinne Bardot, Vincent Grossi, Benoit Keraval, Eleonore Attard, Jean-Pierre Morel, Christian Amblard, Gérard Fonty
article
Lake Pavin: History, biogeochemistry and sedimentology of a deep meromictic crater lake, 2016
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titre
The significance of transparent exopolymeric particles (TEP) for microorganisms in Lake Pavin.
auteur
Jean-François Carrias, Christian Amblard, Telesphore Sime-Ngando
article
Lac Pavin - History, geology, biogeochemistry, and sedimentology of a deep meromictic maar lake, 2016
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titre
The importance of phagotrophic protists in Lake Pavin
auteur
Jean-François Carrias, Christian Amblard, Gilles Bourdier, Telesphore Sime-Ngando
article
Lac Pavin - History, geology, biogeochemistry, and sedimentology of a deep meromictic maar lake., 2016
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titre
Lake Pavin: A pioneer site for ecological studies of freshwater viruses
auteur
Telesphore Sime-Ngando, Yvan Bettarel, Jonathan Colombet, Stéphanie Palesse, Angia Sriram Pradeep Ram, Marie Charpin, Christian Amblard
article
Lake Pavin: History, biogeochemistry and sedimentology of a deep meromictic crater lake, 2016
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titre
Lac Pavin – History, geology, biogeochemistry, and sedimentology of a deep meromictic maar lake.
auteur
Telesphore Sime-Ngando, Pierre Boivin, Emmanuel Chapron, Didier Jezequel, Michel Meybeck
article
2016
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titre
Study of microorganisms and virus in aquatic ecosystems by metagenetic and metagenomic approaches.
auteur
Gisèle Bronner, Didier Debroas, Francois Enault, Mylène Hugoni, Isabelle Jouan-Dufournel, Isabelle Mary, Viviane Ravet, Simon Roux, Najwa Taib
article
Lake Pavin: History, biogeochemistry and sedimentology of a deep meromictic crater lake, 2016
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titre
INF-04 - Épidémie de varicelle chez des migrants Soudanais en provenance de Calais
auteur
A. Lhermet, Z. Lacombe, O. Baud, C. Henquell, J. Beytout, O. Lesens
article
Médecine et Maladies Infectieuses, Elsevier Masson, 2016, 46 (4), ⟨10.1016/S0399-077X(16)30590-X⟩
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titre
HEP-06 - Nouveaux antiviraux oraux contre le virus de l’hépatite C chez des patients co-infectés VIH-VHC : remarquables résultats des combinaisons orales sans interféron, 2014-2015
auteur
G. Laurichesse, S. Casanova, V. Corbin, A. Mirand, C. Henquell, O. Lesens, C. Jacomet, J. Beytout, H. Laurichesse
article
Médecine et Maladies Infectieuses, Elsevier Masson, 2016, 46 (4), ⟨10.1016/S0399-077X(16)30383-3⟩
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titre
Extreme events in the sedimentary record of maar Lake Pavin: Implications for natural hazards assessment in the French Massif Central
auteur
Léo Chassiot, Emmanuel Chapron, Christian Di Giovanni, Patrick Albéric, Patrick Lajeunesse, Anne-Catherine Lehours, Michel Meybeck
article
Quaternary Science Reviews, Elsevier, 2016, 141, pp.9-25. ⟨10.1016/j.quascirev.2016.03.020⟩
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titre
Étude expérimentale de la formulation des mortiers à base de sable recyclé
auteur
Layachi Berredjem, Laurent Molez, Nguyen van Minh, Houria Meftah, Nourredine Arabi
article
34èmes Rencontres Universitaires de Génie Civil (RUGC 2016), May 2016, Liège, Belgique
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01366545/file/MAT-REC.3.pdf BibTex
titre
The significance of soil microalgae and cyanobacteria to assess pesticide stresses, in agricultural soils
auteur
Olivier Crouzet, Christelle Marrauld, Pierre-Alain Maron, Frédéric Rimet, Christian Mougin, Clarisse Mallet
article
SETAC Europe 26th Annual Meeting, May 2016, Nantes, France
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titre
mTOR transcriptionally and post-transcriptionally regulates Npm1 gene expression to contribute to enhanced proliferation in cells with Pten inactivation
auteur
Rafik Boudra, Rosyne Lagrafeuille, Corinne Lours-Calet, Cyrille de Joussineau, Gaëlle Loubeau-Legros, Cédric Chaveroux, Jean-Paul Saru, Silvère Baron, Laurent Morel, Claude Beaudoin
article
Cell Cycle, Taylor & Francis, 2016, 15 (10), pp.1352 - 1362. ⟨10.1080/15384101.2016.1166319⟩
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titre
Functional and structural characterization of two Bacillus megaterium nitroreductases biotransforming the herbicide mesotrione.
auteur
Louis Carles, Pascale Besse-Hoggan, Muriel Joly, Armelle Vigouroux, Solange Moréra, Isabelle Batisson
article
Biochemical Journal, Portland Press, 2016, pp.1443-53. ⟨10.1042/BJ20151366⟩
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titre
Anti-biofilm Activity as a Health Issue
auteur
Sylvie Miquel, Rosyne Lagrafeuille, Bertrand Souweine, Christiane Forestier
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.592. ⟨10.3389/fmicb.2016.00592⟩
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titre
Correction: Prevalence and Risk Factors for Intestinal Protozoan Infections with Cryptosporidium, Giardia, Blastocystis and Dientamoeba among Schoolchildren in Tripoli, Lebanon
auteur
Marwan Osman, Dima El Safadi, Amandine Cian, Sadia Benamrouz, Céline Nourrisson, Philippe Poirier, Bruno Pereira, Romy Razakandrainibe, Anthony Pinon, Céline Lambert, Ivan Wawrzyniak, Fouad Dabboussi, Frederic Delbac, Loïc Favennec, Monzer Hamze, Eric Viscogliosi, Gabriela Certad
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, Public Library of Science, 2016, 10 (4), ⟨10.1371/journal.pntd.0004643⟩
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titre
Taxonomy of prokaryotic viruses: update from the ICTV bacterial and archaeal viruses subcommittee.
auteur
M Krupovic, Be Dutilh, Em Adriaenssens, J Wittmann, Fk Vogensen, Mb Sullivan, J Rumnieks, D Prangishvili, R Lavigne, Am Kropinski, J Klumpp, A Gillis, F Enault, Ra Edwards, S Duffy, Mr Clokie, J Barylski, Hw Ackermann, Jh Kuhn
article
Archives of Virology, Springer Verlag, 2016, 161 (4), pp.1095-1099. ⟨10.1007/s00705-015-2728-0⟩
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titre
Les microalgues et cyanobactéries des sols : quels apports pour l’écotoxicologie terrestre
auteur
Olivier Crouzet, Laurent Consentino, Christelle Marrauld, Clarisse Mallet, Pierre-Alain Maron, Annette Berard
article
3ème journée Ecotoxicomic, Mar 2016, Valence, France
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titre
Prevalence and Risk Factors for Intestinal Protozoan Infections with Cryptosporidium, Giardia, Blastocystis and Dientamoeba among Schoolchildren in Tripoli, Lebanon
auteur
Marwan Osman, Dima El Safadi, Amandine Cian, Sadia Benamrouz, Céline Nourrisson, Philippe Poirier, Bruno Pereira, Romy Razakandrainibe, Anthony Pinon, Céline Lambert, Ivan Wawrzyniak, Fouad Dabboussi, Frederic Delbac, Loïc Favennec, Monzer Hamze, Eric Viscogliosi, Gabriela Certad, Albert Picado
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, Public Library of Science, 2016, 10 (3), ⟨10.1371/journal.pntd.0004496⟩
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titre
Host–parasite interactions in food webs: Diversity, stability, and coevolution
auteur
Thomas Jephcott, Télesphore Sime-Ngando, Frank H. Gleason, Deborah J. Macarthur
article
Food Webs, Elsevier, 2016, 6, pp.1 - 8. ⟨10.1016/j.fooweb.2015.12.001⟩
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titre
Microbial diversity in support of anaerobic biomass valorization
auteur
M. Jobard, J. Pessiot, R. Nouaille, G. Fonty, T. Sime-Ngando
article
Critical Reviews in Biotechnology, Taylor & Francis, 2016, 37 (1), pp.1 - 10. ⟨10.3109/07388551.2015.1100584⟩
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titre
Viral Regulation of Prokaryotic Carbon Metabolism in a Hypereutrophic Freshwater Reservoir Ecosystem (Villerest, France)
auteur
Angia Sriram Pradeep Ram, Jonathan Colombet, Fanny Perrière, Antoine Thouvenot, Télesphore Sime-Ngando
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, ⟨10.3389/fmicb.2016.00081⟩
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titre
Impact of two disinfectants on detachment of Enterococcus faecalis from polythene in aquatic microcosm
auteur
C. Lontsi Djimeli, A. Tamsa Arfao, V Rossi, N Nsulem, V. Raspal, G Bricheux, M. Nola, T. Sime-Ngando
article
Research in Biotechnology, 2016, 7 (1), ⟨10.19071/rib.2016.v7.2981⟩
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titre
Enterovirus meningitis in Tunisia (Monastir, Mahdia, 2011–2013): identification of virus variants cocirculating in France
auteur
Ines Othman, Romain Volle, Aida Elargoubi, Mohamed Guediche, Mohamed Chakroun, Mohamed Tahar Sfar, Bruno Pereira, Hélène Peigue-Lafeuille, Mahjoub Aouni, Christine Archimbaud, Jean-Luc Bailly
article
Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, Elsevier, 2016, 84 (2), pp.116 - 122. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2015.10.019⟩
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titre
Outcome of totally implantable venous-access port-related infections
auteur
M. Vidal, J.P. Genillon, E. Forestier, S. Trouiller, B. Pereira, N. Mrozek, C. Aumeran, O. Lesens
article
Médecine et Maladies Infectieuses, Elsevier Masson, 2016, 46 (1), pp.32-38
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titre
Is real-time PCR-based diagnosis similar in performance to routine parasitological examination for the identification of Giardia intestinalis , Cryptosporidium parvum / Cryptosporidium hominis and Entamoeba histolytica from stool samples? Evaluation of a new commercial multiplex PCR assay and literature review
auteur
A. Laude, S. Valot, G. Desoubeaux, N. Argy, C. Nourrisson, C. Pomares, M. Machouart, Y. Le Govic, N. Bourgeois, E. Cateau, M. Leterrier, P. Le Pape, F. Morio
article
Clinical Microbiology and Infection, Elsevier for the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2016, 22 (2), pp.190.e1 - 190.e8. ⟨10.1016/j.cmi.2015.10.019⟩
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titre
Correction: Structural Diversity of Bacterial Communities Associated with Bloom-Forming Freshwater Cyanobacteria Differs According to the Cyanobacterial Genus
auteur
Imen Louati, Noémie Pascault, Didier Debroas, Cécile Bernard, Jean-François Humbert, Julie Leloup
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (1), pp.e0146866. ⟨10.1371/journal.pone.0146866⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01360257/file/pone.0146866.pdf BibTex
titre
Diversity and Dynamics of Active Small Microbial Eukaryotes in the Anoxic Zone of a Freshwater Meromictic Lake (Pavin, France)
auteur
Cécile Lepère, Isabelle Domaizon, Mylène Hugoni, Agnès Vellet, Didier Debroas
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7 (130), ⟨10.3389/fmicb.2016.00130⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01599386/file/fmicb-07-00130.pdf BibTex
titre
Colonization with the enteric protozoa Blastocystis is associated with increased diversity of human gut bacterial microbiota
auteur
Christophe Audebert, Gaël Even, Amandine Cian, Dima El Safadi, Gabriela Certad, Laurence Delhaes, Bruno Pereira, Céline Nourrisson, Philippe Poirier, Ivan Wawrzyniak, Frédéric Delbac, Christelle Morelle, Patrick Bastien, Laurence Lachaud, Anne-Pauline Bellanger, Françoise Botterel, Ermanno Candolfi, Guillaume Desoubeaux, Florent Morio, Christelle Pomares, Meja Rabodonirina, Alexandre Loywick, Sophie Merlin, Eric Viscogliosi, Magali Chabé
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, pp.25255. ⟨10.1038/srep25255⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01363189/file/Colonization%20with%20the%20enteric%20protozoa%20Blastocystis%20is%20associated%20with%20increased%20diversity%20of%20human%20gut%20bacterial%20microbiota.pdf BibTex
titre
Analysis of metagenomic data reveals common features of halophilic viral communities across continents
auteur
Simon Roux, Francois Enault, Viviane Ravet, Jonathan Colombet, Yvan Bettarel, Jean-Christophe Auguet, Thierry Bouvier, Soizick Lucas-Staat, Agnès Vellet, David Prangishvili, Patrick Forterre, Didier Debroas, Telesphore Sime-Ngando
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2016, 18 (3), pp.889 - 903. ⟨10.1111/1462-2920.13084⟩
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BibTex
titre
Genome Sequence of a Clinical Staphylococcus aureus Strain from a Prosthetic Joint Infection
auteur
Claire Marquès, Christine Franceschi, Valérie Collin, Frédéric Laurent, Sonia Chatellier, Christiane Forestier
article
Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2016, 4 (2), pp.e00198-16. ⟨10.1128/genomeA.00198-16⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01394081/file/Genome%20Announc.-2016-Marqu%C3%A8s-.pdf BibTex
titre
Identification of an anti-inflammatory protein from Faecalibacterium prausnitzii, a commensal bacterium deficient in Crohn's disease
auteur
E. Quévrain, M.A. Maubert, C. Michon, F. Chain, R. Marquant, J. Tailhades, S. Miquel, L. Carlier, L.G. Bermúdez-Humarán, B. Pigneur, O. Lequin, P. Kharrat, G. Thomas, D. Rainteau, C. Aubry, N. Breyner, Carlos Afonso, S. Lavielle, J.-P. Grill, G. Chassaing, J.M. Chatel, G. Trugnan, R. Xavier, P. Langella, H. Sokol, P. Seksik
article
Gut, BMJ Publishing Group, 2016, 65 (3), pp.415-425. ⟨10.1136/gutjnl-2014-307649⟩
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BibTex
titre
Epidemiological and clinical characteristics of patients infected with enterovirus D68, France, July to December 2014
auteur
Isabelle Schuffenecker, Audrey Mirand, Laurence Josset, Cécile Henquell, Denise Hecquet, Léa Pilorgé, Joelle Petitjean-Lecherbonnier, Catherine Manoha, Jérôme Legoff, Claire Deback, Sylvie Pillet, Quentin Lepiller, Jean Michel Mansuy, Stéphanie Marque-Juillet, Denise Antona, Hélène Peigue-Lafeuille, Bruno Lina
article
Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2016, 21 (19), ⟨10.2807/1560-7917.es.2016.21.19.30226⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01883183/file/eurosurv-21-30226-2.pdf BibTex
titre
Slight Pro-Inflammatory Immunomodulation Properties of Dendritic Cells byGardnerella vaginalis: The “Invisible Man” of Bacterial Vaginosis?
auteur
Thomas Bertran, Patrick Brachet, Marjolaine Vareille, Julie Falenta, Annie Dosgilbert, Marie-Paule Vasson, Christiane Forestier, Arlette Tridon, Bertrand Evrard
article
Journal of Immunology Research, Hindawi Publishing Corporation, 2016, pp.1-13. ⟨10.1155/2016/9747480⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01595704/file/2016_Bertran_Slight%20_J%20Immunol%20Res_%7B53C02D9C-AD6B-41A4-B94B-C1623ED7D67C%7D.pdf BibTex
titre
Empirical Micafungin Treatment and Survival Without Invasive Fungal Infection in Adults With ICU-Acquired Sepsis, Candida Colonization, and Multiple Organ Failure The EMPIRICUS Randomized Clinical Trial
auteur
Kada Klouche, Samir Jaber, Jean-Louis Trouillet, Fabrice Bruneel, Laurent Argaud, Joel Cousson, Ferhat Meziani, Didier Gruson, Adeline Paris, Michael Darmon, Maïté Garrouste-Orgeas, Jean-Christophe Navellou, Arnaud Foucrier, Bernard Allaouchiche, Vincent Das, Jean-Pierre Gangneux, Stephane Ruckly, Danièle Maubon, Vincent Jullien, Michel Wolff, Jean-François Timsit, Élie Azoulay, Carole Schwebel, Pierre Emmanuel Charles, Muriel Cornet, Bertrand Souweine
article
Journal of the American Medical Association, American Medical Association (AMA), 2016, 316 (15), pp.1555--1564. ⟨10.1001/jama.2016.14655⟩
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BibTex
titre
Estimation of sedimentation rates based on the excess of radium 228 in granitic reservoir sediments
auteur
Jean-Louis Reyss, Arnaud Mangeret, Christelle Courbet, Sylvain Bassot, Gilles Alcalde, Antoine Thouvenot, Jérôme Guillevic
article
Journal of Environmental Radioactivity, Elsevier, 2016, 162-163, pp.8 - 13. ⟨10.1016/j.jenvrad.2016.04.032⟩
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BibTex
titre
Functional and structural responses of soil N-cycling microbial communities to the herbicide mesotrione: a dose-effect microcosm approach
auteur
Olivier Crouzet, Franck Poly, Frédérique Bonnemoy, David Bru, Isabelle Batisson, Jacques Bohatier, Laurent Philippot, Clarisse Mallet
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2016, 23 (5), pp.4207 - 4217. ⟨10.1007/s11356-015-4797-8⟩
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BibTex
titre
A cuckoo-like parasitic moth leads African weaver ant colonies to their ruin
auteur
Alain Dejean, Jérôme Orivel, Frédéric Azémar, Bruno Hérault, Bruno Corbara
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, ⟨10.1038/srep23778⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02630869/file/2016_Dejean_Scientific%20Reports_1.pdf BibTex
titre
The contribution of microorganisms and metazoans to mineral nutrition in bromeliads
auteur
Céline Leroy, Jean-François Carrias, Régis Céréghino, Bruno Corbara
article
Journal of Plant Ecology, Wiley, 2016, 9 (3), pp.241-255. ⟨10.1093/jpe/rtv052⟩
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BibTex
titre
Biogeomorphic ecosystems within stressful and disturbed environments: a focus on termites and pioneer plants
auteur
Dov Jean-François Corenblit, Bruno Corbara, Johannes Steiger
article
Johnson E.; Martin Y. A Biogeoscience Approach to Ecosystems, Cambridge University Press, pp.456-474, 2016
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BibTex
titre
Detachment of adhered enteropathogenic Escherichia coli cells from polythene fragments immersed in aquatic microcosm using Eucalyptus microcorys extract (Myrtaceae)
auteur
Antoine Arfao, Chrétien Djimeli, Olive Ewoti, Geneviève Bricheux, Moïse Nola, Télesphore Sime-Ngando
article
Current Research in Microbiology and Biotechnology, Aizeon Publishers, 2016, 4 (3), pp.847-857
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01392650/file/crmb847-857.pdf BibTex
titre
Encephalitis caused by an unusual human herpes virus type 6 and Toxoplasma gondii co-infection in a cord blood transplant recipient
auteur
Alexandra Chapuis, Cécile Chabrot, Audrey Mirand, Philippe Poirier, Céline Nourrisson
article
International Journal of Infectious Diseases, Elsevier, 2016, 46, pp.79-81. ⟨10.1016/j.ijid.2016.04.002⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01883191/file/1-s2.0-S1201971216310153-main%20%281%29.pdf BibTex
titre
Distinct Spatial Patterns of SAR11, SAR86, and Actinobacteria Diversity along a Transect in the Ultra-oligotrophic South Pacific Ocean
auteur
Nyree J. West, Cécile Lepère, Carmem-Lara de O. Manes, Philippe Catala, David J. Scanlan, Philippe Lebaron
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.234. ⟨10.3389/fmicb.2016.00234⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01294340/file/fmicb-07-00234.pdf BibTex
titre
Influence of streambed substratum composition on stream microbial communities exposed to the fungicide tebuconazole
auteur
Florence Donnadieu, Pascale Besse-Hoggan, Christiane Forestier, Joan Artigas
article
Freshwater Biology, Wiley, 2016, 61, pp.2026-2036. ⟨10.1111/fwb.12679⟩
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BibTex
titre
Ecological impacts of parasitic chytrids, syndiniales and perkinsids on populations of marine photosynthetic dinoflagellates
auteur
Thomas G. Jephcott, Catharina Alves-De-Souza, Frank H. Gleason, Floris F. Ogtrop, Télesphore Sime-Ngando, Sergey A. Karpov, Laure Guillou
article
Fungal Ecology, Elsevier, 2016, 19, pp.47-58. ⟨10.1016/j.funeco.2015.03.007⟩
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BibTex
titre
Occurrence and diversity of both bacterial and fungal communities in dental unit waterlines subjected to disinfectants.
auteur
Damien Costa, Anne Mercier, Kevin Gravouil, Jérôme Lesobre, Julien Verdon, Christine Imbert
article
Foodborne Pathogens and Disease, Mary Ann Liebert, 2016, 74 (7), ⟨10.1093/femspd/ftw094⟩
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BibTex
titre
Combined effects of drought and the fungicide tebuconazole on aquatic leaf litter decomposition
auteur
S. Pesce, O. Zoghlami, C. Margoum, J. Artigas, Arnaud Chaumot, A. Foulquier
article
Aquatic Toxicology, Elsevier, 2016, 173, pp.120-131. ⟨10.1016/j.aquatox.2016.01.012⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01804836/file/ly2016-pub00046834.pdf BibTex
titre
Characterization of biofilm formation in natural water subjected to low-frequency electromagnetic fields.
auteur
Anne Mercier, Joanne Bertaux, Jérôme Lesobre, Kevin Gravouil, Julien Verdon, Christine Imbert, Eric Valette, Yann Héchard
article
Biofouling, Taylor & Francis, 2016, 32 (3), pp.287-99. ⟨10.1080/08927014.2015.1137896⟩
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BibTex
titre
Feasibility of a Chronic Foreign Body Infection Model Studying the Influence of TiO2 Nanotube Layers on Bacterial Contamination
auteur
Charles Vorilhon, Christophe Massard, Vincent Raspal, Yves Sibaud, Christiane Forestier, Nicolas Charbonnel, Stéphane Descamps, Komla Oscar Awitor
article
Journal of Biomaterials and Nanobiotechnology, Scientific Research, 2016, 07 (01), pp.45 - 54. ⟨10.4236/jbnb.2016.71006⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01829437/file/JBNB_2016CV.pdf BibTex
titre
The Gaia mission
auteur
T. Prusti, H. de Bruijne, A. Brown, A. Vallenari, C. Babusiaux, L. Bailer-Jones, U. Bastian, M. Biermann, W. Evans, L. Eyer, F. Jansen, C. Jordi, S. Klioner, U. Lammers, L. Lindegren, X. Luri, F. Mignard, J. Milligan, C. Panem, V. Poinsignon, D. Pourbaix, S. Randich, G. Sarri, P. Sartoretti, H. Siddiqui, C. Soubiran, V. Valette, F. van Leeuwen, A. Walton, C. Aerts, F. Arenou, M. Cropper, R. Drimmel, E. Høg, D. Katz, M. Lattanzi, W. O’mullane, E. Grebel, D. Holland, C. Huc, X. Passot, L. Bramante, C. Cacciari, J. Castañeda, L. Chaoul, N. Cheek, F. de Angeli, C. Fabricius, R. Guerra, J. Hernández, A. Jean-Antoine-Piccolo, E. Masana, R. Messineo, N. Mowlavi, K. Nienartowicz, D. Ordóñez-Blanco, P. Panuzzo, J. Portell, J. Richards, M. Riello, M. Seabroke, P. Tanga, F. Thévenin, J. Torra, S. Els, G. Gracia-Abril, G. Comoretto, M. Garcia-Reinaldos, T. Lock, E. Mercier, M. Altmann, R. Andrae, L. Astraatmadja, I. Bellas-Velidis, K. Benson, J. Berthier, R. Blomme, G. Busso, B. Carry, A. Cellino, G. Clementini, S. Cowell, O. Creevey, J. Cuypers, M. David, J. de Ridder, A. de Torres, L. Delchambre, A. Dell’oro, C. Ducourant, Y. Frémat, M. García-Torres, E. Gosset, J. Halbwachs, C. Hambly, L. Harrison, M. Hauser, D. Hestroffer, S. Hodgkin, H. Huckle, A. Hutton, Gérard Jasniewicz, S. Jordan, M. Kontizas, J. Korn, C. Lanza, M. Manteiga, A. Moitinho, K. Muinonen, J. Osinde, E. Pancino, T. Pauwels, J.-M. Petit, A. Recio-Blanco, C. Robin, L. Sarro, C. Siopis, M. Smith, W. Smith, A. Sozzetti, W. Thuillot, W. van Reeven, Y. Via, U. Abbas, A. Abreu Aramburu, S. Accart, J. Aguado, P. Allan, W. Allasia, G. Altavilla, M. Álvarez, J. Alves, R. Anderson, H. Andrei, E. Anglada Varela, E. Antiche, T. Antoja, S. Antón, B. Arcay, A. Atzei, L. Ayache, N. Bach, S. Baker, L. Balaguer-Núñez, C. Barache, C. Barata, A. Barbier, F. Barblan, M. Baroni, D. Barrado y Navascués, M. Barros, M. Barstow, U. Becciani, M. Bellazzini, G. Bellei, A. Bello García, V. Belokurov, P. Bendjoya, A. Berihuete, L. Bianchi, O. Bienaymé, F. Billebaud, N. Blagorodnova, S. Blanco-Cuaresma, T. Boch, A. Bombrun, R. Borrachero, S. Bouquillon, G. Bourda, H. Bouy, A. Bragaglia, M. Breddels, N. Brouillet, T. Brüsemeister, B. Bucciarelli, F. Budnik, P. Burgess, R. Burgon, A. Burlacu, D. Busonero, R. Buzzi, E. Caffau, J. Cambras, H. Campbell, R. Cancelliere, T. Cantat-Gaudin, T. Carlucci, J. Carrasco, M. Castellani, P. Charlot, J. Charnas, P. Charvet, F. Chassat, A. Chiavassa, M. Clotet, G. Cocozza, S. Collins, P. Collins, G. Costigan, F. Crifo, J. Cross, M. Crosta, C. Crowley, C. Dafonte, Y. Damerdji, A. Dapergolas, P. David, P. de Cat, F. de Felice, P. de Laverny, F. de Luise, R. de March, D. Martino, R. de Souza, J. Debosscher, E. del Pozo, M. Delbo, A. Delgado, H. Delgado, F. Di Marco, P. Di Matteo, S. Diakite, E. Distefano, C. Dolding, S. dos Anjos, P. Drazinos, J. Durán, Y. Dzigan, E. Ecale, B. Edvardsson, H. Enke, M. Erdmann, D. Escolar, M. Espina, G. Eynard Bontemps, C. Fabre, M. Fabrizio, S. Faigler, J. Falcão, M. Farràs Casas, F. Faye, L. Federici, G. Fedorets, J. Fernández-Hernández, P. Fernique, A. Fienga, F. Figueras, F. Filippi, K. Findeisen, A. Fonti, M. Fouesneau, E. Fraile, M. Fraser, J. Fuchs, R. Furnell, M. Gai, S. Galleti, L. Galluccio, D. Garabato, F. García-Sedano, P. Garé, A. Garofalo, N. Garralda, P. Gavras, J. Gerssen, R. Geyer, G. Gilmore, S. Girona, G. Giuffrida, M. Gomes, A. González-Marcos, J. González-Núñez, J. González-Vidal, M. Granvik, A. Guerrier, P. Guillout, J. Guiraud, A. Gúrpide, R. Gutiérrez-Sánchez, L. Guy, R. Haigron, D. Hatzidimitriou, M. Haywood, U. Heiter, A. Helmi, D. Hobbs, W. Hofmann, B. Holl, G. Holland, S. Hunt, A. Hypki, V. Icardi, M. Irwin, G. Jevardat de Fombelle, P. Jofré, P. Jonker, A. Jorissen, F. Julbe, A. Karampelas, A. Kochoska, R. Kohley, K. Kolenberg, E. Kontizas, S. Koposov, G. Kordopatis, P. Koubsky, A. Kowalczyk, A. Krone-Martins, M. Kudryashova, I. Kull, R. Bachchan, F. Lacoste-Seris, F. Lanza, J. Lavigne, C. Le Poncin-Lafitte, Y. Lebreton, T. Lebzelter, S. Leccia, N. Leclerc, I. Lecoeur-Taibi, V. Lemaitre, H. Lenhardt, F. Leroux, S. Liao, E. Licata, H. Lindstrøm, A. Lister, E. Livanou, A. Lobel, W. Löffler, M. López, A. Lopez-Lozano, D. Lorenz, T. Loureiro, I. Macdonald, T. Magalhães Fernandes, S. Managau, R. Mann, G. Mantelet, O. Marchal, J. Marchant, M. Marconi, J. Marie, S. Marinoni, P. Marrese, G. Marschalkó, J. Marshall, J. Martín-Fleitas, M. Martino, N. Mary, G. Matijevič, T. Mazeh, J. Mcmillan, S. Messina, A. Mestre, D. Michalik, R. Millar, H. Miranda, D. Molina, R. Molinaro, M. Molinaro, L. Molnár, M. Moniez, P. Montegriffo, D. Monteiro, R. Mor, A. Mora, R. Morbidelli, T. Morel, S. Morgenthaler, T. Morley, D. Morris, F. Mulone, T. Muraveva, I. Musella, J. Narbonne, G. Nelemans, L. Nicastro, L. Noval, C. Ordénovic, J. Ordieres-Meré, P. Osborne, C. Pagani, I. Pagano, F. Pailler, H. Palacin, L. Palaversa, P. Parsons, T. Paulsen, M. Pecoraro, R. Pedrosa, H. Pentikäinen, J. Pereira, B. Pichon, M. Piersimoni, F. Pineau, E. Plachy, G. Plum, E. Poujoulet, A. Prša, L. Pulone, S. Ragaini, S. Rago, N. Rambaux, M. Ramos-Lerate, P. Ranalli, G. Rauw, A. Read, S. Regibo, F. Renk, C. Reylé, R. Ribeiro, L. Rimoldini, V. Ripepi, A. Riva, G. Rixon, M. Roelens, M. Gómez, N. Rowell, F. Royer, A. Rudolph, L. Ruiz-Dern, G. Sadowski, T. Sagristà Sellés, J. Sahlmann, J. Salgado, E. Salguero, M. Sarasso, H. Savietto, A. Schnorhk, M. Schultheis, E. Sciacca, M. Segol, J. Segovia, D. Segransan, E. Serpell, C. Shih, R. Smareglia, R. Smart, C. Smith, E. Solano, F. Solitro, R. Sordo, S. Soria Nieto, J. Souchay, A. Spagna, F. Spoto, U. Stampa, A. Steele, H. Steidelmüller, C. Stephenson, H. Stoev, F. Suess, M. Süveges, J. Surdej, L. Szabados, E. Szegedi-Elek, D. Tapiador, F. Taris, G. Tauran, M. Taylor, R. Teixeira, D. Terrett, B. Tingley, S. Trager, C. Tur, A. Ulla, E. Utrilla, G. Valentini, A. van Elteren, E. van Hemelryck, M. van Leeuwen, M. Varadi, A. Vecchiato, J. Veljanoski, T. Via, D. Vicente, S. Vogt, H. Voss, V. Votruba, S. Voutsinas, G. Walmsley, M. Weiler, K. Weingrill, D. Werner, T. Wevers, G. Whitehead, Ł. Wyrzykowski, A. Yoldas, M. Žerjal, S. Zucker, C. Zurbach, T. Zwitter, A. Alecu, M. Allen, C. Allende Prieto, A. Amorim, G. Anglada-Escudé, V. Arsenijevic, S. Azaz, P. Balm, M. Beck, H. Bernstein, L. Bigot, A. Bijaoui, C. Blasco, M. Bonfigli, G. Bono, S. Boudreault, A. Bressan, S. Brown, P. Brunet, P. Bunclark, R. Buonanno, A. Butkevich, C. Carret, Claire Carrion, L. Chemin, F. Chéreau, L. Corcione, E. Darmigny, S. de Boer, P. de Teodoro, P. de Zeeuw, C. Delle Luche, D. Domingues, P. Dubath, F. Fodor, B. Frézouls, A. Fries, D. Fustes, D. Fyfe, E. Gallardo, J. Gallegos, D. Gardiol, M. Gebran, A. Gomboc, A. Gómez, E. Grux, A. Gueguen, A. Heyrovsky, J. Hoar, G. Iannicola, Y. Isasi Parache, M. Janotto, E. Joliet, A. Jonckheere, R. Keil, W. Kim, P. Klagyivik, J. Klar, J. Knude, O. Kochukhov, I. Kolka, J. Kos, A. Kutka, V. Lainey, D. Lebouquin, C. Liu, D. Loreggia, V. Makarov, M. Marseille, C. Martayan, O. Martinez-Rubi, B. Massart, F. Meynadier, S. Mignot, U. Munari, A. Nguyen, T. Nordlander, P. Ocvirk, S. O’flaherty, A. Olias Sanz, P. Ortiz, J. Osorio, D. Oszkiewicz, A. Ouzounis, M. Palmer, P. Park, E. Pasquato, C. Peltzer, J. Peralta, F. Péturaud, T. Pieniluoma, E. Pigozzi, J. Poels, G. Prat, T. Prod’homme, F. Raison, J. Rebordao, D. Risquez, B. Rocca-Volmerange, S. Rosen, M. I. Ruiz-Fuertes, F. Russo, S. Sembay, I. Serraller Vizcaino, A. Short, A. Siebert, H. Silva, D. Sinachopoulos, E. Slezak, M. Soffel, D. Sosnowska, V. Straižys, M. ter Linden, D. Terrell, S. Theil, C. Tiede, L. Troisi, P. Tsalmantza, D. Tur, M. Vaccari, F. Vachier, P. Valles, W. van Hamme, L. Veltz, J. Virtanen, J.-M. Wallut, R. Wichmann, M. I. Wilkinson, H. Ziaeepour, S. Zschocke, Yves Viala, Catherine Turon, Gómez Anita
article
Astronomy and Astrophysics - A&A, EDP Sciences, 2016, 595, pp.id.A1. ⟨10.1051/0004-6361/201629272⟩
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https://arxiv.org/pdf/1609.04153 BibTex
titre
Distribution of dehalococcoidia in the anaerobic deep water of a remote meromictic crater lake and detection of dehalococcoidia-derived reductive dehalogenase homologous genes
auteur
Corinne Biderre-Petit, Eric Dugat-Bony, Mickaël Mege, Nicolas Parisot, Lorenz Adrian, Anne Moné, Jérémie Denonfoux, Eric Peyretaillade, Didier Debroas, Delphine Boucher, Pierre Peyret
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (1), ⟨10.1371/journal.pone.0145558⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01599389/file/journal.pone.0145558_%7BCD5A8714-A800-4F9F-A650-EF9BCAE6A869%7D.pdf BibTex
titre
Transcriptional profiling of Klebsiella pneumoniae defines signatures for planktonic, sessile and biofilm-dispersed cells
auteur
Cyril Guilhen, Nicolas Charbonnel, Nicolas Parisot, Nathalie Gueguen, Agnès Iltis, Christiane Forestier, Damien Balestrino
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2016, 17 (1), ⟨10.1186/s12864-016-2557-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01394069/file/2016_Guilhen_BMC%20Genomics_1.pdf BibTex
titre
ArthropodaCyc: a CycADS powered collection of BioCyc databases to analyse and compare metabolism of arthropods
auteur
Patrice Baa-Puyoulet, Nicolas Parisot, Gérard Febvay, Jaime Huerta-Cepas, Augusto F Vellozo, Toni Gabaldon, Federica Calevro, Hubert Charles, Stefano Colella
article
Database - The journal of Biological Databases and Curation, Oxford University Press, 2016, pp.1-9. ⟨10.1093/database/baw081⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01352558/file/BaaPuyoulet-2016.pdf BibTex
titre
Bacterial communities associated with four cyanobacterial genera display structural and functional differences: evidence from an experimental approach
auteur
Lin Zhu, Anouk Zancarini, Imen Louati, Silvia de Cesare, Charlotte Duval, Kevin Tambosco, Cecile Bernard, Didier Debroas, Lirong Song, Julie Leloup, Jean Francois Humbert
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.1-11. ⟨10.3389/fmicb.2016.01662⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01602443/file/2016_Zhu_Frontiers%20in%20Microbiology_1.pdf BibTex
titre
Soil carbon dioxide emissions controlled by an extracellular oxidative metabolism identifiable by its isotope signature
auteur
Benoit Keraval, Anne Catherine Lehours, Jonathan Colombet, Christian Amblard, Gaël Alvarez, Sébastien Fontaine
article
Biogeosciences, European Geosciences Union, 2016, 13 (22), pp.6353 - 6362. ⟨10.5194/bg-13-6353-2016⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01595310/file/Keraval_B_2016_Biogeosciences_%7BD828EBE8-97C8-48F3-B4C4-81E0736A1373%7D.pdf BibTex
titre
The effects of food web structure on ecosystem function exceeds those of precipitation
auteur
M. Kurtis Trzcinski, Diane Srivastava, Bruno Corbara, Olivier Dézerald, Céline Leroy, Jean-François Carrias, Alain Dejean, Régis Cereghino
article
Journal of Animal Ecology, Wiley, 2016, 85 (5), pp.1147-1160. ⟨10.1111/1365-2656.12538⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01933190/file/Trzcinski%20et%20al.%202016.pdf BibTex
titre
On Blastocystis secreted cysteine proteases: a legumain-activated cathepsin B increases paracellular permeability of intestinal Caco-2 cell monolayers
auteur
C. Nourrisson, I. Wawrzyniak, A. Cian, Valerie Livrelli, F. Viscogliosi, F. Delbac, P. Poirier
article
Parasitology, Cambridge University Press (CUP), 2016, 143 (13), pp.1713-1722. ⟨10.1017/S0031182016001396⟩
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titre
Microbial treatment of water containing the bacteria Enterococcus faecalis and Escherichia coli in microcosm using Artemesia annua plant extract: Hierarchical order of some abiotic factors affecting cell’s cultivability
auteur
O. B. Mobili, C. Lontsi Djimeli, L. M. Moungang, O Allaadhin, A Tamsa Arfao, Joseph Mabingui, Geneviève Bricheux, Moïse Nola, Télesphore Sime-Ngando
article
European Journal of Biotechnology and Bioscience, Gupta Publications, 2016, 4 (9), pp.16-26
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01392643/file/Mobili%20et%20al%2C%202016%20%28Europ%20J%20Biotechnol%20Biosc%29%29.pdf BibTex
titre
Microbial dynamics in industrial blue veined cheeses in different packaging
auteur
P. Duval, C. Chatelard-Chauvin, C. Gayard, E. Rifa, P. Bouchard, S. Hulin, D. Picque, M.C. Montel
article
International Dairy Journal, Elsevier, 2016, 56, pp.198 - 207. ⟨10.1016/j.idairyj.2016.01.024⟩
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titre
New insights into the microbial contribution to the chlorine cycle in aquatic ecosystems
auteur
Eric Dugat-Bony, Pierre Peyret, Corinne Biderre-Petit
article
Lake Pavin, Springer International Publishing, 2016, 978-3-319-39960-7. ⟨10.1007/978-3-319-39961-4_17⟩
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titre
Lake Pavin Paleolimnology and Event Stratigraphy
auteur
Léo Chassiot, Emmanuel Chapron, Yannick Miras, Markus J. Schwab, Patrick Albéric, Aude Beauger, Anne-Lise Develle, Fabien Arnaud, P Lajeunesse, Renata Zocatelli, Sylvain Bernard, Anne-Catherine Lehours, D Jézéquel
article
Lake Pavin, history, geology, biogeochemistry and sedimentology of a deep meromictic maar lake, Springer, pp.381 - 406, 2016, ⟨10.1007/978-3-319-39961-4_23⟩
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https://hal-univ-tlse2.archives-ouvertes.fr/hal-01447131/file/Chapter_23_Chassiot_et_al_cor.pdf BibTex
titre
Long-term dynamics in microbial eukaryotes communities: a palaeolimnological view based on sedimentary DNA
auteur
Éric Capo, Didier Debroas, Fabien Arnaud, Typhaine Guillemot, Vincent Bichet, Laurent Millet, Emilie Gauthier, Charly Massa, Anne-Lise Develle, Cécile Pignol, Franck Lezjerowicz, Isabelle Domaizon
article
Molecular Ecology, Wiley, 2016, 25 (23), pp.5925-5943. ⟨10.1111/mec.13893⟩
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titre
Dynamics of Viral Abundance and Diversity in a Sphagnum-Dominated Peatland: Temporal Fluctuations Prevail Over Habitat
auteur
Flore Ballaud, Alexis Dufresne, Andre-Jean Francez, Jonathan Colombet, Télesphore Sime-Ngando, Achim Quaiser
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 6, pp.1494. ⟨10.3389/fmicb.2015.01494⟩
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2015

titre
Thermodynamics of selenium sorption on alumina and montmorillonite
auteur
Jean-Pierre Morel, Nicolas Marmier, Charlotte Hurel, Nicole Morel-Desrosiers
article
Cogent Chemistry, Taylor & Francis Online, 2015, 1 (1), ⟨10.1080/23312009.2015.1070943⟩
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titre
Renal replacement therapy in adult and pediatric intensive care: Recommendations by an expert panel from the French Intensive Care Society (SRLF) with the French Society of Anesthesia Intensive Care (SFAR) French Group for Pediatric Intensive Care Emergencies (GFRUP) the French Dialysis Society (SFD)
auteur
Christophe Vinsonneau, Emma Allain-Launay, Clarisse Blayau, Michael Darmon, Damien Ducheyron, Theophile Gaillot, Patrick M. Honore, Etienne Javouhey, Thierry Krummel, Annie Lahoche, Serge Letacon, Matthieu Legrand, Mehran Monchi, Christophe Ridel, Rene Robert, Frédérique Schortgen, Bertrand Souweine, Patrick Vaillant, Lionel Velly, David Osman, Ly Van Vong
article
Annals of Intensive Care, SpringerOpen, 2015, 5 (1), pp.58. ⟨10.1186/s13613-015-0093-5⟩
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titre
Etude des interactions hôte-parasite dans le cadre d'infections par des microsporidies, un groupe de champignons parasites intracellulaires obligatoires
auteur
Johan Panek
article
Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2015. Français. ⟨NNT : 2015CLF22618⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01295048/file/PANEK_2015CLF22618.pdf BibTex
titre
Genome Sequence of a Clinical Klebsiella pneumoniae Sequence Type 6 Strain
auteur
Gabriel Carvalho, Jean-Denis Mathias, Cyril Guilhen, A. Iltis, Christiane Forestier, Damien Balestrino
article
Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2015, 3 (6), pp.1616 - 1627. ⟨10.1128/genomeA.01311-15⟩
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titre
Propriétés mécaniques et durabilité des bétons à base de graviers et sables recyclés issus de béton de démolition
auteur
Layachi Berredjem, Nourredine Arabi, Laurent Molez, Raoul Jauberthie
article
Deuxième Conférence Internationale Francophone Nouveaux Matériaux et Durabilité (NoMad 2015) , Nov 2015, Douai, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01366521/file/NoMaD-2015_Berredjem.pdf BibTex
titre
Devenir et impacts d’un « cocktail » d’herbicides sur des groupes fonctionnels microbiens: élaboration de bioindicateurs de perturbations
auteur
Clarisse Mallet, Pierre Joly, Frédérique Bonnemoy, Pascale Besse-Hoggan, - Legeret B., Olivier Crouzet
article
VIIème colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne, Nov 2015, Anglet, France. 2015
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titre
Structural Diversity of Bacterial Communities Associated with Bloom-Forming Freshwater Cyanobacteria Differs According to the Cyanobacterial Genus
auteur
Imen Louati, Noémie Pascault, Didier Debroas, Cécile Bernard, Jean-François Humbert, Julie Leloup
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (11), pp.e0140614. ⟨10.1371/journal.pone.0140614⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01272957/file/journal.pone.0140614.pdf BibTex
titre
Skin antisepsis with chlorhexidine–alcohol versus povidone iodine–alcohol, with and without skin scrubbing, for prevention of intravascular-catheter-related infection (CLEAN): an open-label, multicentre, randomised, controlled, two-by-two factorial trial
auteur
Olivier Mimoz, Jean-Christophe Lucet, Thomas Kerforne, Julien Pascal, Bertrand Souweine, Véronique Goudet, Alain Mercat, Lila Bouadma, Sigismond Lasocki, Serge Alfandari, Arnaud Friggeri, Florent Wallet, Nicolas Allou, Stephane Ruckly, Dorothée Balayn, Alain Lepape, Jean-François Timsit
article
The Lancet, Elsevier, 2015, 386 (10008), pp.2069-2077. ⟨10.1016/S0140-6736(15)00244-5⟩
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BibTex
titre
Antimicrosporidian activity of sulphated polysaccharides from algae and their potential to control honeybee nosemosis
auteur
M. Roussel, A. Villay, F. Delbac, Céline Laroche, P. Michaud, D. Roriz, H. El Alaoui, M. Diogon
article
Carbohydrate Polymers, Elsevier, 2015, 133, ⟨10.1016/j.carbpol.2015.07.022⟩
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BibTex
titre
Is Planktonic Diversity Well Recorded in Sedimentary DNA? Toward the Reconstruction of Past Protistan Diversity
auteur
Eric Capo, Didier Debroas, Fabien Arnaud, Isabelle Domaizon
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2015, 70 (4), pp.865-875. ⟨10.1007/s00248-015-0627-2⟩
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titre
Contrôle climatique sur la sédimentation et la limnologie du lac Pavin (Auvergne) au cours des derniers 7000 ans
auteur
Léo Chassiot, Emmanuel Chapron, Beauger Aude, Yannick Miras, Patrick Albéric, Ledoux G, Patrick Lajeunesse, Schwab M, Anne-Lise Develle, Fabien Arnaud, Anne-Catherine Lehours, Didier Jezequel
article
15e congrès biannuel de l’ASF, Oct 2015, Chambéry, France
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titre
Metagenomic characterization of viral communities in corals: mining biological signal from methodological noise
auteur
Elisha Wood-Charlson, Karen Weynberg, Curtis Suttle, Simon Roux, Madeleine van Oppen
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2015, 17 (10), pp.3440-3449
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titre
Bat aggregation mediates the functional structure of ant assemblages
auteur
Alain Dejean, Sarah Groc, Bruno Herault, Hector Rodriguez-Perez, Axel Touchard, Régis Céréghino, Jacques H.C. Delabie, Bruno Corbara
article
Comptes Rendus Biologies, Elsevier Masson, 2015, 338 (10), pp.688-695
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BibTex
titre
European surveillance for enterovirus D68 during the emerging North-American outbreak in 2014
auteur
Randy Poelman, Isabelle Schuffenecker, Coretta van Leer-Buter, Laurence Josset, Hubert G.M. Niesters, Bruno Lina, Escv-Ecdc Ev-D68 Group Mirand A
article
Journal of Clinical Virology, Elsevier, 2015, 71, pp.1 - 9. ⟨10.1016/j.jcv.2015.07.296⟩
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titre
Honeybee Conservation centers in Western Europe: an innovative strategy using sustainable beekeeping to reduce honeybee decline
auteur
Miguel Vilas Boas, Maria Alice Pinto, Catia Neves, Lionel Garnery, Hélène Legout, Sylvie Houte, Jean Francois Odoux, Andone Estonba, Irati Miguel, Iratxe Montes, Noël Mallet, Claude Grenier, Jean-Charles Labat, Luc Champin, Jonathan Colombet, Samuel Guyot, Télesphore Sime-Ngando, Frédéric Delbac, Iris Eouzan, David G. Biron
article
44. Apimondia congress, Sep 2015, Daejon, South Korea. 2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01216261/file/BBP012_Miguel%20VILAS%20BOAS_BEEHOPE_%7B56975ED9-684F-4510-AB9D-DCFD4D0D82C4%7D.pdf BibTex
titre
Pyrosequencing analysis of bacterial diversity in dental unit waterlines.
auteur
Damien Costa, Anne Mercier, Kevin Gravouil, Jérôme Lesobre, Vincent Delafont, Anne Bousseau, Julien Verdon, Christine Imbert
article
Water Research, IWA Publishing, 2015, 81, pp.223-31. ⟨10.1016/j.watres.2015.05.065⟩
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BibTex
titre
Protein expression parallels thermal tolerance and ecologic changes in the diversification of a diving beetle species complex
auteur
A Hidalgo-Galiana, M Monge, D G Biron, F Canals, I Ribera, A Cieslak
article
Heredity, Nature Publishing Group, 2015, 116 (1), pp.114 - 123. ⟨10.1038/hdy.2015.80⟩
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Effects of antibiotics on biofilm and unattached cells of a clinical Staphylococcus aureus isolate from bone and joint infection
auteur
Claire Marquès, Jason Tasse, Anne Pracros, Valérie Collin, Christine Franceschi, Frédéric Laurent, Sonia Chatellier, Christiane Forestier
article
Journal of Medical Microbiology, Society for General Microbiology, 2015, 64 (9), pp.1021-1026. ⟨10.1099/jmm.0.000125⟩
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Devenir et impacts d'un « cocktail » d'herbicides sur des groupes fonctionnels microbiens : élaboration de bioindicateurs de perturbations. DevImCocMic
auteur
Clarisse Mallet, Pierre Joly, Frédérique Bonnemoy, Pascale Besse-Hoggan, Fanny Perrière, Nathalie Cheviron, Christelle Marrauld, Olivier Crouzet
article
Séminaire EC2CO de restitution des projets et de prospective ECODYN, Sep 2015, Paris, France
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The Prediction and Validation of Small CDSs Expand the Gene Repertoire of the Smallest Known Eukaryotic Genomes
auteur
Abdel Belkorchia, Cyrielle Gasc, Valérie Polonais, Nicolas Parisot, Nicolas Gallois, Céline Ribière, Emmanuelle Lerat, Christine Gaspin, Jean-François Pombert, Pierre Peyret, Eric Peyretaillade, Cynthia Gibas
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (9), pp.1-12. ⟨10.1371/journal.pone.0139075⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01247479/file/2015_Belkorchia_Plos_One_1.pdf BibTex
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Microbial players involved in the decline of filamentous and colonial cyanobacterial blooms with a focus on fungal parasitism
auteur
Mélanie Gerphagnon, Deborah Macarthur, Delphine Latour, Claire Gachon, Floris van Ogtrop, Frank Gleason, Télesphore Sime-Ngando
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2015, 17 (8), pp.2573-2587
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Systematic and Evolution of Microorganisms: General Concepts
auteur
Charles-Francois Boudouresque, Pierre Caumette, Jean-Claude Bertrand, Philippe Normand, Télesphore Sime-Ngando
article
Jean-Claude Bertrand; Pierre Caumette; Philippe Lebaron; Robert Matheron; Philippe Normand; Télesphore Sime-Ngando. Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.107-144, 2015, 978-94-017-9118-2. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_5⟩
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titre
HIV-1 subtype B-infected MSM may have driven the spread of transmitted resistant strains in France in 2007–12: impact on susceptibility to first-line strategies
auteur
Pierre Frange, Pierre Assoumou, Diane Descamps, Antoine Chéret, Cécile Goujard, Laurent Tran, Marine Gousset, Véronique Avettand-Fenoël, Laurence Bocket, Samira Tran, Jérôme Guinard, Pierre Morand-Joubert, Florence Nicot, Jean-Christophe Plantier, Sylvie Rogez, Pierre Wirden, Christine Rouzioux, Laurence Meyer, Marie-Laure Chaix, S. Abel, B. Abraham, A. Antoniotti, R. Armero, B. Audhuy, H. Aumaitre, G. Beaucaire, G. Beck-Wirth, J.L. Berger, L. Bernard, C. Beuscart, L. Bodard, O. Bouchaud, F. Boue, J.-P. Cabane, A. Cabié, H. Champagne, C. Cheneau, J.-M. Chennebault, A. Cheret, B. Christian, A. Compagnucci, V. Daneluzzi, Y. Debab, P. Dellamonica, F. Delfraissy, A. Devidas, G. Diab, J. Doll, C. Drobacheff-Thebaut, A. Durel, L. Esnault, L. Faba, E. Froguel, D. Garipuy, V. Garrait, L. Geffray, C. Genet, P. Genet, L. Gérard, J. Ghosn, J. Girard, Pascal Girard, C. Godin-Collet, P. Hochedez, B. Hoen, D. Houlbert, C. Jacomet, V. Jeantils, K. Jidar, E. Klement, A. Lafeuillade, V. Launay, A. Leprêtre, Y. Levy, D. Makhloufi, D. Malbec, B. Martha, T. May, D. Merrien, P. Miailhes, C. Miodovski, P. Morlat, E. Mortier, D. Neau, M. Obadia, O. Patey, L. Pellegrin, V. Perronne, P. Philibert, G. Pialoux, G. Pichancourt, L. Piroth, Y. Poinsignon, I. Poizot-Martin, T. Prazuck, V. Prendki, F. Du Clary, D. Quinsat, A. Regnier, J. Reynes, E. Rosenthal, E. Rouveix, D. Salmon, F. Salanville, L. Schmitt, A. Simon-Coutellier, A. Sotto, F. Souala, A. Stein, F. Timsit, P. de Truchis, A. Uludag, O. Vaillant, R. Verdon, A. Verlesch-Langlin, J.-P. Viard, D. Vittecoq, L. Weiss, P. Yéni, D. Zucman, C. Allavena, T. Allegre, I. Amri, B. Autran, C. Bacchus, C. Blanc, S. Bonne, B. Bonne, S. Bouchez, C. Charlier, H. Consigny, C. Duvivier, E. Fourn, F. Guiroy, T. Huleux, C. Katlama, C. Lascoux, A. Leplatois, T. Lyavanc, J.-M. Molina, A. Naqvi, G. Nembot, Y. Quertainmont, F. Raffi, A. Samri, L. Schneider, S. Seang, B. Seksik, M. Shoai-Tehrani, L. Slama, A. Valentin, Y. Yazdanpanah, C. Alloui, C. Amiel, P. André, E. André, G. Anies, F. Barin, P. Bellecave, D. Bettinger, M. Bouvier-Alias, F. Brun-Vézinet, A. Calmy, V. Calvez, W. Caveng, A. Chaillon, S. Chapalay, C. Charpentier, D. Costagliola, J. Cottalorda, C. Delamare, C. Delaugerre, J. Dina, G. Santos, V. Ferre, P. Flandre, H. Fleury, S. Fourati, C. Gaille, G. Giraudeau, A. Guigon, S. Haim-Boukobza, E. Lagier, H. Le Guillou-Guillemette, C. Henquell, Jacques Izopet, Lambert Lambert-Niclot, M. Leroux, A. Maillard, I. Malet, Marc Marcelin, S. Marque-Juillet, B. Masquelier, A. Mirand, P. Morand, B Montes, L. Mouna, C. Noel, C. Pallier, G. Peytavin, P. Pinson-Recordon, J. Poveda, S. Raymond, S. Reigadas, A. Roques, A. de Rougemont, C. Roussel, P. Schmitt, V. Schneider, E. Schvoerer, A. Signori-Schmuck, C. Soulié, C. Tamalet, C. Tardy, A. Trabaud, A. Vabret, S. Vallet, S. Yerly
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2015, 70 (7), pp.2084-2089. ⟨10.1093/jac/dkv049⟩
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Differential permissivity of human cerebrovascular endothelial cells to enterovirus infection and specificities of serotype EV-A71 in crossing an in vitro model of the human blood–brain barrier
auteur
Romain Volle, Christine Archimbaud, Pierre-Olivier Couraud, Ignacio Romero, Babette Weksler, Audrey Mirand, Bruno Pereira, Cécile Henquell, Hélène Peigue-Lafeuille, Jean-Luc Bailly
article
Journal of General Virology, Microbiology Society, 2015, 96 (7), pp.1682 - 1695. ⟨10.1099/vir.0.000103⟩
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Cross-talk in host–parasite associations: What do past and recent proteomics approaches tell us?
auteur
Chérif Chetouhi, Johan Panek, Ludovic Bonhomme, Hicham Elalaoui, Catherine Texier, Thierry Langin, Charissa de Bekker, Serge Urbach, Edith Demettre, Dorothée Missé, Philippe Holzmuller, David P. Hughes, Andreas Zanzoni, Christine Brun, David G. Biron
article
Infection, Genetics and Evolution, Elsevier, 2015, 33, pp.84 - 94. ⟨10.1016/j.meegid.2015.04.015⟩
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The hydrological context determines the beta-diversity of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria in European Arctic seas but does not favor endemism
auteur
Anne-Catherine Lehours, Christian Jeanthon
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6, pp.638. ⟨10.3389/fmicb.2015.00638⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01218500/file/fmicb-06-00638.pdf BibTex
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Impact of intestinal dysbiosis on mouse models of colonic hypersensitivity
auteur
F. Carvalho, A. Lashermes, S. Miquel, Rebeca Martin Rosique, A. Gelor, N. Barnich, A. Eschalier, D. Ardid, Muriel Thomas, Philippe Langella
article
NeuroGASTRO 2015, Jun 2015, Istanbul, Turkey. John Wiley and Sons, Neurogastroenterology and Motility, 27 (Suppl. S2), 2015, Neurogastroenterology and Motility
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Draft genome sequence of the intestinal parasite Blastocystis subtype 4-isolate WR1
auteur
Ivan Wawrzyniak, Damien Courtine, Marwan Osman, Christine Hubans-Pierlot, Amandine Cian, Céline Nourrisson, Magali Chabe, Philippe Poirier, Aldert Bart, Valérie Polonais, Pilar Delgado-Viscogliosi, Hicham El Alaoui, Abdel Belkorchia, Tom van Gool, Kevin S.W. Tan, Stéphanie Ferreira, Eric Viscogliosi, Frédéric Delbac
article
Genomics-based Drug Data Report, Prous Science Publishers, 2015, 4, ⟨10.1016/j.gdata.2015.01.009⟩
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titre
How territoriality and host-tree taxa determine the structure of ant mosaics
auteur
Alain Dejean, Suzanne Ryder, Barry Bolton, Arthur Compin, Maurice Leponce, Frédéric Azemar, Régis Céréghino, Jérôme Orivel, Bruno Corbara
article
The Science of Nature Naturwissenschaften, Springer Verlag, 2015, 102 (5-6)
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titre
Les communautés microbiennes photosynthétiques (cyanobactéries et micro-algues) comme bioindicateurs de stress phytosanitaires dans les sols agricoles
auteur
Olivier Crouzet, Sylvie Nelieu, Christelle Marrauld, Ghislaine Delarue, Frédéric Rimet, Annette Berard, Clarisse Mallet
article
45e congrès du Groupe Français des Pesticides, May 2015, Versailles, France. 2015
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titre
Les communautés micro-algales et cyanobactériennes comme bioindicateurs de stress phytosanitaires dans les sols agricoles
auteur
Olivier Crouzet, Sylvie Nelieu, Christelle Marrauld, Ghislaine Delarue, Frédéric Rimet, Annette Berard, Clarisse Mallet
article
45e Congrès du Groupe Français des Pesticides Devenir et impact des pesticides : verrous à lever et nouveaux enjeux, May 2015, Versailles, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01603887/file/2016-Crouzet-GFP_1.pdf BibTex
titre
Contribution à l'amélioration du comportement des routes par l'utilisation de laitier
auteur
Hocine Hadidane, Hocine Oucief, Mouloud Merzoud, Zina Djebbari
article
Rencontres Universitaires de Génie Civil, May 2015, Bayonne, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01167724/file/Contribution_a_l_amelioration_du_comportement_des_routes_par_l_utilisation_de_laitier.pdf BibTex
titre
Modélisation d'un portique en situation d'incendie
auteur
Nadia Otmani-Benmehidi
article
Rencontres Universitaires de Génie Civil, May 2015, Bayonne, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01167756/file/augc2015_paper1_modif_OTMANI.pdf BibTex
titre
Contribution a l'amélioration du comportement de la couche de roulement par l'utilisation des polymères
auteur
Hocine Hadidane, Hocine Oucief, Mouloud Merzoud
article
Rencontres Universitaires de Génie Civil, May 2015, Bayonne, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01167620/file/polymers.pdf BibTex
titre
Failure of Empirical Systemic Antifungal Therapy in Mechanically Ventilated Critically Ill Patients
auteur
Sébastien Bailly, Lila Bouadma, Élie Azoulay, Maité Garrouste Orgeas, Christophe Adrie, Bertrand Souweine, Carole Schwebel, Danièle Maubon, Rebecca Hamidfar-Roy, Michael Darmon, Michel Wolff, Muriel Cornet, Jean-François Timsit
article
American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, American Thoracic Society, 2015, 191 (10), pp.1139 - 1146. ⟨10.1164/rccm.201409-1701OC⟩
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titre
Editorial: Roles and mechanisms of parasitism in aquatic microbial communities
auteur
Télesphore Sime-Ngando, Kevin Lafferty, David Biron
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6
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BibTex
titre
The MAST® D68C test: an interesting tool for detecting extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae
auteur
C. Nourrisson, R. N. Tan, C. Hennequin, L. Gibold, R. Bonnet, F. Robin
article
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2015, 34 (5), pp.975-983. ⟨10.1007/s10096-014-2305-6⟩
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titre
Diversity and comparative genomics of Microviridae in Sphagnum-dominated peatlands
auteur
Achim Quaiser, Alexis Dufresne, Flore Ballaud, Simon Roux, Yvan Zivanovic, Jonathan Colombet, Télesphore Sime-Ngando, Andre-Jean Francez
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6, pp.375. ⟨10.3389/fmicb.2015.00375⟩
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titre
Age of Transfused Blood in Critically Ill Adults
auteur
Jacques Lacroix, Paul C. Hébert, Dean A. Fergusson, Alan Tinmouth, Deborah J. Cook, John C. Marshall, Lucy Clayton, Lauralyn Mcintyre, Jeannie Callum, Alexis F. Turgeon, Morris A. Blajchman, Timothy S. Walsh, Simon J. Stanworth, Helen Campbell, Gilles Capellier, Pierre Tiberghien, Laurent Bardiaux, Leo van de Watering, Nardo J. van der Meer, Elham Sabri, Dong Vo, Canadian Critical Care Trials Group Souweine
article
New England Journal of Medicine, Massachusetts Medical Society, 2015, 372 (15), pp.1410 - 1418. ⟨10.1056/NEJMoa1500704⟩
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BibTex
titre
Reciprocal protection from natural enemies in an ant-wasp association
auteur
Roger Le Guen, Bruno Corbara, Vivien Rossi, Frédéric Azemar, Alain Dejean
article
Comptes Rendus Biologies, Elsevier Masson, 2015, 338 (4), pp.255-259
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titre
Traits allowing some ant species to nest syntopically with the fire ant Solenopsis saevissima in its native range
auteur
Alain Dejean, Bruno Corbara, Régis Céréghino, Maurice Leponce, Olivier Roux, Vivien Rossi, Jacques Delabie, Arthur Compin
article
Insect Science, Wiley, 2015, 22 (2), pp.289-294
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titre
Acute flaccid myelitis and enteroviruses: an ongoing story
auteur
Audrey Mirand, Hélène Peigue-Lafeuille
article
The Lancet, Elsevier, 2015, 385 (9978), pp.1601 - 1602. ⟨10.1016/S0140-6736(15)60121-0⟩
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titre
Seasonal variations of marine protist community structure based on taxon-specific traits using the eastern English Channel as a model coastal system
auteur
Savvas Genitsaris, Sébastien Monchy, Eric Viscogliosi, Télesphore Sime-Ngando, Stéphanie Ferreira, Urania Christaki
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2015, 91 (5), ⟨10.1093/femsec/fiv034⟩
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titre
In Silico Analysis of Usher Encoding Genes in Klebsiella pneumoniae and Characterization of Their Role in Adhesion and Colonization
auteur
Fida Khater, Damien Balestrino, Nicolas Charbonnel, Jean François Dufayard, Sylvain Brisse, Christiane Forestier
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (3), ⟨10.1371/journal.pone.0116215⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01393629/file/journal-pone-0116215.pdf BibTex
titre
Evidence for an active rare biosphere within freshwater protists community
auteur
Didier Debroas, Mylène Hugoni, Isabelle Domaizon
article
Molecular Ecology Resources, Wiley/Blackwell, 2015, 24 (6), pp.1236-1247. ⟨10.1111/mec.13116⟩
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titre
Mini-P-gp and P-gp Co-Expression in Brown Trout Erythrocytes: A Prospective Blood Biomarker of Aquatic Pollution
auteur
Emeline Valton, Christian Amblard, François Desmolles, Bruno Combourieu, Frédérique Penault-Llorca, Mahchid Bamdad
article
Diagnostics, MDPI, 2015, 5 (1), pp.10-26
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BibTex
titre
Genomic characteristics and environmental distributions of the uncultivated Far-T4 phages
auteur
Simon Roux, François Enault, Viviane Ravet, Olivier Pereira, Matthew B. Sullivan
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6, pp.199. ⟨10.3389/fmicb.2015.00199⟩
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BibTex
titre
Genetic diversity along the life cycle of the cyanobacterium M icrocystis : highlight on the complexity of benthic and planktonic interactions
auteur
Marion Sabart, Benjamin Misson, Marlène Jobard, Gisèle Bronner, Florence Donnadieu-Bernard, Emilie Duffaud, Marie-José Salençon, Christian Amblard, Delphine Latour
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2015, 17 (3), pp.901 - 911. ⟨10.1111/1462-2920.12555⟩
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BibTex
titre
Recurrence of cyanobacterial blooms since 6 thousand years in the French Lake Aydat. Aquatic Sciences: global and regional perspectives
auteur
Marion Sabart, B. Legrand, Yannick Miras, Marlène Lavrieux, Delphine Latour
article
Aquatic Sciences: global and regional perspectives. North Meets South, Association for Sciences of Limnology and Oceanography, Feb 2015, Granada, Spain
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BibTex
titre
Involvement of type VI secretion systems in virulence of adherent-invasive Escherichia coli isolated from patients with Crohn's disease
auteur
Sébastien Massier, Sylvie Miquel, Nicolas Dreux, Allison Agus, S. Bouhours, Jérémy Denizot, Arlette Darfeuille-Michaud, Nicolas Barnich
article
10. Congress of ECCO. Inflammatory Bowel Diseases, ECCO European Crohn's and Colitis Organization., Feb 2015, Barcelona, Spain
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titre
Aeromonas: a book review
auteur
Telesphore Sime-Ngando
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6
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BibTex
titre
Aquatic hyphomycetes: a potential source of polyunsaturated fatty acids in detritus-based stream food webs
auteur
J. Arce Funck, A. Bec, F. Perrière, V. Felten, M. Danger
article
Fungal Ecology, Elsevier, 2015, 13, pp.205-210. ⟨10.1016/j.funeco.2014.09.004⟩
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BibTex
titre
Viral and grazer regulation of prokaryotic growth efficiency in temperate freshwater pelagic environments
auteur
A.S. Pradeep Ram, Jonathan Colombet, Fanny Perrière, Antoine Thouvenot, Télesphore Sime-Ngando
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2015, 91 (2), pp.1-12
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BibTex
titre
Ordering and surface segregation in Co1−cPtc nanoparticles: A theoretical study from surface alloys to nanoalloys
auteur
A. Lopes, G. Tréglia, C. Mottet, B. Legrand
article
Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics (1998-2015), American Physical Society, 2015, 91, pp.035407
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BibTex
titre
Microbiomes, plausible players or not in alteration of host behavior
auteur
David Georges Biron, Ludovic Bonhomme, Marianne Coulon, Oyvind Overli
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 5, pp.25628614. ⟨10.3389/fmicb.2014.00775⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01112568/file/2015_Biron_Frontiers%20in%20Microbiology_1.pdf BibTex
titre
Evaluation of real-time RT-PCR Rhino&EV/Cc r-gene® (bioMérieux) kit versions 1 and 2 for rhinovirus detection
auteur
Amélie Brebion, Audrey Mirand, Christel Regagnon, Christine Archimbaud, Martine Chambon, Hélène Peigue-Lafeuille, Cécile Henquell
article
Journal of Clinical Virology, Elsevier, 2015, 62, pp.110 - 113. ⟨10.1016/j.jcv.2014.10.019⟩
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BibTex
titre
Effects of nutrients and warming on Planktothrix dynamics and diversity: a palaeolimnological view based on sedimentary DNA and RNA
auteur
Olga Savichtcheva, Didier Debroas, Marie Elodie Perga, Fabien Arnaud, Clement Villar, Emilie Lyautey, Amy Kirkham, Cècile Chardon, Benjamin Alric, Isabelle Domaizon
article
Freshwater Biology, Wiley, 2015, 60 (1), pp.31-49. ⟨10.1111/fwb.12465⟩
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titre
Responses of Limagne "Clay/Organic matter-rich" soil microbial communities to realistic formulated herbicide mixtures, including S-metolachlor, mesotrione and nicosulfuron
auteur
Pierre Joly, Frédérique Bonnemoy, Pascale Besse-Hoggan, Fanny Perrière, Olivier Crouzet, Nathalie Cheviron, Clarisse Mallet
article
Water, Air, and Soil Pollution, Springer Verlag, 2015, 226 (12), 413, 15 p. ⟨10.1007/s11270-015-2683-0⟩
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BibTex
titre
Phase II study of bendamustine, bortezomib and dexamethasone as second-line treatment for elderly patients with multiple myeloma: the Intergroupe Francophone du Myelome 2009-01 trial
auteur
P. Rodon, C. Hulin, B. Pegourie, M. Tiab, B. Anglaret, L. Benboubker, H. Jardel, O. Decaux, B. Kolb, M. Roussel, L. Garderet, X. Leleu, O. Fitoussi, C. Chaleteix, P. Casassus, P. Lenain, B. Royer, A. Banos, R. Benramdane, P. Cony-Makhoul, M. Dib, J. Fontan, A.-M. Stoppa, C. Traulle, J.-P. Vilque, M.-O. Petillon, C. Mathiot, T. Dejoie, H. Avet-Loiseau, P. Moreau
article
Haematologica, Ferrata Storti Foundation, 2015, 100 (2), pp.e56-9. ⟨10.3324/haematol.2014.110890⟩
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BibTex
titre
Open lung biopsy in nonresolving ARDS frequently identifies diffuse alveolar damage regardless of the severity stage and may have implications for patient management
auteur
Claude Guerin, Frédérique Bayle, Véronique Leray, Sophie Debord, Alina Stoian, Hodane Yonis, Jean-Baptiste Roudaut, Gael Bourdin, Mojgan Devouassoux-Shisheboran, Elodie Bucher, Louis Ayzac, Sylvie Lantuejoul, Carole Philipponnet, Jean Louis Kemeny, Bertrand Souweine, Jean-Christophe Richard
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2015, 41 (2), pp.222 - 230. ⟨10.1007/s00134-014-3583-2⟩
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BibTex
titre
Enterovirus A71 Subgenotype B5, France, 2013
auteur
Audrey Mirand, Lucie Molet, Chervin Hassel, Hélène Peigue-Lafeuille, Flore Rozenberg, Jean-Luc Bailly, Cécile Henquell
article
Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2015, 21 (4), pp.707-709. ⟨10.3201/eid2104.141093⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01885353/file/14-1093.pdf BibTex
titre
La biodiversité en Auvergne
auteur
Christian Amblard, Pascal Carrère, Philippe Cochet, Boris Fumanal, Stéphane Herbette, Olivier Villepoux
article
Alliance Universitaire d'Auvergne, Société des amis des Universités, 615-616, 466 p., 2015, Revue d'Auvergne
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BibTex
titre
Microbial Food Webs in Aquatic and Terrestrial Ecosystems
auteur
Behzad Mostajir, Christian Amblard, Evelyne Buffan-Dubau, Rutger de Wit, Robert Lensi, Telesphore Sime-Ngando
article
Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, pp.485-509, 2015, 978-94-017-9117-5
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BibTex
titre
Ventilator-Associated Events: Prevalence, Outcome, and Relationship With Ventilator-Associated Pneumonia.
auteur
Lila Bouadma, Romain Sonneville, Maité Garrouste-Orgeas, Michael Darmon, Bertrand Souweine, Guillaume Voiriot, Hatem Kallel, Carole Schwebel, Dany Goldgran-Toledano, Anne-Sylvie Dumenil, Laurent Argaud, Stéphane Ruckly, Samir Jamali, Benjamin Planquette, Christophe Adrie, Jean-Christophe Lucet, Elie Azoulay, Jean-François Timsit
article
Critical Care Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2015, 43 (9), pp.1798 - 1806. ⟨10.1097/CCM.0000000000001091⟩
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titre
Ethanol Lock and Risk of Hemodialysis Catheter Infection in Critically Ill Patients. A Randomized Controlled Trial
auteur
Bertrand Souweine, Alexandre Lautrette, Didier Gruson, Emmanuel Canet, Kada Klouche, Laurent Argaud, Julien Bohe, Maïté Garrouste-Orgeas, Christophe Mariat, François Vincent, Sophie Cayot, Olivier Cointault, Alain Lepape, Dominique Guelon, Michael Darmon, Aurélien Vesin, Nicolas Caillot, Carole Schwebel, Alexandre Boyer, Elie Azoulay, Lila Bouadma, Jean-François Timsit
article
American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, American Thoracic Society, 2015, 191 (9), pp.1024 - 1032. ⟨10.1164/rccm.201408-1431OC⟩
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BibTex
titre
Levels of intracellular HIV-DNA in patients with suppressive antiretroviral therapy
auteur
Lise Cuzin, Pascal Pugliese, Karine Sandres-Sauné, Clotilde Allavena, Jade Ghosn, Jacqueline Cottalorda, Audrey Rodallec, Marie Laure Chaix, Samira Fafi-Kremer, Cathia Soulié, Marlène Ouka, Charlotte Charpentier, Laurence Bocket, Audrey Mirand, Marguerite Guiguet
article
AIDS, Lippincott, Williams & Wilkins, 2015, 29 (13), pp.1665 - 1671. ⟨10.1097/QAD.0000000000000723⟩
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titre
Hand, Foot and Mouth Disease and Kingella kingae Infections
auteur
Nawal El Houmami, Audrey Mirand, Gregory Dubourg, Derek Hung, Philippe Minodier, Jean-Luc Jouve, Rémi Charrel, Didier Raoult, Pierre-Edouard Fournier
article
Pediatric Infectious Disease Journal, Lippincott, Williams & Wilkins, 2015, 34 (5), pp.547 - 548. ⟨10.1097/INF.0000000000000607⟩
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titre
Vingt ans d'études sur les fourmis en Guyane
auteur
Alex Salas-Lopez, Bruno Corbara, Alain Dejean, Jérôme Orivel
article
Nature guyanaise - 50 ans de progrès et de souvenirs, Orphie, 376 p., 2015, 979-1-02980-043-6
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01306361/file/2015_Vingt_ans_etudes_fourmis_1.pdf BibTex
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Temperature: Diet Interactions Affect Survival through Foraging Behavior in a Bromeliad-Dwelling Predator
auteur
Olivier Dézerald, Régis Céréghino, Bruno Corbara, Alain Dejean, Céline Leroy
article
Biotropica, Wiley, 2015, 47 (5), pp.569-578. ⟨10.1111/btp.12249⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02084254/file/D%C3%A9zerald%20et%20al.%202015.pdf BibTex
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Environmental Microbiology: fundamentals and Applications
auteur
Jean-Claude Bertrand, Pierre Caumette, Philippe Lebaron, Robert Matheron, Philippe Normand, Télesphore Sime-Ngando
article
Springer, 2015, 978-94-017-9117-5. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2⟩
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titre
Synergistic effect of light, pH and Artemisia annua extract on Enterococcus faecalis in aquatic microcosms
auteur
O. B. Mobili, C. Lontsi Djimeli, A. Tamsa Arfao, Mireille Ebiane Nougang, O. Allahdin, O. V. Noah Ewoti, Joseph Mabingui, Geneviève Bricheux, T Sime-Ngando, Moïse Nola
article
International Journal of Applied Microbiology and Biotechnology Research, Blue Pen Journals, 2015, 7 (3), pp.62 - 72
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01983759/file/Mobili_et_al.pdf BibTex
titre
Transmission patterns of human enterovirus 71 to, from and among European countries, 2003 to 2013
auteur
Chervin Hassel, Audrey Mirand, Alexander Lukashev, Elena Terletskaialadwig, Agnes Farkas, Isabelle Schuffenecker, Sabine Diedrich, Hartwig Huemer, Christine Archimbaud, Hélène Peigue-Lafeuille, Cécile Henquell, Jean-Luc Bailly
article
Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2015, 20 (34), ⟨10.2807/1560-7917.es.2015.20.34.30005⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01885350/file/eurosurv-20-30005-1.pdf BibTex
titre
Assessment of the potential effect of some streams properties on the isolated Aeromonas hydrophila strains susceptibility against some β-Lactams and Sulfamids
auteur
J. Signe Mbiada, C. Lontsi Djimeli, A. Manouore Njoya, J. S. Eheth, S. Tchakonté, A. Tamsa Arfao, H. Ateba Bessa, Geneviève Bricheux, M. Nola, T. Sime-Ngando
article
Research in Biotechnology, 2015, 6 (5), pp.33-44
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01392607/file/458-1716-1-PB.pdf BibTex
titre
Sequence Variation in Amplification Target Genes and Standards Influences Interlaboratory Comparison of BK Virus DNA Load Measurement
auteur
Morgane Solis, Mariam Meddeb, Charlotte Sueur, Pilar Domingo-Calap, Eric Soulier, Angeline Chabaud, Peggy Perrin, Bruno Moulin, Seiamak Bahram, Francoise Stoll-Keller, Sophie Caillard, Heidi Barth, Samira Fafi-Kremer, French Bkv Group Mirand A
article
Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2015, 53 (12), pp.3842-3852. ⟨10.1128/jcm.02145-15⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01885363/file/3842.full.pdf BibTex
titre
Enterovirus Migration Patterns between France and Tunisia
auteur
Ines Othman, Audrey Mirand, Ichrak Slama, Maha Mastouri, Hélène Peigue-Lafeuille, Mahjoub Aouni, Jean-Luc Bailly
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (12), pp.0145674. ⟨10.1371/journal.pone.0145674⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01885357/file/journal.pone.0145674.PDF BibTex
titre
VirSorter: mining viral signal from microbial genomic data.
auteur
Simon Roux, Francois Enault, Bonnie L Hurwitz, Matthew B Sullivan
article
PeerJ, PeerJ, 2015, 3, pp.e985
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titre
Trans-generational Immune Priming Protects the Eggs Only against Gram-Positive Bacteria in the Mealworm Beetle
auteur
Aurore Dubuffet, Caroline Zanchi, Gwendoline Boutet, Jérôme Moreau, Maria Teixeira, Yannick Moret
article
PLoS Pathogens, Public Library of Science, 2015, 11 (10), pp.e1005178. ⟨10.1371/journal.ppat.1005178⟩
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https://hal.uca.fr/hal-01588049/file/journal.ppat.1005178.PDF BibTex
titre
Abundance Dynamic of Vibrio Cells Associated with Freshwater Shrimps Atyidae (Crustacea-Decapoda) in the Coastal Surface Waters of Cameroon (Central Africa): Assessment of the Role of some Environmental Factors
auteur
E Koji, C Lontsi Djimeli, A Tamsa Arfao, V Noah Ewoti, S TchakontÉ, Geneviève Bricheux, M Nola, T Sime-Ngando
article
International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences, Krishna Institute of Science, 2015, 4 (6), pp.358-378
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titre
Impact of Rainfall and Some Water Abiotic Factors on the Abundance Dynamic of Vibrio and Aeromonas Adhered to Copepods Surface in Some Coastal Streams and Rivers in Cameroon (Central Africa)
auteur
E. Koji, A. Tamsa Arfao, C. Lontsi Djimeli, O.V. Noah Ewoti, M.E. Nougang, Geneviève Bricheux, M. Nola, T. Sime-Ngando
article
International Journal of Research Studies in Biosciences, Academicians research center, 2015, 3 (9), pp.11-21
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01392567/file/3.pdf BibTex
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Soil physicochemical parameters affecting abundance and distribution of Dicoelophrya nkoldaensis (ciliophora : radiophryidae) living in the gut of earthworms (Annelida : glossoscolecidae) collected in Bambui (nord-west Cameroon)
auteur
Z Fokam, Pa Nana, P Ngassam, Geneviève Bricheux, B Vigues, P Bouchard, T Sime-Ngando
article
International Journal of Current Research, T. Manikandan, 2015, 7 (6), pp.17164-17173
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titre
Viruses and bacteria microfauna of the soil and the digestive tract of earthworms (Oligochaetes annelids) of Cameroon: highlighting, quantification and importance
auteur
Pa Nana, Z Fokam, Geneviève Bricheux, K Moche, J Colombet, P Ngassam, T Sime-Ngando
article
International Journal of Biosciences, International Network for Natural Sciences, 2015, 6 (1), pp.252-260
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titre
Potential roles for recently discovered chytrid parasites in the dynamics of harmful algal blooms
auteur
Frank H. Gleason, Thomas G. Jephcott, Frithjof C. Kuepper, Mélanie Gerphagnon, Télesphore Sime-Ngando, Sergey A. Karpov, Laure Guillou, Floris F. van Ogtrop
article
Fungal Biology Reviews, Elsevier, 2015, 29 (1), pp.20-33. ⟨10.1016/j.fbr.2015.03.002⟩
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titre
Morphological characterization of two new species of Dicontophrya (Ciliophora: Astomatia: Contophryidae) commensal of earthworms (Oligochaeta: Annelida) of Ebebda and Nkolbikogo (Cameroon)
auteur
Z Fokam, Pa Nana, P Ngassam, Geneviève Bricheux, P Bouchard, B Vigues, T Sime-Ngando
article
International Journal of Biosciences, International Network for Natural Sciences, 2015, 7, pp.49-57
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titre
Influence of soil physicochemical parameters on the abundance of Paracoelophrya polymorphus (Ciliophora: Radiophryidae) commensal of earthworms (Annelida: Glossoscolecidae) collected in Bambui (NorthWest Cameroon)
auteur
Zéphyrin Fokam, Paul Alain Nana, Karine Moche, Geneviève Bricheux, Philippe Bouchard, Pierre Ngassam, Télesphore Sime-Ngando
article
Journal of Biodiversity and Environmental Sciences, 2015, 6 (2), pp.376-389. ⟨10.1.1.682.4015⟩
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titre
High-frequency percussive ventilation as a rescue therapy for ARDS patients under ECMO: About a case
auteur
Raiko Blondonnet, Jugurtha Aliane, Thomas Godet, Bertrand Souweine, Jean-Michel Constantin
article
Anaesthesia Critical Care & Pain Medicine, Elsevier Masson, 2015, 34 (2), pp.105 - 107. ⟨10.1016/j.accpm.2015.02.003⟩
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titre
Thermodynamics of selenium sorption on alumina and montmorillonite
auteur
Jean-Pierre Morel, Nicolas Marmier, Charlotte Hurel, Nicole Morel-Desrosiers
article
Cogent Chemistry, Taylor & Francis Online, 2015, 1, pp.1070943
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titre
Impact of early nutrition and feeding route on outcomes of mechanically ventilated patients with shock: a post hoc marginal structural model study
auteur
Jean Reignier, Michael Darmon, Romain Sonneville, Anne-Laure Borel, Maité Garrouste-Orgeas, Stéphane Ruckly, Bertrand Souweine, Anne-Sylvie Dumenil, Hakim Haouache, Christophe Adrie, Laurent Laurent, Lilia Soufir, Guillaume Marcotte, Virginie Laurent, Dany Goldgran-Toledano, Christophe Clec’h, Carole Schwebel, Elie Azoulay, Jean-François Timsit
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2015, 41 (5), pp.875 - 886. ⟨10.1007/s00134-015-3730-4⟩
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titre
Respective impact of no escalation of treatment, withholding and withdrawal of life-sustaining treatment on ICU patients’ prognosis: a multicenter study of the Outcomerea Research Group
auteur
Alexandre Lautrette, Maïté Garrouste-Orgeas, Bertrand Bertrand, Dany Goldgran-Toledano, Samir Jamali, Virginie Laurent, Laurent Argaud, Carole Schwebel, Bruno Mourvillier, Michaël Darmon, Stéphane Ruckly, Anne-Sylvie Dumenil, Virginie Lemiale, Bertrand Souweine, Jean-François Timsit
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2015, 41 (10), pp.1763 - 1772. ⟨10.1007/s00134-015-3944-5⟩
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titre
Photoactive TiO2 antibacterial coating on surgical external fixation pins for clinical application
auteur
Guillaume Villatte, Christophe Massard, Stéphane Descamps, Yves Sibaud, Christiane Forestier, Komla Oscar Awitor
article
International Journal of Nanomedicine, Dove Medical Press, 2015, ⟨10.2147/IJN.S81518⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01829424/file/iNTERNATIONAL%20JOURNAL%20OF%20NANOMEDECINE%202015GV.pdf BibTex
titre
Co-occurrence of microcystin and anatoxin-a in the freshwater lake Aydat (France): analytical and molecular approaches during a three-year survey.
auteur
Marion Sabart, Kristell Crenna, Fanny Perrière, Angélique Abila, Martin Leremboure, Jonathan Colombet, Cyril Jousse, Delphine Latour
article
Harmful Algae, Elsevier, 2015, 48, pp.12-20. ⟨10.1016/j.hal.2015.06.007⟩
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titre
How the edaphic Bacillus megaterium strain Mes11 adapts its metabolism to the herbicide mesotrione pressure.
auteur
Corinne Bardot, Pascale Besse-Hoggan, Louis Carles, Morgane Le Gall, Guilhem Clary, Philippe Chafey, Christian Federici, Cédric Broussard, Isabelle Batisson
article
Environmental Pollution (1970), Elsevier Science, 2015, 199, pp.198-208. ⟨10.1016/j.envpol.2015.01.029⟩
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titre
La biodiversité en Auvergne. Etat de conservation des espèces.
auteur
Christian Amblard, Pascal Carrère, Philippe Cochet, Boris Fumanal, Stéphane Herbette, Olivier Villepoux
article
Alliance Universitaire d'Auvergne, 2015 2-3 (615-616), 466 p., 2015, Revue d'Auvergne, 1269-8946
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titre
Arthropod Distribution in a Tropical Rainforest: Tackling a Four Dimensional Puzzle
auteur
Yves Basset, Lukas Cizek, Philippe Cuénoud, Raphael Didham, Vojtech Novotny, Frode Ødegaard, Tomas Roslin, Alexey Tishechkin, Jürgen Schmidl, Neville Winchester, David Roubik, Henri-Pierre Aberlenc, Johannes Bail, Hector Barrios, Jonathan Bridle, Gabriela Castaño-Meneses, Bruno Corbara, Gianfranco Curletti, Wesley Duarte da Rocha, Domir de Bakker, Jacques Delabie, Alain Dejean, Laura Fagan, Andreas Floren, Roger Kitching, Enrique Medianero, Evandro Gama de Oliveira, Jérôme Orivel, Marc Pollet, Mathieu Rapp, Sérvio Ribeiro, Yves Roisin, Jesper Schmidt, Line Sørensen, Thomas Lewinsohn, Maurice Leponce
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (12), pp.e0144110. ⟨10.1371/journal.pone.0144110⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01983602/file/journal.pone.0144110.PDF BibTex
titre
Capturing prokaryotic dark matter genomes
auteur
C. Gasc, C. Ribière, N. Parisot, R. Beugnot, C. Defois, C. Petit-Biderre, D. Boucher, E. Peyretaillade, P. Peyret
article
Research in Microbiology, Elsevier, 2015, 166 (10), pp.814-830. ⟨10.1016/j.resmic.2015.06.001⟩
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titre
Probing the Metabolic Network in Bloodstream-Form Trypanosoma brucei Using Untargeted Metabolomics with Stable Isotope Labelled Glucose
auteur
Darren Creek, Muriel Mazet, Fiona Achcar, Jana Anderson, Dong-Hyun Kim, Ruwida Kamour, Pauline Morand, Yoann Millerioux, Marc Biran, Eduard Kerkhoven, Achuthanunni Chokkathukalam, Stefan Weidt, Karl Burgess, Rainer Breitling, David Watson, Frédéric Bringaud, Michael Barrett
article
PLoS Pathogens, Public Library of Science, 2015, 11 (3), pp.e1004689. ⟨10.1371/journal.ppat.1004689⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02483499/file/journal.ppat.1004689.PDF BibTex
titre
Transient and Persistent Acute Kidney Injury and the Risk of Hospital Mortality in Critically Ill Patients
auteur
Sophie Perinel, François Vincent, Alexandre Lautrette, Jean Dellamonica, Christophe Mariat, Fabrice Zeni, Yves Cohen, Bernard Tardy, Bertrand Souweine, Michael Darmon
article
Critical Care Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2015, 43 (8), pp.e269 - e275. ⟨10.1097/CCM.0000000000001077⟩
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titre
Drying responses of microbial litter decomposition and associated fungal and bacterial communities are not affected by emersion frequency
auteur
A. Foulquier, J. Artigas, S. Pesce, T. Datry
article
Freshwater Science, 2015, 34 (4), pp.1233 - 1244. ⟨10.1086/682060⟩
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titre
Temporal Dynamics of Active Prokaryotic Nitrifiers and Archaeal Communities from River to Sea
auteur
Mylène Hugoni, Hélène Agogué, Najwa Taib, Isabelle Domaizon, Anne Moné, Pierre E. Galand, Gisèle Bronner, Didier Debroas, Isabelle Mary
article
Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, 2015, 70 (2), pp.473-483. ⟨10.1007/s00248-015-0601-z⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01354835/file/Hugoni%2CAgogu%C3%A9etal%2C%20MicrobEcol%2C%202015_HAL.pdf BibTex
titre
Temporal dynamics of active Archaea in oxygen-depleted zones of two deep lakes
auteur
Mylène Hugoni, Isabelle Domaizon, Najwa Taib, Corinne Biderre-Petit, Hélène Agogué, Pierre E. Galand, Didier Debroas, Isabelle Mary
article
Environmental Microbiology Reports, Wiley, 2015, 7 (2), pp.321-329. ⟨10.1111/1758-2229.12251⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01354841/file/Hugonietal%2CEnvMicrReports%2C%202015_HAL.pdf BibTex
titre
Functional trait responses of aquatic macroinvertebrates to simulated drought in a Neotropical bromeliad ecosystem
auteur
Olivier Dezerald, Régis Céréghino, Bruno Corbara, Alain Dejean, Céline Leroy
article
Freshwater Biology, Wiley, 2015, 60 (9), pp.1917-1929. ⟨10.1111/fwb.12621⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02184259/file/D%C3%A9zerald%20et%20al.%202015%282%29.pdf BibTex
titre
Microbial food web structural and functional responses to oyster and fish as top predators
auteur
Behzad Mostajir, Cécile Roques, Corinne Bouvier, Thierry Bouvier, Éric Fouilland, Patrice Got, Emilie Le Floc’h, Jean Nouguier, Sébastien Mas, Richard Sempere, Télesphore Sime-Ngando, Marc Troussellier, Francesca Vidussi
article
Marine Ecology Progress Series, Inter Research, 2015, 535, pp.11-27. ⟨10.3354/meps11429⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01199541/file/Fouilland%20et%20al%20JEMBE%20%282013%29-HAL.pdf BibTex
titre
Anti-nociceptive effect of Faecalibacterium prausnitzii in non-inflammatory IBS-like models
auteur
S. Miquel, R. Martín, A. Lashermes, Marion Gillet, M. Meleine, A. Gelot, A. Eschalier, D. Ardid, L. G. Bermúdez-Humarán, H. Sokol, M. Thomas, Vassilia Theodorou, P. Langella, F. A. Carvalho
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2015, 6, pp.19399. ⟨10.1038/srep19399⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01263911/file/srep19399.pdf BibTex

2014

titre
Soil photosynthetic microbial communities as bioindicators for pesticide stress assessment
auteur
Olivier Crouzet, Pierre Joly, Christelle Marrauld, Frédéric Rimet, Benjamin Misson, Annette Berard, Clarisse Mallet
article
1. Global Soil Biodiversity Initiative Conference (GSBI), Dec 2014, Dijon, France. 702 p., 2014, The First Global Soil Biodiversity Conference, december 2-5, 2014, Dijon, France : book of abstracts
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https://hal.inrae.fr/hal-02738907/file/2014_Crouzet_1st_GSBI_Conference_Book_of_Abstracts_p_395_1.pdf BibTex
titre
A high-throughput sequencing ecotoxicology study of freshwater bacterial communities and their responses to tebuconazole
auteur
Noémie Pascault, Simon Roux, Joan Artigas, Stéphane Pesce, Julie Leloup, Rémy D. Tadonleke, Didier Debroas, Agnès Bouchez, Jean-François Humbert
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2014, 90 (3), pp.25135322. ⟨10.1111/1574-6941.12416⟩
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titre
Detection of decreased glomerular filtration rate in intensive care units: serum cystatin C versusserum creatinine
auteur
Pierre Delanaye, Etienne Cavalier, Jérome Morel, Manolie Mehdi, Nicolas Maillard, Guillaume Claisse, Bernard Lambermont, Bernard Dubois, Pierre Damas, Jean-Marie Krzesinski, Alexandre Lautrette, Christophe Mariat
article
BMC Nephrology, BioMed Central, 2014, 15 (1)
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titre
Nutrient ratios and the complex structure of phytoplankton communities in a highly turbid estuary of Southeast Asia
auteur
Thuoc Van Chu, Jean-Pascal Torréton, Xavier Mari, Huyen Minh Thi Nguyen, Kha Thi Pham, Thu The Pham, Thierry Bouvier, Yvan Bettarel, Olivier Pringault, Corinne Bouvier, Emma Rochelle-Newall
article
Environmental Monitoring and Assessment, Springer Verlag (Germany), 2014, 186 (12), pp.8555-8572. ⟨10.1007/s10661-014-4024-y⟩
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titre
Les communautés microbiennes photosynthétiques (cyanobactéries et micro-algues) comme bioindicateurs de stress phytosanitaires dans les sols agricoles
auteur
Olivier Crouzet, Christelle Marrauld, Pierre Joly, Clarisse Mallet, Frédéric Rimet, Annette Berard
article
5. Séminaire d'Ecotoxicologie de l'INRA, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA., Nov 2014, Biarritz, France. 66 p
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https://hal.inrae.fr/hal-02743610/file/2014_Crouzet_5_Seminaire_Ecotox_Actes_1.pdf BibTex
titre
Impact of environmental changes on lacustrine dynamics in the Lake Pavin over the last 7,000 years (French Massif Central)
auteur
Léo Chassiot, Emmanuel Chapron, Aude Beauger, Yannick Miras, Patrick Albéric, Grégoire Ledoux, Patrick Lajeunesse, Markus Schwab, Anne-Lise Develle, Fabien Arnaud, Anne-Catherine Lehours, Christian Giovanni, Didier Jézéquel
article
5 th International MAAR Conference, Nov 2014, Santiago de Querétaro, Mexico. 2 p
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https://hal-univ-tlse2.archives-ouvertes.fr/hal-02093898/file/5IMC_Oral_Chassiot_et_al%281%29_cor1.pdf BibTex
titre
Microbial diversity supporting dark fermentation of waste
auteur
Marlène Jobard, Jérémy Pessiot, Régis Nouaille, Télesphore Sime-Ngando
article
Trends in Biotechnology, Elsevier, 2014, 32 (11), pp.549-550
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titre
Plasticity between MyoC- and MyoA-Glideosomes: An Example of Functional Compensation in Toxoplasma gondii Invasion
auteur
Karine Frénal, Jean-Baptiste Marq, Damien Jacot, Valérie Polonais, Dominique Soldati-Favre
article
PLoS Pathogens, Public Library of Science, 2014, 10 (11), pp.25393004. ⟨10.1371/journal.ppat.1004504⟩
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BibTex
titre
Linking Host Prokaryotic Physiology to Viral Lifestyle Dynamics in a Temperate Freshwater Lake (Lake Pavin, France)
auteur
S. Palesse, J. Colombet, S. Pradeep Ram, T. Sime-Ngando
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2014, 68 (4), pp.740-750
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titre
Soil surface colonization by phototrophic indigenous organisms, in two contrasted soils treated by formulated maize herbicide mixtures
auteur
Pierre Joly, Benjamin Misson, Fanny Perrière, Frédérique Bonnemoy, Muriel Joly, Florence Donnadieu-Bernard, Jean-Pierre Aguer, Jacques Bohatier, Clarisse Mallet
article
Ecotoxicology, Springer Verlag, 2014, 23 (9), pp.1648 - 1658. ⟨10.1007/s10646-014-1304-9⟩
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titre
Blastocystis Is Associated with Decrease of Fecal Microbiota Protective Bacteria: Comparative Analysis between Patients with Irritable Bowel Syndrome and Control Subjects
auteur
Céline Nourrisson, Julien Scanzi, Bruno Pereira, Christina Nkoudmongo, Ivan Wawrzyniak, Amandine Cian, Eric Viscogliosi, Valérie Livrelli, Frédéric Delbac, Michel Dapoigny, Philippe Poirier
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 9 (11), pp.25365580. ⟨10.1371/journal.pone.0111868⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01111985/file/journal.pone.0111868.PDF BibTex
titre
AGRO-MORPHOLOGICAL CHARACTERIZATION OF TWO RICE VARIETIES FROM JAPAN; ORYSA SATIVA L. AND FOUR NERICAS VARIETIES IN AN AGRO-ECOLOGICAL ZONE OF THE TOWN OF YAOUNDE (CAMEROON); COMPARATIVE STUDY OF THEIR PERFORMANCES
auteur
Karine Moche, Champlain Djieto Lordon, Marie Noel Melie Feyem, Zéphirin Tadu, Paul Alain Nana, Zéphyrin Fokam, Geneviève Bricheux, Noé Woin
article
International Journal of Current Research, T. Manikandan, 2014, 6 (11), pp.9941-9946
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01091004/file/Moche%20et%20al%202014%20%281%29.pdf BibTex
titre
Ressources pollinifères et mellifères de l'Abeille domestique, Apis Mellifera, en paysage rural du nord-ouest de la France
auteur
Mélanie Piroux
article
Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2014. Français. ⟨NNT : 2014CLF22501⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01135137/file/PIROUX_2014CLF22501.pdf BibTex
titre
Détermination de sondes oligonucléotidiques pour l'exploration à haut débit de la diversité taxonomique et fonctionnelle d'environnements complexes
auteur
Nicolas Parisot
article
Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2014. Français. ⟨NNT : 2014CLF22498⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01086970/file/PARISOT_2014CLF22498.pdf BibTex
titre
Using SILAC strategy to identify protein effectors in the wheat-Fusarium graminearum pathosystem.
auteur
Philippe Lecomte, Serge Urbach, Edith Demettre, David Georges Biron, Thierry Langin, Ludovic Bonhomme
article
Effectome Network, Oct 2014, Lauret, France. 2014, Effectome Network
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Using SILAC strategy to identify protein effectors in the wheat-Fusarium graminearum pathosystem
auteur
Ludovic Bonhomme, Philippe Lecomte, Serge Urbach, Edith Demettre, David G. Biron, Thierry Langin
article
7. Effectome meeting, Oct 2014, Lauret, France
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The Microsporidian Polar Tube and Spore Wall in “Microsporidia: Pathogens of Opportunity
auteur
Lm Weiss, Frédéric Delbac, Jr Hayman, G Pan, Z Zhou
article
.Microsporidia: Pathogens of Opportunity, 2014
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First outbreak of community-acquired MRSA USA300 in France: failure to suppress prolonged MRSA carriage despite decontamination procedures
auteur
O. Baud, S. Giron, C. Aumeran, D. Mouly, G. Bardon, M. Besson, J. Delmas, B. Coignard, A. Tristan, F. Vandenesch, G. Illes, O. Lesens
article
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2014, 33 (10), pp.1757-1762
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Are adverse drug reaction patterns different between romiplostim and eltrombopag? 2009-2013 French PharmacoVigilance assessment.
auteur
Guillaume Moulis, Haleh Bagheri, Laurent Sailler, Annie-Pierre Jonville-Bera, Emmanuelle Weber, Claire Guy, Nadine Petitpain, Marie-Laure Laroche, Sylvie Favrelière, Johana Béné, Bernadette Baldin, Laure Villeval-Federici, Martine Tebacher-Alt, Virginie Bres, Gwenaëlle Veyrac, Aurélie Grandvuillemin, Cédric Mauprivez, Maryse Lapeyre-Mestre, Jean-Louis Montastruc
article
European Journal of Internal Medicine, Elsevier, 2014, 25 (8), pp.777-80. ⟨10.1016/j.ejim.2014.09.006⟩
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Quasi-Experimental Study of Sodium Citrate Locks and the Risk of Acute Hemodialysis Catheter Infection among Critically Ill Patients
auteur
Jean-Jacques Parienti, Stephanie Deryckere, Bruno Mégarbane, Xavier Valette, Amélie Seguin, Bertrand Sauneuf, Jean-Paul Mira, Bertrand Souweine, Vincent Cattoir, Cédric Daubin, Damien Du Cheyron
article
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, American Society for Microbiology, 2014, 58 (10), pp.5666-5672
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Tracking long-term human impacts on landscape, vegetal biodiversity and water quality in the Lake Aydat catchment (Auvergne, France) using pollen, NPP and diatom assemblages.
auteur
Yannick Miras, Aude Beauger, Marlène Lavrieux, Karen K. Serieyssol, Valérie Andrieu-Ponel, Delphine Latour
article
QuickLakeH2014, an international workshop on Lakes and Human interactions, Sep 2014, Ankara, Turkey
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Technical challenges in metatranscriptomic studies applied to the bacterial communities of freshwater ecosystems
auteur
Noémie Pascault, Valentin Loux, Sandra Derozier, Véronique Martin, Didier Debroas, Selma Maloufi, Jean-François Humbert, Julie Leloup
article
Genetica, Springer Verlag, 2014, 143 (2), pp.25216965. ⟨10.1007/s10709-014-9783-4⟩
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Initiation of nutritional support is delayed in critically ill obese patients: a multicenter cohort study
auteur
Anne-Laure Borel, Carole Schwebel, Benjamin Planquette, Aurélien Vesin, Maïté Garrouste-Orgeas, Christophe Adrie, Christophe Clec’h, Elie Azoulay, Bertrand Souweine, Bernard Allaouchiche, Dany Goldgran-Toledano, Samir Jamali, Michael Darmon, Jean-François Timsit
article
American Journal of Clinical Nutrition, American Society for Nutrition, 2014, 100 (3), pp.859-866
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How does the resuspension of the biofilm alter the functioning of the benthos–pelagos coupled food web of a bare mudflat in Marennes-Oléron Bay (NE Atlantic)?
auteur
Blanche Saint-Béat, Christine Dupuy, Hélène Agogué, Alexandre Carpentier, Julien Chalumeau, Serena Como, Valérie David, Margot de Crignis, Jean-Claude Duchêne, Camille Fontaine, Eric Feunteun, Katell Guizien, Hans Hartmann, Johann Lavaud, Sébastien Lefebvre, Christel Lefrançois, Clarisse Mallet, Hélène Montanié, Jean-Luc Mouget, Francis Orvain, Pascaline Ory, Pierre-Yves Pascal, Gilles Radenac, Pierre Richard, Nathalie Niquil
article
Journal of Sea Research (JSR), Elsevier, 2014, 92, pp.144-157. ⟨10.1016/j.seares.2014.02.003⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01097877/file/RES_JSR_03.02.2014_without%20tracked%20changes.pdf BibTex
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Two coexisting tank bromeliads host distinct algal communities on a tropical inselberg
auteur
J.F Carrias, R. Céréghino, O. Brouard, L. Pélozuélo, A. Déjean, A. Couté, B. Corbara, Céline Leroy, J. Arroyo
article
Plant Biology, Wiley, 2014, 16 (5), pp.997 - 1004. ⟨10.1111/plb.12139⟩
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Temporal changes in essential fatty acid availability in different food sources in the littoral macrophyte zone
auteur
Hélène Masclaux, Gilles Bourdier, Lionel Jouve, Emilie Duffaud, Alexandre Bec
article
Hydrobiologia, Springer, 2014, 736 (1), pp.127-137
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Distinctive patterns in prokaryotic community composition in response to viral lysis and flagellate grazing in freshwater microcosms
auteur
Angia Sriram Pradeep Ram, Télesphore Sime-Ngando
article
Freshwater Biology, Wiley, 2014, 59 (9), pp.1945-1955
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Exploiting the architecture and the features of the microsporidian genomes to investigate diversity and impact of these parasites on ecosystems
auteur
E Peyretaillade, D Boucher, N Parisot, C Gasc, R Butler, J-F Pombert, E Lerat, P Peyret
article
Heredity, Nature Publishing Group, 2014, pp.25182222. ⟨10.1038/hdy.2014.78⟩
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titre
Sequential resuspension of biofilm components (viruses, prokaryotes and protists) as measured by erodimetry experiments in the Brouage mudflat (French Atlantic coast)
auteur
Christine Dupuy, Clarisse Mallet, Katell Guizien, Hélène Montanié, Martine Bréret, Françoise Mornet, Camille Fontaine, Caroline Nérot, Francis Orvain
article
Journal of Sea Research (JSR), Elsevier, 2014, 92, pp.56-65. ⟨10.1016/j.seares.2013.12.002⟩
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titre
Bacterial dynamics in a microphytobenthic biofilm: A tidal mesocosm approach
auteur
Hélène Agogué, Clarisse Mallet, Francis Orvain, Margot de Crignis, Françoise Mornet, Christine Dupuy
article
Journal of Sea Research (JSR), Elsevier, 2014, Trophic significance of microbial biofilm in tidal flats, 92, pp.36 - 45. ⟨10.1016/j.seares.2014.03.003⟩
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Differential proteomic analysis of midguts from Nosema ceranae-infected honeybees reveals manipulation of key host functions.
auteur
Cyril Vidau, Johan Panek, Catherine Texier, David Georges Biron, Luc P Belzunces, Morgane Le Gall, Cédric Broussard, Frédéric Delbac, Hicham El Alaoui
article
Journal of Invertebrate Pathology, Elsevier, 2014, 121, pp.89-96. ⟨10.1016/j.jip.2014.07.002⟩
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Evolution and management of the ligneous vegetation during the neolithic: chacoal analysis of two sheepfold caves in Provence (south of France) : (Pendimoun & Perthus II, France)
auteur
J Battentier, Didier Binder, Cécile Lepère, Isabelle Théry-Parisot, S. Thiébault, A. Carre, Claire Delhon
article
9th European plaeobotany and palynology conference, Aug 2014, Padova, Italy
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Lake Pavin paleolimnology and sedimentary records of regional Natural Hazards over the last 7000 years (French Massif Central)
auteur
Léo Chassiot, Emmanuel Chapron, Aude Beauger, Yannick Miras, Patrick Albéric, Grégoire Ledoux, Patrick Lajeunesse, M. Schwab, Anne-Lise Develle, Fabien Arnaud, Anne-Catherine Lehours, Didier Jézéquel
article
International Congress of Sedimentology, Aug 2014, Genève, Switzerland
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Abstracts: The 22nd Annual Meeting of the Israel Society for Neuroscience (ISFN) & The 2nd Bi national Italy-Israel Neuroscience Meeting
auteur
M Kaiser, D Biron, F Libersat
article
Journal of Molecular Neuroscience, Humana Press, 2014, 53 (S1), pp.53: S66. ⟨10.1007/s12031-014-0252-4⟩
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Transmission of infectious diseases from internationally adopted children to their adoptive families
auteur
J. Sciauvaud, E. Rigal, J. Pascal, C. Nourrisson, P. Poirier, V. Poirier, M. Vidal, N. Mrozek, H. Laurichesse, J. Beytout, A. Labbe, O. Lesens
article
Clinical Microbiology and Infection, Elsevier for the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2014, 20 (8), pp.24261464. ⟨10.1111/1469-0691.12454⟩
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Reproducibility and Consistency of Proteomic Experiments on Natural Populations of a Non-Model Aquatic Insect
auteur
Amparo Hidalgo-Galiana, Marta Monge, David Georges Biron, Francesc Canals, Ignacio Ribera, Alexandra Cieslak, Vengatesen Thiyagarajan (rajan)
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 9 (8), pp.25133588. ⟨10.1371/journal.pone.0104734⟩
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Draft Genomes of Three Strains Representative of the Bacillus anthracis Diversity Found in France
auteur
G. Girault, N. Parisot, E. Peyretaillade, P. Peyret, S. Derzelle
article
Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2014, 2 (4), pp.25081258. ⟨10.1128/genomeA.00736-14⟩
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Environmental bacteriophages: viruses of microbes in aquatic ecosystems
auteur
Telesphore Sime-Ngando
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2014, 5
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BCKDH: The Missing Link in Apicomplexan Mitochondrial Metabolism Is Required for Full Virulence of Toxoplasma gondii and Plasmodium berghei
auteur
Rebecca Oppenheim, Darren Creek, James Macrae, Katarzyna Modrzynska, Paco Pino, Julien Limenitakis, Valérie Polonais, Frank Seeber, Michael Barrett, Oliver Billker, Malcolm Mcconville, Dominique Soldati-Favre, L. David Sibley
article
PLoS Pathogens, Public Library of Science, 2014, 10 (7), pp.e1004263
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titre
Deciphering wheat susceptibility factors to Fusarium Head Blight
auteur
Ludovic Bonhomme, Cherif Chetouhi, Philippe Lecomte, Florence Cambon, Olivier Soudière, David Biron, Thierry Langin
article
16. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, Jul 2014, Rhodes, Greece. 2014, International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions
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titre
BCKDH: The Missing Link in Apicomplexan Mitochondrial Metabolism Is Required for Full Virulence of Toxoplasma gondii and Plasmodium berghei
auteur
Rebecca D. Oppenheim, Darren J. Creek, James I. Macrae, Katarzyna K. Modrzynska, Paco Pino, Julien Limenitakis, Valerie Polonais, Frank Seeber, Michael P. Barrett, Oliver Billker, Malcolm J. Mcconville, Dominique Soldati-Favre, L. David Sibley
article
PLoS Pathogens, Public Library of Science, 2014, 10 (7), pp.25032958. ⟨10.1371/journal.ppat.1004263⟩
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titre
Conception et analyse des biopuces à ADN en environnements parallèles et distribués
auteur
Faouzi Jaziri
article
Autre [cs.OH]. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2014. Français. ⟨NNT : 2014CLF22465⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01276669/file/JAZIRI_2014CLF22464.pdf BibTex
titre
Are ontogenetic shifts in foliar structure and resource acquisition spatially conditioned in tank-bromeliads?
auteur
Matthis Petit, Régis Céréghino, Jean-François Carrias, Bruno Corbara, Olivier Dezerald, Fréderic Petitclerc, Alain Dejean, Céline Leroy
article
Botanical Journal of the Linnean Society, Linnean Society of London, 2014, 175 (2), pp.299-312. ⟨10.1111/boj.12171⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02181065/file/Petit%20et%20al.%202014.pdf BibTex
titre
Lésion ostéolytique chez une patiente splénectomisée : à propos d’un cas d’échinococcose alvéolaire vertébrale
auteur
C. Nourrisson, Séverine Mathieu, J. Beytout, M. Cambon, P. Poirier
article
La Revue De Médecine Interne, Elsevier, 2014, 35 (6), pp.23890484. ⟨10.1016/j.revmed.2013.06.004⟩
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BibTex
titre
Temporal evolution and vertical stratification of Microcystis toxic potential during a first bloom event
auteur
H. Ait Hammou, D. Latour, M. Sabart, S. Samoudi, Kh. Mouhri, J. Robin, M. Loudiki
article
Aquatic Ecology, Springer Verlag, 2014, 48 (2), pp.219-228
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titre
Acute Respiratory Distress Syndrome and Risk of AKI among Critically Ill Patients.
auteur
Michael Darmon, Christophe Clec'H, Christophe Adrie, Laurent Argaud, Bernard Allaouchiche, Elie Azoulay, Lila Bouadma, Maïté Garrouste-Orgeas, Hakim Haouache, Carole Schwebel, Dany Goldgran-Toledano, Hatem Khallel, Anne-Sylvie Dumenil, Samir Jamali, Bertrand Souweine, Fabrice Zeni, Yves Cohen, Jean-François Timsit
article
Clinical Journal of the American Society of Nephrology, American Society of Nephrology, 2014, epub ahead of print. ⟨10.2215/CJN.08300813⟩
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titre
Parasitic chytrids sustain zooplankton growth during inedible algal bloom
auteur
Serena Rasconi, Boutheina Grami, Nathalie Niquil, Marlene Jobard, Telesphore Sime-Ngando
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2014, 5
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titre
A COMPARISON BETWEEN PLANT COMMUNITY COMPOSITION AND BOTANICAL SPECIES GATHERED BY HONEY BEES IN A CULTIVATED LANDSCAPE OF WESTERN FRANCE
auteur
Mélanie Piroux, Chantal Thorin, Isabelle Farrera, Monique L’hostis, Bernard Vigues, Olivier Lambert
article
International Journal of Current Research, T. Manikandan, 2014, Vol. 6, Issue, 05, pp.6699-6709
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titre
Economic process to produce biohydrogen and volatile fatty acids by a mixed culture using vinasse from sugarcane ethanol industry as nutrient source
auteur
Eduardo Bittencourt Sydney, Christian Larroche, Alessandra Cristine Novak, Régis Nouaille, Saurabh Jyoti Sarma, Satinder Kaur Brar, Luiz Alberto Junior Letti, Vanete Thomaz Soccol, Carlos Ricardo Soccol
article
Bioresource Technology, Elsevier, 2014, 159, pp.380-386
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titre
Acquiring procedural skills in ICUs: a prospective multicenter study*.
auteur
Damien Roux, Jean Reignier, Guillaume Thiery, Alexandre Boyer, Jan Hayon, Bertrand Souweine, Laurent Papazian, Alain Mercat, Gilles Bernardin, Alain Combes, Jean-Daniel Chiche, Jean-Luc Diehl, Damien Du Cheyron, Erwan l'Her, Dominique Perrotin, Francis Schneider, Marie Thuong, Michel Wolff, Fabrice Zeni, Didier Dreyfuss, Jean-Damien Ricard
article
Critical Care Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2014, 42 (4), pp.886-95. ⟨10.1097/CCM.0000000000000049⟩
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titre
Noninvasive mechanical ventilation in acute respiratory failure: trends in use and outcomes
auteur
David Schnell, Jean-François Timsit, Michael Darmon, Aurélien Vesin, Dany Goldgran-Toledano, Anne-Sylvie Dumenil, Maïté Garrouste-Orgeas, Christophe Adrie, Lila Bouadma, Benjamin Planquette, Yves Cohen, Carole Schwebel, Lila Soufir, Samir Jamali, Bertrand Souweine, Elie Azoulay
article
Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2014, 40 (4), pp.582-591
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titre
Molecular subtyping of Blastocystis spp. using a new rDNA marker from the mitochondria-like organelle genome.
auteur
P. Poirier, D. Meloni, C. Nourrisson, I. Wawrzyniak, E. Viscogliosi, V. Livrelli, Frédéric Delbac
article
Parasitology, Cambridge University Press (CUP), 2014, 141 (5), pp.670-81. ⟨10.1017/S0031182013001996⟩
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titre
Two distinct sensing pathways allow recognition of Klebsiella pneumoniae by Dictyostelium amoebae.
auteur
Wanessa C Lima, Damien Balestrino, Christiane Forestier, Pierre Cosson
article
Cellular Microbiology, Wiley, 2014, 16 (3), pp.311-23. ⟨10.1111/cmi.12226⟩
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BibTex
titre
Maize herbicides mixtures effects on soil microbial communities : microcosms studies
auteur
Pierre Joly
article
Agricultural sciences. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2014. English. ⟨NNT : 2014CLF22440⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01020037/file/JOLY_2014CLF22440.pdf BibTex
titre
Effet de l'infection par la microsporidie Nosema Ceranae sur la régulation de la température par l'abeille domestique
auteur
Marie-Paule Lofe, M. Saudreau, Samuel Guyot, David Georges Biron
article
2ème Journées de la recherche apicole, Feb 2014, Paris, France. ITSAP, pp.19, 2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01268585/file/2014_JRA_ITSAP_resume_des_interventions_1.pdf https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01268585/file/2014_LOFE_JRA_ITSAP_Poster_2.pdf BibTex
titre
The relative importance of viral lysis and nanoflagellate grazing for prokaryote mortality in temperate lakes
auteur
Angia Sriram Pradeep Ram, Stéphanie Palesse, Jonathan Colombet, Antoine Thouvenot, Télesphore Sime-Ngando
article
Freshwater Biology, Wiley, 2014, 59 (2), pp.300-311
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BibTex
titre
Archaebiotics Proposed therapeutic use of archaea to prevent trimethylaminuria and cardiovascular disease
auteur
Paul W O’toole, Jean-François Brugère, Guillaume Borrel, Nadia Gaci, William Tottey, Paul O’toole, Corinne Malpuech-Brugère
article
Gut microbes, Taylor & Francis, 2014, 5 (1), pp.5 - 10. ⟨10.4161/gmic.26749⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01612755/file/2014_GutMicrobes_Archaebiotics.pdf BibTex
titre
Comparative sensitivity to the fungicide tebuconazole of biofilm and plankton microbial communities in freshwater ecosystems
auteur
Joan Artigas, N. Pascault, A. Bouchez, J. Chastaine, D. Debroas, J.F. Humbert, J. Leloup, R.D. Tadonleke, A. ter Halle, S. Pesce
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2014, 468-469, pp.326-336. ⟨10.1016/j.scitotenv.2013.08.074⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00995683/file/ly2014-pub00042861.pdf BibTex
titre
Variations in Abundance, Genome Size, Morphology, and Functional Role of the Virioplankton in Lakes Annecy and Bourget over a 1-Year Period
auteur
Xu Zhong, Angia Siram Pradeep Ram, Jonathan Colombet, Stéphan Jacquet
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2014, 67 (1), pp.66-82
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BibTex
titre
Children of Senegal River Basin show the highest prevalence of Blastocystis sp. ever observed worldwide.
auteur
Dima El Safadi, Lobna Gaayeb, Dionigia Meloni, Amandine Cian, Philippe Poirier, Ivan Wawrzyniak, Frédéric Delbac, Fouad Dabboussi, Laurence Delhaes, Modou Seck, Monzer Hamze, Gilles Riveau, Eric Viscogliosi
article
BMC Infectious Diseases, BioMed Central, 2014, 14 (1), pp.164. ⟨10.1186/1471-2334-14-164⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00981310/file/1471-2334-14-164.pdf BibTex
titre
Microbial food web dynamics during spring phytoplankton blooms in the naturally iron-fertilized Kerguelen area (Southern Ocean)
auteur
U. Christaki, Dominique Lefèvre, C. Georges, J. Colombet, P. Catala, C. Courties, T. Sime-Ngando, S. Blain, I. Obernosterer
article
Biogeosciences, European Geosciences Union, 2014, 11 (23), pp.6739-6753. ⟨10.5194/bg-11-6739-2014⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01983048/file/bg-11-6739-2014.pdf BibTex
titre
New insights into the extraction of uranium(VI) by an N,N-dialkylamide
auteur
F. Rodrigues, G. Ferru, Laurence Berthon, N. Boubals, P. Guilbaud, C. Sorel, Olivier Diat, P. Bauduin, J.P. Simonin, Jean-Pierre Morel, Nicole Morel-Desrosiers, M.C. Charbonnel
article
Molecular Physics, Taylor & Francis, 2014, 112, pp.1362-1374. ⟨10.1080/00268976.2014.902139⟩
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titre
Morphological description of four new species of Nyctotherus (Ciliophora: Nyctotheridae: Heterotri- chida), commensal ciliates of the digestive tract of a terrestrial Oligochaete (Megascolecidae) from the northwest region of Cameroon
auteur
Zéphyrin Fokam, Paul Alain Nana, Pierre Ngassam, Geneviève Bricheux, Philippe Bouchard, Bernard Vigues, Télesphore Sime-Ngando
article
Protistology, 2014, 8 (2), pp.62-70
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01070952/file/Fokam_Nana_Ngassam_et_al_2014.pdf BibTex
titre
INFLUENCE OF IONIC CONTENTS ON THE STRATIFICATION OF ASTOMATIA AND HYSTEROCINETIDAE (CILIOPHORA, OLIGOHYMENOPHORA) ALONG THE DIGESTIVE TRACT OF ALMA EMINI (OLIGOCHAETE, GLOSSOSCOLECIDAE) FROM THE CENTER REGION OF CAMEROON
auteur
Paul Alain Nana, Zéphyrin Fokam, Pierre Ngassam, Gideon Aghaindum Ajeagah, Karine Moche, Geneviève Bricheux, Philippe Bouchard, Bernard Vigues, Télesphore Sime-Ngando
article
International Journal of Current Research, T. Manikandan, 2014, 6 (1), pp.4468-4474
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01114626/file/Nana_et_al._2014.pdf BibTex
titre
Metavir 2: new tools for viral metagenome comparison and assembled virome analysis.
auteur
Simon Roux, Jeremy Tournayre, Antoine Mahul, Didier Debroas, François Enault
article
BMC Bioinformatics, BioMed Central, 2014, 15, pp.76. ⟨10.1186/1471-2105-15-76⟩
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titre
Unique Characteristics of the Pyrrolysine System in the 7th Order of Methanogens: Implications for the Evolution of a Genetic Code Expansion Cassette
auteur
Guillaume Borrel, Nadia Gaci, Pierre Peyret, Paul W. O'Toole, Simonetta Gribaldo, Jean-François Brugère
article
Archaea, Hindawi Publishing Corporation, 2014, 2014, pp.1 - 11. ⟨10.1155/2014/374146⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01612761/file/2014_Archaea_Pyrrolysine7eOrdre.pdf BibTex
titre
Dynamics of auto- and heterotrophic picoplankton and associated viruses in Lake Geneva
auteur
Ammini Parvathi, Xu Zhong, A. S. Pradeep Ram, Stéphan Jacquet
article
Hydrology and Earth System Sciences, European Geosciences Union, 2014, 18 (3), pp.1073 - 1087. ⟨10.5194/hess-18-1073-2014⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02632569/file/2014_Parvathi_Hydrology%20and%20Earth%20System%20Sciences_1.pdf BibTex
titre
Environmental determinants of macroinvertebrate diversity in small water bodies: insights from tank-bromeliads
auteur
Olivier Dézerald, Stanislas Talaga, Céline Leroy, Jean-François Carrias, Bruno Corbara, Alain Dejean, Régis Céréghino
article
Hydrobiologia, Springer, 2014, 723 (1), pp.77-86. ⟨10.1007/s10750-013-1464-2⟩
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BibTex
titre
Adhesion of Candida albicans to polythene in Sodium hypochlorite disinfected aquatic microcosm and potential impact of cell surface properties
auteur
Chrétien Djimeli, Antoine Arfao, Olive Ewoti, Geneviève Bricheux, Moïse Nola, Télesphore Sime-Ngando
article
Current Research in Microbiology and Biotechnology, Aizeon Publishers, 2014, 2 (5), pp.479-489
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01983207/file/Djimeli%20Curr%20Res%20Microbiol%20Biotechnol%2C%202014%2C%202%285%29%2C%20479-489.pdf BibTex
titre
Correlating the pollens gathered by Apis mellifera with the landscape features in western France
auteur
Mélanie Piroux, Olivier Lambert, Sophie Puyo, Isabelle Farrera, Chantal Thorin, Monique l'Hostis, Bernard Viguès, Suzanne Bastian
article
Applied Ecology and Environmental Research, ALOKI Ltd, 2014, 12 (2), pp.423-439
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titre
Mixture of Sodium Hypochlorite and Hydrogen Peroxide on Adhered Aeromonas hydrophila to Solid Substrate in Water: Impact of Concentration and Assessment of the Synergistic Effect
auteur
Chrétien Lontsi Djimeli, Antoine Tamsa Arfao, Olive Noah Ewoti, Mireille Ebiane Nougang, Marlyse Moungang, Geneviève Bricheux, Moïse Nola, Télesphore Sime-Ngando
article
International Journal of Bacteriology, Hindawi Publishing Corporation, 2014, 2014, pp.121367. ⟨10.1155/2014/121367⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01983212/file/Djimeli%202014..pdf BibTex
titre
Anti-biofilm activity: a function of Klebsiella pneumoniae capsular polysaccharide.
auteur
Marina dos Santos Goncalves, Cédric Delattre, Damien Balestrino, Nicolas Charbonnel, Redouan Elboutachfaiti, Anne Wadouachi, Stéphanie Badel, Thierry Bernardi, Philippe Michaud, Christiane Forestier
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 9 (6), pp.e99995. ⟨10.1371/journal.pone.0099995⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01053796/file/10.1371%252Fjournal.pone.0099995.pdf