Publications

2021

titre

Prokaryotic and Eukaryotic Fecal Microbiota in Irritable Bowel Syndrome Patients and Healthy Individuals Colonized With Blastocystis

auteur

Céline Nourrisson, Julien Scanzi, Julie Brunet, Frédéric Delbac, Michel Dapoigny, Philippe Poirier

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2021, 12, ⟨10.3389/fmicb.2021.713347⟩

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Potential of preventive bioremediation to reduce environmental contamination by pesticides in an agricultural context: A case study with the herbicide 2,4-D

auteur

Louis Carles, Fabrice Martin-Laurent, Marion Devers, Aymé Spor, Nadine Rouard, Jérémie Beguet, Pascale Besse-Hoggan, Isabelle Batisson

article

Journal of Hazardous Materials, Elsevier, In press, 416, ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.125740⟩

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Genomic analysis of the Bacillus megaterium Mes11: New insights into nitroreductase genes associated with the degradation of mesotrione

auteur

Louis Carles, Florence Donnadieu, Ivan Wawrzyniak, Pascale Besse-Hoggan, Isabelle Batisson

article

International Biodeterioration & Biodegradation, 2021, 162, pp.105254. ⟨10.1016/j.ibiod.2021.105254⟩

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Antibiotic susceptibility of four Enterobacteriaceae strains (Enterobacter cloacae, Citrobacter freundii, Salmonella typhi and Shigella sonnei) isolated from wastewater, surface water and groundwater in the equatorial zone of Cameroon (Central Africa)

auteur

Awawou Manouore Manouore, Yves Poutoum Yogne, Jean Samuel Eheth, Edith Brunelle Mouafo Tamnou, Claire Stéphane Metsopkeng, Olive Vivien Noah Ewoti, Antoine Tamsa Arfao, Luciane Marlyse Moungang, Paul Alain Nana, Sylvie Chinche Belengfe, Estelle Masseret, Télesphore Sime-Ngando, Moïse Nola

article

World Journal of Advanced Research and Reviews, World Journal of Advanced Research and Reviews, 2021, 11 (1), pp.120 - 137. ⟨10.30574/wjarr.2021.11.1.0303⟩

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Answer to August 2021 Photo Quiz

auteur

Claudel Catinot Noubam Tchatat, Catherine Godfraind, Laura Montrieul, Nicolas Saroul, Elisa Creuzet, Maxime Moniot, Laurent Gilain, Philippe Poirier, Céline Nourrisson

article

Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2021, 59 (8), pp.e0277020. ⟨10.1128/JCM.02770-20⟩

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Photo Quiz: A Bag of Marbles in the Nose

auteur

Claudel Catinot Noubam Tchatat, Catherine Godfraind, Laura Montrieul, Nicolas Saroul, Elisa Creuzet, Maxime Moniot, Laurent Gilain, Philippe Poirier, Céline Nourrisson

article

Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2021, 59 (8), ⟨10.1128/JCM.02768-20⟩

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Evaluation of Two Commercial Kits on the Automated ELITe InGenius PCR Platform for Molecular Diagnosis of Toxoplasmosis

auteur

Céline Nourrisson, Maxime Moniot, Philippe Poirier, Yvon Sterkers

article

Journal of Molecular Diagnostics, American Society for Investigative Pathology (ASIP), 2021, 23 (7), pp.865-871. ⟨10.1016/j.jmoldx.2021.04.004⟩

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Physiological effects of the interaction between Nosema ceranae and sequential and overlapping exposure to glyphosate and difenoconazole in the honey bee Apis mellifera

auteur

Hanine Almasri, Daiana Tavares, Marie Diogon, Maryline Pioz, Maryam Alamil, Déborah Sené, Sylvie Tchamitchian, Marianne Cousin, Jean-Luc Brunet, L.P. Belzunces

article

Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2021, 217, pp.112258. ⟨10.1016/j.ecoenv.2021.112258⟩

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From K. pneumoniae Colonization to Dissemination: An Overview of Studies Implementing Murine Models

auteur

Laura Joseph, Thomas Merciecca, Christiane Forestier, Damien Balestrino, Sylvie Miquel

article

Microorganisms, MDPI, 2021, 9 (6), pp.1282. ⟨10.3390/microorganisms9061282⟩

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The TOTUM-63 Supplement and High-Intensity Interval Training Combination Limits Weight Gain, Improves Glycemic Control, and Influences the Composition of Gut Mucosa-Associated Bacteria in Rats on a High Fat Diet

auteur

Marine Dupuit, Vivien Chavanelle, Benoit Chassaing, Fanny Perriere, Monique Etienne, Claire Plissonneau, Audrey Boscaro, Nicolas Barnich, Vincent Pialoux, Thierry Maugard, Florian Le Joubioux, Sébastien Peltier, Pascal Sirvent, Yolanda Otero, Nathalie Boisseau

article

Nutrients, MDPI, 2021, 13 (5), pp.1-24. ⟨10.3390/nu13051569⟩

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Copper-Doped Biphasic Calcium Phosphate Powders: Dopant Release, Cytotoxicity and Antibacterial Properties

auteur

Aurélie Jacobs, Guillaume Renaudin, Nicolas Charbonnel, Jean-Marie Nedelec, Christiane Forestier, Stéphane Descamps

article

Materials, MDPI, 2021, 14 (9), pp.2393. ⟨10.3390/ma14092393⟩

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Assemblages of anoxygenic phototrophic bacteria in tank bromeliads exhibit a host‐specific signature

auteur

Antoine Vergne, Vincent Darbot, Corinne Bardot, François Enault, Anne‐hélène Le Jeune, Jean‐françois Carrias, Bruno Corbara, Régis Céréghino, Céline Leroy, Christian Jeanthon, Eric Giraud, Isabelle Mary, Anne‐catherine Lehours

article

Journal of Ecology, Wiley, 2021, 109 (7), pp.2550-2565. ⟨10.1111/1365-2745.13657⟩

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A prospective study on the pathogenesis of catheter-associated bacteriuria in critically ill patients

auteur

Claire Aumeran, Benoit Mottet-Auselo, Christiane Forestier, Paul-Alain Nana, Claire Hennequin, Frédéric Robin, Bertrand Souweine, Ousmane Traoré, Alexandre Lautrette

article

BMC Microbiology, BioMed Central, 2021, 21 (1), pp.1-10. ⟨10.1186/s12866-021-02147-9⟩

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Regards croisés sur les pandémies

auteur

Patricia Gilbert, Estelle Baehrel, David Biron, Chloé Bourmaud, Vincent Dubreuil, David Giron, Sylvie Guillerme, Jean Nicolas Haas, Evelyne Heyer, Philippe Jarne, Didier Jouffre, Bruno Maureille, Laurent Memery, Frédéric Mery, Pierre Moret, Thomas Perrin, Soizic Prado, Geneviève Prevost, Alain Queffelec, Virginie Rougeron, Sabine Sauvage, Marc-André Selosse, Margareta Tengberg, Frédérique Viard

article

Patricia GIBERT. CNRS EDITIONS, 2021, 978-2-271-13665-7

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Lake Sedimentary DNA Research on Past Terrestrial and Aquatic Biodiversity: Overview and Recommendations

auteur

Eric Capo, Charline Giguet-Covex, Alexandra Rouillard, Kevin Nota, Peter Heintzman, Aurèle Vuillemin, Daniel Ariztegui, Fabien Arnaud, Simon Belle, Stefan Bertilsson, Christian Bigler, Richard Bindler, Antony Brown, Charlotte Clarke, Sarah Crump, Didier Debroas, Göran Englund, Gentile Francesco Ficetola, Rebecca Garner, Joanna Gauthier, Irene Gregory-Eaves, Liv Heinecke, Ulrike Herzschuh, Anan Ibrahim, Veljo Kisand, Kurt Kjær, Youri Lammers, Joanne Littlefair, Erwan Messager, Marie-Eve Monchamp, Fredrik Olajos, William Orsi, Mikkel Pedersen, Dilli Rijal, Johan Rydberg, Trisha Spanbauer, Kathleen Stoof-Leichsenring, Pierre Taberlet, Liisi Talas, Camille Thomas, David Walsh, Yucheng Wang, Eske Willerslev, Anne van Woerkom, Heike Zimmermann, Marco Coolen, Laura Epp, Isabelle Domaizon, Inger G. Alsos, Laura Parducci

article

Quaternary, MDPI, 2021, 4 (1), pp.6. ⟨10.3390/quat4010006⟩

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ITS2 Metabarcoding: A promising approach for identification of botanical origin of bee-collected pollen.

auteur

A. Quaresma, J.J.F. van der Steen, J. Amaral, David Biron, R. Brodschneider, V. Brusbardis, N.L. Carreck, M.F. Coffey, G. Formato, D. de Graaf, K. Gratzer, F. Hatjina, O. Kilpinem, A. Keller, D. Laget, M. Pietropaoli, J. Rufino, F. Vejsnaes, M.A. Pinto

article

1st International Online Conference: “Natural Products Application: Health, Cosmetic and Food”, Feb 2021, Bragança, Portugal

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OUP accepted manuscript

auteur

Céline Nourrisson, Solène Le Gal, Maxime Moniot, Frederic Delbac, Jean Pierre Bail, Gilles Nevez, Philippe Poirier

article

Clinical Infectious Diseases, Oxford University Press (OUP), 2021, ⟨10.1093/cid/ciaa563⟩

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titre

Effects of sulfonamide antibiotics on aquatic microbial community composition and functions

auteur

Martin Paumelle, Florence Donnadieu, Muriel Joly, Pascale Besse-Hoggan, Joan Artigas

article

Environment International, Elsevier, 2021, 146, pp.106198. ⟨10.1016/j.envint.2020.106198⟩

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Thermo-Mineral Springs, Old and Unique Aquatic Ecosystems to Survey and Preserve

auteur

Aude Beauger, Lory-Anne Baker, Carlos Wetzel, Luc Ector, David Biron

article

Biodiversity Online Journal, Crimson Publishers, 2021, 1 (4)

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Upstream/downstream food quality differences in a Caribbean Island River

auteur

Lou Frotté, Alexandre Bec, Cédric Hubas, Fanny Perrière, Sébastien Cordonnier, Etienne Bezault, Dominique Monti

article

Aquatic Ecology, Springer Verlag, 2021, ⟨10.1007/s10452-021-09887-w⟩

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Quantifying the energetic cost of food quality constraints on resting metabolism to integrate nutritional and metabolic ecology

auteur

Thomas Ruiz, Apostolos‐manuel Koussoroplis, Michael Danger, Jean‐pierre Aguer, Nicole Morel‐desrosiers, Alexandre Bec

article

Ecology Letters, Wiley, 2021, ⟨10.1111/ele.13855⟩

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Rapid responses of pristine marine planktonic communities in experimental approach to diuron and naphthalene (Juan de Nova Island, Western Indian Ocean)

auteur

Marc Bouvy, Christine Dupuy, Patrice Got, Isabelle Domaizon, Claire Carré, Pagano Marc, Didier Debroas, Cécile Roques, Christophe Leboulanger

article

Marine and Freshwater Research, CSIRO Publishing, 2021, ⟨10.1071/MF20276⟩

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Climate influences the response of community functional traits to local conditions in bromeliad invertebrate communities

auteur

Laura Melissa Guzman, M. Kurtis Trzcinski, Ignacio Barberis, Régis Céréghino, Diane Srivastava, Benjamin Gilbert, Valério Pillar, Paula de Omena, Andrew Macdonald, Bruno Corbara, Celine Leroy, Fabiola Ospina Bautista, Gustavo Romero, Pavel Kratina, Vanderlei Debastiani, Ana Gonįalves, Nicholas Marino, Vinicius Farjalla, Barbara Richardson, Michael Richardson, Olivier Dézerald, Gustavo Piccoli, Merlijn Jocqué, Guillermo Montero

article

Ecography, Wiley, 2021, 44 (3), pp.440-452. ⟨10.1111/ecog.05437⟩

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In situ resistance, not immigration, supports invertebrate community resilience to drought intensification in a Neotropical ecosystem

auteur

Camille Bonhomme, Régis Céréghino, Jean-Francois Carrias, Arthur Compin, Bruno Corbara, Vincent Jassey, Joséphine Leflaive, Vinicius Farjalla, Nicholas Marino, Thibaut Rota, Diane Srivastava, Celine Leroy

article

Journal of Animal Ecology, Wiley, In press, ⟨10.1111/1365-2656.13392⟩

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titre

A phylogenetic framework to investigate the microsporidian communities through metabarcoding and its application to lake ecosystems

auteur

Aurore Dubuffet, Marina Chauvet, Anne Moné, Didier Debroas, Cécile Lepère

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, In press, ⟨10.1111/1462-2920.15618⟩

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titre

High-Intensity interval training and α-linolenic acid supplementation improve DHA conversion and increase the abundance of gut mucosa-associated oscillospira bacteria

auteur

Claire Plissonneau, Frédéric Capel, Benoit Chassaing, Marine Dupuit, Florie Maillard, Ivan Wawrzyniak, Lydie Combaret, Frederic Dutheil, Monique Etienne, Guillaume Mairesse, Guillaume Chesneau, Nicolas Barnich, Nathalie Boisseau

article

Nutrients, MDPI, 2021, 788, 13 (3), pp.1-19. ⟨10.3390/nu13030788⟩

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Assessment of a Multiplex PCR for the Simultaneous Diagnosis of Intestinal Cryptosporidiosis and Microsporidiosis

auteur

Maxime Moniot, Céline Nourrisson, Charlotte Faure, Frédéric Delbac, Loïc Favennec, Frédéric Dalle, Cyril Garrouste, Philippe Poirier

article

Journal of Molecular Diagnostics, American Society for Investigative Pathology (ASIP), 2021, 23 (4), pp.417-423. ⟨10.1016/j.jmoldx.2020.12.005⟩

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2020

titre

Relationships between Plant Defense Inducer Activities and Molecular Structure of Gallomolecules

auteur

Pascale Goupil, Elodie Peghaire, Razik Benouaret, Claire Richard, Mohamad Sleiman, Hicham El Alaoui, Ayhan Kocer

article

Journal of Agricultural and Food Chemistry, American Chemical Society, 2020, 68 (52), pp.15409-15417. ⟨10.1021/acs.jafc.0c05719⟩

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Identification of botanical origin of bee-collected mixed pollen samples: a comparison between palynological and DNA metabarcoding methods

auteur

A. Quaresma, J.J.F. van der Steen, J. Amaral, David Biron, R. Brodschneider, V. Brusbardis, N.L. Carreck, G. Formato, K. Gratzer, F. Hatjina, O. Kilpinen, M. Pietropaoli, J. Rufino, F. Vejsnæs, M.A. Pinto

article

Trends in Biodiversity and Evolution | Metabarcoding and Metagenomics, Dec 2020, CIBIO-InBIO (virtual event), Portugal

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A comprehensive analysis of the global human gut archaeome from a thousand genome catalogue

auteur

Cynthia Maria Chibani, Alexander Mahnert, Guillaume Borrel, Alexandre Almeida, Almut Werner, Jean-François Brugère, Simonetta Gribaldo, Robert Finn, Ruth Schmitz, Christine Moissl-Eichinger

article

2020

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Impact of advance directives on the variability between intensivists in the decisions to forgo life-sustaining treatment

auteur

Margot Smirdec, Mercé Jourdain, Virginie Guastella, Céline Lambert, Jean-Christophe Richard, Laurent Argaud, Samir Jaber, Kada Klouche, Anne Medard, Jean Reignier, Jean-Philippe Rigaud, Jean-Marc Doise, Russell Chabanne, Bertrand Souweine, Jeremy Bourenne, Julie Delmas, Pierre-Marie Bertrand, Philippe Verdier, Jean-Pierre Quenot, Cecile Aubron, Nathanael Eisenmann, Pierre Asfar, Alexandre Fratani, Jean Dellamonica, Nicolas Terzi, Jean-Michel Constantin, Axelle van Lander, Renaud Guerin, Bruno Pereira, Alexandre Lautrette

article

Critical Care, BioMed Central, 2020, 24 (1), pp.672. ⟨10.1186/s13054-020-03402-7⟩

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Desiccation resistance traits predict freshwater invertebrate survival and community response to drought scenarios in a Neotropical ecosystem

auteur

Régis Céréghino, Léa Françoise, Camille Bonhomme, Jean-Francois Carrias, Arthur Compin, Bruno Corbara, Vincent Jassey, Joséphine Leflaive, Thibaut Rota, Vinicius Farjalla, Céline Leroy

article

Ecological Indicators, Elsevier, 2020, 119, pp.106839. ⟨10.1016/j.ecolind.2020.106839⟩

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titre

Mucormycosis in intensive care unit: surgery is a major prognostic factor in patients with hematological malignancy

auteur

Johanna Claustre, R. Larcher, Thomas Jouve, Anne-Sophie Truche, Saad Nseir, Julien Cadiet, Yoann Zerbib, Alexandre Lautrette, Jean-Michel Constantin, Pierre-Emmanuel Charles, Cédric Daubin, Rémi Coudroy, Jean Dellamonica, Laurent Argaud, Pierre Phelouzat, Damien Contou, Juliette Pocquet, Guillaume Voiriot, Jean-Christophe Navellou, Pierre Lavagne, Michel Durand, Muriel Cornet, Carole Schwebel, Nicolas Terzi

article

Annals of Intensive Care, SpringerOpen, 2020, 10 (1), ⟨10.1186/s13613-020-00673-9⟩

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Protist taxonomic and functional diversity in soil, freshwater and marine ecosystems

auteur

David Singer, Christophe Seppey, Guillaume Lentendu, Micah Dunthorn, David Bass, Lassâad Belbahri, Quentin Blandenier, Didier Debroas, G de Groot, Colomban de Vargas, Isabelle Domaizon, Clément Duckert, Irina Izaguirre, Isabelle Koenig, Gabriela Mataloni, M Schiaffino, Edward Mitchell, Stefan Geisen, Enrique Lara

article

Environment International, Elsevier, 2020, 146, pp.106262. ⟨10.1016/j.envint.2020.106262⟩

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titre

Rescoring ensembles of protein-protein docking poses using consensus approaches

auteur

Guillaume Launay, Masahito Ohue, Julia Prieto Santero, Yuri Matsuzaki, Cécile Hilpert, Nobuyuki Uchikoga, Takanori Hayashi, Juliette Martin

article

2020

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Study of bacterial communities in several naturally radioactive mineral sources in Auvergne (Massif Central, France) and their role in uranium biogeochemistry.

auteur

Guillaume Holub, Claire Sergeant, Marie-Hélène Vesvres, Clarisse Mallet, Lory-Anne Baker, Sofia Kolovi, Aude Beauger, David Biron, Patrick Chardon, Lydia Maigne, Didier Miallier, Hervé Michel, Gilles Montavon, Vincent Breton

article

5éme colloque des Zones Ateliers – CNRS, Nov 2020, En distanciel, cause Covid-19, France

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Influence de la radioactivité naturellement renforcée (NOR) sur les peuplements de diatomées actuelles et passées des sources minérales.

auteur

Lory-Anne Baker, Beauger Aude, Sofia Kolovi, Olivier Voldoire, Alain Elisabeth, Jonathan Colombet, Vincent Breton, Patrick Chardon, Didier Miallier, Céline Bailly, Gilles Montavon, Agnes Bouchez, Frédéric Rimet, Cécile Chardon, David Biron

article

5e colloque des Zones Ateliers – CNRS 2000-2020, 20 ans de recherche du Réseau des Zones Ateliers, Nov 2020, Tours, France

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A global multinational survey of cefotaxime-resistant coliforms in urban wastewater treatment plants

auteur

Roberto B.M. Marano, Telma Fernandes, Célia Manaia, Olga Nunes, Donald Morrison, Thomas Berendonk, Norbert Kreuzinger, Tanel Telson, Gianluca Corno, Despo Fatta-Kassinos, Christophe Merlin, Edward Topp, Edouard Jurkevitch, Leonie Henn, Andrew Scott, Stefanie Heß, Katarzyna Slipko, Mailis Laht, Veljo Kisand, Andrea Cesare, Popi Karaolia, Stella Michael, Alice Petre, Roberto Rosal, Amy Pruden, Virginia Riquelme, Ana Agüera, Belen Esteban, Aneta Luczkiewicz, Agnieszka Kalinowska, Anne Leonard, William Gaze, Anthony Adegoke, Thor Stenstrom, Alfieri Pollice, Carlo Salerno, Carsten Schwermer, Pawel Krzeminski, Hélène Guilloteau, Erica Donner, Barbara Drigo, Giovanni Libralato, Marco Guida, Helmut Bürgmann, Karin Beck, Hemda Garelick, Marta Tacão, Isabel Henriques, Isabel Martínez-Alcalá, Jose Guillén-Navarro, Magdalena Popowska, Marta Piotrowska, Marcos Quintela-Baluja, Joshua Bunce, Maria Polo-López, Samira Nahim–granados, Marie-Noëlle Pons, Milena Milakovic, Nikolina Udikovic-Kolic, Jérôme Ory, Traore Ousmane, Pilar Caballero, Antoni Oliver, Sara Rodriguez-Mozaz, Jose Balcazar, Thomas Jager, Thomas Schwartz, Ying Yang, Shichun Zou, Yunho Lee, Younggun Yoon, Bastian Herzog, Heidrun Mayrhofer, Om Prakash, Yogesh Nimonkar, Ester Heath, Anna Baraniak, Joana Abreu-Silva, Manika Choudhury, Leonardo Munoz, Stela Krizanovic, Gianluca Brunetti, Ayella Maile-Moskowitz, Connor Brown, Eddie Cytryn

article

Environment International, Elsevier, 2020, 144, pp.106035. ⟨10.1016/j.envint.2020.106035⟩

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Comparison of DNA extraction methods and real-time PCR assays for the detection of blastocystis sp. in stool specimens

auteur

Céline Nourrisson, Julie Brunet, Pierre Flori, Maxime Moniot, Virginie Bonnin, Frédéric Delbac, Philippe Poirier

article

Microorganisms, MDPI, 2020, 8 (11), pp.1-8. ⟨10.3390/microorganisms8111768⟩

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A drift‐barrier model drives the genomic landscape of a structured bacterial population

auteur

Hélène Gardon, Corinne Biderre-Petit, Isabelle Jouan-Dufournel, Gisèle Bronner

article

Molecular Ecology, Wiley, 2020, 29 (21), pp.4143-4156. ⟨10.1111/mec.15628⟩

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High Prevalence of Headaches During Covid‐19 Infection: A Retrospective Cohort Study

auteur

Louis Poncet‐megemont, Pauline Paris, Amélie Tronchere, Jean‐pascal Salazard, Bruno Pereira, Radhouane Dallel, Claire Aumeran, Jean Beytout, Christine Jacomet, Henri Laurichesse, Olivier Lesens, Natacha Mrozek, Magali Vidal, Xavier Moisset

article

Headache: The Journal of Head and Face Pain, American Headache Society, 2020, 60 (10), pp.2578-2582. ⟨10.1111/head.13923⟩

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Unveiling Crucivirus Diversity by Mining Metagenomic Data

auteur

Ignacio de la Higuera, George Kasun, Ellis Torrance, Alyssa Pratt, Amberlee Maluenda, Jonathan Colombet, Maxime Bisseux, Viviane Ravet, Anisha Dayaram, Daisy Stainton, Simona Kraberger, Peyman Zawar-Reza, Sharyn Goldstien, James Briskie, Robyn White, Helen Taylor, Christopher Gomez, David Ainley, Jon Harding, Rafaela Fontenele, Joshua Schreck, Simone Ribeiro, Stephen Oswald, Jennifer Arnold, François Enault, Arvind Varsani, Kenneth Stedman

article

mBio, 2020, 11 (5), ⟨10.1128/mBio.01410-20⟩

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Nutritional constraints on growth and metabolic rate of an ectotherm consumers (Daphnia magna) in a context of global change : Experimental approach by microcalorimetry

auteur

Thomas Ruiz

article

Ecology, environment. Université Clermont Auvergne, 2020. English. ⟨NNT : 2020CLFAC029⟩

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Array of microbial indicators, a promise for a better monitoring of pesticide effects on stream biological quality

auteur

Jeremy Jabiol, Joan Artigas, Jérémie Beguet, Chloé Bonnineau, Eric Chauvet, Marion Devers, François Guérold, Matthieu Le Dréau, Camille Legrand, Christelle Margoum, Fabrice Martin-Laurent, Nicolas Mazzella, Stéphane Pesce, Nadine Rouard, Véronique Gouy

article

EcotoxicoMic 2020, 2nd International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier, France

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titre

Bioremediation of agricultural soils: a natural preventive approach to reduce the environmental contamination by pesticides

auteur

L. Carles, A. Wauquier, P. Joly, C. Bardon, B. Combourieu, I. Batisson, Pascale Besse-Hoggan

article

EcotoxicoMic 2020, 2nd International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier, France

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Metabolic response of Microbacterium sp. C448 exposed to environmental and medicinal concentrations of sulfamethazine antibiotic

auteur

Laurianne Paris, Muriel Joly, Marion Devers-Lamrani, Nadine Rouard, Didier Viala, Michel Hébraud, Fabrice Martin-Laurent, Isabelle Batisson, Pascale Besse-Hoggan

article

EcotoxicoMic 2020, 2nd International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier, France

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A combined LC-MS and NMR approach to reveal metabolic changes in the hemolymph of honeybees infected by the gut parasite Nosema ceranae

auteur

Cyril Jousse, Céline Dalle, Angélique Abila, Mounir Traïkia, Marie Diogon, Bernard Lyan, Hicham El Alaoui, Cyril Vidau, Frédéric Delbac

article

Journal of Invertebrate Pathology, Elsevier, 2020, 176, pp.107478. ⟨10.1016/j.jip.2020.107478⟩

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Seasonal microbial food web dynamics in contrasting Southern Ocean productivity regimes

auteur

Urania Chistaki, Audrey Guenegues, Yan Liu, Stéphane Blain, Philippe Catala, Jonathan Colombet, Pavla Debeljak, Ludwig Jardillier, Solène Irion, Frédéric Planchon, Ingrid Sassenhagen, Télesphore Sime-Ngando, Ingrid Obernosterer

article

Limnology and Oceanography, Association for the Sciences of Limnology and Oceanography, 2020, ⟨10.1002/lno.11591⟩

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Biological properties of copper-doped biomaterials for orthopedic applications: A review of antibacterial, angiogenic and osteogenic aspects

auteur

Aurélie Jacobs, Guillaume Renaudin, Christiane Forestier, J.-M. Nedelec, Stéphane Descamps

article

Acta Biomaterialia, Elsevier, 2020, 117, pp.21-39. ⟨10.1016/j.actbio.2020.09.044⟩

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Transient Dynamics of Archaea and Bacteria in Sediments and Brine Across a Salinity Gradient in a Solar Saltern of Goa, India

auteur

Kabilan Mani, Najwa Taïb, Mylène Hugoni, Gisèle Bronner, Judith Bragança, Didier Debroas

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2020, 11, pp.1-19. ⟨10.3389/fmicb.2020.01891⟩

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Stable isotopes of fatty acids: current and future perspectives for advancing trophic ecology

auteur

Cornelia Twining, Sami Taipale, Liliane Ruess, Alexandre Bec, Dominik Martin-Creuzburg, Martin Kainz

article

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2020, 375 (1804), pp.20190641. ⟨10.1098/rstb.2019.0641⟩

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A European multicentre evaluation of detection and typing methods for human enteroviruses and parechoviruses using RNA transcripts

auteur

A. Hayes, D. Nguyen, M. Andersson, A. Antón, J.‐l. Bailly, S. Beard, K. Benschop, N. Berginc, S. Blomqvist, E. Cunningham, D. Davis, J. Dembinski, S. Diedrich, S. Dudman, R. Dyrdak, G. Eltringham, S. Gonzales‐goggia, R. Gunson, H. Howson‐wells, A. Jääskeläinen, F. López‐labrador, M. Maier, M. Majumdar, S. Midgley, A. Mirand, U. Morley, S. Nordbø, S. Oikarinen, H. Osman, A. Papa, L. Pellegrinelli, A. Piralla, N. Rabella, J. Richter, M. Smith, A. Söderlund Strand, K. Templeton, B. Vipond, T. Vuorinen, C. Williams, E. Wollants, K. Zakikhany, T. Fischer, H. Harvala, P. Simmonds

article

Journal of Medical Virology, Wiley-Blackwell, 2020, 92 (8), pp.1065-1074. ⟨10.1002/jmv.25659⟩

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titre

The host-associated archaeome

auteur

Guillaume Borrel, Jean-François Brugere, Simonetta Gribaldo, Ruth Schmitz, Christine Moissl-Eichinger

article

Nature Reviews Microbiology, Nature Publishing Group, 2020, ⟨10.1038/s41579-020-0407-y⟩

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Analysis of bacterial and archaeal communities associated with Fogo volcanic soils of different ages

auteur

Corinne Biderre-Petit, Corentin Hochart, Hélène Gardon, Eric Dugat-Bony, Sébastien Terrat, Isabelle Jouan-Dufournel, Raphael Paris

article

FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2020, 96 (7), ⟨10.1093/femsec/fiaa104⟩

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How does continuous venovenous hemofiltration theoretically expose (ex-vivo models) inpatients to diethylhexyladipate, a plasticizer of PVC medical devices?

auteur

Lise Bernard, Mélanie Bailleau, Teuta Eljezi, Philip Chennell, Bertrand Souweine, Alexandre Lautrette, Valérie Sautou

article

Chemosphere, Elsevier, 2020, 250, pp.126241. ⟨10.1016/j.chemosphere.2020.126241⟩

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Testing markers to characterize microbial communities in food ecosystems using a metagenomics approach

auteur

Claire Vincent, Serge Casaregola, Monika Coton, Céline Delbes, Hugo Devillers, Eric Dugat-Bony, Stephane Guezenec, Kate Howell, Francoise Irlinger, Jean Luc Legras, Valentin Loux, Elisa Michel, Jerome Mounier, Cécile Neuvéglise, Thibault Nidelet, Audrey Pawtowski, Pierre Renault, Delphine Sicard, Monique Zagorec, Olivier Rué

article

JOBIM, Jun 2020, Montpellier, France

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The IL-22 pathway as target to relieve visceral pain and animal well-being

auteur

Maeva Meynier, Elodie Baudu, Manon Defaye, Y Wawzyniak, Frederic Delbac, Nicolas Barnich, D Ardid, Philippe Poirier, Romain Villeger, J.M. Chatel, V Livrelli, Mathilde Bonnet, Frederic Carvalho

article

ICTRHN, Jun 2020, Clermont-Ferrand, France

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Trophic conditions influence widespread distribution of Aster-Like nanoparticles within aquatic environments

auteur

Maxime Fuster, Hermine Billard, Marie Mandart, Johannes Steiger, Telesphore Sime-Ngando, Jonathan Colombet

article

Microbial Ecology, Springer Verlag, 2020, 80 (4), pp.741-745. ⟨10.1007/s00248-020-01541-6⟩

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Fecal dysbiosis associated with colonic hypersensitivity and behavioral alterations in chronically Blastocystis-infected rats

auteur

Manon Defaye, Céline Nourrisson, Elodie Baudu, Amandine Lashermes, Maeva Meynier, Mathieu Meleine, Ivan Wawrzyniak, Virginie Bonnin, Julie Barbier, Benoit Chassaing, Catherine Godfraind, Agathe Gelot, Nicolas Barnich, Denis Ardid, Mathilde Bonnet, Frédéric Delbac, Frédéric Antonio Carvalho, Philippe Poirier

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.9146. ⟨10.1038/s41598-020-66156-w⟩

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Archaea, specific genetic traits, and development of improved bacterial live biotherapeutic products: another face of next-generation probiotics

auteur

Khaled Fadhlaoui, Marie-Edith Arnal, Matthieu Martineau, Paméla Camponova, Bernard Ollivier, Paul O’toole, Jean-François Brugere

article

Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2020, 104 (11), pp.4705-4716. ⟨10.1007/s00253-020-10599-8⟩

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Multi‐model assessment of hydrological and environmental impacts on streambed microbes in Mediterranean catchments

auteur

Giulia Gionchetta, Joan Artigas, Rebeca Arias‐real, Francesc Oliva, Anna Maria Romaní

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2020, 22 (6), pp.2213-2229. ⟨10.1111/1462-2920.14990⟩

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Epidemiological investigation for grouped cases of Trichosporon asahii using whole genome and IGS1 sequencing

auteur

Marie Desnos-Ollivier, Corinne Maufrais, Marc Pihet, Christine Aznar, Françoise Dromer, N. Brieu, T. Chouaki, S. Bland, V. Blanc, A.P. Bellanger, F. Grenouillet, L. Millon, S. Brun, I. Poilane, F. Gabriel, A.L. Roux, D. Quinio, E. Moalic, J. Bonhomme, P. Poirier, C. Nourrisson, F. Botterel, N. Fauchet, E. Forget, F. Dalle, P. Cahen, C. Lawrence, O. Faure, D. Maubon, M. Cornet, M. Nicolas, M. Demar, C. Nabet, A. Angoulvant, S. Picot, N. Traversier, O. Eloy, B. Sendid, B. Bouteille, F. Persat, M. Wallon, S. Ranque, H. Piarroux, N. Desbois, L. Collet, N. Bourgeois, L. Lachaux, F. Moriot, O. Mouquet, L. Hasseine, M. Gari‐toussaint, M. Sasso, D. Poisson, A. Minoza, C. Kauffman, D. Toubas, J.P. Gangneux, L. Favennec, N. Godineau, H. Rabérin, V. Bru, S. Cassaing, E. Bailly, E. Chachaty, C. Bonnal, A. Paugam, B. Heym, M.‐e. Bougnoux, E. Sitterle, Alexandre Alanio, D. Moissenet, S. Bonacorsi, P. Mariani

article

Mycoses, Wiley, 2020, ⟨10.1111/myc.13126⟩

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Klebsiella pneumoniae survival and regrowth in endoscope channel biofilm exposed to glutaraldehyde and desiccation

auteur

A. Cholley, O. Traoré, C. Hennequin, C. Aumeran

article

European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2020, 39 (6), pp.1129-1136. ⟨10.1007/s10096-020-03818-7⟩

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Interaction between glyphosate and dissolved phosphorus on bacterial and eukaryotic communities from river biofilms

auteur

Louis Carles, Joan Artigas

article

Science of the Total Environment, Elsevier, 2020, 719, pp.137463. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.137463⟩

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Reconstruction of plasmids by shotgun sequencing from environmental DNA: which bioinformatic workflow?

auteur

Cécile Hilpert, Geneviève Bricheux, Didier Debroas

article

Briefings in Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2020, 2020, pp.1 - 14. ⟨10.1093/bib/bbaa059⟩

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Partitioning of microbial cells between clouds and precipitation

auteur

Raphaëlle Péguilhan, Ludovic Besaury, Florent Rossi, Jean-Luc Baray, Thibaud Mas, Laurent Deguillaume, Barbara Ervens, Pierre Amato

article

EGU General Assembly 2020, May 2020, Vienne, Austria. ⟨10.5194/egusphere-egu2020-2876⟩

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Biofilm interactions can modulate microbial decomposer responses to antibiotics

auteur

Martin Paumelle, Florence Donnadieu, Muriel Joly, Joan Artigas, Pascale Besse-Hoggan

article

30th Annual Meeting SETAC Europe,, May 2020, Dublin, Ireland

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Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018-2019 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee

auteur

Evelien Adriaenssens, Matthew Sullivan, Petar Knezevic, Leonardo van Zyl, B. Sarkar, Bas Dutilh, Poliane Alfenas-Zerbini, Małgorzata Łobocka, Yigang Tong, James Rodney Brister, Andrea Moreno Switt, Jochen Klumpp, Ramy Karam Aziz, Jakub Barylski, Jumpei Uchiyama, Rob Edwards, Andrew Kropinski, Nicola Petty, Martha Clokie, Alla Kushkina, Vera Morozova, Siobain Duffy, Annika Gillis, Janis Rumnieks, İpek Kurtböke, Nina Chanishvili, Lawrence Goodridge, Johannes Wittmann, Rob Lavigne, Ho Bin Jang, David Prangishvili, François Enault, Dann Turner, Minna Poranen, Hanna Oksanen, Mart Krupovic

article

Archives of Virology, Springer Verlag, 2020, 165 (5), pp.1253-1260. ⟨10.1007/s00705-020-04577-8⟩

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Honeybee gut microbiota dysbiosis in pesticide/parasite co-exposures is mainly induced by Nosema ceranae

auteur

Laurianne Paris, Elodie Peghaire, Anne Mone, Marie Diogon, Didier Debroas, Frédéric Delbac, Hicham El Alaoui

article

Journal of Invertebrate Pathology, Elsevier, 2020, 172, pp.107348. ⟨10.1016/j.jip.2020.107348⟩

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Dissolved organic matter does not promote glyphosate degradation in auto-heterotrophic aquatic microbial communities

auteur

Joan Artigas, Isabelle Batisson, Louis Carles

article

Environmental Pollution, Elsevier, 2020, 259, pp.113951. ⟨10.1016/j.envpol.2020.113951⟩

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Antifungal susceptibility testing practices in mycology laboratories in France, 2018

auteur

A.-P. Bellanger, F. Persat, F. Foulet, C. Bonnal, I. Accoceberry, C. Angebault, A. Angoulvant, O. Augereau, E. Bailly, F. Bert, J. Bonhomme, J.-P. Bouchara, M.-E. Bougnoux, P. Bourdeau, B. Bouteille, S. Brun, K. Brunet, A.-M. Camin-Ravenne, S. Cassaing, T. Chouaki, M. Cornet, D. Costa, N. Desbois, J. Dorin, A. Fekkar, A. Fiacre, E. Fréalle, J.-P. Gangneux, J. Guillot, J. Guitard, L. Hasseine, A. Huguenin, L. Lachaud, S. Larréché, R.-A. Lavergne, S. Le Gal, Y. Le Govic, V. Letscher-Bru, M. Machouart, E. Mazars, C. Nourrisson, A. Paugam, S. Ranque, V. Risco-Castillo, M. Sasso, M. Sautour, B. Sendid, Y. Senghor, F. Botterel, Eric Dannaoui

article

Journal of Medical Mycology / Journal de Mycologie Médicale, Elsevier Masson, 2020, 30 (2), pp.100970. ⟨10.1016/j.mycmed.2020.100970⟩

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Aphids in focus: unravelling their complex ecology and evolution using genetic and molecular approaches

auteur

Hugh Loxdale, Adalbert Balog, David Biron

article

Biological Journal of the Linnean Society, Linnean Society of London, 2020, 129 (3), pp.507-531. ⟨10.1093/biolinnean/blz194⟩

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Resource availability drives bacterial succession during leaf-litter decomposition in a bromeliad ecosystem

auteur

Jean-Francois Carrias, Mélanie Gerphagnon, Hector Rodriguez Perez, Guillaume Borrel, Camille Loiseau, Bruno Corbara, Régis Cereghino, Isabelle Mary, Céline Leroy

article

FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2020, 96 (4), pp.fiaa045. ⟨10.1093/femsec/fiaa045⟩

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Role of Biofilms in Contaminant Bioaccumulation and Trophic Transfer in Aquatic Ecosystems: Current State of Knowledge and Future Challenges

auteur

Chloé Bonnineau, Joan Artigas, Betty Chaumet, Aymeric Dabrin, Juliette Fabure, Benoît Ferrari, Jeremie Lebrun, Christelle Margoum, Nicolas Mazzella, Cecile Miege, Soizic Morin, Emmanuelle Uher, Marc Babut, Stéphane Pesce

article

Reviews of Environmental Contamination and Toxicology (Continuation of Residue Reviews), Springer, pp.115 - 153, 2020, ⟨10.1007/398_2019_39⟩

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The effect of natural radioactivity on diatom communities in mineral springs

auteur

Fanny Millan, Cheilla Izere, Vincent Breton, Olivier Voldoire, David Biron, Carlos Wetzel, Didier Miallier, Elisabeth Allain, Luc Ector, Aude Beauger

article

Botany Letters, Taylor & Francis, 2020, 167, pp.95-113. ⟨10.1080/23818107.2019.1691051⟩

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A Pediococcus strain to rescue honeybees by decreasing Nosema ceranae- and pesticide-induced adverse effects

auteur

Elodie Peghaire, Anne Mone, Frédéric Delbac, Didier Debroas, Frédérique Chaucheyras-Durand, Hicham El Alaoui

article

Biology, MDPI 2020, 163, pp.138-146. ⟨10.1016/j.pestbp.2019.11.006⟩

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AUTOMATIC DETECTION AND CLASSIFICATION OF HONEY BEE COMB CELLS USING DEEP LEARNING

auteur

Thiago Alves, M Pinto, Paulo Ventura, Cátia Neves, David Biron, Arnaldo Junior, Pedro L. de Paula Filho, Pedro Rodrigues

article

Computers and Electronics in Agriculture, Elsevier, 2020

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Differential impact of top-down and bottom-up forces in structuring freshwater bacterial communities

auteur

A Pradeep ram, J Keshri, T Sime-Ngando

article

FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2020, 96 (2), ⟨10.1093/femsec/fiaa005⟩

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Monitoring of enterovirus diversity in wastewater by ultra-deep sequencing: An effective complementary tool for clinical enterovirus surveillance

auteur

Maxime Bisseux, Didier Debroas, Audrey Mirand, Christine Archimbaud, Hélène Peigue-Lafeuille, Jean-Luc Bailly, Cécile Henquell

article

Water Research, IWA Publishing, 2020, 169, pp.115246. ⟨10.1016/j.watres.2019.115246⟩

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Freshwater Perkinsea: diversity, ecology and genomic information

auteur

M Jobard, I Wawrzyniak, G Bronner, D Marie, A Vellet, T Sime-Ngando, D Debroas, C Lepère

article

Journal of Plankton Research, Oxford University Press (OUP), 2020, 42 (1), pp.3-17. ⟨10.1093/plankt/fbz068⟩

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Let’s talk about POÆMS !! A story of photosynthetic organisms from atmospheric ecosystem in a multiscale study

auteur

A. Patrigeon, H. Billard, J. Colombet, J.-L. Baray, C. Judon, M. Lagree, B. Dieme, D. Latour, Cyril Jousse

article

Metabomeeting, Jan 2020, Toulouse, France

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L’homme et l'abeille, une histoire des pratiques

auteur

Bruno Corbara, Eric Fayet

article

2020

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Co-circulation of multiple enterovirus D68 subclades, including a novel B3 cluster, across Europe in a season of expected low prevalence, 2019/20

auteur

Sofie Elisabeth Midgley, Kimberley Benschop, Robert Dyrdak, Audrey Mirand, Jean-Luc Bailly, Sibylle Bierbaum, Stefan Buderus, Sindy Böttcher, Anna-Maria Eis-Hübinger, Mario Hönemann, Veronika Vorobieva Jensen, Ulla Birgitte Hartling, Cécile Henquell, Marcus Panning, Marianne Kragh Thomsen, Emma Hodcroft, Adam Meijer

article

Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2020, 25 (2), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2020.25.2.1900749⟩

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Temperature and nutrient effects on the relative importance of brown and green pathways for stream ecosystem functioning: A mesocosm approach

auteur

Alice Gossiaux, Marc Rollin, Francois Guerold, Vincent Felten, Martin Laviale, Quentin Bachelet, Pascal Poupin, Eric Chauvet, Alexandre Bec, Michaël Danger

article

Freshwater Biology, Wiley, 2020, 65 (7), pp.1239-1255. ⟨10.1111/fwb.13474⟩

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Analysis of Spounaviruses as a Case Study for the Overdue Reclassification of Tailed Phages

auteur

Jakub Barylski, Francois Enault, Bas Dutilh, Margo Bp Schuller, Robert Edwards, Annika Gillis, Jochen Klumpp, Petar Knezevic, Mart Krupovic, Jens Kuhn, Rob Lavigne, Hanna Oksanen, Matthew Sullivan, Ho Bin Jang, Peter Simmonds, Pakorn Aiewsakun, Johannes Wittmann, Igor Tolstoy, J Rodney Brister, Andrew Kropinski, Evelien Adriaenssens

article

Systematic Biology, Oxford University Press (OUP), 2020, 69 (1), pp.110-123. ⟨10.1093/sysbio/syz036⟩

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Shifting levels of ecological network’s analysis reveals different system properties

auteur

N. Niquil, M. Haraldsson, T. Sime-Ngando, P. Huneman, S.R. Borrett

article

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2020, 375 (1796), ⟨10.1098/rstb.2019.0326⟩

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Extreme rainfall events alter the trophic structure in bromeliad tanks across the Neotropics

auteur

Gustavo Romero, Nicholas Marino, A Andrew, M Macdonald, Reǵis Ceŕeǵhino, M Trzcinski, Acosta Mercado, Céline Leroy, Bruno Corbara, Vinicius Farjalla, Ignacio Barberis, Olivier Deźerald, Edd Hammill, Trisha Atwood, Gustavo Piccoli, Fabiola Ospina Bautista, Jean-Francois Carrias, Juliana Leal, Guillermo Montero, Pablo Antiqueira, Rodrigo Freire, Emilio Realpe, Sarah Amundrud, Paula de Omena, Alice Campos, Pavel Kratina, Eoin O'Gorman, Diane Srivastava

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 11 (1), pp.3215. ⟨10.1038/s41467-020-17036-4⟩

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Bioactive polysaccharides from microalgae

auteur

Nastasia Prybylski, Claire Toucheteau, Hicham El Alaoui, Nicolas Bridiau, Thierry Maugard, Slim Abdelkafi, Imen Fendri, Cédric Delattre, Pascal Dubessay, Guillaume Pierre, Philippe Michaud

article

Handbook of Microalgae-Based Processes and Products, Elsevier, pp.533-571, 2020, ⟨10.1016/B978-0-12-818536-0.00020-8⟩

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Identification of sulfur components enhancing the anti-Candida effect of Lactobacillus rhamnosus Lcr35

auteur

Caroline Dausset, Stéphanie Bornes, Sylvie Miquel, Nathalie Kondjoyan, Magaly Angenieux, Laurence Nakusi, Philippe Veisseire, Elina Alaterre, Luis Bermúdez-Humarán, Philippe Langella, Erwan Engel, Christiane Forestier, Adrien Nivoliez

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.17074. ⟨10.1038/s41598-020-74027-7⟩

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Ecological determinants of community structure across the trophic levels of freshwater food webs: a test using bromeliad phytotelmata

auteur

Régis Cereghino, Bruno Corbara, Céline Leroy, Jean-Francois Carrias

article

Hydrobiologia, Springer, 2020, 847, pp.391 - 402. ⟨10.1007/s10750-019-04100-4⟩

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Ecological response to altered rainfall differs across the Neotropics

auteur

Diane S. Srivastava, Régis Cereghino, M. Kurtis Trzcinski, Arthur Andrew M. Macdonald, Nicholas A. C. Marino, Dimaris Acosta Mercado, Céline Leroy, Bruno Corbara, Gustavo Q. Romero, Vinicius F. Farjalla, Ignacio M. Barberis, Olivier Dezerald, Edd Hammill, Trisha B. Atwood, Gustavo C. O. Piccoli, Fabiola Ospina Bautista, Jean-Francois Carrias, Juliana S. Leal, Guillermo Montero, Pablo Antiqueira, Rodrigo Freire, Emilio Realpe, S. Amundrud, Paula de Omena, Alice Campos

article

Ecology, Ecological Society of America, 2020, 101 (4), pp.e02984. ⟨10.1002/ecy.2984⟩

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Species niches, not traits, determine abundance and occupancy patterns: A multi‐site synthesis

auteur

Nicholas A. C. Marino, Régis Cereghino, Benjamin Gilbert, Jana S. Petermann, Diane S. Srivastava, Paula M. Omena, Fabiola Ospina Bautista, Laura Melissa Guzman, Gustavo Q. Romero, M. Kurtis Trzcinski, Ignacio M. Barberis, Bruno Corbara, Vanderlei J. Debastiani, Olivier Dézerald, Pavel Kratina, Céline Leroy, Arthur Andrew M. Macdonald, Guillermo Montero, Valério D. Pillar, Barbara A. Richardson, Michael J. Richardson, Stanislas Talaga, Ana Z. Gonçalves, Gustavo C. O. Piccoli, Merlijn Jocqué, Vinicius F. Farjalla, Jonathan Belmaker

article

Global Ecology and Biogeography, Wiley, 2020, 29 (2), pp.295-308. ⟨10.1111/geb.13029⟩

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Assessing the response of micro-eukaryotic diversity to the Great Acceleration using lake sedimentary DNA

auteur

François Keck, Laurent Millet, Didier Debroas, David Etienne, Didier Galop, Damien Rius, Isabelle Domaizon

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 8 p. ⟨10.1038/s41467-020-17682-8⟩

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Diversity and Structure of the Prokaryotic Communities Indigenous to Two Volcanic Lakes: Nyos and Monoun in Cameroon

auteur

Paul-Alain Nana, Moïse Nola, Geneviève Bricheux, Zéphyrin Fokam, Pierre Ngassam, Dickson Achuo Enah, Jonathan Colombet, Agnès Vellet, Anne Mone, Viviane Ravet, Didier Debroas, Télesphore Sime-Ngando

article

Open Journal of Ecology, SCIRP, 2020, 10 (09), pp.632-650. ⟨10.4236/oje.2020.109039⟩

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Ant Gardens

auteur

Bruno Corbara

article

Encyclopedia of Social Insects, Springer International Publishing, pp.1 - 4, 2020, ⟨10.1007/978-3-319-90306-4_7-1⟩

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A mouse ear skin model to study the dynamics of innate immune Running title: Biofilm-dependent modulation of physiological inflammation

auteur

Aizat Abdul Hamid, Laurence Nakusi, Mickael Givskov, Young-Tae Chang, Claire Marquès, Pascale Gueirard

article

BMC Microbiology, BioMed Central, 2020, 20, ⟨10.1186/s12866-019-1635-z⟩

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Contrasting pelagic ecosystem functioning in eastern and western Baffin Bay revealed by trophic network modeling

auteur

Blanche Saint-Béat, Brian Fath, Cyril Aubry, Jonathan Colombet, Julie Dinasquet, Louis Fortier, Virginie Galindo, Pierre-Luc Grondin, Fabien Joux, Catherine Lalande, Mathieu Leblanc, Patrick Raimbault, Télesphore Sime-Ngando, Jean-Eric Tremblay, Daniel Vaulot, Frédéric Maps, Marcel Babin

article

Elementa: Science of the Anthropocene, University of California Press, 2020, 8, ⟨10.1525/elementa.397⟩

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Lyme Snap: a feasibility study of on-line declarations of erythema migrans in a rural area of France

auteur

P. Letertre-Gibert, Gwenaël Vourc'H, Isabelle Lebert, Magalie René-Martellet, V. Corbin-Valdenaire, D. Portal-Martineau, J. Beytout, O. Lesens

article

Ticks and Tick-borne Diseases, Elsevier, 2020, 11, ⟨10.1016/j.ttbdis.2019.101301⟩

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Inducing Plant Defense Reactions in Tobacco Plants with Phenolic-Rich Extracts from Red Maple Leaves: A Characterization of Main Active Ingredients

auteur

Elodie Peghaire, Samar Hamdache, Antonin Galien, Mohamad Sleiman, Alexandra ter Halle, Hicham El Alaoui, Ayhan Kocer, Claire Richard, Pascale Goupil

article

Forests, MDPI, 2020, 11 (6), pp.705. ⟨10.3390/f11060705⟩

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Severe Acute Flaccid Myelitis Associated With Enterovirus in Children: Two Phenotypes for Two Evolution Profiles?

auteur

Melodie Aubart, Cyril Gitiaux, Charles Joris Roux, Raphael Levy, Isabelle Schuffenecker, Audrey Mirand, Nathalie Bach, Florence Moulin, Jean Bergounioux, Marianne Leruez-Ville, Flore Rozenberg, Delphine Sterlin, Lucile Musset, Denise Antona, Nathalie Boddaert, Shen Ying Zhang, Manoelle Kossorotoff, Isabelle Desguerre

article

Frontiers in Neurology, Frontiers, 2020, 11, pp.343. ⟨10.3389/fneur.2020.00343⟩

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2019

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Distinct responses from bacterial, archaeal and fungal streambed communities to severe hydrological disturbances

auteur

G. Gionchetta, A. Romaní, F. Oliva, J. Artigas

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-49832-4⟩

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Screening of marine microalgae: Investigation of new exopolysaccharide producers

auteur

Clément Gaignard, Céline Laroche, Guillaume Pierre, Pascal Dubessay, Cédric Delattre, Christine Gardarin, Priscilla Gourvil, Ian Probert, Aurore Dubuffet, Philippe Michaud

article

Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, Elsevier, 2019, 44, pp.101711. ⟨10.1016/j.algal.2019.101711⟩

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Diagnosis and management of metabolic acidosis: guidelines from a French expert panel

auteur

Boris Jung, Mikaël Martinez, Yann-Erick Claessens, Michaël Darmon, Kada Klouche, Alexandre Lautrette, Jacques Levraut, Eric Maury, Mathieu Oberlin, Nicolas Terzi, Damien Viglino, Youri Yordanov, Pierre-Géraud Claret, Naiké Bigé

article

Annals of Intensive Care, SpringerOpen, 2019, 9 (1), pp.92. ⟨10.1186/s13613-019-0563-2⟩

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Editorial: Viruses, Genetic Exchange, and the Tree of Life

auteur

Nikos Kyrpides, Simon Roux, Arshan Nasir, Gustavo Caetano-Anollés, Jean-Michel Claverie

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.02782⟩

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Abeilles Une histoire intime avec l’humanité.

auteur

David Biron, Jean-Marc Bonmatin, Dorothée Dussy, Lionel Garnery, Martin Giurfa, Delphine Julien, Martine Regert, Arnaud Zucker

article

Martine REGERT. .Le Cherche-Midi; CNRS, pp.159, 2019, 978-2-7491-6224-9

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Cutting-Edge Evolution of Insects: Factors Governing Ecological Divergence of Natural Populations Assessed Using Molecular and Genetic Markers", A special issue of Insects (ISSN 2075-4450). https://www.mdpi.com/journal/insects/special_issues/cutting_edge#info

auteur

Hugh D Loxdale, Astrid T. Groot, David Biron

article

Insects, 10, 2019, Cutting-Edge Evolution of Insects: Factors Governing Ecological Divergence of Natural Populations Assessed Using Molecular and Genetic Markers

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Viruses as key reservoirs of antibiotic resistance genes in the environment

auteur

Didier Debroas, Cléa Siguret

article

ISME Journal, Nature Publishing Group, 2019, 13 (11), pp.2856-2867. ⟨10.1038/s41396-019-0478-9⟩

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Discovery of High Abundances of Aster-Like Nanoparticles in Pelagic Environments: Characterization and Dynamics

auteur

Jonathan Colombet, Hermine Billard, Bernard Viguès, Stephanie Balor, Christelle Boulé, Lucie Geay, Karim Benzerara, Nicolas Menguy, Guy Ilango, Maxime Fuster, François Enault, Corinne Bardot, Véronique Gautier, Angia Sriram Pradeep Ram, Télesphore Sime-Ngando

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.02376⟩

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Podocotyle atomon (Trematoda: Digenea) impacts reproductive behaviour, survival and physiology in Gammarus zaddachi (Amphipoda)

auteur

Katherine L. Arundell, Aurore Dubuffet, Nina Wedell, Jamie Bojko, Martin S. J. Rogers, Alison M. Dunn

article

Diseases of Aquatic Organisms, Inter Research, 2019, 136 (1), pp.51-62. ⟨10.3354/dao03416⟩

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Effect of Postextubation High-Flow Nasal Oxygen With Noninvasive Ventilation vs High-Flow Nasal Oxygen Alone on Reintubation Among Patients at High Risk of Extubation Failure

auteur

Arnaud Thille, Grégoire Muller, Arnaud Gacouin, Rémi Coudroy, Maxens Decavele, Romain Sonneville, Francois Beloncle, Christophe Girault, Laurence Dangers, Alexandre Lautrette, Séverin Cabasson, Anahita Rouzé, Emmanuel Vivier, Anthony Le Meur, Jean-Damien Ricard, Keyvan Razazi, Guillaume Barberet, Christine Lebert, Stephan Ehrmann, Caroline Sabatier, Jeremy Bourenne, Gael Pradel, Pierre Bailly, Nicolas Terzi, Jean Dellamonica, Guillaume Lacave, Pierre-Eric Danin, Hodanou Nanadoumgar, Aude Gibelin, Lassane Zanre, Nicolas Deye, Alexandre Demoule, Adel Maamar, Mai-Anh Nay, René Robert, Stéphanie Ragot, Jean-Pierre Frat

article

JAMA Cardiology, American Medical Association 2019, 322 (15), pp.1465. ⟨10.1001/jama.2019.14901⟩

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Editorial: Host Manipulation by Parasites

auteur

Marta Sánchez, David Biron

article

Frontiers in Ecology and Evolution, Frontiers Media S.A, 2019, 7, ⟨10.3389/fevo.2019.00369⟩

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Distribution patterns of bacterial communities and their potential link to variable viral lysis in temperate freshwater reservoirs

auteur

Angia Sriram Pradeep Ram, Jitendra Keshri, Télesphore Sime-Ngando

article

Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, Springer Verlag, 2019, 81 (4), ⟨10.1007/s00027-019-0669-5⟩

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Distribution patterns of bacterial communities and their potential link to variable viral lysis in temperate freshwater reservoirs

auteur

Angia Sriram Pradeep Ram, Jitendra Keshri, Télesphore Sime-Ngando

article

Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, Springer Verlag, 2019, 81 (4), ⟨10.1007/s00027-019-0669-5⟩

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Akinetes and ancient DNA reveal toxic cyanobacterial recurrences and their potential for resurrection in a 6700-year-old core from a eutrophic lake

auteur

Benjamin Legrand, Yannick Miras, Aude Beauger, Matthieu Dussauze, Delphine Latour

article

Science of the Total Environment, Elsevier, 2019, 687, pp.1369-1380. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.07.100⟩

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New HIV-1 circulating recombinant form 94: from phylogenetic detection of a large transmission cluster to prevention in the age of geosocial-networking apps in France, 2013 to 2017

auteur

Marc Wirden, Fabienne de Oliveira, Magali Bouvier-Alias, Sidonie Lambert-Niclot, Marie-Laure Chaix, Stéphanie Raymond, Ali Si-Mohammed, Chakib Alloui, Elisabeth André-Garnier, Pantxika Bellecave, Brice Malve, Audrey Mirand, Coralie Pallier, Jean-Dominique Poveda, Theresa Rabenja, Véronique Schneider, Anne Signori-Schmuck, Karl Stefic, Vincent Calvez, Diane Descamps, Jean-Christophe Plantier, Anne-Geneviève Marcelin, Benoit Visseaux

article

Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2019, 24 (39), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2019.24.39.1800658⟩

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An uneasy alliance: a nesting association between aggressive ants and equally fierce social wasps

auteur

Pablo Servigne, Jérôme Orivel, Frédéric Azémar, James Carpenter, Alain Dejean, Bruno Corbara

article

Insect Science, Wiley, 2019, 27 (1), pp.122-132. ⟨10.1111/1744-7917.12597⟩

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Prognostic and Long-term Survival of Immune Thrombotic Thrombocytopenic Purpura in older patients

auteur

Renaud Prevel, Claire Roubaud-Roubaud, Samuel Gourlain, Matthieu Jamme, Karine Pérès, Ygal Benhamou, Lionel Galicier, Elie Azoulay, Pascale Poullin, François Provôt, Eric Maury, Claire Presne, Mohamed Hamidou, Samir Saheb, Alain Wynckel, Aude Servais, Stéphane Girault, Yahsou Delmas, Valérie Châtelet, Jean-François Augusto, Christiane Mousson, Pierre Perez, Jean-Michel Halimi, Tarik Kanouni, Alexandre Lautrette, Anne Charvet Rumpler, Christophe Deligny, Dominique Chauveau, Agnès Veyradier, Paul Coppo

article

Blood, American Society of Hematology, 2019, pp.blood.2019000748. ⟨10.1182/blood.2019000748⟩

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Assessment of the first commercial multiplex PCR kit (ParaGENIE Crypto-Micro Real-Time PCR) for the detection of Cryptosporidium spp., Enterocytozoon bieneusi, and Encephalitozoon intestinalis from fecal samples

auteur

Florent Morio, Philippe Poirier, Yohann Le Govic, Adrien Laude, Stephane Valot, Guillaume Desoubeaux, Nicolas Argy, Céline Nourrisson, Christelle Pomares, Marie Machouart, Frederic Dalle, Françoise Botterel, Nathalie Bourgeois, Estelle Cateau, Marion Leterrier, Jessica Beser, Rose-Anne Lavergne, Patrice Le Pape

article

Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, Elsevier, 2019, 95 (1), pp.34-37. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2019.04.004⟩

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Early Recognition of Persistent Acute Kidney Injury

auteur

Michael Darmon, Anne-Sophie Truche, Moustapha Abdel-Nabey, David Schnell, Bertrand Souweine

article

Seminars in Nephrology, WB Saunders, 2019, 39 (5), pp.431-441. ⟨10.1016/j.semnephrol.2019.06.003⟩

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Genomic ecology of Marine Group II, the most common marine planktonic Archaea across the surface ocean

auteur

Olivier Pereira, Corentin Hochart, Jean Christophe Auguet, Didier Debroas, Pierre Galand

article

MicrobiologyOpen, Wiley, 2019, 8 (9), pp.e00852. ⟨10.1002/mbo3.852⟩

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“You helped me keep my head above water”—experience of bereavement research after loss of a loved one in the ICU: insights from the ARREVE study

auteur

A. Laurent, Jean Reignier, Amélie Le Gouge, Alice Cottereau, Melanie Adda, Djillali Annane, Juliette Audibert, François Barbier, Patrick Bardou, Simon Bourcier, Jeremy Bourenne, Alexandre Boyer, François Brenas, Vincent Das, Arnaud Desachy, Jérôme Devaquet, Marc Feissel, Frédérique Ganster, Maïté Garrouste-Orgeas, Guillaume Grillet, Olivier Guisset, Rebecca Hamidfar-Roy, Anne-Claire Hyacinthe, Sebastien Jochmans, Mercé Jourdain, Alexandre Lautrette, Nicolas Lerolle, Olivier Lesieur, Fabien Lion, Philippe Mateu, Bruno Mégarbane, Sybille Merceron, Emmanuelle Mercier, Jonathan Messika, Paul Morin-Longuet, Bénédicte Philippon-Jouve, Jean-Pierre Quenot, Anne Renault, Xavier Repessé, Jean-Philippe Rigaud, Ségolène Robin, Antoine Roquilly, Amélie Seguin, Didier Thevenin, Patrice Tirot, Isabelle Vinatier, Elie Azoulay, René Robert, Nancy Kentish-Barnes

article

Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2019, 45 (9), pp.1252-1261. ⟨10.1007/s00134-019-05722-x⟩

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Genotyping Approach for Potential Common Source of Enterocytozoon bieneusi Infection in Hematology Unit

auteur

C. Nourisson, Philippe Poirrier, Guillaume Desoubeaux

article

Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2019, 25 (9), pp.1631-1631. ⟨10.3201/eid2509.ET2509⟩

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Distribution patterns of bacterial communities and their potential link to variable viral lysis in temperate freshwater reservoirs

auteur

Angia Sriram Pradeep Ram, Jitendra Keshri, Télesphore Sime-Ngando

article

Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, Springer Verlag, 2019, ⟨10.1007/s00027-019-0669-5⟩

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High food quality increases infection of Gammarus pulex (Crustacea: Amphipoda) by the acanthocephalan parasite Pomphorhynchus laevis.

auteur

Kevin Sanchez-Thirion, Michaël Danger, Alexandre Bec, Elise Billoir, Sophie Labaude, Thierry Rigaud, Jean-Nicolas Beisel, Vincent Felten

article

International Journal for Parasitology, Elsevier, 2019, 49 (10), pp.805-817. ⟨10.1016/j.ijpara.2019.05.005⟩

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Nurses' practices in the preparation and administration of intramuscular injections in mental health: A cross-sectional study

auteur

Guillaume Legrand, Candy Guiguet-Auclair, Hervé Viennet, Claire Aumeran, Dominique Reynaud, Laurence Baldrikian, Anne Debost-Legrand

article

Journal of Clinical Nursing, Wiley, 2019

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The Honeybee Gut Microbiota Is Altered after Chronic Exposure to Different Families of Insecticides and Infection by Nosema ceranae

auteur

Régis Rouzé, Anne Moné, Frédéric Delbac, Luc Belzunces, Nicolas Blot

article

Microbes and environments / JSME, Nakanishi Printing Co, 2019, 34 (3), pp.226-233. ⟨10.1264/jsme2.ME18169⟩

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Draft Genome Sequence of Tubulinosema ratisbonensis , a Microsporidian Species Infecting the Model Organism Drosophila melanogaster

auteur

Valérie Polonais, Sebastian Niehus, Ivan Wawrzyniak, Adrien Franchet, Christine Gaspin, Abdel Belkorchia, Matthieu Reichstadt, Caroline Belser, Karine Labadie, Arnaud Couloux, Frédéric Delbac, Eric Peyretaillade, Dominique Ferrandon

article

Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2019, 8 (31), ⟨10.1128/MRA.00077-19⟩

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Genome analysis of Marinobacter phage AS1 suggests its close interactions with host Marinobacter sp.

auteur

S Aparna, A Parvathi, As Pradeep Ram, T. Sime-Ngando

article

Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, 2019, 83 (2), pp.119-129. ⟨10.3354/ame01912⟩

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Assessment of the Effect of Light, HgCl2 and Organic Compound on Enterococcus faecalis and Escherichia coli Cells Survive in Aquatic Microcosm

auteur

Pierrette Ngo Bahebeck,, Claire Stephane Metsopkeng, Joelle Signe Mbiada, Chrétien Lontsi Djimeli, Antoine Tamsa Arfao, Paul Alain Nana, Olive Vivien Noah Ewoti, Luciane Marlyse Moungang, Geneviève Bricheux, Télesphore Sime-Ngando, Moïse Nola

article

International Journal of Microbiology and Biotechnology, Science Publishing Group, 2019

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Effect of an ICU Diary on Posttraumatic Stress Disorder Symptoms Among Patients Receiving Mechanical Ventilation

auteur

Maïté Garrouste-Orgeas, Cécile Flahault, Isabelle Vinatier, Jean-Philippe Rigaud, Nathalie Thieulot-Rolin, Emmanuelle Mercier, Antoine Rouget, Hubert Grand, Olivier Lesieur, Fabienne Tamion, Rebecca Hamidfar, Anne Renault, Erika Parmentier-Decrucq, Yannick Monseau, Laurent Argaud, Cédric Bretonnière, Alexandre Lautrette, Julio Badie, Eric Boulet, Bernard Floccard, Xavier Forceville, Eric Kipnis, Lilia Soufir, Sandrine Valade, Naïke Bige, Alain Gaffinel, Olfa Hamzaoui, Georges Simon, Marina Thirion, Lila Bouadma, Audrey Large, Jean-Paul Mira, Nora Amdjar-Badidi, Mercé Jourdain, Paul-Henri Jost, Virginie Maxime, François Santoli, Stephane Ruckly, Christel Vioulac, Marie Annick Leborgne, Lucie Bellalou, Léonor Fasse, Benoît Misset, Sébastien Bailly, Jean-François Timsit

article

JAMA Cardiology, American Medical Association 2019, 322 (3), pp.229. ⟨10.1001/jama.2019.9058⟩

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Patterning Holocene lake dynamics and detecting early Prehistoric human impacts: targets of an improved integration of multivariate ecological indicators thanks to the data mining approach.

auteur

Yannick Miras, Beauger Aude, Jerry Lonlac, Benjamin Legrand, Delphine Latour, Karen K. Serieyssol, Marlène Lavrieux, Paul M Ledger, Jean-Luc Peiry, Engelbert Mephu Nguifo

article

MEDPALYNO, The Mediterranean Palynological Societies Symposium, Jul 2019, Bordeaux, France

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Warming bends the threshold elemental ratio in a homeostatic consumer

auteur

Thomas Ruiz, Michael Danger, Apostolos-Manuel Koussoroplis, Jean-Pierre Aguer, Nicole Morel Desrosier, Alexandre Bec

article

11th Symposium of European Freshwater Sciences, Jun 2019, zagreb, Croatia

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Occurrence and ecological determinants of the contamination of floodplain wetlands with Klebsiella pneumoniae and pathogenic or antibiotic-resistant Escherichia coli

auteur

Charles Henriot, Daniel Martak, Quentin Cuenot, Christophe Loup, Hélène Masclaux, François Gillet, Xavier Bertrand, Didier Hocquet, Gudrun Bornette

article

FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2019, 95 (8), ⟨10.1093/femsec/fiz097⟩

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Impact of bronchial colonization with Candida spp. on the risk of bacterial ventilator-associated pneumonia in the ICU: the FUNGIBACT prospective cohort study

auteur

Jean-François Timsit, Carole Schwebel, Lenka Styfalova, Muriel Cornet, Philippe Poirier, Christiane Forestier, Stephane Ruckly, Marie-Christine Jacob, Bertrand Souweine

article

Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2019, 45 (6), pp.834-843. ⟨10.1007/s00134-019-05622-0⟩

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Novel haloarchaeal viruses from Lake Retba infecting Haloferax and Halorubrum species

auteur

Carolina Mizuno, Bina Prajapati, Soizick Lucas‐staat, Télesphore Sime-Ngando, Patrick Forterre, Dennis Bamford, David Prangishvili, Mart Krupovic, Hanna Oksanen

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, Environmental viruses and their role in shaping ecosystems, 21 (6), pp.2129-2147. ⟨10.1111/1462-2920.14604⟩

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Environmental risk assessment of antibiotics in agroecosystems: ecotoxicological effects on aquatic microbial communities and dissemination of antimicrobial resistances and antibiotic biodegradation potential along the soil-water continuum

auteur

Fabrice Martin-Laurent, Edward Topp, Loren Billet, Isabelle Batisson, Cédric Malandain, Pascale Besse-Hoggan, Soizic Morin, Joan Artigas, Chloé Bonnineau, Laura Kergoat, Marion Devers-Lamrani, Stéphane Pesce

article

Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2019, 26 (18), pp.18930-18937. ⟨10.1007/s11356-019-05122-0⟩

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A De Novo Robust Clustering Approach for Amplicon-Based Sequence Data

auteur

Alexandre Bazin, Didier Debroas, Engelbert Mephu Nguifo

article

Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2019, 26 (6), pp.618-624. ⟨10.1089/cmb.2018.0170⟩

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Multirecombinant Enterovirus A71 Subgenogroup C1 Isolates Associated with Neurologic Disease, France, 2016–2017

auteur

Stéphanie Tomba Ngangas, Alexander Lukashev, Gwendoline Jugie, Olga Ivanova, Jean-Michel Mansuy, Catherine Mengelle, Jacques Izopet, Anne-Sophie L’honneur, Flore Rozenberg, David Leyssene, Denise Hecquet, Stéphanie Marque-Juillet, David Boutolleau, Sonia Burrel, Hélène Peigue-Lafeuille, Christine Archimbaud, Kimberley Benschop, Cécile Henquell, Audrey Mirand, Jean-Luc Bailly

article

Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2019, 25 (6), pp.1204-1208. ⟨10.3201/eid2506.181460⟩

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Do the agricultural have any impact on the mi crobial toxicity and biodegradation of the active substance?

auteur

Pascale Besse-Hoggan, M. Youness, C. Descarpentries, M. Sancelme, I. Batisson

article

14th International IUPAC Conference of Crop Protection, May 2019, Gand, Belgium

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A comment on “Variability in plant nutrients reduces insect herbivore performance”

auteur

Apostolos-Manuel Koussoroplis, Toni Klauschies, Sylvain Pincebourde, David Giron, Alexander Wacker

article

Rethinking Ecology, Pensoft, 2019, 4, pp.79-87. ⟨10.3897/rethinkingecology.4.32252⟩

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Impact of Leptospermone, a Natural β-Triketone Herbicide, on the Fungal Composition and Diversity of Two Arable Soils

auteur

Clarisse Mallet, Sana Romdhane, Camille Loiseau, Jérémie Béguet, Fabrice Martin-Laurent, Christophe Calvayrac, Lise Barthelmebs

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.01024⟩

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Resistance to integrase inhibitors: a national study in HIV-1-infected treatment-naive and -experienced patients

auteur

Anne-Geneviève Marcelin, Maxime Grude, Charlotte Charpentier, Pantxika Bellecave, Laura Le Guen, Coralie Pallier, Stéphanie Raymond, Audrey Mirand, Laurence Bocket, Djeneba Bocar Fofana, Constance Delaugerre, Thuy Nguyen, Brigitte Montes, Helène Jeulin, Thomas Mourez, Samira Fafi-Kremer, Corinne Amiel, Catherine Roussel, Julia Dina, Mary-Anne Trabaud, Hélène Le Guillou-Guillemette, Sophie Vallet, Anne Signori-Schmuck, Anne Maillard, Virginie Ferré, Diane Descamps, Vincent Calvez, Philippe Flandre

article

Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2019, 74 (5), pp.1368-1375. ⟨10.1093/jac/dkz021⟩

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Glyphosate, but not its metabolite AMPA, alters the honeybee gut microbiota

auteur

Nicolas Blotid, Loïs Veillat, Régis Rouzé, Hélène Delatte

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2019

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Interactive Impacts of Silver and Phosphorus on Autotrophic Biofilm Elemental and Biochemical Quality for a Macroinvertebrate Consumer

auteur

Clément Crenier, Kevin Sanchez-Thirion, Alexandre Bec, Vincent Felten, Jessica Ferriol, Aridane González, Joséphine Leflaive, Fanny Perrière, Loïc Ten-Hage, Michaël Danger

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00732⟩

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Temporal covariation of epibacterial community and surface metabolome in the Mediterranean seaweed holobiont Taonia atomaria

auteur

Benoît Paix, Ahlem Othmani, Didier Debroas, Gérald Culioli, Jean-François Briand

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (9), pp.3346-3363. ⟨10.1111/1462-2920.14617⟩

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Immobilisation of bacteria onto magnetic nanoparticles for the decolorisation and degradation of azo dyes

auteur

Ayoub Nadi, Damien Boyer, Nicolas Charbonnel, Aicha Boukhriss, Christiane Forestier, Saïd Gmouh

article

IET Nanobiotechnology, Institution of Engineering and Technology (IET), 2019, 13 (2), pp.144-149. ⟨10.1049/iet-nbt.2018.5026⟩

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Community‐Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems

auteur

Luigi Caputi, Quentin Carradec, Damien Eveillard, Amos Kirilovsky, Eric Pelletier, Juan J Pierella Karlusich, Fabio Rocha Jimenez Vieira, Emilie Villar, Samuel Chaffron, Shruti Malviya, Eleonora Scalco, Silvia Acinas, Adriana Alberti, Jean-Marc Aury, Anne-Sophie Benoiston, Alexis Bertrand, Tristan Biard, Lucie Bittner, Martine Boccara, Jennifer R. Brum, Christophe Brunet, Greta Busseni, Anna Carratalà, Hervé Claustre, Luis Pedro Coelho, Sébastien Colin, Salvatore d'Aniello, Corinne da Silva, Marianna del Core, Hugo Doré, Stéphane Gasparini, Florian Kokoszka, Jean-Louis Jamet, Christophe Lejeusne, Cyrille Lepoivre, Magali Lescot, Gipsi Lima-Mendez, Fabien Lombard, Julius Lukeš, Nicolas Maillet, Mohammed-Amin Madoui, Elodie Martinez, Maria Grazia Mazzocchi, Mario Néou, Javier Paz-Yepes, Julie Poulain, Simon Ramondenc, Jean-Baptiste Romagnan, Simon Roux, Daniela Salvagio Manta, Remo Sanges, Mario Sprovieri, Shinichi Sunagawa, Vincent Taillandier, Atsuko Tanaka, Leila Tirichine, Camille Trottier, Julia Uitz, Alaguraj Veluchamy, Jana Veselá, Flora Vincent, Sheree Yau, Stefanie Kandels-Lewis, Sarah Searson, Céline Dimier, Marc Picheral, Peer Bork, Emmanuel Boss, Colomban de Vargas, Michael Follows, Nigel Grimsley, Lionel Guidi, Pascal Hingamp, Eric Karsenti, Paolo Sordino, Lars Stemmann, Matthew B. Sullivan, Alessandro Tagliabue, Adriana Zingone, Laurence Garczarek, Fabrizio d'Ortenzio, Pierre Testor, Fabrice Not, Maurizio Ribera d'Alcalà, Patrick Wincker, Chris Bowler, Daniele Iudicone, Gabriel Gorsky, Olivier Jaillon, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Hiroyuki Ogata, Stéphane Pesant, Jeroen Raes, Emmanuel Reynaud, Christian Sardet, Mike Sieracki, Sabrina Speich, Didier Velayoudon

article

Global Biogeochemical Cycles, American Geophysical Union, 2019, 3 (33), pp.391-419. ⟨10.1029/2018GB006022⟩

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High permissiveness for genetic exchanges between enteroviruses of species A, including enterovirus 71, favours evolution through intertypic recombination in Madagascar

auteur

Romain Volle, Richter Razafindratsimandresy, Marie-Line Joffret, Mael Bessaud, Sendraharimanana Rabemanantsoa, Seta Andriamamonjy, Jonhson Raharinantoanina, Bruno Blondel, Jean-Michel Heraud, Jean-Luc Bailly, Francis Delpeyroux

article

Journal of Virology, American Society for Microbiology, 2019, 93 (6), pp.e01667-18. ⟨10.1128/JVI.01667-18⟩

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Thymus-specific serine protease, a protease that shapes the CD4 T cell repertoire

auteur

Sylvie Guerder, Chervin Hassel, Alice Carrier

article

Immunogenetics, Springer Verlag, 2019, 71 (3), pp.223-232. ⟨10.1007/s00251-018-1078-y⟩

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Épidémiologie de l’insuffisance rénale aiguë

auteur

Julien Aniort, Anne-Elisabeth Heng, Patrice Deteix, Bertrand Souweine, Alexandre Lautrette

article

Néphrologie et Thérapeutique, Elsevier Masson, 2019, 15 (1), pp.63-69. ⟨10.1016/j.nephro.2018.11.002⟩

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Less effect of wells physicochemical properties on the antimicrobial susceptibility Pseudomonas aeruginosa isolated in equatorial region of Central Africa

auteur

Jean Samuel Eheth, Chrétien Lontsi Djimeli, Paul Alain Nana, Antoine Tamsa Arfao, Olive Vivien Noah Ewoti, Luciane Marlyse Moungang, Geneviève Bricheux, Télesphore Sime-Ngando, Moïse Nola

article

Applied Water Science, 2019, 9 (2), ⟨10.1007/s13201-019-0909-9⟩

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Meta-analysis of glyphosate contamination in surface waters and dissipation by biofilms

auteur

Louis Carles, Hélène Gardon, Laura Joseph, Josep Sanchís, Marinella Farre, Joan Artigas

article

Environment International, Elsevier, 2019, 124, pp.284-293. ⟨10.1016/j.envint.2018.12.064⟩

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Potential of cyanobacterial akinetes reviviscence through a 6700 years core in a eutrophic lake

auteur

Benjamin Legrand, Yannick Miras, Delphine Latour

article

ASLO 2019 Aquatic Sciences Meeting “PlanetWater Challenges and Successes”, Feb 2019, San Juan, Puerto Rico

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Hygroregulation, a key ability for eusocial insects: Native Western European honeybees as a case study

auteur

Iris Eouzan, Lionel Garnery, M. Alice Pinto, Damien Delalande, Catia Neves, Francis Fabre, Jérôme Lesobre, Sylvie Houte, Andone Estonba, Iratxe Montes, Télesphore Sime-Ngando, David Biron

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2019, 14 (2), pp.e0200048. ⟨10.1371/journal.pone.0200048⟩

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Amperometric detection of the herbicide mesotrione based on competitive reactions at nitroreductase@layered double hydroxide bioelectrode

auteur

Slim Hidouech, Felipe Bruna, Isabelle Batisson, Pascale Besse-Hoggan, Vanessa Prevot, Christine Mousty

article

Journal of Electroanalytical Chemistry, Elsevier 2019, 835, pp.324-328. ⟨10.1016/j.jelechem.2019.01.054⟩

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Comparison of sterol and fatty acid profiles of chytrids and their hosts reveals trophic upgrading of nutritionally inadequate phytoplankton by fungal parasites

auteur

Mélanie Gerphagnon, Ramsy Agha, Dominik Martin‐creuzburg, Alexandre Bec, Fanny Perriere, Cecilia Rad‐menéndez, Claire M.M. Gachon, Justyna Wolinska

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (3), pp.949-958. ⟨10.1111/1462-2920.14489⟩

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Bacterial anti-adhesion activity based on the electrochemical properties of polymethacrylates bearing ferrocenyl pendant groups

auteur

Ronald Nguema Edzang, The Hy Duong, Jean-François Briand, Marlene Lejars, Jean-Manuel Raimundo, Christine Bressy, Hugues Brisset

article

Biofouling, Taylor & Francis, 2019, 34 (9), pp.1055-1063. ⟨10.1080/08927014.2018.1539165⟩

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Volatolomics in Bacterial Ecotoxicology, A Novel Method for Detecting Signatures of Pesticide Exposure?

auteur

Kévin Hidalgo, Jérémy Ratel, Frédéric Mercier, Benedicte Gauriat, Philippe Bouchard, Erwan Engel

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 9

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Rapid diagnostic tests relying on antigen detection from stool as an efficient point of care testing strategy for giardiasis and cryptosporidiosis? Evaluation of a new immunochromatographic duplex assay

auteur

Adeline Goudal, Adrien Laude, Stéphane Valot, Guillaume Desoubeaux, Nicolas Argy, Céline Nourrisson, Christelle Pomares, Marie Machouart, Yohann Le Govic, Frédéric Dalle, Françoise Botterel, Nathalie Bourgeois, Estelle Cateau, Marion Leterrier, Rose-Anne Lavergne, Jessica Beser, Patrice Le Pape, Florent Morio

article

Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, Elsevier, 2019, 93 (1), pp.33-36. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2018.07.012⟩

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Assembly of nitroreductase and layered double hydroxides toward functional biohybrid materials

auteur

Felipe Bruna, Christine Mousty, Pascale Besse-Hoggan, Isabelle Batisson, Vanessa Prevot

article

Journal of Colloid and Interface Science, Elsevier, 2019, 533, pp.71-81. ⟨10.1016/j.jcis.2018.07.126⟩

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Stimulation or inhibition: Leaf microbial decomposition in streams subjected to complex chemical contamination

auteur

Florent Rossi, Clarisse Mallet, Christophe Portelli, Florence Donnadieu, Frédérique Bonnemoy, Joan Artigas

article

Science of the Total Environment, Elsevier, 2019, 648, pp.1371-1383. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.08.197⟩

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A Comparison of the Mortality Risk Associated With Ventilator-Acquired Bacterial Pneumonia and Nonventilator ICU-Acquired Bacterial Pneumonia

auteur

L. Bouadma, M. Darmon, E. Montmollin, L. Argaud, H. Kallel, M. Garrouste-Orgeas, L. Soufir, C. Schwebel, B. Souweine, D. Glodgran-Toledano, L. Papazian, J. F. Timsit, W. Ibn Saied, B. Mourvillier, Y. Cohen, S. Ruckly, J. Reignier, G. Marcotte, S. Siami

article

Crit Care Med, 2019, 47 (3), pp.345--352. ⟨10.1097/ccm.0000000000003553⟩

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titre

Hydrogenotrophic methanogens of the mammalian gut: Functionally similar, thermodynamically different—A modelling approach

auteur

Rafael Munoz Tamayo, Milka Popova, Maxence Tillier, Diego Morgavi, Jean-Pierre Morel, Gérard Fonty, Nicole Morel-Desrosiers

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2019, 14 (12), pp.e0226243. ⟨10.1371/journal.pone.0226243⟩

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titre

Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG)

auteur

Simon Roux, Evelien M. Adriaenssens, Bas E. Dutilh, Eugene V. Koonin, Andrew M. Kropinski, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Rob Lavigne, J. Rodney Brister, Arvind Varsani, Clara Amid, Ramy K. Aziz, Seth R. Bordenstein, Peer Bork, Mya Breitbart, Guy R. Cochrane, Rebecca A. Daly, Christelle Desnues, Melissa B. Duhaime, Joanne B. Emerson, François Enault, Jed A. Fuhrman, Pascal Hingamp, Philip Hugenholtz, Bonnie L. Hurwitz, Natalia N. Ivanova, Jessica M. Labonté, Kyung-Bum Lee, Rex R. Malmstrom, Manuel Martinez-Garcia, Ilene Karsch Mizrachi, Hiroyuki Ogata, David Páez-Espino, Marie-Agnès Petit, Catherine Putonti, Thomas Rattei, Alejandro Reyes, Francisco Rodriguez-Valera, Karyna Rosario, Lynn Schriml, Frederik Schulz, Grieg F. Steward, Matthew B. Sullivan, Shinichi Sunagawa, Curtis A. Suttle, Ben Temperton, Susannah G. Tringe, Rebecca Vega Thurber, Nicole S. Webster, Katrine L. Whiteson, Steven W. Wilhelm, K. Eric Wommack, Tanja Woyke, Kelly C. Wrighton, Pelin Yilmaz, Takashi Yoshida, Mark J. Young, Natalya Yutin, Lisa Zeigler Allen, Nikos C. Kyrpides, Emiley A. Eloe-Fadrosh

article

Nature Biotechnology, Nature Publishing Group, 2019, 37 (1), pp.29-37. ⟨10.1038/nbt.4306⟩

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Pneumonia in acute ischemic stroke patients requiring invasive ventilation: Impact on short and long-term outcomes

auteur

J. Bourenne, N. Brule, C. Bretonniere, C. Cheval, J. Carvelli, E. Coupez, M. Cour, L. Dopeux, A. S. Dumenil, C. Dupuis, J. M. Forel, C. Garret, S. Grange, A. Gros, A. Haouache, T. Hissem, V. H. T. Ha, S. Jochmans, J. B. Joffredo, H. Kallel, G. Lacave, A. Lautrette, V. Lemiale, M. Lermuzeaux, J. Lebut, M. Lugosi, E. Magalhaes, S. Merceron, B. Mourvillier, B. Misset, M. Neuville, L. Nicolet, J. Oziel, L. Papazian, B. Planquette, J. P. Quenot, A. Radjou, M. Simon, J. Reignier, B. Souweine, R. Smonig, G. Troche, M. Thuong, G. Thierry, D. Toledano, G. van der Meersch, M. Venot, O. Zambon, J. Fournier, C. Tournegros, S. Bagur, M. Adda, V. Vindrieux, S. Salle, P. Enguerrand, L. Ferrand, V. Gobert, S. Guessens, H. Merle, N. Kaddour, B. Berthe, S. Bekkhouche, K. Mellouk, M. Lebrazic, C. Ouisse, D. Maugars, C. Aparicio, I. Theodose, M. Nouacer, V. Deiler, M. Moussa, A. Mouaci, N. Viguier, F. Lamara, S. Letrou, S. Siami, Outcomerea Study Grp, E. Montmollin, S. Ruckly, C. Schwebel, F. Philippart, C. Adrie, E. Mariotte, G. Marcotte, Y. Cohen, B. Sztrymf, D. Silva, F. Bruneel, M. Gainnier, M. Garrouste-Orgeas, R. Sonneville, J. F. Timsit, E. Azoulay, J. R. Zahar, M. Darmon, C. Clec'H, C. Alberti, A. Francais, A. Vesin, S. Bailly, F. Lecorre, D. Nakache, A. Van-Nieuwenhuyze, R. Hernu, C. Agasse, B. Allaouchiche, O. Andremont, P. Andreu, L. Argaud, C. Ara-Somohano, F. Barbier, D. Boyer, J. P. Bedos, T. Baudry, J. Bedel, J. Bohe, L. Bouadma

article

Journal of Infection, WB Saunders, 2019, 79 (3), pp.220--227. ⟨10.1016/j.jinf.2019.06.012⟩

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titre

Growth of indigenous bacteria Vibrio alginolyticus and Dietzia sp. isolated from the east coast of Algeria in the presence of monoaromatic hydrocarbons

auteur

Nesrine Feknous, Zidane Branes, Isabelle Batisson, Christian Amblard

article

Environment Protection Engineering, Oficyna Wydawnicza Politechniki Wrocławskiej, 2019, 45 (3), ⟨10.5277/epe190309⟩

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titre

Immunomodulatory effects of Lactobacillus plantarum on inflammatory response induced by Klebsiella pneumoniae

auteur

Marjolaine Vareille-Delarbre, Sylvie Miquel, Sophie Garcin, Thomas Bertran, Damien Balestrino, Bertrand Evrard, Christiane Forestier

article

Infection and Immunity, American Society for Microbiology, 2019, 87 (11), ⟨10.1128/iai.00570-19⟩

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titre

Hepatitis C subtype distribution in chronically infected patients with mild liver fibrosis in France: the GEMHEP study

auteur

T. Semenova, B. Nemoz, V. Thibault, G. Lagathu, G. Duverlie, E. Brochot, P. Trimoulet, C. Payan, S. Vallet, C. Henquell, S. Chevaliez, M. Bouvier-Alias, S. Maylin, A-M. Roque-Afonso, L. Izquierdo, F. Lunel-Fabiani, P. Marcellin, P. Morand, V. Leroy, S. Larrat

article

Epidemiology and Infection, Cambridge University Press (CUP), 2019, 147, ⟨10.1017/S0950268819001225⟩

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Dynamical effects of retention structures on the mitigation of lake eutrophication

auteur

A. Caen, D. Latour, Jean-Denis Mathias

article

Environmental Modelling and Software, Elsevier, 2019, 119, pp.309-326. ⟨10.1016/j.envsoft.2019.06.012⟩

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Protective mechanisms of polyphenolic-enriched extract of plants against H2O2-induced oxidative stress in human retinal pigment epithelial cells.

auteur

H. Nezzar, S. Hermitte, P. Goupil, C. Richard, M. Sleiman, E. Peghaire, H. El Alaoui, Niyazi Acar, A. Kocer

article

Annual Meeting of the Association-for-Research-in-Vision-and-Ophthalmology (ARVO), Apr 2019, Vancouver, Canada. 60, ASSOC RESEARCH VISION OPHTHALMOLOGY INC, pp.Meeting Abstract: 5377, 2019

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titre

Diversity, spatial distribution and activity of fungi in freshwater ecosystems

auteur

Cécile Lepère, Isabelle Domaizon, Jean-François Humbert, Ludwig Jardillier, Mylène Hugoni, Didier Debroas

article

PeerJ, PeerJ, 2019, 7, pp.e6247. ⟨10.7717/peerj.6247⟩

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Comparison of microbiological results obtained from per-wound bone biopsies versus transcutaneous bone biopsies in diabetic foot osteomyelitis: a prospective cohort study

auteur

Alice Couturier, Aurore Chabaud, Françoise Desbiez, Stéphane Descamps, Evelina Petrosyan, Paule Letertre-Gilbert, Natacha Mrozek, Magali Vidal, Igor Tauveron, Salwan Maqdasy, Olivier Lesens

article

European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2019, 38 (7), pp.1287-1291. ⟨10.1007/s10096-019-03547-6⟩

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titre

Biofilms in hospital effluents as a potential crossroads for carbapenemase-encoding strains

auteur

J. Ory, G. Bricheux, F. Robin, Anne Togola, C. Forestier, O. Traore

article

Science of the Total Environment, Elsevier, 2019, 657, pp.7-15. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.11.427⟩

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Antibiotic resilience: a necessary concept to complement antibiotic resistance?

auteur

Gabriel Carvalho, Christiane Forestier, Jean-Denis Mathias

article

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2019, 286 (1916), ⟨10.1098/rspb.2019.2408⟩

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titre

Fosfomycin and Staphylococcus aureus: transcriptomic approach to assess effect on biofilm, and fate of unattached cells

auteur

Claire Marquès, Valérie Collin, Christine Franceschi, Nicolas Charbonnel, Sonia Chatellier, Christiane Forestier

article

Journal of Antibiotics, Nature Publishing Group: Open Access Hybrid Model Option B, In press, ⟨10.1038/s41429-019-0256-y⟩

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titre

Assessing extracellular enzymatic activities of biofilms on natural and standardized organic substrata immersed in a stream

auteur

M. Joly, Clarisse Mallet, J. Artigas

article

Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, In press, ⟨10.3354/ame01914⟩

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titre

Volatolomics in bacterial ecotoxicology, A novel method for detecting signatures of pesticide exposure?

auteur

Kévin Hidalgo, Jérémy Ratel, Frederic Mercier, Benedicte Gauriat, Philippe Bouchard, Erwan Engel

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.03113⟩

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titre

Reducing the ionizing radiation background does not significantly affect the evolution of Escherichia coli populations over 500 generations

auteur

Nathanael Lampe, Pierre Marin, Marianne Coulon, Pierre Micheau, Lydia Maigne, David Sarramia, Fabrice Piquemal, Sébastien Incerti, David Biron, Camille Ghio, Télesphore Sime-Ngando, Thomas Hindré, Vincent Breton

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.14891. ⟨10.1038/s41598-019-51519-9⟩

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titre

Biotic and abiotic determinants of the formation of ant mosaics in primary Neotropical rainforests

auteur

Alain Dejean, Arthur Compin, Jacques Delabie, Frédéric Azemar, Bruno Corbara, Maurice Leponce

article

Ecological Entomology, Wiley, 2019, 44 (4), pp.560-570. ⟨10.1111/een.12735⟩

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titre

Consommation et digestion des végétaux : Rôles des microbiotes et fonctions essentielles à la biodiversité

auteur

Gérard Fonty, Annick Bernalier-Donadile, Evelyne Forano, Pascale Mosoni

article

2019

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titre

Comparison of sterol and fatty acid profiles of chytrids and their hosts reveals trophic upgrading of nutritionally inadequate phytoplankton by fungal parasites

auteur

Mélanie Gerphagnon, Ramsy Agha, Dominik Martin-Creuzburg, Alexandre Bec, Fanny Perrière, Cecilia Rad-Menéndez, Claire M.M. Gachon, Justyna Wolinska

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, In press

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titre

A Pediococcus strain to rescue honeybees by decreasing Nosema ceranae-and pesticide-induced adverse effects

auteur

Elodie Peghaire, Anne Moné, Frédéric Delbac, Didier Debroas, Frédérique Chaucheyras-Durand, Hicham Alaoui

article

Pesticide Biochemistry and Physiology, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.pestbp.2019.11.006⟩

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titre

How does environmental inter-annual variability shape aquatic microbial communities? A 40-year annual record of sedimentary DNA from a boreal lake (Nylandssjön, Sweden)

auteur

Eric Capo, Johan Rydberg, Julie Tolu, Isabelle Domaizon, Didier Debroas, Richard Bindler, Christian Bigler

article

Frontiers in Ecology and Evolution, Frontiers Media S.A, 2019, 7, ⟨10.3389/fevo.2019.00245⟩

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titre

Tank Bromeliads : aquatic life at the heart of plants

auteur

Bruno Corbara, Camille Bonhomme, Jean-Francois Carrias, Régis Cereghino, Olivier Dézerald, Céline Leroy

article

ESpèces - Revue d’Histoire naturelle , Kyrnos publications, 2019

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titre

Disagreement Between Clinicians and Score in Decision-Making Capacity of Critically Ill Patients

auteur

P. M. Bertrand, B. Pereira, M. Adda, J. F. Timsit, M. Wolff, G. Hilbert, D. Gruson, M. Garrouste-Orgeas, L. Argaud, J. M. Constantin, R. Chabanne, J. P. Quenot, J. Bohe, C. Guerin, L. Papazian, O. Jonquet, K. Klouche, Arnaud Delahaye, B. Riu, L. Zieleskiewicz, M. Darmon, E. Azoulay, B. Souweine, A. Lautrette

article

Crit Care Med, 2019, 47 (3), pp.337--344. ⟨10.1097/ccm.0000000000003550⟩

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titre

Evaluation of the efficacy of an interdialytic "ethanol 40% v/v - enoxaparin 1000 U/mL" lock solution to prevent tunnelled catheter infections in chronic hemodialysis patients: a multi-centre, randomized, single blind, parallel group study

auteur

D. Thibaudin, C. G. Vela, G. Vernin, H. Weclawiak, L. Bernard, A. E. Heng, B. Souweine, J. Aniort, A. Piraud, M. Adda, B. Perreira, M. Bouiller, J. Fourcade, A. Guerraoui, E. Kalbacher, T. Krumel, H. L. Moragues

article

BMC Nephrology, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.149. ⟨10.1186/s12882-019-1338-6⟩

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2018

titre

Optimisation du diagnostic des infections à entérovirus et étude de leur pouvoir pathogène

auteur

Jérémy Lafolie

article

Santé. Université Clermont Auvergne, 2018. Français. ⟨NNT : 2018CLFAS008⟩

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titre

Nicosulfuron Degradation by an Ascomycete Fungus Isolated From Submerged Alnus Leaf Litter

auteur

Louis Carles, Florent Rossi, Pascale Besse-Hoggan, Christelle Blavignac, Martin Leremboure, Joan Artigas, Isabelle Batisson

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, pp.3167. ⟨10.3389/fmicb.2018.03167⟩

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titre

Performances des trousses Panther/Fusion virus respiratoires (Hologic) chez les enfants de moins de 3 ans

auteur

Adeline Baron, Audrey Mirand, Astrid Vabret, Jean Plantier, Marie Gueudin

article

RICAI, Dec 2018, Paris, France

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titre

Facteurs génétiques, biogéographiques et temporels : quels effets sur la structuration du microbiote de la lignée évolutive M de l'abeille européenne Apis mellifera ?

auteur

Iris Eouzan

article

Ecologie, Environnement. Université Clermont Auvergne, 2018. Français. ⟨NNT : 2018CLFAC073⟩

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titre

Leaf Litter decomposition in streams subjected to global change : the role of heterotrophic microbial communities

auteur

Florent Rossi

article

Ecology, environment. Université Clermont Auvergne, 2018. English. ⟨NNT : 2018CLFAC101⟩

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titre

Mise en place d'un modèle animal d'infection par Blastocystis : répercussion sur la sensibilité colique, le comportement et le microbiote intestinal

auteur

Manon Defaye

article

Microbiologie et Parasitologie. Université Clermont Auvergne, 2018. Français. ⟨NNT : 2018CLFAS019⟩

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titre

A De Novo Robust Clustering Approach for Amplicon-Based Sequence Data

auteur

Alexandre Bazin, Didier Debroas, Engelbert Mephu Nguifo

article

Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2018

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titre

Rediscovering Zygorhizidium affluens Canter: Molecular Taxonomy, Infectious Cycle, and Cryopreservation of a Chytrid Infecting the Bloom-Forming Diatom Asterionella formosa

auteur

Cecilia Rad-Menéndez, Mélanie Gerphagnon, Andrea Garvetto, Paola Arce, Yacine Badis, Télesphore Sime-Ngando, Claire Gachon, Karyn Johnson

article

Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2018, 84 (23)

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titre

How do environment-dependent switching rates between susceptible and persister cells affect the dynamics of biofilms faced with antibiotics?

auteur

Gabriel Carvalho, Damien Balestrino, Christiane Forestier, Jean-Denis Mathias

article

npj Biofilms and Microbiomes, [London?]: Springer Nature published in partnership with Nanyang Technological University, 2018, 4 (1), ⟨10.1038/s41522-018-0049-2⟩

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titre

There's no harm in having too much: A comprehensive toolbox of methods in trophic ecology

auteur

Nabil Majdi, Nicolas Hette-Tronquart, Etienne Auclair, Alexandre Bec, Tiphaine Chouvelon, Bruno Cognie, Michaël Danger, Priscilla Decottignies, Aurélie Dessier, Christian Desvilettes, Stanislas Dubois, Christine Dupuy, Clémentine Fritsch, Cédric Gaucherel, Mickael Hedde, Franck Jabot, Sébastien Lefebvre, Martin Marzloff, Benjamin Pey, Nathalie Peyrard, Thibaut Powolny, Regis Sabbadin, Elisa Thébault, Marie-Elodie Perga

article

Food Webs, Elsevier, 2018, 17, pp.e00100-. ⟨10.1016/j.fooweb.2018.e00100⟩

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titre

Single-cell genomics of multiple uncultured stramenopiles reveals underestimated functional diversity across oceans

auteur

Yoann Seeleuthner, Samuel Mondy, Vincent Lombard, Quentin Carradec, Eric Pelletier, Marc Wessner, Jade Leconte, Jean-François Mangot, Julie Poulain, Karine Labadie, Ramiro Logares, Shinichi Sunagawa, Véronique de Berardinis, Marcel Salanoubat, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Sarah Searson, Stéphane Pesant, Nicole Poulton, Ramunas Stepanauskas, Peer Bork, Chris Bowler, Pascal Hingamp, Matthew Sullivan, Daniele Iudicone, Ramon Massana, Jean-Marc Aury, Bernard Henrissat, Eric Karsenti, Olivier Jaillon, Mike Sieracki, Colomban de Vargas, Patrick Wincker, Silvia G. Acinas, Emmanuel Boss, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Nigel Grimsley, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Fabrice Not, Jeroen Raes, Emmanuel G. Reynaud, Christian Sardet, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Jean Weissenbach, Didier Velayoudon

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2018, 9, pp.310. ⟨10.1038/s41467-017-02235-3⟩

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titre

Host–pathogen interactions and prognosis of critically ill immunocompetent patients with pneumococcal pneumonia: the nationwide prospective observational STREPTOGENE study

auteur

Jean-Pierre Bedos, Emmanuelle Varon, Raphaël Porcher, Pierre Asfar, Yves Le Tulzo, Bruno Mégarbane, Armelle Mathonnet, Anthony Dugard, Anne Veinstein, Kader Ouchenir, Shidasp Siami, Jean Reignier, Arnaud Galbois, Joel Cousson, Sébastien Préau, Olivier Baldési, Jean-Philippe Rigaud, Bertrand Souweine, Benoît Misset, Frederic Jacobs, Florent Dewavrin, Jean-Paul Mira

article

Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (12), pp.2162-2173. ⟨10.1007/s00134-018-5444-x⟩

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titre

Histologically proven acute tubular necrosis in a series of 27 ICU patients

auteur

René Robert, Denis Frasca, Bertrand Souweine, Jean-François Augusto, Carole Philipponnet, Florent Joly, Jean-Michel Goujon, Nicolas Lerolle

article

Journal of Critical Care, WB Saunders, 2018, 48, pp.130-134. ⟨10.1016/j.jcrc.2018.08.029⟩

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titre

A microcalorimetric approach for investigating stoichiometric constraints on the standard metabolic rate of a small invertebrate

auteur

Thomas Ruiz, Alexandre Bec, Michael Danger, Apostolos-Manuel Koussoroplis, Jean-Pierre Aguer, Jean-Pierre Morel, Nicole Morel-Desrosiers

article

Ecology Letters, Wiley, 2018, 21 (11), pp.1714 - 1722. ⟨10.1111/ele.13137⟩

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titre

Evaluation of a new multiplex PCR assay (ParaGENIE G-Amoeba Real-Time PCR kit) targeting Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica and Entamoeba dispar/Entamoeba moshkovskii from stool specimens: evidence for the limited performances of microscopy-based approach for amoeba species identification

auteur

F. Morio, S. Valot, A. Laude, G. Desoubeaux, N. Argy, C. Nourrisson, C. Pomares, M. Machouart, Y. Le Govic, F. Dalle, F. Botterel, N. Bourgeois, E. Cateau, M. Leterrier, F. Jeddi, M. Gaboyard, P. Le Pape

article

Clinical Microbiology and Infection, Elsevier for the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2018, 24 (11), pp.1205-1209. ⟨10.1016/j.cmi.2018.02.007⟩

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titre

A European Multi Lake Survey dataset of environmental variables, phytoplankton pigments and cyanotoxins

auteur

Evanthia Mantzouki, James Campbell, Emiel van Loon, Petra Visser, Iosif Konstantinou, Antonio Antoniou, Grégory Giuliani, Daniel Machado-Vieira, Alinne Gurjão de Oliveira, Dubravka Špoljarić Maronić, Filip Stević, Tanja Žuna Pfeiffer, Itana Bokan Vucelić, Petar Žutinić, Marija Gligora Udovič, Anđelka Plenković-Moraj, Nikoletta Tsiarta, Luděk Bláha, Rodan Geriš, Markéta Fránková, Kirsten Seestern Christoffersen, Trine Perlt Warming, Tõnu Feldmann, Alo Laas, Kristel Panksep, Lea Tuvikene, Kersti Kangro, Kerstin Häggqvist, Pauliina Salmi, Lauri Arvola, Jutta Fastner, Dietmar Straile, Karl-Otto Rothhaupt, Jeremy Fonvielle, Hans Grossart, Christos Avagianos, Triantafyllos Kaloudis, Theodoros Triantis, Sevasti-Kiriaki Zervou, Ana Hiskia, Spyros Gkelis, Manthos Panou, Valerie Vale, Victor Perello, Ulrike Obertegger, Adriano Boscaini, Giovanna Flaim, Nico Salmaso, Leonardo Cerasino, Judita Koreivienė, Jūratė Karosienė, Jūratė Kasperovičienė, Ksenija Savadova, Irma Vitonytė, Sigrid Haande, Birger Skjelbred, Magdalena Grabowska, Maciej Karpowicz, Damian Chmura, Lidia Nawrocka, Justyna Kobos, Hanna Mazur-Marzec, Pablo Alcaraz-Párraga, Elżbieta Wilk-Woźniak, Wojciech Krztoń, Edward Walusiak, Ilona Gagala, Joan Mankiewicz-Boczek, Magdalena Toporowska, Barbara Pawlik-Skowronska, Michał Niedźwiecki, Wojciech Pęczuła, Agnieszka Napiórkowska-Krzebietke, Julita Dunalska, Justyna Sieńska, Daniel Szymański, Marek Kruk, Agnieszka Budzyńska, Ryszard Goldyn, Anna Kozak, Joan Rosińska, Elżbieta Szeląg-Wasielewska, Piotr Domek, Natalia Jakubowska-Krepska, Kinga Kwasizur, Beata Messyasz, Aleksandra Pełechata, Mariusz Pełechaty, Mikolaj Kokocinski, Beata Madrecka, Iwona Kostrzewska-Szlakowska, Magdalena Frąk, Agnieszka Bańkowska-Sobczak, Michał Wasilewicz, Agnieszka Ochocka, Agnieszka Pasztaleniec, Iwona Jasser, Ana Antão-Geraldes, Manel Leira, Armand Hernández, Vitor Vasconcelos, João Morais, Micaela Vale, Pedro Raposeiro, Vítor Gonçalves, Boris Aleksovski, Svetislav Krstić, Hana Nemova, Iveta Drastichova, Lucia Chomova, Spela Remec-Rekar, Tina Elersek, Jordi Delgado-Martín, David Garcia, Jose Luís Cereijo, Joan Gomà, Carmen Trapote, Teresa Vegas-Vilarrúbia, Biel Obrador, Ana García-Murcia, Monserrat Real, Elvira Romans, Jordi Noguero-Ribes, David Parreño Duque, Elísabeth Fernández-Morán, Bárbara Úbeda, José Ángel Gálvez, Rafael Marcé, Nuria Catalan, Carmen Pérez-Martínez, Eloísa Rodríguez, Carmen Cillero-Castro, Enrique Moreno-Ostos, José María Blanco, Valeriano Rodríguez, Jorge Juan Montes-Pérez, Roberto Palomino, Estela Rodríguez-Pérez, Rafael Carballeira, Antonio Camacho, Antonio Picazo, Carlos Rochera, Anna Santamans, Carmen Ferriol, Susana Romo, Juan Miguel Soria, Hans Hansson, Pablo Urrutia-Cordero, Arda Özen, Andrea Bravo, Moritz Buck, William Colom-Montero, Kristiina Mustonen, Don Pierson, Yang Yang, Jolanda M. H. Verspagen, Lisette de Senerpont Domis, Laura Seelen, Sven Teurlincx, Yvon Verstijnen, Miquel Lürling, Valentini Maliaka, Elisabeth Faassen, Delphine Latour, Cayelan Carey, Hans W. Paerl, Andrea Torokne, Tünay Karan, Nilsun Demir, Meryem Beklioğlu, Nur Filiz, Eti E. Levi, Uğur Iskin, Gizem Bezirci, Ülkü Nihan Tavşanoğlu, Kemal Çelik, Koray Özhan, Nusret Karakaya, Mehmet Koçer, Mete Yilmaz, Faruk Maraşlıoğlu, Özden Fakioglu, Elif Neyran Soylu, Meral Apaydın Yağcı, Şakir Çınar, Kadir Çapkın, Abdulkadir Yağcı, Mehmet Cesur, Fuat Bilgin, Cafer Bulut, Rahmi Uysal, Latife Köker, Reyhan Akçaalan, Meriç Albay, Mehmet Tahir Alp, Korhan Özkan, Tuğba Ongun Sevindik, Hatice Tunca, Burçin Önem, Jessica Richardson, Christine Edwards, Victoria Bergkemper, Sarah O'Leary, Eilish Beirne, Hannah Cromie, Bastiaan Ibelings

article

Scientific Data , Nature Publishing Group, 2018, 5, ⟨10.1038/sdata.2018.226⟩

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titre

Combining multi-variate palaeoecological indicators and mining closed gradual patterns for refining past lake dynamics and the induced ecological legacies

auteur

Yannick Miras, Beauger Aude, Jerry Lonlac, Benjamin Legrand, Delphine Latour, Karen K. Serieyssol, Marlène Lavrieux, Jean-Luc Peiry, Engelbert Mephu Nguifo

article

International Conference on Ecological Sciences, SFEcologie 2018, Oct 2018, Rennes, France

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titre

Investigating the long-term recurrence of nostocalean cyanobacteria through a 6 700 years core in a eutrophic Lake

auteur

Benjamin Legrand, Aude Beauger, Yannick Miras, Karen K. Serieyssol, Marlène Lavrieux, J. Lesobre, M Dussauze, Delphine Latour

article

International Conference on Ecological Sciences, Sfécologie 2018, Oct 2018, Rennes, France

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titre

Interactive Effects of Pesticides and Nutrients on Microbial Communities Responsible of Litter Decomposition in Streams

auteur

Florent Rossi, Stéphane Pesce, Clarisse Mallet, Christelle Margoum, Arnaud Chaumot, Matthieu Masson, Joan Artigas

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, pp.13. ⟨10.3389/fmicb.2018.02437⟩

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titre

Human intestinal parasites in Mahajanga, Madagascar: The kingdom of the protozoa

auteur

Valentin Greigert, Ahmed Abou-Bacar, Julie Brunet, Céline Nourrisson, Alexander Pfaff, Leila Benarbia, Bruno Pereira, Milijaona Randrianarivelojosia, Jean-Louis Razafindrakoto, Rivo Rakotomalala, Eugène Morel, Ermanno Candolfi, Philippe Poirier

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (10), pp.e0204576. ⟨10.1371/journal.pone.0204576⟩

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titre

Should we expand the indications for the DAIR (debridement, antibiotic therapy, and implant retention) procedure for Staphylococcus aureus prosthetic joint infections? A multicenter retrospective study

auteur

O. Lesens, T. Ferry, E. Forestier, E. Botelho-Nevers, P. Pavese, E. Piet, B. Pereira, E. Montbarbon, B. Boyer, S. Lustig, S. Descamps

article

European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2018, 37 (10), pp.1949-1956. ⟨10.1007/s10096-018-3330-7⟩

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titre

Prenatal therapy with pyrimethamine + sulfadiazine vs spiramycin to reduce placental transmission of toxoplasmosis: a multicenter, randomized trial

auteur

Laurent Mandelbrot, Francois Kieffer, Rémi Sitta, Hélène Laurichesse-Delmas, Norbert Winer, Louis Mesnard, Alain Berrebi, Gwenaelle Le Bouar, Jean-Paul Bory, Anne-Gaëlle Cordier, Yves Ville, Franck Perrotin, Jean-Marie Jouannic, Florence Biquard, Claude D’ercole, Véronique Houfflin-Debarge, Isabelle Villena, Rodolphe Thiebaut, Denis Pons, C. Nourrisson, Rose-Anne Lavergne, Judith Fillaux, Corinne Assouline, Florence Robert-Gangneux, Coralie L’ollivier, Florence Bretelle, Béatrice Guidicelli, Patricia Garcia, Alexandra Benachi, Christelle Vauloup-Fellous, Emmanuelle Letamendia, Marie-Elisabeth Bougnoux, Nathalie van Langendonck, Jérôme Potin, Pierre Marty, Christelle Pomares, Cynthia Trastour, Anne Sophie Deleplancque, Jean-Marc Costa, Marie-Thérèse Chève, Yves Col, Bernard Cimon, Y. Sterkers, Laurence Lachaud, Gilles Burlet, Martine Maréchaud, Estelle Perraud, Anne-Gaelle Grébille, Morgane Valentin, Sandrine Houzé, Sophie Omnès, Yvon Chitrit, Christine Boissinot, Hélène Yera, Olivia Anselem, Vassilis Tsatsaris, Marie-Victoire Senat, Florent Fuchs, Adela Angoulvant, Charles Muszynski, Anne Totet, Catherine Noël, Laurent Bidat, Tiphaine Barjat, Pierre Flori, Hervé Pelloux, Pierre Brenier-Pinchart, Catherine Thong-Vanh, Corinne Floch, Lionel Carbillon, Eric Lachassine, Aude Ricbourg, Luc Paris, Marc Dommergues, Thierry Rousseau, Frédéric Dalle, Marie Laure Darde, Véronique Aubard, Camille Olivier, Eric Verspyk, Loïc Favennec

article

American Journal of Obstetrics and Gynecology, Elsevier, 2018, 219 (4), pp.386.e1-386.e9. ⟨10.1016/j.ajog.2018.05.031⟩

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titre

A New Freshwater Cyanosiphovirus Harboring Integrase

auteur

Kevin Zhong, Kevin Xu Zhong, Curtis Suttle, Anne-Claire Baudoux, Evelyne Derelle, Jonathan Colombet, Anna Cho, Jessica Caleta, Christophe Six, Stéphan Jacquet

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.02204⟩

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titre

On Evidential Clustering with Partial Supervision

auteur

Nicolas Labroche, Antoine Violaine, Kevin Gravouil

article

BELIEF 2018, Sep 2018, Compiègne, France. pp.14-21, ⟨10.1007/978-3-319-99383-6_3⟩

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titre

New insights into the pelagic microorganisms involved in the methane cycle in the meromictic Lake Pavin through metagenomics

auteur

Corinne Biderre-Petit, Najwa Taib, Hélène Gardon, Corentin Hochart, Didier Debroas

article

FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2018, ⟨10.1093/femsec/fiy183⟩

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titre

Rumen methanogens exhibit specific energetic and growth dynamics: a modelling approach

auteur

Rafael Munoz Tamayo, Milka Popova, Diego Morgavi, Dominique Graviou, Jean Pierre Morel, Gérard Fonty, Nicole Morel-Desrosiers

article

10. International Symposium on the Nutrition of Herbivores (ISNH10), Sep 2018, Clermont-Ferrand, France. Cambridge University Press, Advances in Animal Biosciences, 9 (3), 2018, 10th. International Symposium on the Nutrition of Herbivores (ISNH10)

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Human cryptosporidiosis in immunodeficient patients in France (2015–2017)

auteur

Damien Costa, Romy Razakandrainibe, Marc Sautour, Stéphane Valot, Louise Basmaciyan, Gilles Gargala, Loïc Favennec, Frédéric Dalle, Anne Debourgogne, Adela Angoulvant, Patrice Agnamey, Julie Bonhomme, Brigitte Degeilh, Cathy Chemla, Cécile Garnaud, Coralie Lollivier, Cécile Angebault, Pascal Delaunay, Guillaume Desoubeaux, Emilie Frealle, Frédéric Grenouillet, Florent Morio, Françoise Botterel, Ghania Belkadi, Hélène Yera, Gilles Nevez, Xavier Iriart, Isabelle Accoceberry, Julie Brunet, Marc Thellier, Denis Lemeteil, Meja Rabodonirina, Milène Sasso, Charline Miossec, Murielle Nicolas, Nicole Desbois, Philippe Poirier, Christelle Pomares, Sandrine Houzé, Yohann Le Govic, Anne Pauline Bellanger, Franck Labbe, Marie Laure Dardé, Olivier Duquesnoy, Pierre Flori, Patrick Bastien, Thomas Gueudet, Isabelle Villena, Dominique Aubert, Estelle Cateau, Marie-Elisabeth Bougnoux, Nathalie Kapel, Eric Dannaoui, Alexis Valentin, Anne Totet, Jean Menotti, Denis Blanchet, Magalie Demar, Emmanuel Dutoit, Renaud Piarroux, Emilie Sitterlé, Denis Magne, Samsa Hamane, Antoine Berry, Cecile Ramade

article

Experimental Parasitology, Elsevier, 2018, 192, pp.108-112. ⟨10.1016/j.exppara.2018.08.001⟩

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titre

One fungus, several microbes

auteur

C. Imbert, C. Hennequin, A. Coste

article

Journal of Medical Mycology / Journal de Mycologie Médicale, Elsevier Masson, 2018, 28 (3), pp.413. ⟨10.1016/j.mycmed.2018.08.001⟩

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titre

In-vitro and in-vivo antileishmanial activity of inexpensive Amphotericin B formulations: Heated Amphotericin B and Amphotericin B-loaded microemulsion

auteur

Andreza Rochelle, Vale Morais, André Silva, Andreza Rochelle Do Vale Morais, André Leandro Silva, Sandrine Cojean, Kaluvu Balaraman, Christian Bories, Sébastien Pomel, Gillian Barratt, Eryvaldo Sócrates Tabosa Do Egito, Philippe Loiseau

article

Experimental Parasitology, Elsevier, 2018, 192, pp.85-92. ⟨10.1016/j.exppara.2018.07.017⟩

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titre

Carbonate Facilitated Mobilization of Uranium from Lacustrine Sediments under Anoxic Conditions

auteur

Marina Seder-Colomina, Arnaud Mangeret, Lucie Stetten, Pauline Merrot, Olivier Diez, Anthony Julien, Evelyne Barker, Antoine Thouvenot, John Bargar, Charlotte Cazala, Guillaume Morin

article

Environmental Science and Technology, American Chemical Society, 2018, 52 (17), pp.9615-9624. ⟨10.1021/acs.est.8b01255⟩

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titre

1,2,3-Triazolium-Based Cationic Amphipathic Peptoid Oligomers Mimicking Antimicrobial Helical Peptides

auteur

Radhe Shyam, Nicolas Charbonnel, Aurélie Job, Christelle Blavignac, Christiane Forestier, Claude Taillefumier, Sophie Faure

article

ChemMedChem, Wiley-VCH Verlag, 2018, 13 (15), pp.1513 - 1516. ⟨10.1002/cmdc.201800273⟩

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Emerging resistance mutations in PI-naive patients failing an atazanavir-based regimen (ANRS multicentre observational study)

auteur

L Lambert-Niclot, C Grude, L. Chaix, L Charpentier, C Reigadas, L Le Guillou-Guillemette, C Rodallec, Pascale Maillard, C Dufayard, C Mourez, C Mirand, L Guinard, S Montes, L Vallet, Marc Marcelin, L Descamps, C Flandre, L Delaugerre, Chakib Alloui, Diane Descamps, Charlotte Charpentier, Benoit Visseaux, Anne Krivine, Ali Bouviers-Alias, Coralie Pallier, Cathia Soulié, Marc Wirden, Anne Marcelin, Vincent Calvez, Laurence Morand, Sidonie Lambert-Niclot, Djeneba Fofana, Nadia Mahjoub, Constance Delaugerre, Marie Chaix, Corinne Amiel, Veronique Schneider, Catherine Roussel, Hélène Le Guillou-Guillemette, Laurence Courdavault, Sandrine Reigadas, Patricia Recordon-Pinson, Hervé Fleury, Sophie Vallet, Julia Dina, Astrid Vabret, Audrey Mirand, Cécile Henquell, Christelle Auvray, Alexis de Rougemont, Helene Giraudon, Ali Si-Mohammed, Dominique Mathez, Anne Signori-Schmuck, Patrice Morand, Laurence Bocket, Anne Trabaud, Brigitte Montes, Laura Le Guen, Audrey Rodallec, Virginie Ferré, Hélène Jeulin, Evelyne Schvoerer, Jacqueline Dufayard, Annick Allardet-Servent, Marie Carles, Jérôme Guinard, Aurélie Guigon, Genevieve Giraudeau, Agnès Beby-Defaux, Anne Maillard, Jean Christophe Plantier, Marie Leoz, Thomas Mourez, Thomas Bourlet, Samira Fafi-Kremer, Julie Chiabrando, Stéphanie Raymond, Jacques Izopet, Francis Barin, Stéphanie Marque-Juillet, Sabine Yerly

article

Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2018, 73 (8), pp.2147 - 2151. ⟨10.1093/jac/dky142⟩

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Taxonomical Resolution and Distribution of Bacterioplankton Along the Vertical Gradient Reveals Pronounced Spatiotemporal Patterns in Contrasted Temperate Freshwater Lakes

auteur

J. Keshri, A. Pradeep Ram, P. Nana, T. Sime-Ngando

article

Microbial Ecology, Springer Verlag, 2018, 76 (2), pp.372-386. ⟨10.1007/s00248-018-1143-y⟩

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titre

Diversity of DHA-1-encoding plasmids in Klebsiella pneumoniae isolates from 16 French hospitals

auteur

Claire Hennequin, Alexandre Chlilek, Racha Beyrouthy, Richard Bonnet, Frédéric Robin

article

Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2018, 73 (11), pp.2981-2989. ⟨10.1093/jac/dky285⟩

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titre

Hordes of Phages in the Gut of the Tilapia Sarotherodon melanotheron

auteur

Yvan Bettarel, Marine Combe, Antoinette Adingra, Awa Ndiaye, Thierry Bouvier, Jacques Panfili, Jean-Dominique Durand

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-29643-9⟩

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Biodiversity and phylogeny of arid-adapted darkling beetle in the subfamily Pimeliinae (Coleoptera: Tenebrionidae)

auteur

P. Bouchard, A.D. Smith, K. Kanda, Monique Kaminski, G. Flores, Gael Kergoat, F.L. Condamine, R. Aalbu, A. Lamb, L. Purchart

article

Canadian Society for Ecology & Evolution Meeting 2018. CSEE 2018, Jul 2018, Guelph, Canada

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titre

Error-prone protein synthesis in parasites with the smallest eukaryotic genome

auteur

Sergey Melnikov, Keith Rivera, Denis Ostapenko, Arthur Makarenko, Neil Sanscrainte, James Becnel, Mark Solomon, Catherine Texier, Darryl Pappin, Dieter Söll

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2018, 115 (27), pp.E6245 - E6253. ⟨10.1073/pnas.1803208115⟩

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titre

Abundance and observations of thermophilic microbial and viral communities in submarine and terrestrial hot fluid systems of the French Southern and Antarctic Lands

auteur

Kaarle Parikka, Stéphan Jacquet, Jonathan Colombet, Damien Guillaume, Marc Le Romancer

article

Polar Biology, Springer Verlag, 2018, 41 (7), pp.1335 - 1352. ⟨10.1007/s00300-018-2288-3⟩

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titre

Biodegradation and toxicity of a maize herbicide mixture: mesotrione, nicosulfuron and S-metolachlor

auteur

Louis Carles, Muriel Joly, Frédérique Bonnemoy, Martin Leremboure, Florence Donnadieu, Isabelle Batisson, Pascale Besse-Hoggan

article

Journal of Hazardous Materials, Elsevier, 2018, 354, pp.42 - 53. ⟨10.1016/j.jhazmat.2018.04.045⟩

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titre

Genetic diversity analysis of Blastocystis subtypes from both symptomatic and asymptomatic subjects using a barcoding region from the 18S rRNA gene

auteur

Tahereh Rezaei Riabi, Hamed Mirjalali, Ali Haghighi, Mohammad Rostami Nejad, Mohammad Pourhoseingholi, Philippe Poirier, Frédéric Delbac, Ivan Wawrzyniak, Mohammad Zali

article

Infection, Genetics and Evolution, Elsevier, 2018, 61, pp.119-126

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titre

Plasmids carrying DHA-1 β-lactamases

auteur

Claire Hennequin, Viviane Ravet, Frédéric Robin

article

European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2018, 37 (7), pp.1197 - 1209. ⟨10.1007/s10096-018-3231-9⟩

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titre

Editorial

auteur

A. Coste, C. Imbert, C. Hennequin

article

Journal of Medical Mycology / Journal de Mycologie Médicale, Elsevier Masson, 2018, 28 (2), pp.235. ⟨10.1016/j.mycmed.2018.06.001⟩

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titre

A state of the art review on optimal practices to prevent, recognize, and manage complications associated with intravascular devices in the critically ill

auteur

Jean-Francois Timsit, Mark Rupp, Emilio Bouza, Vineet Chopra, Tarja Kärpänen, Kevin Laupland, Thiago Lisboa, Leonard Mermel, Olivier Mimoz, Jean-Jacques Parienti, Garyphalia Poulakou, Bertrand Souweine, Walter Zingg

article

Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (6), pp.742-759. ⟨10.1007/s00134-018-5212-y⟩

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titre

Cost-effectiveness analysis of chlorhexidine-alcohol versus povidone iodine-alcohol solution in the prevention of intravascular-catheter-related bloodstream infections in France

auteur

Christian Farinetto, Franck Maunoury, Stephane Ruckly, Jeremy Guenezan, Jean-Christophe Lucet, Alain Lepape, Julien Pascal, Bertrand Souweine, Olivier Mimoz, Jean-François Timsit, Iratxe Puebla

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (5), ⟨10.1371/journal.pone.0197747⟩

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titre

ASaiM: a Galaxy-based framework to analyze microbiota data

auteur

Bérénice Batut, Kevin Gravouil, Clemence Defois, Saskia Hiltemann, Jean-François Brugère, Eric Peyretaillade, Pierre Peyret

article

GigaScience, BioMed Central, 2018, 7 (6)

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titre

ASaiM: a Galaxy-based framework to analyze microbiota data

auteur

Bérénice Batut, Kevin Gravouil, Clemence Defois, Saskia Hiltemann, Jean-François Brugère, Eric Peyretaillade, Pierre Peyret

article

GigaScience, BioMed Central, 2018, 7 (6), pp.1-7. ⟨10.1093/gigascience/giy057⟩

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titre

Bioinformatics Meets Virology: The European Virus Bioinformatics Center’s Second Annual Meeting

auteur

Bashar Ibrahim, Ksenia Arkhipova, Arno Andeweg, Susana Posada-Céspedes, François Enault, Arthur Gruber, Eugene Koonin, Anne Kupczok, Philippe Lemey, Alice Mchardy, Dino Mcmahon, Brett Pickett, David Robertson, Richard Scheuermann, Alexandra Zhernakova, Mark Zwart, Alexander Schönhuth, Bas Dutilh, Manja Marz

article

Viruses, MDPI, 2018, 10 (5), pp.256. ⟨10.3390/v10050256⟩

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titre

RSV-hRV co-infection is a risk factor for recurrent bronchial obstruction and early sensitization 3 years after bronchiolitis

auteur

Flore Amat, Chloé Plantard, Aurelien Mulliez, Isabelle Petit, Emmanuelle Rochette, Matthieu Verdan, Cécile Henquell, Guillaume Labbé, Marie Christine Heraud, Bertrand Evrard, André Labbé

article

Journal of Medical Virology, Wiley-Blackwell, 2018, 90 (5), pp.867-872. ⟨10.1002/jmv.25037⟩

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titre

Infection-related ventilator-associated complications in ICU patients colonised with extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae

auteur

François Barbier, Sébastien Bailly, Carole Schwebel, Laurent Papazian, Élie Azoulay, Hatem Kallel, Shidasp Siami, Laurent Argaud, Guillaume Marcotte, Beno\ⁱt Misset, Jean Reignier, Michaël Darmon, Jean-Ralph Zahar, Dany Goldgran-Toledano, Étienne Montmollin, Bertrand Souweine, Bruno Mourvillier, Jean-François Timsit

article

Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (5), pp.616-626. ⟨10.1007/s00134-018-5154-4⟩

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titre

Infection-related ventilator-associated complications in ICU patients colonised with extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae

auteur

François Barbier, Sébastien Bailly, Carole Schwebel, Laurent Papazian, Élie Azoulay, Hatem Kallel, Shidasp Siami, Laurent Argaud, Guillaume Marcotte, Benoît Misset, Jean Reignier, Michaël Darmon, Jean Zahar, Dany Goldgran-Toledano, Etienne de Montmollin, Bertrand Souweine, Bruno Mourvillier, François Timsit

article

Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (5), pp.616-626

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titre

ASSESSMENT OF THE ADSORPTION OF AEROMONAS HYDROPHILA ON POLYTHENE IN SODIUM HYPOCHLORITE AND HYDROGEN PEROXIDE TREATED WATER

auteur

Chrétien Djimeli, Antoine Arfao, O. V. Noah Ewoti, Vivien Rossi, Ernest Lango-Yaya, Vincent Raspal, Moïse Nola, T Sime-Ngando

article

Journal of Water and Environmental Sciences, 2018

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titre

Rumen methanogens display species-specific energetic and growth dynamics: a thermodynamic and kinetic based modelling approach

auteur

Rafael Munoz Tamayo, Milka Popova, Diego Morgavi, Dominique Graviou, Jean-Pierre Morel, Gerard Fonty, Nicole Morel-Desrosiers

article

Journées d'Animation Scientifique du département PHASE, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Apr 2018, Rennes, France

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titre

Phenotypic analysis of HIV-1 E157Q integrase polymorphism and impact on virological outcome in patients initiating an integrase inhibitor-based regimen

auteur

Charlotte Charpentier, Isabelle Malet, Elisabeth André-Garnier, Alexandre Storto, Laurence Bocket, Corinne Amiel, Laurence Morand-Joubert, Camille Tumiotto, Thuy Nguyen, Anne Maillard, Audrey Rodallec, Marie Leoz, Brigitte Montes, Véronique Schneider, Jean-Christophe Plantier, Julia Dina, Coralie Pallier, Audrey Mirand, Catherine Roussel, Anne Signori-Schmuck, Stéphanie Raymond, Vincent Calvez, Constance Delaugerre, Anne Marcelin, Diane Descamps

article

Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2018, 73 (4), pp.1039-1044. ⟨10.1093/jac/dkx511⟩

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titre

Taxonomy of prokaryotic viruses: 2017 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee

auteur

Evelien M. Adriaenssens, Johannes Wittmann, Jens Kuhn, Dann Turner, Matthew Sullivan, Bas Dutilh, Ho Bin Jang, Leonardo van Zyl, Jochen Klumpp, Malgorzata Lobocka, Andrea Moreno Switt, Janis Rumnieks, Rob Edwards, Jumpei Uchiyama, Poliane Alfenas-Zerbini, Nicola Petty, Andrew Kropinski, Jakub Barylski, Annika Gillis, Martha Clokie, David Prangishvili, Rob Lavigne, Ramy Karam Aziz, Siobain Duffy, Mart Krupovic, Minna Poranen, Petar Knezevic, Francois Enault, Yigang Tong, Hanna Oksanen, J. Rodney Brister

article

Archives of Virology, Springer Verlag, 2018, 163 (4), pp.1125-1129. ⟨10.1007/s00705-018-3723-z⟩

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titre

Population Structure of Candida parapsilosis: No Genetic Difference Between French and Uruguayan Isolates Using Microsatellite Length Polymorphism

auteur

Marie Desnos-Ollivier, Victoria Bórmida, Philippe Poirier, Céline Nourrisson, Dinorah Pan, Stéphane Bretagne, Andrès Puime, Françoise Dromer

article

Mycopathologia, Springer Verlag, 2018, 183 (2), pp.381 - 390. ⟨10.1007/s11046-017-0224-7⟩

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titre

Corallivory and the microbial debacle in two branching scleractinians

auteur

Yvan Bettarel, Sebastien Halary, Jean-Christophe Auguet, Thanh Chi Mai, Ngoc Van Bui, Thierry Bouvier, Patrice Got, Corinne Bouvier, Sonia Monteil-Bouchard, Christelle Desnues

article

ISME Journal, Nature Publishing Group, 2018, 12 (4), pp.1109--1126. ⟨10.1038/s41396-017-0033-5⟩

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titre

Recommendations for enterovirus diagnostics and characterisation within and beyond Europe

auteur

Heli Harvala, Eeva Broberg, Kimberley Benschop, Natasa Berginc, Shamez Ladhani, Petri Susi, Claus Christiansen, James Mckenna, David Allen, Phoebe Makiello, Georgina Mcallister, Mirabelli Carmen, Katherina Zakikhany, Robert Dyrdak, Xiaohui Nielsen, Tina Madsen, Joel Paul, Catherine Moore, Karin von Eije, Antonio Piralla, Mieke Carlier, Laura Vanoverschelde, Randy Poelman, Andrés Anton, F. Xavier López-Labrador, Laura Pellegrinelli, Kathrin Keeren, Melanie Maier, Hayley Cassidy, Stavros Derdas, Carita Savolainen-Kopra, Sabine Diedrich, Svein Nordbø, Javier Buesa, Jean-Luc Bailly, Fausto Baldanti, Andrew Macadam, Audrey Mirand, Susanne Dudman, Isabelle Schuffenecker, Seilesh Kadambari, Johan Neyts, Michael Griffiths, Jan Richter, Cristina Margaretto, Sheila Govind, Ursula Morley, Ortwin Adams, Sidsel Krokstad, Jonathan Dean, Margarita Pons-Salort, Birgit Prochazka, Maria Cabrerizo, Manasi Majumdar, Gaia Nebbia, Maryse Wiewel, Simon Cottrell, Peter Coyle, Javier Martin, Catrin Moore, Sofie Midgley, Peter Horby, Katja Wolthers, Peter Simmonds, Hubert Niesters, Thea Fischer

article

Journal of Clinical Virology, Elsevier, 2018, 101, pp.11-17

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titre

Additive effect of calcium depletion and low resource quality on Gammarus fossarum (Crustacea, Amphipoda) life history traits

auteur

Marc Rollin, Romain Coulaud, Michael Danger, Benedicte Sohm, Justine Flayac, Alexandre Bec, Arnaud Chaumot, Geffard Olivier, Vincent Felten

article

Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2018, 25 (12), pp.11264 - 11280. ⟨10.1007/s11356-017-9390-x⟩

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titre

Effects of the gut parasite Nosema ceranae on honey bee physiology and behavior

auteur

Laurianne Paris, Hicham El Alaoui, Frédéric Delbac, Marie Diogon

article

Current Opinion in Insect Science, Elsevier, 2018, 26, pp.149-154

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titre

Differential impact of lytic viruses on prokaryotic morphopopulations in a tropical estuarine system (Cochin estuary, India)

auteur

Vijayan Jasna, Angia Sriram Pradeep Ram, Ammini Parvathi, Télesphore Sime-Ngando, Adelaide Almeida

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (3), pp.e0194020

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titre

Morphology and infraciliature of two new earthworm ciliates, Hoplitophrya polymorphus sp. nov. and Anoplophrya simplex sp. nov. (Ciliophora: Oligohymenophorea: Astomatia)

auteur

Paul Alain Nana, Zéphyrin Fokam, Bernard Vigues, Geneviève Bricheux, GidÉon Ajeagah Aghaindum, Pierre Ngassam, Moïse Nola, Télesphore Sime-Ngando

article

Zootaxa, Magnolia Press, 2018, 4392 (1), ⟨10.11646/zootaxa.4392.1.9⟩

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titre

A mimetic nesting association between a timid social wasp and an aggressive arboreal ant

auteur

Bruno Corbara, Pablo Servigne, Alain Dejean, James Carpenter, Jérôme Orivel

article

Comptes Rendus Biologies, Elsevier Masson, 2018, 341 (3), pp.182-188. ⟨10.1016/j.crvi.2018.01.006⟩

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titre

Method validation of a set of 12 GEM® Premier™ 4000 blood gas analyzers for point-of-care testing in a university teaching hospital

auteur

Damien Bouvier, Thomas Duret, Paul Rouzaire, Matthieu Jabaudon, Marion Rouzaire, Céline Nourrisson, Céline Bourgne, Bruno Pereira, Bertrand Evrard, Vincent Sapin

article

Practical Laboratory Medicine, Elsevier, 2018, 10, pp.21 - 33. ⟨10.1016/j.plabm.2017.12.001⟩

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titre

Invasive Infections Caused by Nannizziopsis spp. Molds in Immunocompromised Patients

auteur

Céline Nourrisson, Magali Vidal-Roux, Sophie Cayot, Christine Jacomet, Charlotte Bothorel, Albane Ledoux-Pilon, Fanny Anthony-Moumouni, Olivier Lesens, Philippe Poirier

article

Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2018, 24 (3), pp.549-552

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titre

Monitoring human enteric viruses in wastewater and relevance to infections encountered in the clinical setting: a one-year experiment in central France, 2014 to 2015

auteur

Maxime Bisseux, Jonathan Colombet, Audrey Mirand, Anne-Marie Roque-Afonso, Florence Legrand-Abravanel, Jacques Izopet, Christine Archimbaud, Hélène Peigue-Lafeuille, Didier Debroas, Jean-Luc Bailly, Cécile Henquell

article

Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2018, 23 (7), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2018.23.7.17-00237⟩

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titre

Diversity of rare and abundant prokaryotic phylotypes in the Prony hydrothermal field and comparison with other serpentinite-hosted ecosystems

auteur

Eléonore Frouin, Méline Bes, Bernard Ollivier, Marianne Quéméneur, Anne Postec, Didier Debroas, Fabrice Armougom, Gaël Erauso

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.00102⟩

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titre

Diel rhythm does not shape the vertical distribution of bacterial and archaeal 16S rRNA transcript diversity in intertidal sediments: a mesocosm study Running title: Diel activities of benthic Bacteria and Archaea

auteur

Céline Lavergne, Mylène Hugoni, Cédric Hubas, Didier Debroas, Christine Dupuy, Hélène Agogué

article

Microbial Ecology, Springer Verlag, 2018, 75 (2), pp.364-374. ⟨10.1007/s00248-017-1048-1⟩

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titre

Changes in biochemical and sensory parameters in industrial blue-veined cheeses in different packaging

auteur

P. Duval, C. Chatelard-Chauvin, C. Gayard, E. Rifa, P. Bouchard, S. Hulin, Armelle Delile, B. Pollet, C. Montel, D. Picque

article

International Dairy Journal, Elsevier, 2018, 77, pp.89-99. ⟨10.1016/j.idairyj.2016.10.004⟩

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titre

Performance of genotypic algorithms for predicting tropism for HIV-1 CRF01_AE recombinant

auteur

C. Soulié, L. Morand-Joubert, J. Cottalorda, C. Charpentier, P. Bellecave, L. Le Guen, S. Yerly, B Montes, S. Fafi-Kremer, J. Dina, V. Avettand-Fenoel, C. Amiel, C. Roussel, C. Pallier, K. Zafilaza, S. Sayon, A. Signori-Schmuck, A. Mirand, A. Trabaud, S. Berger, V. Calvez, A. Marcelin

article

Journal of Clinical Virology, Elsevier, 2018, 99-100, pp.57-60

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titre

Characterization of an easy-to-use method for the routine analysis of the central metabolism using an affordable low-resolution GC–MS system: application to Arthrospira platensis

auteur

Myriam Phélippé, Rémy Coat, Camille Le Bras, Lorene Perrochaud, Eric Peyretaillade, Delphine Kucma, Abdellah Arhaliass, Gerald Thouand, Guillaume Cogne, Olivier Gonçalves

article

Analytical and Bioanalytical Chemistry, Springer Verlag, 2018, 410 (4), pp.1341-1361

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Diagnosis of Infective Endocarditis After TAVR

auteur

Erwan Salaün, Laura Sportouch, Pierre-Antoine Barral, Sandrine Hubert, Cécile Lavoute, Anne-Claire Casalta, Julie Pradier, Daniel Ouk, Jean-Paul Casalta, Marc Lambert, Frederique Gouriet, Jean-Yves Gaubert, Aurélie Dehaene, Alexis Jacquier, Laetitia Tessonnier, Julie Haentjens, Alexis Theron, Alberto Riberi, Serge Cammilleri, Dominique Grisoli, Nicolas Jaussaud, Frederic Collart, Jean-Louis Bonnet, Laurence Camoin, Sebastien Renard, Thomas Cuisset, Jean-François Avierinos, Hubert Lepidi, Olivier Mundler, Didier Raoult, Gilbert Habib

article

JACC: Cardiovascular Imaging, Elsevier/American College of Cardiology, 2018, 11 (1), pp.143-146. ⟨10.1016/j.jcmg.2017.05.016⟩

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Assessment of blood enterovirus PCR testing in paediatric populations with fever without source, sepsis-like disease, or suspected meningitis: a prospective, multicentre, observational cohort study

auteur

Jeremy Lafolie, André Labbé, Anne-Sophie l'Honneur, Fouad Madhi, Bruno Pereira, Marion Decobert, Marie Adam, François Gouraud, Frédéric Faibis, Francois Arditty, Stéphanie Marque-Juillet, Marie Guitteny, Gisèle Lagathu, Matthieu Verdan, Flore Rozenberg, Audrey Mirand, Hélène Peigue-Lafeuille, Cécile Henquell, Jean-Luc Bailly, Christine Archimbaud

article

The Lancet Infectious Diseases, New York, NY : Elsevier Science ; The Lancet Pub. Group, 2001-, 2018, 18 (12), pp.1385-1396. ⟨10.1016/S1473-3099(18)30479-1⟩

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Management and outcomes of acute respiratory distress syndrome patients with and without comorbid conditions

auteur

E. Azoulay, V. Lemiale, B. Mourvillier, M. Garrouste-Orgeas, C. Schwebel, S. Ruckly, Laurent Argaud, Y. Cohen, B. Souweine, L. Papazian, J. Reignier, G. Marcotte, S. Siami, H. Kallel, M. Darmon, J. F. Timsit, Outcomerea Study Grp

article

Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2018, 44 (7), pp.1050--1060

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Efficient and reproducible experimental infections of rats with Blastocystis spp.

auteur

Manon Defaye, Céline Nourrisson, Elodie Baudu, Ivan Warwzyniak, Virginie Bonnin, Mathilde Bonnet, Nicolas Barnich, Denis Ardid, Frédéric Delbac, Frédéric Antonio Carvalho, Philippe Poirier

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (11), pp.1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0207669⟩

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Usefulness of Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus (KSHV) DNA Viral Load in Whole Blood for Diagnosis and Monitoring of KSHV-Associated Diseases

auteur

Aude Jary, Valentin Leducq, Romain Palich, Adélie Gothland, Diane Descamps, Véronique Joly, Sidonie Lambert-Niclot, Corinne Amiel, Ana Canestri, Audrey Mirand, Elyanne Gault, Astrid Vabret, Marc-Antoine Valantin, Christine Katlama, Vincent Calvez, Nicolas Dupin, Jean-Philippe Spano, Anne-Geneviève Marcelin

article

Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2018, 56 (6), pp.1-4. ⟨10.1128/JCM.00569-18⟩

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Biogeographic patterns of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria reveal an ecological consistency of phylogenetic clades in different oceanic biomes

auteur

Anne-Catherine Lehours, Francois Enault, Dominique Boeuf, Christian Jeanthon

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8, pp.4105. ⟨10.1038/s41598-018-22413-7⟩

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High Incidence of Lysogeny in the Oxygen Minimum Zones of the Arabian Sea (Southwest Coast of India)

auteur

Ammini Parvathi, Vijayan Jasna, Sreekumar Aparna, Angia Pradeep Ram, Vijaya Aswathy, Kizhakkeppat Balachandran, Kallungal Muraleedharan, Dayana Mathew, Télesphore Sime-Ngando

article

Viruses, MDPI, 2018, 10 (11), pp.588

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Forces, failles et opportunités de la recherche française en écologie trophique

auteur

Marie-Elodie Perga, Michael Danger, Stanislas Dubois, Clémentine Fritsch, Cedric Gaucherel, Cedric Hubas, Franck Jabot, Gérard Lacroix, Sébastien Lefebvre, Pierre Marmonier, Alexandre Bec

article

Comptes Rendus Biologies, Elsevier Masson, 2018, 341 (6), pp.301-314. ⟨10.1016/j.crvi.2018.05.001⟩

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Bacterial-viral interactions in the sea surface microlayer of a black carbon-dominated tropical coastal ecosystem (Halong Bay, Vietnam)

auteur

A.S. Pradeep Ram, Xavier Mari, J. Brune, J.P. Torréton, V.T. Chu, Patrick Raimbault, J. Niggemann, T. Sime-Ngando

article

Elementa: Science of the Anthropocene, University of California Press, 2018, 6 (1), pp.13. ⟨10.1525/elementa.276⟩

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Ant-plant relationships in the canopy of an Amazonian rainforest: the presence of an ant mosaic

auteur

Alain Dejean, Jérôme Orivel, Maurice Leponce, Arthur Compin, Jacques Delabie H. C, Frédéric Azémar, Bruno Corbara

article

Biological Journal of the Linnean Society, Linnean Society of London, 2018, 125 (2), pp.344-354. ⟨10.1093/biolinnean/bly125⟩

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titre

Ant–plant relationships in the canopy of an Amazonian rainforest: the presence of an ant mosaic

auteur

Alain Dejean, Jérôme Orivel, Maurice Leponce, Arthur Compin, Jacques Delabie, Frédéric Azémar, Bruno Corbara

article

Biological Journal of the Linnean Society, Linnean Society of London, 2018, 125, pp.344 - 354

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Tank bromeliads sustain high secondary production in neotropical forests

auteur

Olivier Dézerald, Céline Leroy, Bruno Corbara, Alain Dejean, Stanislas Talaga, Régis Céréghino

article

Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, Springer Verlag, 2018, 80 (2), ⟨10.1007/s00027-018-0566-3⟩

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Constraints on the functional trait space of aquatic invertebrates in bromeliads

auteur

Régis Cereghino, Valério Pillar, Diane Srivastava, Paula de Omena, A. Andrew M. Macdonald, Ignacio Barberis, Bruno Corbara, Laura Guzman, Céline Leroy, Fabiola Ospina Bautista, Gustavo Romero, M. Kurtis Trzcinski, Pavel Kratina, Vanderlei Debastiani, Ana Z. Gonçalves, Nicholas Marino, Vinicius Farjalla, Barbara Richardson, Michael Richardson, Olivier Dézerald, Benjamin Gilbert, Jana Petermann, Stanislas Talaga, Gustavo Piccoli, Merlijn Jocqué, Guillermo Montero

article

Functional Ecology, Wiley, 2018, 32 (10), pp.2435-2447. ⟨10.1111/1365-2435.13141⟩

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Prokaryote/eukaryote dichotomy and bacteria/archaea/eukarya domains : two inseparable concepts

auteur

J.C. Bertrand, Pierre Caumette, P. Normand, Bernard Ollivier, T. Sime-Ngando

article

Bertrand, J.C. (ed.); Normand, P. (ed.); Ollivier, Bernard (ed.); Sime-Ngando, T. (ed.). Prokaryotes and evolution, Springer, p. 1-21, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_1⟩

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titre

Impact of the microsporidian Nosema ceranae on the gut epithelium renewal of the honeybee, Apis mellifera

auteur

Johan Panek, Laurianne Paris, Diane Roriz, Anne Mone, Aurore Dubuffet, Frédéric Delbac, Marie Diogon, Hicham El Alaoui

article

Journal of Invertebrate Pathology, Elsevier, 2018, 159, pp.121-128. ⟨10.1016/j.jip.2018.09.007⟩

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REPLY: De-Escalation of the P2Y12 Inhibitor After Acute Coronary Syndromes According to On-Treatment Platelet Reactivity A Promising Step of Enormous Magnitude That Should Be Explored

auteur

Pierre Deharo, Laurence Camoin, Jacques Quilici, Jean Louis Bonnet, Thomas Cuisset

article

JACC: Cardiovascular Interventions, Elsevier/American College of Cardiology, 2018, 11 (5), pp.508-509. ⟨10.1016/j.jcin.2018.01.256⟩

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Microbial parasites make cyanobacteria blooms less of a trophic dead end than commonly assumed

auteur

Matilda Haraldsson, Mélanie Gerphagnon, Pauline Bazin, Jonathan Colombet, Samuele Tecchio, Télesphore Sime-Ngando, Nathalie Niquil

article

ISME Journal, Nature Publishing Group, 2018, 12, pp.1008-1020. ⟨10.1038/s41396-018-0045-9⟩

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titre

Biomorphology of crustaceans in a unpolluted stream in the equatorial forest of Cameroon

auteur

Gideon Aghaindum Ajeagah, Gertrude Estelle Yogback, Siméon Tchakonté, Paul Alain Nana, Geneviève Bricheux, Télesphore Sime-Ngando, Champlain Djieto-Lordon

article

Journal of Water Science / Revue des Sciences de l'Eau, Lavoisier (Hermes Science Publications), 2018, 31 (1), ⟨10.7202/1047051ar⟩

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titre

A New Freshwater Cyanosiphovirus Harboring Integrase

auteur

Kevin Zhong, Curtis A. Suttle, Anne-Claire Baudoux, Evelyne Derelle, Jonathan Colombet, Anna Cho, Jessica Caleta, Christophe Six, Stéphan Jacquet

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, pp.2204. ⟨10.3389/fmicb.2018.02204⟩

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titre

Functional traits and environmental conditions predict community isotopic niches and energy pathways across spatial scales

auteur

Olivier Dézerald, Diane Srivastava, Régis Céréghino, Jean-François Carrias, Bruno Corbara, Vinicius Farjalla, Céline Leroy, Nicholas Marino, Gustavo Piccoli, Barbara Richardson, Michael Richardson, Gustavo Romero, Angélica González

article

Functional Ecology, Wiley, 2018, 32 (10), pp.2423-2434. ⟨10.1111/1365-2435.13142⟩

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titre

Highly modular pattern in ant-plant interactions involving specialized and non-specialized myrmecophytes

auteur

Alain Dejean, Frédéric Azémar, Frédéric Petitclerc, Jacques Delabie, Bruno Corbara, Céline Leroy, Régis Cereghino, Arthur Compin

article

The Science of Nature Naturwissenschaften, Springer Verlag, 2018, 105 (7-8), ⟨10.1007/s00114-018-1570-0⟩

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titre

A strong link between marine microbial community composition and function challenges the idea of functional redundancy

auteur

Pierre E. Galand, Olivier Pereira, Corentin Hochart, J.-C. Auguet, Didier Debroas

article

ISME Journal, Nature Publishing Group, 2018, 12 (10), pp.2470-2478. ⟨10.1038/s41396-018-0158-1⟩

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titre

Cellular and non-cellular mineralization of organic carbon in soils with contrasted physicochemical properties

auteur

Benoit Keraval, Sébastien Fontaine, Audrey Lallement, Sandrine Revaillot, Hermine Billard, Gaël Alvarez, Fernando Maestre, Christian Amblard, Anne-Catherine Lehours

article

Soil Biology and Biochemistry, Elsevier, 2018, 125, pp.286-289. ⟨10.1016/j.soilbio.2018.07.023⟩

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titre

Hydrogenotrophic methanogens of the mammalian gut: functionally similar, thermodynamically different -A modelling approach

auteur

Rafael Munoz Tamayo, Milka Popova, Maxence Tillier, Diego Morgavi, Gérard Fonty, Nicole Morel-Desrosiers

article

2018

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titre

Simulated drought regimes reveal community resilience and hydrological thresholds for altered decomposition

auteur

Hector Rodriguez Perez, Guillaume Borrel, Céline Leroy, Jean-Francois Carrias, Bruno Corbara, Diane S. Srivastava, Régis Céréghino

article

Oecologia, Springer Verlag, 2018, 187 (1), pp.267-279. ⟨10.1007/s00442-018-4123-5⟩

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2017

titre

Caractérisation des proliférations nostocaléennes anciennes et futures via les akinètes présents dans les sédiments

auteur

Benjamin Legrand

article

Etudes de l'environnement. Université Clermont Auvergne, 2017. Français. ⟨NNT : 2017CLFAC109⟩

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titre

Spatial and temporal changes of parasitic chytrids of cyanobacteria

auteur

Mélanie Gerphagnon, Jonathan Colombet, Delphine Latour, Télesphore Sime-Ngando

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), ⟨10.1038/s41598-017-06273-1⟩

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titre

Plastics in the North Atlantic garbage patch: A boat-microbe for hitchhikers and plastic degraders

auteur

Didier Debroas, Anne Mone, Alexandra ter Halle

article

Science of the Total Environment, Elsevier, 2017, 599-600, pp.1222 - 1232. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.05.059⟩

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titre

To what extent is the DNA of microbial eukaryotes modified during burying into lake sediments? A repeat-coring approach on annually laminated sediments

auteur

Eric Capo, Isabelle Domaizon, Dominique Maier, Didier Debroas, Christian Bigler

article

Journal of Paleolimnology, Springer Verlag, 2017, 58 (4), pp.479 - 495. ⟨10.1007/s10933-017-0005-9⟩

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titre

Cost assessment of a new oral care program in the intensive care unit to prevent ventilator-associated pneumonia

auteur

Jérôme Ory, Charline Mourgues, Evelyne Raybaud, Russell Chabanne, Jean Christophe Jourdy, Fabien Belard, Renaud Guerin, Bernard Cosserant, Jean Sébastien Faure, Laure Calvet, Bruno Pereira, Dominique Guélon, Ousmane Traore, Laurent Gerbaud

article

Clinical Oral Investigations, Springer Verlag, 2017, ⟨10.1007/s00784-017-2289-6⟩

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titre

Volatolomics in microbial ecotoxicology, a pathway for detecting metabolic signatures of exposure to xenobiotics

auteur

Kévin Hidalgo, Erwan Engel, Jean Louis Bonnet, Patrice Bouchard

article

1. International Conference on Microbial Ecotoxicology, Nov 2017, Lyon, France. 2017

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titre

Ecotoxicological impact of leptospermone, a b-triketone bioherbicide, on fungal community of two arable soils

auteur

Clarisse Mallet, Sana Romdhane, Jérémie Béguet, Fabrice Martin-Laurent, Christophe Calvayrac, Cédric Bertrand, Lise Barthelmebs

article

1. International Congress of Microbial Ecotoxicology (1st EcotoxicoMic 2017), Nov 2017, Lyon, France

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titre

Akinetes May Be Representative of Past Nostocalean Blooms: a Case Study of Their Benthic Spatiotemporal Distribution and Potential for Germination in a Eutrophic Lake

auteur

Benjamin Legrand, Anne-Hélène Le Jeune, Jonathan Colombet, Antoine Thouvenot, Delphine Latour, Harold Drake

article

Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2017, 83 (23), ⟨10.1128/AEM.01571-17⟩

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titre

Benefit of switching dual antiplatelet therapy after acute coronary syndrome: the TOPIC (timing of platelet inhibition after acute coronary syndrome) randomized study

auteur

Thomas Cuisset, Pierre Deharo, Jacques Quilici, Thomas Johnson, Stéphanie Deffarges, Clémence Bassez, Guillaume Bonnet, Laurent Fourcade, Jean Philippe Mouret, Marc Lambert, Valentine Verdier, Pierre-Emmanuel Morange, Marie-Christine Alessi, Jean Louis Bonnet

article

European Heart Journal, Oxford University Press (OUP): Policy B, 2017, 38 (41), pp.3070 - 3078. ⟨10.1093/eurheartj/ehx175⟩

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titre

What drives detrital decomposition in neotropical tank bromeliads?

auteur

Céline Leroy, Bruno Corbara, Olivier Dézerald, M. Kurtis Trzcinski, Jean-François Carrias, Alain Dejean, Régis Cereghino

article

Hydrobiologia, Springer, 2017, 802 (1), pp.85-95

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titre

What drives detrital decomposition in neotropical tank bromeliads?

auteur

Céline Leroy, Bruno Corbara, Olivier Dezerald, M. Kurtis Trzcinski, Jean-François Carrias, Alain Dejean, Régis Céréghino

article

Hydrobiologia, Springer, 2017, 802 (1), pp.85-95. ⟨10.1007/s10750-017-3242-z⟩

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titre

Differential impact of lytic viruses on the taxonomical resolution of freshwater bacterioplankton community structure

auteur

Jitendra Keshri, Angia Sriram Pradeep Ram, Jonathan Colombet, Fanny Perrière, Antoine Thouvenot, Télesphore Sime-Ngando

article

Water Research, IWA Publishing, 2017, 124, pp.129 - 138. ⟨10.1016/j.watres.2017.07.053⟩

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titre

Adding Azathioprine to Remission-Induction Glucocorticoids for Eosinophilic Granulomatosis With Polyangiitis (Churg-Strauss), Microscopic Polyangiitis, or Polyarteritis Nodosa Without Poor Prognosis Factors

auteur

Xavier Puechal, Christian Pagnoux, Gabriel Baron, Thomas Quemeneur, Antoine Néel, Christian Agard, François Lifermann, Eric Liozon, Marc Ruivard, Pascal Godmer, Nicolas Limal, Arsène Mekinian, Thomas Papo, Anne Ruppert, Anne Bourgarit, Boris Bienvenu, Loïc Geffray, Luc Saraux, Elisabeth Diot, Bruno Crestani, Xavier Delbrel, Laurent Sailler, Pascal Cohen, Véronique Le Guern, Benjamin Terrier, Matthieu Groh, Claire Le Jeunne, Luc Mouthon, Philippe Ravaud, Loïc Guillevin, Marc Pineton de Chambrun, Charles-Edouard Luyt, Francois Beloncle, Marie Gousseff, Wladimir Mauhin, Laurent Argaud, Stanislas Ledochowski, Anne-Sophie Moreau, Romain Sonneville, Bruno Verdière, Sybille Merceron, Nathalie Zappella, Mickael Landais, Damien Contou, Alexandre Demoule, Sylvie Paulus, Bertrand Souweine, Bernard Lecomte, Antoine Vieillard-Baron, Nicolas Terzi, Elie Azoulay, Raymond Friolet, Marc Puidupin, Jérôme Devaquet, Jean-Marc Mazou, Yannick Fédun, Jean-Paul Mira, Jean-Herlé Raphalen, Alain Combes, Zahir Amoura, Jean-Christophe Lega, Marc Lambert, Sophie Rivière, Antoine Dossier, François Lhote, Gilles Blaison, Laurent Alric, David Saadoun, Julie Graveleau, Martin Soubrier, Marie-Josée Lecomte, Christine Christides, Annick Bosseray, Hervé Lévesque, François Viallard, Nathalie Tieulie, Pierre-Yves Lovey, Sylvie Le Moal, Béatrice Bibes, Giuseppe Malizia, Pierre Abgueguen, François Liferman, Jacques Ninet, Pierre-Yves Hatron, Arnaud Hot, Romain Hernu, Sylvie de la Salle, Thomas Similowski, Julien Haroche, Julien Boileau, Thomas Hanslik, Caroline Bulte, Aline Talasczka, Eric Hachulla, Olivier Decaux, Florent Ibouanga, Bertrand Arnulf, Marc Benedit, Assaad Maalouf, Bruno Moulin, Fleur Cohen-Aubart, Micheline Pha, Georges-Etienne Rivard, Eric Rondeau, Philippe Debourdeau, Claire Presne, Maude Andrieu, Oscar Len Abad, Hervé Devilliers, Alister Rogers, Miguel Hie, Alexis Mathian, Valentine Heidelberger, Saskia Ingen-Housz-Oro, Alicia Marquet, Matthieu Mahevas, Didier Bessis, Laurence Bouillet, Frédéric Caux, Catherine Chapelon-Abric, Sebastien Debarbieux, Emmanuel Delaporte, Anne-Bénédicte Duval-Modeste, Olivier Fain, Pascal Joly, Marc Marchand-Adam, Jean-Benoît Monfort, Nicolas Noel, Thierry Passeron, Françoise Sarrot-Reynauld, Denis Verrot, Diane Bouvry, Laurence Fardet, Olivier Chosidow, Pascal Sève, Dominique Valeyre, Sophie Moreau

article

Arthritis & rheumatology, Wiley, 2017, 69 (11), pp.2175 - 2186. ⟨10.1002/art.40205⟩

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titre

Analyse des interactions entre le parasite Nosema ceranae et l'insecticide fipronil chez l'abeille domestique Apis mellifera

auteur

Laurianne Paris

article

Agronomie. Université Clermont Auvergne, 2017. Français. ⟨NNT : 2017CLFAC062⟩

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Opposing effect of Lactobacillus on in vitro Klebsiella pneumoniae in biofilm and in an in vivo intestinal colonisation model

auteur

R. Lagrafeuille, S. Miquel, D. Balestrino, M. Vareille-Delarbre, F. Chain, P. Langella, C. Forestier

article

Beneficial Microbes, Wageningen Academic Publishers 2017, 9 (1), pp.87-100. ⟨10.3920/BM2017.0002⟩

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titre

Effluents hospitaliers : sources de pollution en antibiotiques et de résistances bacériennes potentiellement transmissibles via un biofilm ? : Microbiologie

auteur

Jérôme Ory

article

Biochimie [q-bio.BM]. Université Clermont Auvergne, 2017. Français. ⟨NNT : 2017CLFAC111⟩

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titre

WIsH: who is the host? Predicting prokaryotic hosts from metagenomic phage contigs

auteur

Clovis Galiez, Matthias Siebert, Francois Enault, Jonathan Vincent, Johannes Söding, Inanc Birol

article

Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2017, 33 (19), pp.3113-3114. ⟨10.1093/bioinformatics/btx383⟩

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titre

Spatio-Temporal Variations of Marine Biofilm Communities Colonizing Artificial Substrata Including Antifouling Coatings in Contrasted French Coastal Environments

auteur

Jean-François Briand, Aude Barani, Cédric Garnier, Karine Rehel, Félix Urvois, Christophe Le Poupon, Agnes Bouchez, Didier Debroas, Christine Bressy

article

Microbial Ecology, Springer Verlag, 2017, 74 (3), pp.585 - 598. ⟨10.1007/s00248-017-0966-2⟩

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titre

Integrating chytrid fungal parasites into plankton ecology: research gaps and needs

auteur

Thijs Frenken, Elisabet Alacid, Stella A. Berger, Elizabeth C. Bourne, Mélanie Gerphagnon, Hans-Peter Grossart, Alena S. Gsell, Bas W. Ibelings, Maiko Kagami, Frithjof C. Küpper, Peter M. Letcher, Adeline Loyau, Takeshi Miki, Jens C. Nejstgaard, Serena Rasconi, Albert Reñé, Thomas Rohrlack, Keilor Rojas-Jimenez, Dirk S. Schmeller, Bettina Scholz, Kensuke Seto, Télesphore Sime-Ngando, Assaf Sukenik, Dedmer B. van de Waal, Silke van den Wyngaert, Ellen van Donk, Justyna Wolinska, Christian Wurzbacher, Ramsy Agha

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2017, 19 (10), pp.3802 - 3822. ⟨10.1111/1462-2920.13827⟩

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titre

Intravenous Immunoglobulins Improve Survival in Monoclonal Gammopathy-Associated Systemic Capillary-Leak Syndrome

auteur

Marc Pineton de Chambrun, Marie Gousseff, Wladimir Mauhin, Jean-Christophe Lega, Marc Lambert, Sophie Rivière, Antoine Dossier, Marc Ruivard, François Lhote, Gilles Blaison, Laurent Alric, Christian Agard, David Saadoun, Julie Graveleau, Martin Soubrier, Marie-Josée Lucchini-Lecomte, Christine Christides, Annick Bosseray, Hervé Lévesque, François Viallard, Nathalie Tieulie, Pierre-Yves Lovey, Sylvie Le Moal, Béatrice Bibes, Giuseppe Malizia, Pierre Abgueguen, François Liferman, Jacques Ninet, Pierre-Yves Hatron, Zahir Amoura, Arnaud Hot, Laurent Argaud, Romain Hernu, Sylvie de la Salle, Stanislas Ledochowski, Sophie Moreau, Thomas Papo, Romain Sonneville, Bruno Verdière, Sybille Merceron, Nathalie Zappella, Mickael Landais, Nicolas Limal, Damien Contou, Thomas Similowski, Alexandre Demoule, Bertrand Souweine, Julien Haroche, Julien Boileau, Bernard Lecomte, Thomas Hanslik, Antoine Vieillard-Baron, Nicolas Terzi, Caroline Bulte, Aline Talasczka, Eric Hachulla, Olivier Decaux, Florent Ibouanga, Bertrand Arnulf, Matthieu Groh, Elie Azoulay, Marc Benedit, Assaad Maalouf, Bruno Moulin, Fleur Cohen-Aubart, Raymond Friolet, Micheline Pha, Georges-Etienne Rivard, Eric Rondeau, Philippe Debourdeau, Marc Puidupin, Francois Beloncle, Jérôme Devaquet, Claire Presne, Jean-Marc Mazou, Maude Andrieu, Sylvie Paulus, Yannick Fédun, Jean-Paul Mira, Jean-Herlé Raphalen, Oscar Len Abad, Hervé Devilliers, Alister Rogers, Pascal Godmer, Charles-Edouard Luyt, Alain Combes, Miguel Hie, Alexis Mathian

article

The American Journal of Medicine, Elsevier [Commercial Publisher] 2017, 130 (10), pp.1219.e19 - 1219.e27. ⟨10.1016/j.amjmed.2017.05.023⟩

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titre

Etude des 6700 ans d’évolution enregistrée dans les sédiments du lac d’Aydat (Massif Central, France) par le couplage des diatomées, pollen, microfossiles non polliniques et akinètes de cyanobactéries.

auteur

Aude Beauger, Karen K. Serieyssol, Benjamin Legrand, Delphine Latour, Marlène Lavrieux, Yannick Miras

article

36ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF)., Sep 2017, Dijon, France

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titre

Étude des 6700 ans d'évolution enregistrés dans les sédiments du lac d'Aydat (Massif central, France) par le couplage des diatomées, pollen, microfossiles non polliniques et akinètes de cyanobactéries

auteur

Beauger Aude, Karen K. Serieyssol, Benjamin Legrand, Delphine Latour, Marlène Lavrieux, Yannick Miras

article

36e Colloque de l’ADLaF, Association des Diatomistes de Langue Française, Sep 2017, Dijon, France

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titre

Caractérisations transcriptionnelle et phénotypique de bactéries dispersées de biofilm à Klebsiella pneumoniae

auteur

Cyril Guilhen

article

Médecine humaine et pathologie. Université Clermont Auvergne, 2017. Français. ⟨NNT : 2017CLFAS015⟩

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Phospholipid-bound eicosapentaenoic acid (EPA) supports higher fecundity than free EPA in Daphnia magna

auteur

Clémence Denoux, Dominik Martin-Creuzburg, Apostolos-Manuel Koussoroplis, Fanny Perriere, Christian Desvillettes, Gilles Bourdier, Alexandre Bec

article

Journal of Plankton Research, Oxford University Press (OUP), 2017, 39 (5), pp.843-848. ⟨10.1093/plankt/fbx037⟩

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titre

Environmental drivers of community diversity in a neotropical urban landscape: a multi-scale analysis

auteur

Stanislas Talaga, Frédéric Petitclerc, Jean-François Carrias, Olivier Dézerald, Céline Leroy, Régis Cereghino, Alain Dejean

article

Landscape Ecology, Springer Verlag, 2017, 32 (9), pp.1805 - 1818. ⟨10.1007/s10980-017-0542-7⟩

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titre

Benthic Archives Reveal Recurrence and Dominance of Toxigenic Cyanobacteria in a Eutrophic Lake over the Last 220 Years

auteur

Benjamin Legrand, Amélie Lamarque, Marion Sabart, Delphine Latour

article

Toxins, MDPI, 2017, 9 (9), ⟨10.3390/toxins9090271⟩

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titre

Distinctive Patterns in the Taxonomical Resolution of Bacterioplankton in the Sediment and Pore Waters of Contrasted Freshwater Lakes

auteur

J. Keshri, A. S. Pradeep Ram, T. Sime-Ngando

article

Microbial Ecology, Springer Verlag, 2017, ⟨10.1007/s00248-017-1074-z⟩

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titre

Doxycycline and its quaternary ammonium derivative for adjuvant therapies of chondrosarcoma

auteur

Imen Miladi, Magali Vivier, Marie-Mélanie Dauplat, Morgane Chatard, Sophie Besse, Aurélien Vidal, Karine Chassain, Betty Jean, Christiane Forestier, Jean-Michel Chezal, Françoise Rédini, Françoise Degoul, Elisabeth Miot-Noirault

article

Cancer Chemotherapy and Pharmacology, Springer Verlag, 2017, 80 (3), pp.517 - 526. ⟨10.1007/s00280-017-3377-7⟩

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Mesotrione Herbicide: Efficiency, Effects, and Fate in the Environment after 15 Years of Agricultural Use

auteur

Louis Carles, Muriel Joly, Pierre Joly

article

CLEAN - Soil, Air, Water, Wiley, 2017, 45 (9), pp.1700011. ⟨10.1002/clen.201700011⟩

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Active microorganisms thrive among extremely diverse communities in cloud water

auteur

Pierre Amato, Muriel Joly, Ludovic Besaury, Anne Oudart, Najwa Taïb, Anne I. Moné, Laurent Deguillaume, Anne-Marie Delort, Didier Debroas

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (8), ⟨10.1371/journal.pone.0182869⟩

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Understanding low radiation background biology through controlled evolution experiments

auteur

Nathanael Lampe, Vincent Breton, David Sarramia, Télesphore Sime-Ngando, David G. Biron

article

Evolutionary Applications, Blackwell, 2017, 10 (7), pp.658 - 666. ⟨10.1111/eva.12491⟩

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Biofilm dispersal: multiple elaborate strategies for dissemination of bacteria with unique properties

auteur

Cyril Guilhen, Christiane Forestier, Damien Balestrino

article

Molecular Microbiology, Wiley, 2017, 105 (2), pp.188 - 210. ⟨10.1111/mmi.13698⟩

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titre

Minor food sources can play a major role in secondary production in detritus-based ecosystems

auteur

Clément Crenier, Julio Arce-Funck, Alexandre Bec, Elise Billoir, Fanny Perrière, Joséphine Leflaive, Francois Guerold, Vincent Felten, Michaël Danger

article

Freshwater Biology, Wiley, 2017, 62 (7), pp.1155-1167. ⟨10.1111/fwb.12933⟩

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Tracking a century of changes in microbial eukaryotic diversity in lakes driven by nutrient enrichment and climate warming

auteur

Eric Capo, Didier Debroas, Fabien Arnaud, Marie-Elodie Perga, Cècile Chardon, Isabelle Domaizon

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2017, 19 (7), pp.2873 - 2892. ⟨10.1111/1462-2920.13815⟩

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Genomics and metagenomics of trimethylamine-utilizing Archaea in the human gut microbiome

auteur

Guillaume Borrel, Angela Mccann, Jennifer Deane, Marta C Neto, Denise B Lynch, Jean- François Brugère, Paul W O'Toole

article

ISME Journal, Nature Publishing Group, 2017, 11 (9), pp.2059 - 2074. ⟨10.1038/ismej.2017.72⟩

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Prevalence of HIV-1 drug resistance in treated patients with viral load >50 copies/mL: a 2014 French nationwide study

auteur

L. Assoumou, C. Charpentier, P. Recordon-Pinson, M. Grude, C. Pallier, L. Morand-Joubert, S. Fafi-Kremer, A. Krivine, B Montes, V. Ferre, M. Bouvier-Alias, C. Plantier, Jacques Izopet, M. Trabaud, S. Yerly, J. Dufayard, C. Alloui, L. Courdavault, H. Le Guillou-Guillemette, A. Maillard, C. Amiel, A. Vabret, C. Roussel, S. Vallet, J. Guinard, A. Mirand, A. Beby-Defaux, F. Barin, A. Allardet-Servent, R. Ait-Namane, M. Wirden, C. Delaugerre, V. Calvez, L. Chaix, D. Descamps, S. Reigadas

article

Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2017, 72 (6), pp.1769-1773. ⟨10.1093/jac/dkx042⟩

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titre

Prevalence of HIV-1 drug resistance in treated patients with viral load >50 copies/mL: a 2014 French nationwide study

auteur

L. Assoumou, C. Charpentier, P. Recordon-Pinson, M. Grude, C. Pallier, L. Morand-Joubert, S. Fafi-Kremer, A. Krivine, B Montes, V. Ferre, M. Bouvier-Alias, C. Plantier, Jacques Izopet, M. Trabaud, S. Yerly, J. Dufayard, C. Alloui, L. Courdavault, H. Le Guillou-Guillemette, A. Maillard, C. Amiel, A. Vabret, C. Roussel, S. Vallet, J. Guinard, A. Mirand, A. Beby-Defaux, F. Barin, A. Allardet-Servent, R. Ait-Namane, M. Wirden, C. Delaugerre, V. Calvez, M.-L. Chaix, D. Descamps, S. Reigadas

article

Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2017, 72 (6), pp.1769 - 1773. ⟨10.1093/jac/dkx042⟩

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Temporal and spatial variations in the composition of freshwater photosynthetic picoeukaryotes revealed by MiSeq sequencing from flow cytometry sorted samples

auteur

Shengnan Li, Gisèle Bronner, Cécile Lepère, Fanxiang Kong, Xiaoli Shi

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2017, 19 (6), pp.2286 - 2300. ⟨10.1111/1462-2920.13724⟩

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titre

Viral-Induced Mortality of Prokaryotes in a Tropical Monsoonal Estuary

auteur

Vijayan Jasna, Ammini Parvathi, Angia Sriram Pradeep Ram, Kizhekkapat K. Balachandran, Nikathil V. Madhu, Maheswari Nair, Retnamma Jyothibabu, K. Veeraraghava Jayalakshmy, Chenicherry Revichandran, Télesphore Sime-Ngando

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, ⟨10.3389/fmicb.2017.00895⟩

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titre

A De Novo Robust Clustering Approach for Amplicon-Based Sequence Data

auteur

Alexandre Bazin, Didier Debroas, Engelbert Mephu Nguifo

article

2017

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Study of fused- chitinase-glucuronan lyase enzymes with antifungal potential

auteur

Nastasia Prybylski, Cédric Delattre, Guillaume Pierre, Céline Laroche, Philippe Michaud, Pascal Dubessay

article

International Bioprocessing Association-7th International Forum on Industrial Bioprocesses, May 2017, Wuxi, China

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Thermothelomyces thermophila human infections

auteur

C. Nourrisson, D. Garcia-Hermoso, F. Morio, C. Kauffmann-Lacroix, N. Berrette, J. Bonhomme, P. Poirier, O. Lortholary, French Mycosis Study Group

article

Clinical Microbiology and Infection, Elsevier for the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2017, 23 (5), pp.338 - 341. ⟨10.1016/j.cmi.2016.10.025⟩

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titre

Revisiting Previously Investigated Plants: A Molecular Networking-Based Study of Geissospermum laeve

auteur

Alexander Fox Ramos, Charlotte Alcover, Laurent Evanno, Alexandre Maciuk, Marc Litaudon, Christophe Duplais, Guillaume Bernadat, Jean-François Gallard, Christophe Jullian, Elisabeth Mouray, Philippe Grellier, Philippe Loiseau, Sébastien Pomel, Erwan Poupon, Pierre Champy, Mehdi Beniddir

article

Journal of Natural Products, American Chemical Society, 2017, 80 (4), pp.1007-1014. ⟨10.1021/acs.jnatprod.6b01013⟩

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titre

P-gp expression levels in the erythrocytes of brown trout: a new tool for aquatic sentinel biomarker development

auteur

Emeline Valton, Ivan Wawrzyniak, Christian Amblard, Bruno Combourieu, Marie-Laure Bayle, François Desmolles, Fabrice Kwiatkowski, Frédérique Penault-Llorca, Mahchid Bamdad

article

Biomarkers, Taylor & Francis, 2017, 22 (6), pp.566 - 574. ⟨10.1080/1354750X.2017.1338314⟩

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Sensitivity of laccase activity to the fungicide tebuconazole in decomposing litter

auteur

J. Artigas, M. Gerphagnon, Florent Rossi, Clarisse Mallet

article

Science of the Total Environment, Elsevier, 2017, 584-585, pp.1084 - 1092. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.01.167⟩

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Taxonomy of prokaryotic viruses: 2016 update from the ICTV bacterial and archaeal viruses subcommittee.

auteur

Evelien M Adriaenssens, Mart Krupovic, Petar Knezevic, Hans-Wolfgang Ackermann, Jakub Barylski, J Rodney Brister, Martha R C Clokie, Siobain Duffy, Bas E Dutilh, Rob Edwards, Francois Enault, Ho Bin Jang, Jochen Klumpp, Andrew M Kropinski, Rob Lavigne, Minna M Poranen, David Prangishvili, Janis Rumnieks, Matthew B Sullivan, Johannes Wittmann, Hanna M Oksanen, Annika Gillis, Jens H Kuhn

article

Archives of Virology, Springer Verlag, 2017, 162 (4), pp.1153-1157. ⟨10.1007/s00705-016-3173-4⟩

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titre

Correlation between some environmental variables and abundance of Almophrya mediovacuolata (Ciliophora: Anoplophryidae) endocommensal ciliate of an anecic earthworms (Oligochaeta: Annelida) in Bambui (North-West Cameroon)

auteur

Z. Fokam, P Nana, B Bricheux, B Vigues, P. Bouchard, P. Ngassam, T. Sime-Ngando

article

International Journal of Biological and Chemical Sciences, International Formulae Group (IFG), 2017, 10 (5), ⟨10.4314/ijbcs.v10i5.4⟩

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Overview of freshwater microbial eukaryotes diversity: a first analysis of publicly available metabarcoding data

auteur

Didier Debroas, Isabelle Domaizon, Jean-François Humbert, Ludwig Jardillier, Cécile Lepère, Anne Oudart, Najwa Taïb

article

FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2017, 93 (4), pp.1-14. ⟨10.1093/femsec/fix023⟩

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Genotypic, size and morphological diversity of virioplankton in a deep oligomesotrophic freshwater lake (Lac Pavin, France)

auteur

Jonathan Colombet, Agnès Robin, Télesphore Sime-Ngando

article

Journal of Environmental Sciences, Elsevier, 2017, 53, pp.48 - 59. ⟨10.1016/j.jes.2016.05.016⟩

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titre

Mixotrophy everywhere on land and in water: the grand écart hypothesis

auteur

Marc-André Selosse, Marie Charpin, Fabrice Not, Punidan Jeyasingh

article

Ecology Letters, Wiley, 2017, 20 (2), pp.246 - 263. ⟨10.1111/ele.12714⟩

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titre

Inhibitory effects of sodium azide on microbial growth in experimental resuspension of marine sediment

auteur

Léa Cabrol, Marianne Quemeneur, Benjamin Misson

article

Journal of Microbiological Methods, Elsevier, 2017, 133, pp.62 - 65. ⟨10.1016/j.mimet.2016.12.021⟩

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titre

Microbial metacommunity: a METABAR coding approach

auteur

Marc Buee, Matthieu Barret, Maria Bernard, Didier Debroas, Isabelle Domaizon, Laure Fauchery, Claude Husson, Valerie Laval, Géraldine Pascal, Charlie Pauvert, Christophe Mougel, Thomas Pommier, Dirk Redecker, Aymé Spor, Sébastien Terrat, Veronique Edel-Hermann, Corinne Vacher

article

2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France

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Population pharmacokinetics of micafungin in ICU patients with sepsis and mechanical ventilation

auteur

Vincent Jullien, Elie Azoulay, Carole Schwebel, Thomas Le Saux, Pierre Emmanuel Charles, Muriel Cornet, Bertrand Souweine, Kadda Klouche, Samir Jaber, Jean-Louis Trouillet, Fabrice Bruneel, Martin Cour, Joel Cousson, Ferhat Meziani, Didier Gruson, Adeline Paris, Michael Darmon, Maité Garrouste-Orgeas, Jean-Christophe Navellou, Arnaud Foucrier, Bernard Allaouchiche, Vincent Das, Jean-Pierre Gangneux, Stéphane Ruckly, Michel Wolff, Jean-François Timsit

article

Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2017, 72 (1), pp.181 - 189. ⟨10.1093/jac/dkw352⟩

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Unveiling and Characterizing Early Bilateral Interactions between Biofilm and the Mouse Innate Immune System

auteur

Christiane Forestier, Elisabeth Billard, Geneviève Milon, Pascale Gueirard

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, pp.2309. ⟨10.3389/fmicb.2017.02309⟩

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Molecular Epidemiology of Blastocystis sp. in Various Animal Groups from Two French Zoos and Evaluation of Potential Zoonotic Risk

auteur

Amandine Cian, Dima El Safadi, Marwan Osman, Romain Moriniere, Nausicaa Gantois, Sadia Benamrouz-Vanneste, Pilar Delgado-Viscogliosi, Karine Guyot, Luen-Luen Li, Sébastien Monchy, Christophe Noël, Philippe Poirier, Céline Nourrisson, Ivan Wawrzyniak, Frédéric Delbac, Stéphanie Bosc, Magali Chabé, Thierry Petit, Gabriela Certad, Eric Viscogliosi

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (1), pp.e0169659. ⟨10.1371/journal.pone.0169659⟩

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Fate and ecotoxicological impact of new generation herbicides from the triketone family: An overview to assess the environmental risks

auteur

E. Dumas, M. Giraudo, Eric Goujon, M. Halma, E. Knhili, M. Stauffert, I. Batisson, Pascale Besse-Hoggan, J. T. Bohatier, P. Bouchard, Hélène Celle-Jeanton, M. Costa Gomes, F. Delbac, C. Forano, Pascale Goupil, Noëlle Guix, P. Husson, Gérard Ledoigt, C. Mallet, C. Mousty, V. Prevot, C. Richard, S. Sarraute

article

Journal of Hazardous Materials, Elsevier, 2017, 325, pp.136-156. ⟨10.1016/j.jhazmat.2016.11.059⟩

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Deciphering biodiversity and interactions between bacteria and microeukaryotes within epilithic biofilms from the Loue River, France

auteur

Anouk Zancarini, Isidora Echenique-Subiabre, Didier Debroas, Najwa Taïb, Catherine Quiblier, Jean-François Humbert

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.4344. ⟨10.1038/s41598-017-04016-w⟩

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Décès d’un nourrisson dans un contexte de syndrome pieds-mains-bouche associé à l’entérovirus A71

auteur

V. Corvest, C. Archimbaud, A-S L’honneur, C. Henquell, H. Peigue-Lafeuille, M. Decobert, A. Mirand

article

Archives de Pédiatrie, Elsevier, 2017, 24 (12), pp.1253-1258. ⟨10.1016/j.arcped.2017.09.010⟩

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titre

Understanding and predicting physiological performance of organisms in fluctuating and multifactorial environments

auteur

Apostolos-Manuel Koussoroplis, Sylvain Pincebourde, Alexander Wacker

article

Ecological monographs, Ecological Society of America, 2017, 87 (2), pp.178-197. ⟨10.1002/ecm.1247⟩

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titre

The Clinical Picture of Severe Systemic Capillary-Leak Syndrome Episodes Requiring ICU Admission

auteur

Marc Ruivard, Marc Pineton de Chambrun, Charles-Edouard Luyt, Francois Beloncle, Marie Gousseff, Wladimir Mauhin, Laurent Argaud, Stanislas Ledochowski, Anne-Sophie Moreau, Romain Sonneville, Bruno Verdière, Sybille Merceron, Nathalie Zappella, Mickael Landais, Damien Contou, Alexandre Demoule, Sylvie Paulus, Bertrand Souweine, Bernard Lecomte, Antoine Vieillard-Baron, Nicolas Terzi, Elie Azoulay, Raymond Friolet, Marc Puidupin, Jérôme Devaquet, Jean-Marc Mazou, Yannick Fédun, Jean-Paul Mira, Jean-Herlé Raphalen, Alain Combes, Zahir Amoura

article

Critical Care Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2017, 45 (7), pp.1216 - 1223. ⟨10.1097/CCM.0000000000002496⟩

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titre

Biotransformation of herbicides by aquatic microbial communities associated to submerged leaves.

auteur

Louis Carles, Florent Rossi, Muriel Joly, Pascale Besse-Hoggan, Isabelle Batisson, Joan Artigas

article

Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2017, 24, pp.3664-3674. ⟨10.1007/s11356-016-8035-9⟩

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titre

Relating switching rates between normal and persister cells to substrate and antibiotic concentrations: a mathematical modelling approach supported by experiments

auteur

G. Carvalho, C. Guilhen, D. Balestrino, C. Forestier, Jean-Denis Mathias

article

Microbial Biotechnology, Wiley, 2017, 10 (6), pp.1616-1627. ⟨10.1111/1751-7915.12739⟩

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titre

Proteomics and host-pathogen interactions: A bright future?

auteur

D. G. Biron, D. Nedelkov, Dorothée Missé, Philippe Holzmuller

article

Genetics and Evolution of Infectious Diseases, ELSEVIER SCIENCE BV, 2017, 978-0-12-800153-0; 978-0-12-799942-5. ⟨10.1016/B978-0-12-799942-5.00011-1⟩

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titre

Natural non-homologous recombination led to the emergence of a duplicated V3-NS5A region in HCV-1b strains associated with hepatocellular carcinoma

auteur

Hélène Le Guillou-Guillemette, Adeline Pivert, Elise Bouthry, Cécile Henquell, Odile Petsaris, Alexandra Ducancelle, Pascal Veillon, Sophie Vallet, Sophie Alain, Vincent Thibault, Florence Legrand-Abravanel, Arielle Rosenberg, Elisabeth André-Garnier, Jean-Baptiste Bour, Yazid Baazia, Pascale Trimoulet, Patrice André, Catherine Gaudy-Graffin, Dominique Bettinger, Sylvie Larrat, Anne Signori-Schmuck, Henia Saoudin, Bruno Pozzetto, Gisèle Lagathu, Sophie Minjolle-Cha, Françoise Stoll-Keller, Jean-Michel Pawlotsky, Jacques Izopet, Christophe Payan, Françoise Lunel-Fabiani, Christophe Lemaire

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (4), pp.e0174651. ⟨10.1371/journal.pone.0174651⟩

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titre

Litter-dwelling ants as bioindicators to gauge the sustainability of small arboreal monocultures embedded in the Amazonian rainforest

auteur

Sarah Groc, Jacques H. C. Delabie, Fernando Fernandez, Frédéric Petitclerc, Bruno Corbara, Maurice Leponce, Régis Cereghino, Alain Dejean

article

Ecological Indicators, Elsevier, 2017, 82, pp.43-49. ⟨10.1016/j.ecolind.2017.06.026⟩

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titre

Hollow Internodes Permit a Neotropical Understory Plant to Shelter Multiple Mutualistic Ant Species, Obtaining Protection and Nutrient Provisioning (Myrmecotrophy)

auteur

Alain Dejean, Frédéric Petitclerc, Arthur Compin, Frédéric Azémar, Bruno Corbara, Jacques Delabie, Céline Leroy

article

American Naturalist, University of Chicago Press, 2017, 190 (5), pp.E124 - E131. ⟨10.1086/693782⟩

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titre

Urbanization impacts the taxonomic and functional structure of aquatic macroinvertebrate communities in a small Neotropical city

auteur

Stanislas Talaga, Olivier Dézerald, Alexis Carteron, Céline Leroy, Jean-François Carrias, Régis Céréghino, Alain Dejean

article

Urban Ecosystems, Springer Verlag, 2017, 20 (5), pp.1001-1009. ⟨10.1007/s11252-017-0653-6⟩

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titre

Symptomatologie et évolution de la maladie « pieds-mains-bouche »

auteur

A. Mirand, H. Peigue-Lafeuille

article

Archives de Pédiatrie, Elsevier, 2017, 24 (10), pp.1036-1046. ⟨10.1016/j.arcped.2017.08.001⟩

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titre

Influence of Anthropogenic Pollution on the Abundance Dynamics of Some Freshwater Invertebrates in the Coastal Area of Cameroon

auteur

E. Koji, O. V. Noah Ewoti, M. Onana, S. Tchakonté, C. Lontsi Djimeli, A. Tamsa Arfao, G. Bricheux, T. Sime-Ngando, M. Nola

article

Journal of Environmental Protection, Scientific Research Publishing, 2017, 08 (07), pp.810-829. ⟨10.4236/jep.2017.87051⟩

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titre

Taxonomical resolution and distribution of bacterioplankton along the vertical gradient reveals pronounced spatio-temporal patterns in contrasted temperate freshwater Lakes.

auteur

Angia Sriram Pradeep Ram, Jitendra Keshri, Paul Alain Nana, Telesphore Sime-Ngando

article

Water Research, IWA Publishing, 2017

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Large-scale HFMD epidemics caused by Coxsackievirus A16 in Bangalore, India during 2013 and 2015

auteur

Durga Rao, Jagadeesh Naidu, Padmanabha Maiya, Ananda Babu, Jean-Luc Bailly

article

Infection, Genetics and Evolution, Elsevier, 2017, 55, pp.228-235. ⟨10.1016/j.meegid.2017.08.030⟩

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titre

Proteomics and host-pathogen interactions: a bright future?

auteur

David Georges Biron, D Nedelkov, D Missée, P Holzmuller

article

Genetics and Evolution of Infectious Diseases, Second Edition, M. Tibayrenc (ed), Chapter 11, pp. 227-255, 2017

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Nosema ceranae, Fipronil and their combination compromise honey bee reproduction via changes in male physiology

auteur

Guillaume Kairo, David G. Biron, Faten Ben Abdelkader, Marc Bonnet, Sylvie Tchamitchian, Marianne Cousin, Claudia Dussaubat, Boris Benoit, Andre Kretzschmar, Luc Belzunces, Jean-Luc Brunet

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7, 14 p. ⟨10.1038/s41598-017-08380-5⟩

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Structural and functional responses of leaf-associated fungal communities to chemical pollution in streams

auteur

Florent Rossi, Joan Artigas, Clarisse Mallet

article

Freshwater Biology, Wiley, 2017, 62 (7), pp.1207-1219. ⟨10.1111/fwb.12937⟩

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titre

PanGeneHome : A Web Interface to Analyze Microbial Pangenomes

auteur

Camille Loiseau, Victor Hatte, Charlotte Andrieu, Loic Barlet, Audric Cologne, Romain de Oliveira, Lionel Ferrato-Berberian, Hélène Gardon, Damien Lauber, Mélanie Molinier, Stéphanie Monnerie, Kissi N 'Gou, Benjamin Penaud, Olivier Pereira, Justine Picarle, Amandine Septier, Antoine Mahul, Jean-Christophe Charvy, François Enault

article

Journal of Bioinformatics, Computational and Systems Biology, Elyns Group, 2017

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titre

Interactions entre parasites et pollution dans un monde en mutation

auteur

Sanchez Mi, Iris Eouzan, Pais-Costa Aj, David Georges Biron

article

Ecotoxicologie des communautés et impacts sur les fonctions des écosystèmes. Eds Bernard C, Mougin C, Pery A, ISTE Editions, Paris., 2017

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titre

Unique and highly variable bacterial communities inhabiting the surface microlayer of an oligotrophic lake

auteur

Mylène Hugoni, Agnes Vellet, Didier Debroas

article

Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, 2017, 79 (2), pp.115-125. ⟨10.3354/ame01825⟩

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titre

Les pesticides, la cause du déclin de l’abeille domestique ?

auteur

Iris Eouzan, L Garnery, Telesphore Sime-Ngando, David Georges Biron

article

Ecotoxicologie des communautés et impacts sur les fonctions des écosystèmes. Eds Bernard C, Mougin C, Pery A, ISTE Editions, Paris., 2017

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titre

Phylogeography of Coxsackievirus A16 Reveals Global Transmission Pathways and Recent Emergence and Spread of a Recombinant Genogroup

auteur

Chervin Hassel, Audrey Mirand, Agnes Farkas, Sabine Diedrich, Hartwig Huemer, Hélène Peigue-Lafeuille, Christine Archimbaud, Cécile Henquell, Jean-Luc Bailly

article

Journal of Virology, American Society for Microbiology, 2017, 91 (18), pp.e00630. ⟨10.1128/jvi.00630-17⟩

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titre

Identification of sulfonylurea biodegradation pathways enabled by a novel nicosulfuron-transforming strain Pseudomonas fluorescens SG-1: toxicity assessment and effect of formulation.

auteur

Louis Carles, Muriel Joly, Frédérique Bonnemoy, Martin Leremboure, Isabelle Batisson, Pascale Besse-Hoggan

article

Journal of Hazardous Materials, Elsevier, 2017, 324, pp.184-193. ⟨10.1016/j.jhazmat.2016.10.048⟩

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titre

Carbon and nutrients of indigestible pollen are transferred to zooplankton by chytrid fungi

auteur

Maiko Kagami, Yasumichi Motoki, Hélène Masclaux, Alexandre Bec

article

Freshwater Biology, Wiley, 2017

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Plants against Malaria and Mosquitoes in Sahel region of Burkina Faso: An Ethno-botanical survey

auteur

Rakiswendé Yerbanga, Jean Ouédraogo, Roch Kounbobr, Correspondence Rakiswendé, Léa Bonkian, Serge Yerbanga, Maminata Traoré, / Coulibaly, Thierry Lefèvre, Ibrahim Sangaré, Théophile Ouédraogo, Ousmane Traore, Jean Bosco Ouédraogo, Tinga Guiguemde, Kounbobr Dabiré

article

International Journal of Herbal Medicine, AkiNik Publications 2017, 5

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titre

Plants against Malaria and Mosquitoes in Sahel region of Burkina Faso: An Ethno-botanical survey

auteur

Léa Bonkian, Rakiswendé Yerbanga, Maminata Traoré Coulibaly, Thierry Lefèvre, Ibrahim Sangaré, Théophile Ouédraogo, Ousmane Traore, Jean Ouédraogo, Tinga Guiguemde, Kounbobr Dabiré

article

International Journal of Herbal Medicine, AkiNik Publications 2017, 5

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Comparative genomics of microsporidian genomes reveals a minimal non-coding RNA set and new insights for transcription in minimal eukaryotic genomes

auteur

Abdel Belkorchia, Jean-François Pombert, Valérie Polonais, Nicolas Parisot, Frédéric Delbac, Jean François Brugere, Pierre Peyret, Christine Gaspin, Eric Peyretaillade

article

DNA Research, Oxford University Press (OUP), 2017, 24 (3), pp.251-260. ⟨10.1093/dnares/dsx002⟩

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Using murine colitis models to analyze probiotics–host interactions

auteur

Rebeca Martin Rosique, Florian Chain, Sylvie Miquel, Jean-Paul Motta, Nathalie Vergnolle, Harry Sokol, Philippe Langella

article

FEMS Microbiology Reviews, Wiley-Blackwell, 2017, 41 (Supp_1), pp.S49-S70. ⟨10.1093/femsre/fux035⟩

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New Insights into the Diversity of the Genus Faecalibacterium

auteur

Leandro Benevides, Sriti Burman, Rebeca Martin, Véronique Robert, Muriel Thomas, Sylvie Miquel, Florian Chain, Harry Sokol, Luis G. Bermudez-Humaran, Mark Morrison, Philippe Langella, Vasco A. Azevedo, Jean-Marc Chatel, Siomar Soares

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, pp.1790. ⟨10.3389/fmicb.2017.01790⟩

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Phages rarely encode antibiotic resistance genes: a cautionary tale for virome analyses.

auteur

F Enault, A Briet, L Bouteille, S Roux, Mb Sullivan, Ma Petit

article

ISME Journal, Nature Publishing Group, 2017, 11 (1), pp.237-247. ⟨10.1038/ismej.2016.90⟩

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The influence of light, substrate and seed origin on the germination and establishment of an ant-garden bromeliad

auteur

Céline Leroy, Frédéric Petitclerc, Jérôme Orivel, B. Corbara, J.-F. Carrias, Alain Dejean, R. Céréghino

article

Plant Biology, Wiley, 2017, 19 (1), pp.70-78. ⟨10.1111/plb.12452⟩

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Respective impact of implementation of prevention strategies, colonization with multiresistant bacteria and antimicrobial use on the risk of early- and late-onset VAP: An analysis of the OUTCOMEREA network

auteur

Wafa Ibn Saied, Bertrand Souweine, Maite Garrouste-Orgeas, Stephane Ruckly, Michael Darmon, Sebastien Bailly, Yves Cohen, Elie Azoulay, Carole Schwebel, Aguila Radjou, Hatem Kallel, Christophe Adrie, Anne-Sylvie Dumenil, Laurent Argaud, Guillaume Marcotte, Samir Jamali, Laurent Papazian, Dany Goldgran-Toledano, Lila Bouadma, Jean-Francois Timsit

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (11), pp.e0187791. ⟨10.1371/journal.pone.0187791⟩

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The predatory behavior of the Neotropical social wasp Polybia rejecta

auteur

Alain Dejean, Hector Rodriguez-Perez, James M. Carpenter, Frédéric Azémar, Bruno Corbara

article

Behavioural Processes, Elsevier, 2017, 140, pp.161-168. ⟨10.1016/j.beproc.2017.05.011⟩

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2016

titre

Influence des fillers du sable recyclé sur les propriétés des mortiers de ciment

auteur

Layachi Berredjem, Laurent Molez, Hocine Hadidane, Ahmed Naha, Nourredine Arabi

article

Innovation et valorisation en génie civil et matériaux de construction - INVACO2016, Dec 2016, Hammamet, Tunisie

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titre

Assessing Vacuolar Escape of Listeria Monocytogenes.

auteur

Juan J Quereda, Martin Sachse, Damien Balestrino, Théodore Grenier, Jennifer Fredlund, Anne Danckaert, Nathalie Aulner, Spencer Shorte, Jost Enninga, Pascale Cossart, Javier Pizarro-Cerdá

article

Collin M. Bacterial Pathogenesis, 1535, Humana Press, New York, NY, pp.173-195, 2016, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-6671-4. ⟨10.1007/978-1-4939-6673-8_11⟩

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Devenir de mélanges de pesticides : étude des voies de biodégradation et développement d'une méthode préventive de bioremédiation

auteur

Louis Carles

article

Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2016. Français. ⟨NNT : 2016CLF22759⟩

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The hide and seek of Plasmodium vivax in West Africa: report from a large-scale study in Beninese asymptomatic subjects

auteur

Philippe Poirier, Cécile Doderer-Lang, Pascal Atchade, Marie-Louise Coquelin de L’isle, Ahmed Abou-Bacar, Alexander Pfaff, Julie Brunet, Lydia Arnoux, Elodie Haar, Denis Filisetti, Sylvie Perrotey, Nicodème Chabi, Casimir Akpovi, Ludovic Anani, André Bigot, Ambaliou Sanni, Ermanno Candolfi, Jean-Philippe Lemoine

article

Malaria Journal, BioMed Central, 2016, 15 (1), ⟨10.1186/s12936-016-1620-z⟩

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Accelerated craniofacial bone regeneration through dense collagen gel scaffolds seeded with dental pulp stem cells

auteur

Frédéric Chamieh, Anne-Margaux Collignon, Benjamin R. Coyac, Julie Lesieur, Sandy Ribes, Jérémy Sadoine, Annie Llorens, Antonino Nicoletti, Didier Letourneur, Marie-Laure Colombier, Showan N. Nazhat, Philippe Bouchard, Catherine Chaussain, Gaël Y. Rochefort

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6 (1), ⟨10.1038/srep38814⟩

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titre

Subtelomere organization in the genome of the microsporidian Encephalitozoon cuniculi: patterns of repeated sequences and physicochemical signatures

auteur

Ndongo Dia, Laurence Lavie, Ngor Faye, Guy Méténier, Edouard Yeramian, Christophe Duroure, Bhen Toguebaye, Roger Frutos, Mbayame Niang, Christian Vivarès, Choukri Ben Mamoun, Emmanuel Cornillot

article

BMC Genomics, BioMed Central, 2016, 17 (1), pp.34. ⟨10.1186/s12864-015-1920-7⟩

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titre

Gaia Data Release 1. Summary of the astrometric, photometric, and survey properties

auteur

A. Brown, A. Vallenari, T. Prusti, H. de Bruijne, F. Mignard, R. Drimmel, C. Babusiaux, L. Bailer-Jones, U. Bastian, M. Biermann, W. Evans, L. Eyer, F. Jansen, C. Jordi, D. Katz, S. Klioner, U. Lammers, L. Lindegren, X. Luri, W. O’mullane, C. Panem, D. Pourbaix, S. Randich, P. Sartoretti, H. Siddiqui, C. Soubiran, V. Valette, F. van Leeuwen, A. Walton, C. Aerts, F. Arenou, M. Cropper, E. Høg, M. Lattanzi, E. Grebel, D. Holland, C. Huc, X. Passot, M. Perryman, L. Bramante, C. Cacciari, J. Castañeda, L. Chaoul, N. Cheek, F. de Angeli, C. Fabricius, R. Guerra, J. Hernández, A. Jean-Antoine-Piccolo, E. Masana, R. Messineo, N. Mowlavi, K. Nienartowicz, D. Ordóñez-Blanco, P. Panuzzo, J. Portell, J. Richards, M. Riello, M. Seabroke, P. Tanga, F. Thévenin, J. Torra, S. Els, G. Gracia-Abril, G. Comoretto, M. Garcia-Reinaldos, T. Lock, E. Mercier, M. Altmann, R. Andrae, L. Astraatmadja, I. Bellas-Velidis, K. Benson, J. Berthier, R. Blomme, G. Busso, B. Carry, A. Cellino, G. Clementini, S. Cowell, O. Creevey, J. Cuypers, M. David, J. de Ridder, A. de Torres, L. Delchambre, A. Dell’oro, C. Ducourant, Y. Frémat, M. García-Torres, E. Gosset, J. Halbwachs, C. Hambly, L. Harrison, M. Hauser, D. Hestroffer, S. Hodgkin, H. Huckle, A. Hutton, Gérard Jasniewicz, S. Jordan, M. Kontizas, J. Korn, C. Lanza, M. Manteiga, A. Moitinho, K. Muinonen, J. Osinde, E. Pancino, T. Pauwels, J.-M. Petit, A. Recio-Blanco, C. Robin, L. Sarro, C. Siopis, M. Smith, W. Smith, A. Sozzetti, W. Thuillot, W. van Reeven, Y. Viala, U. Abbas, A. Abreu Aramburu, S. Accart, J. Aguado, P. Allan, W. Allasia, G. Altavilla, M. Álvarez, J. Alves, R. Anderson, H. Andrei, E. Anglada Varela, E. Antiche, T. Antoja, S. Antón, B. Arcay, N. Bach, S. Baker, L. Balaguer-Núñez, C. Barache, C. Barata, A. Barbier, F. Barblan, D. Barrado y Navascués, M. Barros, M. Barstow, U. Becciani, M. Bellazzini, A. Bello García, V. Belokurov, P. Bendjoya, A. Berihuete, L. Bianchi, O. Bienaymé, F. Billebaud, N. Blagorodnova, S. Blanco-Cuaresma, T. Boch, A. Bombrun, R. Borrachero, S. Bouquillon, G. Bourda, H. Bouy, A. Bragaglia, M. Breddels, N. Brouillet, T. Brüsemeister, B. Bucciarelli, P. Burgess, R. Burgon, A. Burlacu, D. Busonero, R. Buzzi, E. Caffau, J. Cambras, H. Campbell, R. Cancelliere, T. Cantat-Gaudin, T. Carlucci, J. Carrasco, M. Castellani, P. Charlot, J. Charnas, A. Chiavassa, M. Clotet, G. Cocozza, S. Collins, G. Costigan, F. Crifo, J. Cross, M. Crosta, C. Crowley, C. Dafonte, Y. Damerdji, A. Dapergolas, P. David, P. de Cat, F. de Felice, P. de Laverny, F. de Luise, R. de March, D. Martino, R. de Souza, J. Debosscher, E. del Pozo, M. Delbo, A. Delgado, H. Delgado, P. Di Matteo, S. Diakite, E. Distefano, C. Dolding, S. dos Anjos, P. Drazinos, J. Duran, Y. Dzigan, B. Edvardsson, H. Enke, G. Eynard Bontemps, C. Fabre, M. Fabrizio, S. Faigler, J. Falcão, M. Farràs Casas, L. Federici, G. Fedorets, J. Fernández-Hernández, P. Fernique, A. Fienga, F. Figueras, F. Filippi, K. Findeisen, A. Fonti, M. Fouesneau, E. Fraile, M. Fraser, J. Fuchs, M. Gai, S. Galleti, L. Galluccio, D. Garabato, F. García-Sedano, A. Garofalo, N. Garralda, P. Gavras, J. Gerssen, R. Geyer, G. Gilmore, S. Girona, G. Giuffrida, M. Gomes, A. González-Marcos, J. González-Núñez, J. González-Vidal, M. Granvik, A. Guerrier, P. Guillout, J. Guiraud, A. Gúrpide, R. Gutiérrez-Sánchez, L. Guy, R. Haigron, D. Hatzidimitriou, M. Haywood, U. Heiter, A. Helmi, D. Hobbs, W. Hofmann, B. Holl, G. Holland, S. Hunt, A. Hypki, V. Icardi, M. Irwin, G. Jevardat de Fombelle, P. Jofré, P. Jonker, A. Jorissen, F. Julbe, A. Karampelas, A. Kochoska, R. Kohley, K. Kolenberg, E. Kontizas, S. Koposov, G. Kordopatis, P. Koubsky, A. Krone-Martins, M. Kudryashova, I. Kull, R. Bachchan, F. Lacoste-Seris, F. Lanza, J. Lavigne, C. Le Poncin-Lafitte, Y. Lebreton, T. Lebzelter, S. Leccia, N. Leclerc, I. Lecoeur-Taibi, V. Lemaitre, H. Lenhardt, F. Leroux, S. Liao, E. Licata, H. Lindstrøm, A. Lister, E. Livanou, A. Lobel, W. Löffler, M. López, D. Lorenz, I. Macdonald, T. Magalhães Fernandes, S. Managau, R. Mann, G. Mantelet, O. Marchal, J. Marchant, M. Marconi, S. Marinoni, P. Marrese, G. Marschalkó, J. Marshall, J. Martín-Fleitas, M. Martino, N. Mary, G. Matijevič, T. Mazeh, J. Mcmillan, S. Messina, D. Michalik, R. Millar, H. Miranda, D. Molina, R. Molinaro, M. Molinaro, L. Molnár, M. Moniez, P. Montegriffo, R. Mor, A. Mora, R. Morbidelli, T. Morel, S. Morgenthaler, D. Morris, F. Mulone, T. Muraveva, I. Musella, J. Narbonne, G. Nelemans, L. Nicastro, L. Noval, C. Ordénovic, J. Ordieres-Meré, P. Osborne, C. Pagani, I. Pagano, F. Pailler, H. Palacin, L. Palaversa, P. Parsons, M. Pecoraro, R. Pedrosa, H. Pentikäinen, B. Pichon, M. Piersimoni, F. Pineau, E. Plachy, G. Plum, E. Poujoulet, A. Prša, L. Pulone, S. Ragaini, S. Rago, N. Rambaux, M. Ramos-Lerate, P. Ranalli, G. Rauw, A. Read, S. Regibo, C. Reylé, R. Ribeiro, L. Rimoldini, V. Ripepi, A. Riva, G. Rixon, M. Roelens, M. Gómez, N. Rowell, F. Royer, L. Ruiz-Dern, G. Sadowski, T. Sagristà Sellés, J. Sahlmann, J. Salgado, E. Salguero, M. Sarasso, H. Savietto, M. Schultheis, E. Sciacca, M. Segol, J. Segovia, D. Segransan, C. Shih, R. Smareglia, R. Smart, E. Solano, F. Solitro, R. Sordo, S. Soria Nieto, J. Souchay, A. Spagna, F. Spoto, U. Stampa, A. Steele, H. Steidelmüller, C. Stephenson, H. Stoev, F. Suess, M. Süveges, J. Surdej, L. Szabados, E. Szegedi-Elek, D. Tapiador, F. Taris, G. Tauran, M. Taylor, R. Teixeira, D. Terrett, B. Tingley, S. Trager, C. Turon, A. Ulla, E. Utrilla, G. Valentini, A. van Elteren, E. van Hemelryck, M. van Leeuwen, M. Varadi, A. Vecchiato, J. Veljanoski, T. Via, D. Vicente, S. Vogt, H. Voss, V. Votruba, S. Voutsinas, G. Walmsley, M. Weiler, K. Weingrill, T. Wevers, Ł. Wyrzykowski, A. Yoldas, M. Žerjal, S. Zucker, C. Zurbach, T. Zwitter, A. Alecu, M. Allen, C. Allende Prieto, A. Amorim, G. Anglada-Escudé, V. Arsenijevic, S. Azaz, P. Balm, M. Beck, H. Bernstein, L. Bigot, A. Bijaoui, C. Blasco, M. Bonfigli, G. Bono, S. Boudreault, A. Bressan, S. Brown, P. Brunet, P. Bunclark, R. Buonanno, A. Butkevich, C. Carret, Claire Carrion, L. Chemin, F. Chéreau, L. Corcione, E. Darmigny, S. de Boer, P. de Teodoro, P. de Zeeuw, C. Delle Luche, D. Domingues, P. Dubath, F. Fodor, B. Frézouls, A. Fries, D. Fustes, D. Fyfe, E. Gallardo, J. Gallegos, D. Gardiol, M. Gebran, A. Gomboc, A. Gómez, E. Grux, A. Gueguen, A. Heyrovsky, J. Hoar, G. Iannicola, Y. Isasi Parache, M. Janotto, E. Joliet, A. Jonckheere, R. Keil, W. Kim, P. Klagyivik, J. Klar, J. Knude, O. Kochukhov, I. Kolka, J. Kos, A. Kutka, V. Lainey, D. Lebouquin, C. Liu, D. Loreggia, V. Makarov, M. Marseille, C. Martayan, O. Martinez-Rubi, B. Massart, F. Meynadier, S. Mignot, U. Munari, A. Nguyen, T. Nordlander, P. Ocvirk, S. O’flaherty, A. Olias Sanz, P. Ortiz, J. Osorio, D. Oszkiewicz, A. Ouzounis, M. Palmer, P. Park, E. Pasquato, C. Peltzer, J. Peralta, F. Péturaud, T. Pieniluoma, E. Pigozzi, J. Poels, G. Prat, T. Prod’homme, F. Raison, J. Rebordao, D. Risquez, B. Rocca-Volmerange, S. Rosen, M. I. Ruiz-Fuertes, F. Russo, S. Sembay, I. Serraller Vizcaino, A. Short, A. Siebert, H. Silva, D. Sinachopoulos, E. Slezak, M. Soffel, D. Sosnowska, V. Straižys, M. ter Linden, D. Terrell, S. Theil, C. Tiede, L. Troisi, P. Tsalmantza, D. Tur, M. Vaccari, F. Vachier, P. Valles, W. van Hamme, L. Veltz, J. Virtanen, J.-M. Wallut, R. Wichmann, M. I. Wilkinson, H. Ziaeepour, S. Zschocke

article

Astronomy and Astrophysics - A&A, EDP Sciences, 2016, 595, pp.id.A2. ⟨10.1051/0004-6361/201629512⟩

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titre

Severe paediatric conditions linked with EV-A71 and EV-D68, France, May to October 2016

auteur

Denise Antona, Manoëlle Kossorotoff, Isabelle Schuffenecker, Audrey Mirand, Marianne Leruez-Ville, Clément Bassi, Mélodie Aubart, Florence Moulin, Daniel Lévy-Bruhl, Cécile Henquell, Bruno Lina, Isabelle Desguerre

article

Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2016, 21 (46), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2016.21.46.30402⟩

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titre

Simulating the Impact of the Natural Radiation Background on Bacterial Systems: Implications for Very Low Radiation Biological Experiments

auteur

Nathanael Lampe, David Biron, Jeremy M. C. Brown, Sébastien Incerti, Pierre Marin, Lydia Maigne, David Sarramia, Hervé Seznec, Vincent Breton

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (11), pp.e0166364. ⟨10.1371/journal.pone.0166364⟩

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titre

Severe Pneumonia Associated with Adenovirus Type 55 Infection, France, 2014

auteur

Jeremy Lafolie, Audrey Mirand, Maud Salmona, Alexandre Lautrette, Christine Archimbaud, Amélie Brebion, Christel Regagnon, Martine Chambon, Séverine Mercier-Delarue, Jérôme Le Goff, Cécile Henquell

article

Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2016, 22 (11), pp.2012-2014. ⟨10.3201/eid2211.160728⟩

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titre

Characterization of akinetes from cyanobacterial strains and lake sediment: A study of their resistance and toxic potential

auteur

Benjamin Legrand, Amélie Lamarque, Marion Sabart, Delphine Latour

article

Harmful Algae, Elsevier, 2016, 59, pp.42 - 50. ⟨10.1016/j.hal.2016.09.003⟩

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titre

Les métabolismes oxydatifs extracellulaires : une nouvelle vision des processus de minéralisation du carbone organique du sol

auteur

Benoît Keraval

article

Biodiversité et Ecologie. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2016. Français. ⟨NNT : 2016CLF22740⟩

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Unexpectedly high bacteriochlorophyll a concentrations in neotropical tank bromeliads

auteur

Anne-Catherine Lehours, Anne-Hélène Le Jeune, Jean-Pierre Aguer, Régis Céréghino, Bruno Corbara, Benoit Keraval, Céline Leroy, Fanny Perrière, Christian Jeanthon, Jean-François Carrias

article

Environmental Microbiology Reports, Wiley, 2016, 8 (5), pp.689 - 698. ⟨10.1111/1758-2229.12426⟩

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titre

Prevalence of aortic valve dystrophy and insufficiency in a cohort of 255 HIV-positive patients followed-up in a cardiology department between 2012 and 2014

auteur

C. Jacomet, G. Illes, F. Kwiatkowski, M. Vidal, N. Mrozek, C. Aumeran, V. Corbin, O. Lesens, H. Laurichesse, P. Bailly

article

International Journal of Cardiology, Elsevier, 2016, 220, pp.82 - 86. ⟨10.1016/j.ijcard.2016.06.237⟩

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titre

Activités anti-biofilm de Lactobacillus vis-à-vis de Klebsiella Pneumoniae

auteur

Rosyne Lagrafeuille

article

Médecine humaine et pathologie. Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I, 2016. Français. ⟨NNT : 2016CLF1PP03⟩

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Crystallographic substrate binding studies of Leishmania mexicana SCP2-thiolase (type-2): unique features of oxyanion hole-1

auteur

Rajesh Harijan, Tiila-Riikka Kiema, Shahan Syed, Imran Qadir, Muriel Mazet, Frédéric Bringaud, Paul A.M. Michels, Rik Wierenga

article

Protein Engineering, Design and Selection, Oxford University Press (OUP), 2016, ⟨10.1093/protein/gzw080⟩

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titre

Horizontal distribution of the cell abundance and toxicity of Microcystis in a hypereutrophic Moroccan reservoir

auteur

S. Samoudi, D. Latour, J. Robin, M. Sabart, Benjamin Misson, H. Ait Hammou, Kh. Mouhri, M. Loudiki

article

Contemporary Problems of Ecology, 2016, 9 (5), pp.554 - 562. ⟨10.1134/S1995425516050139⟩

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titre

Differential localization and functional specialization of centrin analogs in the parasitic ciliate Trichodina pediculus

auteur

Bernard Vigues, Jonathan Colombet, Raghida Damaj

article

Protoplasma, Springer Verlag, 2016, 253 (5), pp.1385-1388

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titre

Molecular tools to detect anatoxin-a genes in aquatic ecosystems: Toward a new nested PCR-based method

auteur

Benjamin Legrand, Jerome Lesobre, Jonathan Colombet, Delphine Latour, Marion Sabart

article

Harmful Algae, Elsevier, 2016, 58, ⟨10.1016/j.hal.2016.07.002⟩

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titre

Prevalence, risk factors for infection and subtype distribution of the intestinal parasite Blastocystis sp. from a large-scale multi-center study in France

auteur

Dima El Safadi, Amandine Cian, Céline Nourrisson, Bruno Pereira, Christelle Morelle, Patrick Bastien, Anne-Pauline Bellanger, Françoise Botterel, Ermanno Candolfi, Guillaume Desoubeaux, Laurence Lachaud, Florent Morio, Christelle Pomares, Meja Rabodonirina, Ivan Wawrzyniak, Frédéric Delbac, Nausicaa Gantois, Gabriela Certad, Laurence Delhaes, Philippe Poirier, Eric Viscogliosi

article

BMC Infectious Diseases, BioMed Central, 2016, 16 (1), pp.451. ⟨10.1186/s12879-016-1776-8⟩

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Unexpected predominance of photosynthetic picoeukaryotes in shallow eutrophic lakes

auteur

Shengnan Li, Xiaoli Shi, Cécile Lepère, Mixue Li, Xiujuan Wang, Fanxiang Kong

article

Journal of Plankton Research, Oxford University Press (OUP), 2016, 38 (4), pp.830-842. ⟨10.1093/plankt/fbw042⟩

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Chronic Polyaromatic Hydrocarbon (PAH) Contamination Is a Marginal Driver for Community Diversity and Prokaryotic Predicted Functioning in Coastal Sediments

auteur

Mathilde Jeanbille, Jérôme Gury, Robert Duran, Jacek Tronczynski, Jean-François Ghiglione, Hélène Agogué, Olfa Ben Saïd, Najwa Taïb, Didier Debroas, Cédric Garnier, Jean-Christophe Auguet

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.1303. ⟨10.3389/fmicb.2016.01303⟩

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The dynamics of ant mosaics in tropical rainforests characterized using the Self-Organizing Map algorithm

auteur

Alain Dejean, Frédéric Azemar, Régis Céréghino, Maurice Leponce, Bruno Corbara, Jérôme Orivel, Arthur Compin

article

Insect Science, Wiley, 2016, 23 (4), pp.630-637

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titre

Functional Responses of Bacterioplankton Diversity and Metabolism to Experimental Bottom-Up and Top-Down Forcings

auteur

S. Pradeep Ram, S. Chaibi-Slouma, J. Keshri, J. Colombet, T. Sime-Ngando

article

Microbial Ecology, Springer Verlag, 2016, 72 (2), pp.347 - 358. ⟨10.1007/s00248-016-0782-0⟩

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titre

Compatibility of Injectable Anticoagulant Agents in Ethanol; In Vitro Antibiofilm Activity and Impact on Polyurethane Catheters of Enoxaparin 400 U/mL in 40% v/v Ethanol

auteur

Damien Balestrino, Mercédès Quintana, Nicolas Charbonnel, Christiane Forestier, Claire Lartigue, Bertrand Souweine

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (7), ⟨10.1371/journal.pone.0159475⟩

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titre

Varicella outbreak in Sudanese refugees from Calais

auteur

O. Lesens, O Baud, C. Henquell, A Lhermet, Nurse, J. Beytout

article

Journal of Travel Medicine, Wiley-Blackwell, 2016, 23 (5), ⟨10.1093/jtm/taw042⟩

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titre

Ciprofloxacin residue and antibiotic-resistant biofilm bacteria in hospital effluent

auteur

Jérôme Ory, Geneviève Bricheux, Anne Togola, Jean Louis Bonnet, Florence Donnadieu-Bernard, Laurence Nakusi, Christiane Forestier, Ousmane Traore

article

Environmental Pollution (1970), Elsevier Science, 2016, 214, ⟨10.1016/j.envpol.2016.04.033⟩

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titre

Ecologie de la santé humaine : contribution à l'étude et à la surveillance des épidémies de gastro-entérite aigüe d'origine hydrique

auteur

Damien Mouly

article

Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2016. Français. ⟨NNT : 2016CLF22706⟩

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Rumen methanogens display species-specific methane production kinetics

auteur

Milka Popova, Maxence Tillier, Dominique Graviou, Diego Morgavi, Gérard Fonty, Jean Pierre Morel, Nicole Morel Desrosier

article

10. Joint Symposium Inra Rowett, Jun 2016, Clermont-Ferrand, France. 2016

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Lethal Effects of Microwave Exposures on Eggs and Pupae of the Cabbage Maggot and Cabbage Plants

auteur

David Biron, M. Giroux, A. Maire, Vincent Charles

article

Journal of Microwave Power and Electromagnetic Energy, International Microwave Power Institute, 2016, 31 (4), pp.228-237. ⟨10.1080/08327823.1996.11688314⟩

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titre

Molecular diversity studies in Lake Pavin reveal the ecological importance of parasitic true fungi in the plankton

auteur

Telesphore Sime-Ngando, Mélanie Gerphagnon, Jonathan Colombet, Marlène Jobard, Emilie Lefèvre, Sébastien Monchy, Serena Rasconi, Delphine Latour, Jean-François Carrias, Christian Amblard

article

Lac Pavin - History, geology, biogeochemistry, and sedimentology of a deep meromictic maar lake, 2016

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titre

Anaerobic microbial communities and processes involved in the methane cycle in freshwater lakes - a focus on lake Pavin.

auteur

Anne Catherine Lehours, Guillaume Borrel, Nicole Morel-Desrosiers, Corinne Bardot, Vincent Grossi, Benoit Keraval, Eleonore Attard, Jean-Pierre Morel, Christian Amblard, Gérard Fonty

article

Lake Pavin: History, biogeochemistry and sedimentology of a deep meromictic crater lake, 2016

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titre

The significance of transparent exopolymeric particles (TEP) for microorganisms in Lake Pavin.

auteur

Jean-François Carrias, Christian Amblard, Telesphore Sime-Ngando

article

Lac Pavin - History, geology, biogeochemistry, and sedimentology of a deep meromictic maar lake, 2016

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The importance of phagotrophic protists in Lake Pavin

auteur

Jean-François Carrias, Christian Amblard, Gilles Bourdier, Telesphore Sime-Ngando

article

Lac Pavin - History, geology, biogeochemistry, and sedimentology of a deep meromictic maar lake., 2016

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Lake Pavin: A pioneer site for ecological studies of freshwater viruses

auteur

Telesphore Sime-Ngando, Yvan Bettarel, Jonathan Colombet, Stéphanie Palesse, Angia Sriram Pradeep Ram, Marie Charpin, Christian Amblard

article

Lake Pavin: History, biogeochemistry and sedimentology of a deep meromictic crater lake, 2016

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Lac Pavin – History, geology, biogeochemistry, and sedimentology of a deep meromictic maar lake.

auteur

Telesphore Sime-Ngando, Pierre Boivin, Emmanuel Chapron, Didier Jezequel, Michel Meybeck

article

2016

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Study of microorganisms and virus in aquatic ecosystems by metagenetic and metagenomic approaches.

auteur

Gisèle Bronner, Didier Debroas, Francois Enault, Mylène Hugoni, Isabelle Jouan-Dufournel, Isabelle Mary, Viviane Ravet, Simon Roux, Najwa Taib

article

Lake Pavin: History, biogeochemistry and sedimentology of a deep meromictic crater lake, 2016

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INF-04 - Épidémie de varicelle chez des migrants Soudanais en provenance de Calais

auteur

A. Lhermet, Z. Lacombe, O. Baud, C. Henquell, J. Beytout, O. Lesens

article

Médecine et Maladies Infectieuses, Elsevier Masson, 2016, 46 (4), ⟨10.1016/S0399-077X(16)30590-X⟩

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titre

HEP-06 - Nouveaux antiviraux oraux contre le virus de l’hépatite C chez des patients co-infectés VIH-VHC : remarquables résultats des combinaisons orales sans interféron, 2014-2015

auteur

G. Laurichesse, S. Casanova, V. Corbin, A. Mirand, C. Henquell, O. Lesens, C. Jacomet, J. Beytout, H. Laurichesse

article

Médecine et Maladies Infectieuses, Elsevier Masson, 2016, 46 (4), ⟨10.1016/S0399-077X(16)30383-3⟩

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Extreme events in the sedimentary record of maar Lake Pavin: Implications for natural hazards assessment in the French Massif Central

auteur

Léo Chassiot, Emmanuel Chapron, Christian Di Giovanni, Patrick Albéric, Patrick Lajeunesse, Anne-Catherine Lehours, Michel Meybeck

article

Quaternary Science Reviews, Elsevier, 2016, 141, pp.9-25. ⟨10.1016/j.quascirev.2016.03.020⟩

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Étude expérimentale de la formulation des mortiers à base de sable recyclé

auteur

Layachi Berredjem, Laurent Molez, Nguyen van Minh, Houria Meftah, Nourredine Arabi

article

34èmes Rencontres Universitaires de Génie Civil (RUGC 2016), May 2016, Liège, Belgique

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The significance of soil microalgae and cyanobacteria to assess pesticide stresses, in agricultural soils

auteur

Olivier Crouzet, Christelle Marrauld, Pierre-Alain Maron, Frédéric Rimet, Christian Mougin, Clarisse Mallet

article

SETAC Europe 26th Annual Meeting, May 2016, Nantes, France

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mTOR transcriptionally and post-transcriptionally regulates Npm1 gene expression to contribute to enhanced proliferation in cells with Pten inactivation

auteur

Rafik Boudra, Rosyne Lagrafeuille, Corinne Lours-Calet, Cyrille de Joussineau, Gaëlle Loubeau-Legros, Cédric Chaveroux, Jean-Paul Saru, Silvère Baron, Laurent Morel, Claude Beaudoin

article

Cell Cycle, Taylor & Francis, 2016, 15 (10), pp.1352 - 1362. ⟨10.1080/15384101.2016.1166319⟩

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Functional and structural characterization of two Bacillus megaterium nitroreductases biotransforming the herbicide mesotrione.

auteur

Louis Carles, Pascale Besse-Hoggan, Muriel Joly, Armelle Vigouroux, Solange Moréra, Isabelle Batisson

article

Biochemical Journal, Portland Press, 2016, pp.1443-53. ⟨10.1042/BJ20151366⟩

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Anti-biofilm Activity as a Health Issue

auteur

Sylvie Miquel, Rosyne Lagrafeuille, Bertrand Souweine, Christiane Forestier

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.592. ⟨10.3389/fmicb.2016.00592⟩

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Correction: Prevalence and Risk Factors for Intestinal Protozoan Infections with Cryptosporidium, Giardia, Blastocystis and Dientamoeba among Schoolchildren in Tripoli, Lebanon

auteur

Marwan Osman, Dima El Safadi, Amandine Cian, Sadia Benamrouz, Céline Nourrisson, Philippe Poirier, Bruno Pereira, Romy Razakandrainibe, Anthony Pinon, Céline Lambert, Ivan Wawrzyniak, Fouad Dabboussi, Frederic Delbac, Loïc Favennec, Monzer Hamze, Eric Viscogliosi, Gabriela Certad

article

PLoS Neglected Tropical Diseases, Public Library of Science, 2016, 10 (4), ⟨10.1371/journal.pntd.0004643⟩

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Taxonomy of prokaryotic viruses: update from the ICTV bacterial and archaeal viruses subcommittee.

auteur

M Krupovic, Be Dutilh, Em Adriaenssens, J Wittmann, Fk Vogensen, Mb Sullivan, J Rumnieks, D Prangishvili, R Lavigne, Am Kropinski, J Klumpp, A Gillis, F Enault, Ra Edwards, S Duffy, Mr Clokie, J Barylski, Hw Ackermann, Jh Kuhn

article

Archives of Virology, Springer Verlag, 2016, 161 (4), pp.1095-1099. ⟨10.1007/s00705-015-2728-0⟩

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Les microalgues et cyanobactéries des sols : quels apports pour l’écotoxicologie terrestre

auteur

Olivier Crouzet, Laurent Consentino, Christelle Marrauld, Clarisse Mallet, Pierre-Alain Maron, Annette Berard

article

3ème journée Ecotoxicomic, Mar 2016, Valence, France

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titre

Prevalence and Risk Factors for Intestinal Protozoan Infections with Cryptosporidium, Giardia, Blastocystis and Dientamoeba among Schoolchildren in Tripoli, Lebanon

auteur

Marwan Osman, Dima El Safadi, Amandine Cian, Sadia Benamrouz, Céline Nourrisson, Philippe Poirier, Bruno Pereira, Romy Razakandrainibe, Anthony Pinon, Céline Lambert, Ivan Wawrzyniak, Fouad Dabboussi, Frederic Delbac, Loïc Favennec, Monzer Hamze, Eric Viscogliosi, Gabriela Certad, Albert Picado

article

PLoS Neglected Tropical Diseases, Public Library of Science, 2016, 10 (3), ⟨10.1371/journal.pntd.0004496⟩

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Host–parasite interactions in food webs: Diversity, stability, and coevolution

auteur

Thomas Jephcott, Télesphore Sime-Ngando, Frank H. Gleason, Deborah J. Macarthur

article

Food Webs, Elsevier, 2016, 6, pp.1 - 8. ⟨10.1016/j.fooweb.2015.12.001⟩

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titre

Microbial diversity in support of anaerobic biomass valorization

auteur

M. Jobard, J. Pessiot, R. Nouaille, G. Fonty, T. Sime-Ngando

article

Critical Reviews in Biotechnology, Taylor & Francis, 2016, 37 (1), pp.1 - 10. ⟨10.3109/07388551.2015.1100584⟩

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Viral Regulation of Prokaryotic Carbon Metabolism in a Hypereutrophic Freshwater Reservoir Ecosystem (Villerest, France)

auteur

Angia Sriram Pradeep Ram, Jonathan Colombet, Fanny Perrière, Antoine Thouvenot, Télesphore Sime-Ngando

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, ⟨10.3389/fmicb.2016.00081⟩

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Impact of two disinfectants on detachment of Enterococcus faecalis from polythene in aquatic microcosm

auteur

C. Lontsi Djimeli, A. Tamsa Arfao, V Rossi, N Nsulem, V. Raspal, G Bricheux, M. Nola, T. Sime-Ngando

article

Research in Biotechnology, 2016, 7 (1), ⟨10.19071/rib.2016.v7.2981⟩

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titre

Enterovirus meningitis in Tunisia (Monastir, Mahdia, 2011–2013): identification of virus variants cocirculating in France

auteur

Ines Othman, Romain Volle, Aida Elargoubi, Mohamed Guediche, Mohamed Chakroun, Mohamed Tahar Sfar, Bruno Pereira, Hélène Peigue-Lafeuille, Mahjoub Aouni, Christine Archimbaud, Jean-Luc Bailly

article

Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, Elsevier, 2016, 84 (2), pp.116 - 122. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2015.10.019⟩

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titre

Outcome of totally implantable venous-access port-related infections

auteur

M. Vidal, J.P. Genillon, E. Forestier, S. Trouiller, B. Pereira, N. Mrozek, C. Aumeran, O. Lesens

article

Médecine et Maladies Infectieuses, Elsevier Masson, 2016, 46 (1), pp.32-38

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Is real-time PCR-based diagnosis similar in performance to routine parasitological examination for the identification of Giardia intestinalis , Cryptosporidium parvum / Cryptosporidium hominis and Entamoeba histolytica from stool samples? Evaluation of a new commercial multiplex PCR assay and literature review

auteur

A. Laude, S. Valot, G. Desoubeaux, N. Argy, C. Nourrisson, C. Pomares, M. Machouart, Y. Le Govic, N. Bourgeois, E. Cateau, M. Leterrier, P. Le Pape, F. Morio

article

Clinical Microbiology and Infection, Elsevier for the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2016, 22 (2), pp.190.e1 - 190.e8. ⟨10.1016/j.cmi.2015.10.019⟩

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titre

Correction: Structural Diversity of Bacterial Communities Associated with Bloom-Forming Freshwater Cyanobacteria Differs According to the Cyanobacterial Genus

auteur

Imen Louati, Noémie Pascault, Didier Debroas, Cécile Bernard, Jean-François Humbert, Julie Leloup

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (1), pp.e0146866. ⟨10.1371/journal.pone.0146866⟩

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Diversity and Dynamics of Active Small Microbial Eukaryotes in the Anoxic Zone of a Freshwater Meromictic Lake (Pavin, France)

auteur

Cécile Lepère, Isabelle Domaizon, Mylène Hugoni, Agnès Vellet, Didier Debroas

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7 (130), ⟨10.3389/fmicb.2016.00130⟩

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Colonization with the enteric protozoa Blastocystis is associated with increased diversity of human gut bacterial microbiota

auteur

Christophe Audebert, Gaël Even, Amandine Cian, Dima El Safadi, Gabriela Certad, Laurence Delhaes, Bruno Pereira, Céline Nourrisson, Philippe Poirier, Ivan Wawrzyniak, Frédéric Delbac, Christelle Morelle, Patrick Bastien, Laurence Lachaud, Anne-Pauline Bellanger, Françoise Botterel, Ermanno Candolfi, Guillaume Desoubeaux, Florent Morio, Christelle Pomares, Meja Rabodonirina, Alexandre Loywick, Sophie Merlin, Eric Viscogliosi, Magali Chabé

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, pp.25255. ⟨10.1038/srep25255⟩

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Analysis of metagenomic data reveals common features of halophilic viral communities across continents

auteur

Simon Roux, Francois Enault, Viviane Ravet, Jonathan Colombet, Yvan Bettarel, Jean-Christophe Auguet, Thierry Bouvier, Soizick Lucas-Staat, Agnès Vellet, David Prangishvili, Patrick Forterre, Didier Debroas, Telesphore Sime-Ngando

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2016, 18 (3), pp.889 - 903. ⟨10.1111/1462-2920.13084⟩

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Genome Sequence of a Clinical Staphylococcus aureus Strain from a Prosthetic Joint Infection

auteur

Claire Marquès, Christine Franceschi, Valérie Collin, Frédéric Laurent, Sonia Chatellier, Christiane Forestier

article

Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2016, 4 (2), pp.e00198-16. ⟨10.1128/genomeA.00198-16⟩

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Identification of an anti-inflammatory protein from Faecalibacterium prausnitzii, a commensal bacterium deficient in Crohn's disease

auteur

E. Quévrain, M.A. Maubert, C. Michon, F. Chain, R. Marquant, J. Tailhades, S. Miquel, L. Carlier, L.G. Bermúdez-Humarán, B. Pigneur, O. Lequin, P. Kharrat, G. Thomas, D. Rainteau, C. Aubry, N. Breyner, Carlos Afonso, S. Lavielle, J.-P. Grill, G. Chassaing, J.M. Chatel, G. Trugnan, R. Xavier, P. Langella, H. Sokol, P. Seksik

article

Gut, BMJ Publishing Group, 2016, 65 (3), pp.415-425. ⟨10.1136/gutjnl-2014-307649⟩

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Epidemiological and clinical characteristics of patients infected with enterovirus D68, France, July to December 2014

auteur

Isabelle Schuffenecker, Audrey Mirand, Laurence Josset, Cécile Henquell, Denise Hecquet, Léa Pilorgé, Joelle Petitjean-Lecherbonnier, Catherine Manoha, Jérôme Legoff, Claire Deback, Sylvie Pillet, Quentin Lepiller, Jean Michel Mansuy, Stéphanie Marque-Juillet, Denise Antona, Hélène Peigue-Lafeuille, Bruno Lina

article

Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2016, 21 (19), ⟨10.2807/1560-7917.es.2016.21.19.30226⟩

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Slight Pro-Inflammatory Immunomodulation Properties of Dendritic Cells byGardnerella vaginalis: The “Invisible Man” of Bacterial Vaginosis?

auteur

Thomas Bertran, Patrick Brachet, Marjolaine Vareille, Julie Falenta, Annie Dosgilbert, Marie-Paule Vasson, Christiane Forestier, Arlette Tridon, Bertrand Evrard

article

Journal of Immunology Research, Hindawi Publishing Corporation, 2016, pp.1-13. ⟨10.1155/2016/9747480⟩

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Empirical Micafungin Treatment and Survival Without Invasive Fungal Infection in Adults With ICU-Acquired Sepsis, Candida Colonization, and Multiple Organ Failure The EMPIRICUS Randomized Clinical Trial

auteur

Kada Klouche, Samir Jaber, Jean-Louis Trouillet, Fabrice Bruneel, Laurent Argaud, Joel Cousson, Ferhat Meziani, Didier Gruson, Adeline Paris, Michael Darmon, Maïté Garrouste-Orgeas, Jean-Christophe Navellou, Arnaud Foucrier, Bernard Allaouchiche, Vincent Das, Jean-Pierre Gangneux, Stephane Ruckly, Danièle Maubon, Vincent Jullien, Michel Wolff, Jean-François Timsit, Élie Azoulay, Carole Schwebel, Pierre Emmanuel Charles, Muriel Cornet, Bertrand Souweine

article

Journal of the American Medical Association, American Medical Association (AMA), 2016, 316 (15), pp.1555--1564. ⟨10.1001/jama.2016.14655⟩

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Estimation of sedimentation rates based on the excess of radium 228 in granitic reservoir sediments

auteur

Jean-Louis Reyss, Arnaud Mangeret, Christelle Courbet, Sylvain Bassot, Gilles Alcalde, Antoine Thouvenot, Jérôme Guillevic

article

Journal of Environmental Radioactivity, Elsevier, 2016, 162-163, pp.8 - 13. ⟨10.1016/j.jenvrad.2016.04.032⟩

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Functional and structural responses of soil N-cycling microbial communities to the herbicide mesotrione: a dose-effect microcosm approach

auteur

Olivier Crouzet, Franck Poly, Frédérique Bonnemoy, David Bru, Isabelle Batisson, Jacques Bohatier, Laurent Philippot, Clarisse Mallet

article

Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2016, 23 (5), pp.4207 - 4217. ⟨10.1007/s11356-015-4797-8⟩

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titre

A cuckoo-like parasitic moth leads African weaver ant colonies to their ruin

auteur

Alain Dejean, Jérôme Orivel, Frédéric Azémar, Bruno Hérault, Bruno Corbara

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, ⟨10.1038/srep23778⟩

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The contribution of microorganisms and metazoans to mineral nutrition in bromeliads

auteur

Céline Leroy, Jean-François Carrias, Régis Céréghino, Bruno Corbara

article

Journal of Plant Ecology, Wiley, 2016, 9 (3), pp.241-255. ⟨10.1093/jpe/rtv052⟩

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Biogeomorphic ecosystems within stressful and disturbed environments: a focus on termites and pioneer plants

auteur

Dov Jean-François Corenblit, Bruno Corbara, Johannes Steiger

article

Johnson E.; Martin Y. A Biogeoscience Approach to Ecosystems, Cambridge University Press, pp.456-474, 2016

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Detachment of adhered enteropathogenic Escherichia coli cells from polythene fragments immersed in aquatic microcosm using Eucalyptus microcorys extract (Myrtaceae)

auteur

Antoine Arfao, Chrétien Djimeli, Olive Ewoti, Geneviève Bricheux, Moïse Nola, Télesphore Sime-Ngando

article

Current Research in Microbiology and Biotechnology, Aizeon Publishers, 2016, 4 (3), pp.847-857

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Encephalitis caused by an unusual human herpes virus type 6 and Toxoplasma gondii co-infection in a cord blood transplant recipient

auteur

Alexandra Chapuis, Cécile Chabrot, Audrey Mirand, Philippe Poirier, Céline Nourrisson

article

International Journal of Infectious Diseases, Elsevier, 2016, 46, pp.79-81. ⟨10.1016/j.ijid.2016.04.002⟩

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Distinct Spatial Patterns of SAR11, SAR86, and Actinobacteria Diversity along a Transect in the Ultra-oligotrophic South Pacific Ocean

auteur

Nyree J. West, Cécile Lepère, Carmem-Lara de O. Manes, Philippe Catala, David J. Scanlan, Philippe Lebaron

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.234. ⟨10.3389/fmicb.2016.00234⟩

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Influence of streambed substratum composition on stream microbial communities exposed to the fungicide tebuconazole

auteur

Florence Donnadieu, Pascale Besse-Hoggan, Christiane Forestier, Joan Artigas

article

Freshwater Biology, Wiley, 2016, 61, pp.2026-2036. ⟨10.1111/fwb.12679⟩

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Ecological impacts of parasitic chytrids, syndiniales and perkinsids on populations of marine photosynthetic dinoflagellates

auteur

Thomas G. Jephcott, Catharina Alves-De-Souza, Frank H. Gleason, Floris F. Ogtrop, Télesphore Sime-Ngando, Sergey A. Karpov, Laure Guillou

article

Fungal Ecology, Elsevier, 2016, 19, pp.47-58. ⟨10.1016/j.funeco.2015.03.007⟩

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Occurrence and diversity of both bacterial and fungal communities in dental unit waterlines subjected to disinfectants.

auteur

Damien Costa, Anne Mercier, Kevin Gravouil, Jérôme Lesobre, Julien Verdon, Christine Imbert

article

Foodborne Pathogens and Disease, Mary Ann Liebert, 2016, 74 (7), ⟨10.1093/femspd/ftw094⟩

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Combined effects of drought and the fungicide tebuconazole on aquatic leaf litter decomposition

auteur

S. Pesce, O. Zoghlami, C. Margoum, J. Artigas, Arnaud Chaumot, A. Foulquier

article

Aquatic Toxicology, Elsevier, 2016, 173, pp.120-131. ⟨10.1016/j.aquatox.2016.01.012⟩

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Characterization of biofilm formation in natural water subjected to low-frequency electromagnetic fields.

auteur

Anne Mercier, Joanne Bertaux, Jérôme Lesobre, Kevin Gravouil, Julien Verdon, Christine Imbert, Eric Valette, Yann Héchard

article

Biofouling, Taylor & Francis, 2016, 32 (3), pp.287-99. ⟨10.1080/08927014.2015.1137896⟩

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Feasibility of a Chronic Foreign Body Infection Model Studying the Influence of TiO2 Nanotube Layers on Bacterial Contamination

auteur

Charles Vorilhon, Christophe Massard, Vincent Raspal, Yves Sibaud, Christiane Forestier, Nicolas Charbonnel, Stéphane Descamps, Komla Oscar Awitor

article

Journal of Biomaterials and Nanobiotechnology, Scientific Research, 2016, 07 (01), pp.45 - 54. ⟨10.4236/jbnb.2016.71006⟩

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The Gaia mission

auteur

T. Prusti, H. de Bruijne, A. Brown, A. Vallenari, C. Babusiaux, L. Bailer-Jones, U. Bastian, M. Biermann, W. Evans, L. Eyer, F. Jansen, C. Jordi, S. Klioner, U. Lammers, L. Lindegren, X. Luri, F. Mignard, J. Milligan, C. Panem, V. Poinsignon, D. Pourbaix, S. Randich, G. Sarri, P. Sartoretti, H. Siddiqui, C. Soubiran, V. Valette, F. van Leeuwen, A. Walton, C. Aerts, F. Arenou, M. Cropper, R. Drimmel, E. Høg, D. Katz, M. Lattanzi, W. O’mullane, E. Grebel, D. Holland, C. Huc, X. Passot, L. Bramante, C. Cacciari, J. Castañeda, L. Chaoul, N. Cheek, F. de Angeli, C. Fabricius, R. Guerra, J. Hernández, A. Jean-Antoine-Piccolo, E. Masana, R. Messineo, N. Mowlavi, K. Nienartowicz, D. Ordóñez-Blanco, P. Panuzzo, J. Portell, J. Richards, M. Riello, M. Seabroke, P. Tanga, F. Thévenin, J. Torra, S. Els, G. Gracia-Abril, G. Comoretto, M. Garcia-Reinaldos, T. Lock, E. Mercier, M. Altmann, R. Andrae, L. Astraatmadja, I. Bellas-Velidis, K. Benson, J. Berthier, R. Blomme, G. Busso, B. Carry, A. Cellino, G. Clementini, S. Cowell, O. Creevey, J. Cuypers, M. David, J. de Ridder, A. de Torres, L. Delchambre, A. Dell’oro, C. Ducourant, Y. Frémat, M. García-Torres, E. Gosset, J. Halbwachs, C. Hambly, L. Harrison, M. Hauser, D. Hestroffer, S. Hodgkin, H. Huckle, A. Hutton, Gérard Jasniewicz, S. Jordan, M. Kontizas, J. Korn, C. Lanza, M. Manteiga, A. Moitinho, K. Muinonen, J. Osinde, E. Pancino, T. Pauwels, J.-M. Petit, A. Recio-Blanco, C. Robin, L. Sarro, C. Siopis, M. Smith, W. Smith, A. Sozzetti, W. Thuillot, W. van Reeven, Y. Via, U. Abbas, A. Abreu Aramburu, S. Accart, J. Aguado, P. Allan, W. Allasia, G. Altavilla, M. Álvarez, J. Alves, R. Anderson, H. Andrei, E. Anglada Varela, E. Antiche, T. Antoja, S. Antón, B. Arcay, A. Atzei, L. Ayache, N. Bach, S. Baker, L. Balaguer-Núñez, C. Barache, C. Barata, A. Barbier, F. Barblan, M. Baroni, D. Barrado y Navascués, M. Barros, M. Barstow, U. Becciani, M. Bellazzini, G. Bellei, A. Bello García, V. Belokurov, P. Bendjoya, A. Berihuete, L. Bianchi, O. Bienaymé, F. Billebaud, N. Blagorodnova, S. Blanco-Cuaresma, T. Boch, A. Bombrun, R. Borrachero, S. Bouquillon, G. Bourda, H. Bouy, A. Bragaglia, M. Breddels, N. Brouillet, T. Brüsemeister, B. Bucciarelli, F. Budnik, P. Burgess, R. Burgon, A. Burlacu, D. Busonero, R. Buzzi, E. Caffau, J. Cambras, H. Campbell, R. Cancelliere, T. Cantat-Gaudin, T. Carlucci, J. Carrasco, M. Castellani, P. Charlot, J. Charnas, P. Charvet, F. Chassat, A. Chiavassa, M. Clotet, G. Cocozza, S. Collins, P. Collins, G. Costigan, F. Crifo, J. Cross, M. Crosta, C. Crowley, C. Dafonte, Y. Damerdji, A. Dapergolas, P. David, P. de Cat, F. de Felice, P. de Laverny, F. de Luise, R. de March, D. Martino, R. de Souza, J. Debosscher, E. del Pozo, M. Delbo, A. Delgado, H. Delgado, F. Di Marco, P. Di Matteo, S. Diakite, E. Distefano, C. Dolding, S. dos Anjos, P. Drazinos, J. Durán, Y. Dzigan, E. Ecale, B. Edvardsson, H. Enke, M. Erdmann, D. Escolar, M. Espina, G. Eynard Bontemps, C. Fabre, M. Fabrizio, S. Faigler, J. Falcão, M. Farràs Casas, F. Faye, L. Federici, G. Fedorets, J. Fernández-Hernández, P. Fernique, A. Fienga, F. Figueras, F. Filippi, K. Findeisen, A. Fonti, M. Fouesneau, E. Fraile, M. Fraser, J. Fuchs, R. Furnell, M. Gai, S. Galleti, L. Galluccio, D. Garabato, F. García-Sedano, P. Garé, A. Garofalo, N. Garralda, P. Gavras, J. Gerssen, R. Geyer, G. Gilmore, S. Girona, G. Giuffrida, M. Gomes, A. González-Marcos, J. González-Núñez, J. González-Vidal, M. Granvik, A. Guerrier, P. Guillout, J. Guiraud, A. Gúrpide, R. Gutiérrez-Sánchez, L. Guy, R. Haigron, D. Hatzidimitriou, M. Haywood, U. Heiter, A. Helmi, D. Hobbs, W. Hofmann, B. Holl, G. Holland, S. Hunt, A. Hypki, V. Icardi, M. Irwin, G. Jevardat de Fombelle, P. Jofré, P. Jonker, A. Jorissen, F. Julbe, A. Karampelas, A. Kochoska, R. Kohley, K. Kolenberg, E. Kontizas, S. Koposov, G. Kordopatis, P. Koubsky, A. Kowalczyk, A. Krone-Martins, M. Kudryashova, I. Kull, R. Bachchan, F. Lacoste-Seris, F. Lanza, J. Lavigne, C. Le Poncin-Lafitte, Y. Lebreton, T. Lebzelter, S. Leccia, N. Leclerc, I. Lecoeur-Taibi, V. Lemaitre, H. Lenhardt, F. Leroux, S. Liao, E. Licata, H. Lindstrøm, A. Lister, E. Livanou, A. Lobel, W. Löffler, M. López, A. Lopez-Lozano, D. Lorenz, T. Loureiro, I. Macdonald, T. Magalhães Fernandes, S. Managau, R. Mann, G. Mantelet, O. Marchal, J. Marchant, M. Marconi, J. Marie, S. Marinoni, P. Marrese, G. Marschalkó, J. Marshall, J. Martín-Fleitas, M. Martino, N. Mary, G. Matijevič, T. Mazeh, J. Mcmillan, S. Messina, A. Mestre, D. Michalik, R. Millar, H. Miranda, D. Molina, R. Molinaro, M. Molinaro, L. Molnár, M. Moniez, P. Montegriffo, D. Monteiro, R. Mor, A. Mora, R. Morbidelli, T. Morel, S. Morgenthaler, T. Morley, D. Morris, F. Mulone, T. Muraveva, I. Musella, J. Narbonne, G. Nelemans, L. Nicastro, L. Noval, C. Ordénovic, J. Ordieres-Meré, P. Osborne, C. Pagani, I. Pagano, F. Pailler, H. Palacin, L. Palaversa, P. Parsons, T. Paulsen, M. Pecoraro, R. Pedrosa, H. Pentikäinen, J. Pereira, B. Pichon, M. Piersimoni, F. Pineau, E. Plachy, G. Plum, E. Poujoulet, A. Prša, L. Pulone, S. Ragaini, S. Rago, N. Rambaux, M. Ramos-Lerate, P. Ranalli, G. Rauw, A. Read, S. Regibo, F. Renk, C. Reylé, R. Ribeiro, L. Rimoldini, V. Ripepi, A. Riva, G. Rixon, M. Roelens, M. Gómez, N. Rowell, F. Royer, A. Rudolph, L. Ruiz-Dern, G. Sadowski, T. Sagristà Sellés, J. Sahlmann, J. Salgado, E. Salguero, M. Sarasso, H. Savietto, A. Schnorhk, M. Schultheis, E. Sciacca, M. Segol, J. Segovia, D. Segransan, E. Serpell, C. Shih, R. Smareglia, R. Smart, C. Smith, E. Solano, F. Solitro, R. Sordo, S. Soria Nieto, J. Souchay, A. Spagna, F. Spoto, U. Stampa, A. Steele, H. Steidelmüller, C. Stephenson, H. Stoev, F. Suess, M. Süveges, J. Surdej, L. Szabados, E. Szegedi-Elek, D. Tapiador, F. Taris, G. Tauran, M. Taylor, R. Teixeira, D. Terrett, B. Tingley, S. Trager, C. Tur, A. Ulla, E. Utrilla, G. Valentini, A. van Elteren, E. van Hemelryck, M. van Leeuwen, M. Varadi, A. Vecchiato, J. Veljanoski, T. Via, D. Vicente, S. Vogt, H. Voss, V. Votruba, S. Voutsinas, G. Walmsley, M. Weiler, K. Weingrill, D. Werner, T. Wevers, G. Whitehead, Ł. Wyrzykowski, A. Yoldas, M. Žerjal, S. Zucker, C. Zurbach, T. Zwitter, A. Alecu, M. Allen, C. Allende Prieto, A. Amorim, G. Anglada-Escudé, V. Arsenijevic, S. Azaz, P. Balm, M. Beck, H. Bernstein, L. Bigot, A. Bijaoui, C. Blasco, M. Bonfigli, G. Bono, S. Boudreault, A. Bressan, S. Brown, P. Brunet, P. Bunclark, R. Buonanno, A. Butkevich, C. Carret, Claire Carrion, L. Chemin, F. Chéreau, L. Corcione, E. Darmigny, S. de Boer, P. de Teodoro, P. de Zeeuw, C. Delle Luche, D. Domingues, P. Dubath, F. Fodor, B. Frézouls, A. Fries, D. Fustes, D. Fyfe, E. Gallardo, J. Gallegos, D. Gardiol, M. Gebran, A. Gomboc, A. Gómez, E. Grux, A. Gueguen, A. Heyrovsky, J. Hoar, G. Iannicola, Y. Isasi Parache, M. Janotto, E. Joliet, A. Jonckheere, R. Keil, W. Kim, P. Klagyivik, J. Klar, J. Knude, O. Kochukhov, I. Kolka, J. Kos, A. Kutka, V. Lainey, D. Lebouquin, C. Liu, D. Loreggia, V. Makarov, M. Marseille, C. Martayan, O. Martinez-Rubi, B. Massart, F. Meynadier, S. Mignot, U. Munari, A. Nguyen, T. Nordlander, P. Ocvirk, S. O’flaherty, A. Olias Sanz, P. Ortiz, J. Osorio, D. Oszkiewicz, A. Ouzounis, M. Palmer, P. Park, E. Pasquato, C. Peltzer, J. Peralta, F. Péturaud, T. Pieniluoma, E. Pigozzi, J. Poels, G. Prat, T. Prod’homme, F. Raison, J. Rebordao, D. Risquez, B. Rocca-Volmerange, S. Rosen, M. I. Ruiz-Fuertes, F. Russo, S. Sembay, I. Serraller Vizcaino, A. Short, A. Siebert, H. Silva, D. Sinachopoulos, E. Slezak, M. Soffel, D. Sosnowska, V. Straižys, M. ter Linden, D. Terrell, S. Theil, C. Tiede, L. Troisi, P. Tsalmantza, D. Tur, M. Vaccari, F. Vachier, P. Valles, W. van Hamme, L. Veltz, J. Virtanen, J.-M. Wallut, R. Wichmann, M. I. Wilkinson, H. Ziaeepour, S. Zschocke, Yves Viala, Catherine Turon, Gómez Anita

article

Astronomy and Astrophysics - A&A, EDP Sciences, 2016, 595, pp.id.A1. ⟨10.1051/0004-6361/201629272⟩

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titre

Distribution of dehalococcoidia in the anaerobic deep water of a remote meromictic crater lake and detection of dehalococcoidia-derived reductive dehalogenase homologous genes

auteur

Corinne Biderre-Petit, Eric Dugat-Bony, Mickaël Mege, Nicolas Parisot, Lorenz Adrian, Anne Moné, Jérémie Denonfoux, Eric Peyretaillade, Didier Debroas, Delphine Boucher, Pierre Peyret

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (1), ⟨10.1371/journal.pone.0145558⟩

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titre

Transcriptional profiling of Klebsiella pneumoniae defines signatures for planktonic, sessile and biofilm-dispersed cells

auteur

Cyril Guilhen, Nicolas Charbonnel, Nicolas Parisot, Nathalie Gueguen, Agnès Iltis, Christiane Forestier, Damien Balestrino

article

BMC Genomics, BioMed Central, 2016, 17 (1), ⟨10.1186/s12864-016-2557-x⟩

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titre

ArthropodaCyc: a CycADS powered collection of BioCyc databases to analyse and compare metabolism of arthropods

auteur

Patrice Baa-Puyoulet, Nicolas Parisot, Gérard Febvay, Jaime Huerta-Cepas, Augusto F Vellozo, Toni Gabaldon, Federica Calevro, Hubert Charles, Stefano Colella

article

Database - The journal of Biological Databases and Curation, Oxford University Press, 2016, pp.1-9. ⟨10.1093/database/baw081⟩

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titre

Bacterial communities associated with four cyanobacterial genera display structural and functional differences: evidence from an experimental approach

auteur

Lin Zhu, Anouk Zancarini, Imen Louati, Silvia de Cesare, Charlotte Duval, Kevin Tambosco, Cecile Bernard, Didier Debroas, Lirong Song, Julie Leloup, Jean Francois Humbert

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.1-11. ⟨10.3389/fmicb.2016.01662⟩

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titre

Soil carbon dioxide emissions controlled by an extracellular oxidative metabolism identifiable by its isotope signature

auteur

Benoit Keraval, Anne Catherine Lehours, Jonathan Colombet, Christian Amblard, Gaël Alvarez, Sébastien Fontaine

article

Biogeosciences, European Geosciences Union, 2016, 13 (22), pp.6353 - 6362. ⟨10.5194/bg-13-6353-2016⟩

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titre

The effects of food web structure on ecosystem function exceeds those of precipitation

auteur

M. Kurtis Trzcinski, Diane Srivastava, Bruno Corbara, Olivier Dézerald, Céline Leroy, Jean-François Carrias, Alain Dejean, Régis Cereghino

article

Journal of Animal Ecology, Wiley, 2016, 85 (5), pp.1147-1160. ⟨10.1111/1365-2656.12538⟩

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titre

On Blastocystis secreted cysteine proteases: a legumain-activated cathepsin B increases paracellular permeability of intestinal Caco-2 cell monolayers

auteur

C. Nourrisson, I. Wawrzyniak, A. Cian, Valerie Livrelli, F. Viscogliosi, F. Delbac, P. Poirier

article

Parasitology, Cambridge University Press (CUP), 2016, 143 (13), pp.1713-1722. ⟨10.1017/S0031182016001396⟩

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titre

Microbial treatment of water containing the bacteria Enterococcus faecalis and Escherichia coli in microcosm using Artemesia annua plant extract: Hierarchical order of some abiotic factors affecting cell’s cultivability

auteur

O. B. Mobili, C. Lontsi Djimeli, L. M. Moungang, O Allaadhin, A Tamsa Arfao, Joseph Mabingui, Geneviève Bricheux, Moïse Nola, Télesphore Sime-Ngando

article

European Journal of Biotechnology and Bioscience, Gupta Publications, 2016, 4 (9), pp.16-26

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titre

Microbial dynamics in industrial blue veined cheeses in different packaging

auteur

P. Duval, C. Chatelard-Chauvin, C. Gayard, E. Rifa, P. Bouchard, S. Hulin, D. Picque, M.C. Montel

article

International Dairy Journal, Elsevier, 2016, 56, pp.198 - 207. ⟨10.1016/j.idairyj.2016.01.024⟩

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titre

New insights into the microbial contribution to the chlorine cycle in aquatic ecosystems

auteur

Eric Dugat-Bony, Pierre Peyret, Corinne Biderre-Petit

article

Lake Pavin, Springer International Publishing, 2016, 978-3-319-39960-7. ⟨10.1007/978-3-319-39961-4_17⟩

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titre

Lake Pavin Paleolimnology and Event Stratigraphy

auteur

Léo Chassiot, Emmanuel Chapron, Yannick Miras, Markus J. Schwab, Patrick Albéric, Aude Beauger, Anne-Lise Develle, Fabien Arnaud, P Lajeunesse, Renata Zocatelli, Sylvain Bernard, Anne-Catherine Lehours, D Jézéquel

article

Lake Pavin, history, geology, biogeochemistry and sedimentology of a deep meromictic maar lake, Springer, pp.381 - 406, 2016, ⟨10.1007/978-3-319-39961-4_23⟩

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titre

Long-term dynamics in microbial eukaryotes communities: a palaeolimnological view based on sedimentary DNA

auteur

Éric Capo, Didier Debroas, Fabien Arnaud, Typhaine Guillemot, Vincent Bichet, Laurent Millet, Emilie Gauthier, Charly Massa, Anne-Lise Develle, Cécile Pignol, Franck Lezjerowicz, Isabelle Domaizon

article

Molecular Ecology, Wiley, 2016, 25 (23), pp.5925-5943. ⟨10.1111/mec.13893⟩

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titre

Dynamics of Viral Abundance and Diversity in a Sphagnum-Dominated Peatland: Temporal Fluctuations Prevail Over Habitat

auteur

Flore Ballaud, Alexis Dufresne, Andre-Jean Francez, Jonathan Colombet, Télesphore Sime-Ngando, Achim Quaiser

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 6, pp.1494. ⟨10.3389/fmicb.2015.01494⟩

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2015

titre

Thermodynamics of selenium sorption on alumina and montmorillonite

auteur

Jean-Pierre Morel, Nicolas Marmier, Charlotte Hurel, Nicole Morel-Desrosiers

article

Cogent Chemistry, Taylor & Francis Online, 2015, 1 (1), ⟨10.1080/23312009.2015.1070943⟩

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titre

Renal replacement therapy in adult and pediatric intensive care: Recommendations by an expert panel from the French Intensive Care Society (SRLF) with the French Society of Anesthesia Intensive Care (SFAR) French Group for Pediatric Intensive Care Emergencies (GFRUP) the French Dialysis Society (SFD)

auteur

Christophe Vinsonneau, Emma Allain-Launay, Clarisse Blayau, Michael Darmon, Damien Ducheyron, Theophile Gaillot, Patrick M. Honore, Etienne Javouhey, Thierry Krummel, Annie Lahoche, Serge Letacon, Matthieu Legrand, Mehran Monchi, Christophe Ridel, Rene Robert, Frédérique Schortgen, Bertrand Souweine, Patrick Vaillant, Lionel Velly, David Osman, Ly Van Vong

article

Annals of Intensive Care, SpringerOpen, 2015, 5 (1), pp.58. ⟨10.1186/s13613-015-0093-5⟩

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titre

Etude des interactions hôte-parasite dans le cadre d'infections par des microsporidies, un groupe de champignons parasites intracellulaires obligatoires

auteur

Johan Panek

article

Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2015. Français. ⟨NNT : 2015CLF22618⟩

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titre

Genome Sequence of a Clinical Klebsiella pneumoniae Sequence Type 6 Strain

auteur

Gabriel Carvalho, Jean-Denis Mathias, Cyril Guilhen, A. Iltis, Christiane Forestier, Damien Balestrino

article

Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2015, 3 (6), pp.1616 - 1627. ⟨10.1128/genomeA.01311-15⟩

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titre

Propriétés mécaniques et durabilité des bétons à base de graviers et sables recyclés issus de béton de démolition

auteur

Layachi Berredjem, Nourredine Arabi, Laurent Molez, Raoul Jauberthie

article

Deuxième Conférence Internationale Francophone Nouveaux Matériaux et Durabilité (NoMad 2015) , Nov 2015, Douai, France

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titre

Devenir et impacts d’un « cocktail » d’herbicides sur des groupes fonctionnels microbiens: élaboration de bioindicateurs de perturbations

auteur

Clarisse Mallet, Pierre Joly, Frédérique Bonnemoy, Pascale Besse-Hoggan, - Legeret B., Olivier Crouzet

article

VIIème colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne, Nov 2015, Anglet, France. 2015

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titre

Structural Diversity of Bacterial Communities Associated with Bloom-Forming Freshwater Cyanobacteria Differs According to the Cyanobacterial Genus

auteur

Imen Louati, Noémie Pascault, Didier Debroas, Cécile Bernard, Jean-François Humbert, Julie Leloup

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (11), pp.e0140614. ⟨10.1371/journal.pone.0140614⟩

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titre

Skin antisepsis with chlorhexidine–alcohol versus povidone iodine–alcohol, with and without skin scrubbing, for prevention of intravascular-catheter-related infection (CLEAN): an open-label, multicentre, randomised, controlled, two-by-two factorial trial

auteur

Olivier Mimoz, Jean-Christophe Lucet, Thomas Kerforne, Julien Pascal, Bertrand Souweine, Véronique Goudet, Alain Mercat, Lila Bouadma, Sigismond Lasocki, Serge Alfandari, Arnaud Friggeri, Florent Wallet, Nicolas Allou, Stephane Ruckly, Dorothée Balayn, Alain Lepape, Jean-François Timsit

article

The Lancet, Elsevier, 2015, 386 (10008), pp.2069-2077. ⟨10.1016/S0140-6736(15)00244-5⟩

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titre

Antimicrosporidian activity of sulphated polysaccharides from algae and their potential to control honeybee nosemosis

auteur

M. Roussel, A. Villay, F. Delbac, Céline Laroche, P. Michaud, D. Roriz, H. El Alaoui, M. Diogon

article

Carbohydrate Polymers, Elsevier, 2015, 133, ⟨10.1016/j.carbpol.2015.07.022⟩

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titre

Is Planktonic Diversity Well Recorded in Sedimentary DNA? Toward the Reconstruction of Past Protistan Diversity

auteur

Eric Capo, Didier Debroas, Fabien Arnaud, Isabelle Domaizon

article

Microbial Ecology, Springer Verlag, 2015, 70 (4), pp.865-875. ⟨10.1007/s00248-015-0627-2⟩

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titre

Contrôle climatique sur la sédimentation et la limnologie du lac Pavin (Auvergne) au cours des derniers 7000 ans

auteur

Léo Chassiot, Emmanuel Chapron, Beauger Aude, Yannick Miras, Patrick Albéric, Ledoux G, Patrick Lajeunesse, Schwab M, Anne-Lise Develle, Fabien Arnaud, Anne-Catherine Lehours, Didier Jezequel

article

15e congrès biannuel de l’ASF, Oct 2015, Chambéry, France

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Metagenomic characterization of viral communities in corals: mining biological signal from methodological noise

auteur

Elisha Wood-Charlson, Karen Weynberg, Curtis Suttle, Simon Roux, Madeleine van Oppen

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2015, 17 (10), pp.3440-3449

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titre

Bat aggregation mediates the functional structure of ant assemblages

auteur

Alain Dejean, Sarah Groc, Bruno Herault, Hector Rodriguez-Perez, Axel Touchard, Régis Céréghino, Jacques H.C. Delabie, Bruno Corbara

article

Comptes Rendus Biologies, Elsevier Masson, 2015, 338 (10), pp.688-695

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titre

European surveillance for enterovirus D68 during the emerging North-American outbreak in 2014

auteur

Randy Poelman, Isabelle Schuffenecker, Coretta van Leer-Buter, Laurence Josset, Hubert G.M. Niesters, Bruno Lina, Escv-Ecdc Ev-D68 Group Mirand A

article

Journal of Clinical Virology, Elsevier, 2015, 71, pp.1 - 9. ⟨10.1016/j.jcv.2015.07.296⟩

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titre

Honeybee Conservation centers in Western Europe: an innovative strategy using sustainable beekeeping to reduce honeybee decline

auteur

Miguel Vilas Boas, Maria Alice Pinto, Catia Neves, Lionel Garnery, Hélène Legout, Sylvie Houte, Jean Francois Odoux, Andone Estonba, Irati Miguel, Iratxe Montes, Noël Mallet, Claude Grenier, Jean-Charles Labat, Luc Champin, Jonathan Colombet, Samuel Guyot, Télesphore Sime-Ngando, Frédéric Delbac, Iris Eouzan, David G. Biron

article

44. Apimondia congress, Sep 2015, Daejon, South Korea. 2015

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titre

Pyrosequencing analysis of bacterial diversity in dental unit waterlines.

auteur

Damien Costa, Anne Mercier, Kevin Gravouil, Jérôme Lesobre, Vincent Delafont, Anne Bousseau, Julien Verdon, Christine Imbert

article

Water Research, IWA Publishing, 2015, 81, pp.223-31. ⟨10.1016/j.watres.2015.05.065⟩

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Protein expression parallels thermal tolerance and ecologic changes in the diversification of a diving beetle species complex

auteur

A Hidalgo-Galiana, M Monge, D G Biron, F Canals, I Ribera, A Cieslak

article

Heredity, Nature Publishing Group, 2015, 116 (1), pp.114 - 123. ⟨10.1038/hdy.2015.80⟩

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titre

Effects of antibiotics on biofilm and unattached cells of a clinical Staphylococcus aureus isolate from bone and joint infection

auteur

Claire Marquès, Jason Tasse, Anne Pracros, Valérie Collin, Christine Franceschi, Frédéric Laurent, Sonia Chatellier, Christiane Forestier

article

Journal of Medical Microbiology, Society for General Microbiology, 2015, 64 (9), pp.1021-1026. ⟨10.1099/jmm.0.000125⟩

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titre

Devenir et impacts d'un « cocktail » d'herbicides sur des groupes fonctionnels microbiens : élaboration de bioindicateurs de perturbations. DevImCocMic

auteur

Clarisse Mallet, Pierre Joly, Frédérique Bonnemoy, Pascale Besse-Hoggan, Fanny Perrière, Nathalie Cheviron, Christelle Marrauld, Olivier Crouzet

article

Séminaire EC2CO de restitution des projets et de prospective ECODYN, Sep 2015, Paris, France

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The Prediction and Validation of Small CDSs Expand the Gene Repertoire of the Smallest Known Eukaryotic Genomes

auteur

Abdel Belkorchia, Cyrielle Gasc, Valérie Polonais, Nicolas Parisot, Nicolas Gallois, Céline Ribière, Emmanuelle Lerat, Christine Gaspin, Jean-François Pombert, Pierre Peyret, Eric Peyretaillade, Cynthia Gibas

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (9), pp.1-12. ⟨10.1371/journal.pone.0139075⟩

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Microbial players involved in the decline of filamentous and colonial cyanobacterial blooms with a focus on fungal parasitism

auteur

Mélanie Gerphagnon, Deborah Macarthur, Delphine Latour, Claire Gachon, Floris van Ogtrop, Frank Gleason, Télesphore Sime-Ngando

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2015, 17 (8), pp.2573-2587

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titre

Systematic and Evolution of Microorganisms: General Concepts

auteur

Charles-Francois Boudouresque, Pierre Caumette, Jean-Claude Bertrand, Philippe Normand, Télesphore Sime-Ngando

article

Jean-Claude Bertrand; Pierre Caumette; Philippe Lebaron; Robert Matheron; Philippe Normand; Télesphore Sime-Ngando. Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.107-144, 2015, 978-94-017-9118-2. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_5⟩

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titre

HIV-1 subtype B-infected MSM may have driven the spread of transmitted resistant strains in France in 2007–12: impact on susceptibility to first-line strategies

auteur

Pierre Frange, Pierre Assoumou, Diane Descamps, Antoine Chéret, Cécile Goujard, Laurent Tran, Marine Gousset, Véronique Avettand-Fenoël, Laurence Bocket, Samira Tran, Jérôme Guinard, Pierre Morand-Joubert, Florence Nicot, Jean-Christophe Plantier, Sylvie Rogez, Pierre Wirden, Christine Rouzioux, Laurence Meyer, Marie-Laure Chaix, S. Abel, B. Abraham, A. Antoniotti, R. Armero, B. Audhuy, H. Aumaitre, G. Beaucaire, G. Beck-Wirth, J.L. Berger, L. Bernard, C. Beuscart, L. Bodard, O. Bouchaud, F. Boue, J.-P. Cabane, A. Cabié, H. Champagne, C. Cheneau, J.-M. Chennebault, A. Cheret, B. Christian, A. Compagnucci, V. Daneluzzi, Y. Debab, P. Dellamonica, F. Delfraissy, A. Devidas, G. Diab, J. Doll, C. Drobacheff-Thebaut, A. Durel, L. Esnault, L. Faba, E. Froguel, D. Garipuy, V. Garrait, L. Geffray, C. Genet, P. Genet, L. Gérard, J. Ghosn, J. Girard, Pascal Girard, C. Godin-Collet, P. Hochedez, B. Hoen, D. Houlbert, C. Jacomet, V. Jeantils, K. Jidar, E. Klement, A. Lafeuillade, V. Launay, A. Leprêtre, Y. Levy, D. Makhloufi, D. Malbec, B. Martha, T. May, D. Merrien, P. Miailhes, C. Miodovski, P. Morlat, E. Mortier, D. Neau, M. Obadia, O. Patey, L. Pellegrin, V. Perronne, P. Philibert, G. Pialoux, G. Pichancourt, L. Piroth, Y. Poinsignon, I. Poizot-Martin, T. Prazuck, V. Prendki, F. Du Clary, D. Quinsat, A. Regnier, J. Reynes, E. Rosenthal, E. Rouveix, D. Salmon, F. Salanville, L. Schmitt, A. Simon-Coutellier, A. Sotto, F. Souala, A. Stein, F. Timsit, P. de Truchis, A. Uludag, O. Vaillant, R. Verdon, A. Verlesch-Langlin, J.-P. Viard, D. Vittecoq, L. Weiss, P. Yéni, D. Zucman, C. Allavena, T. Allegre, I. Amri, B. Autran, C. Bacchus, C. Blanc, S. Bonne, B. Bonne, S. Bouchez, C. Charlier, H. Consigny, C. Duvivier, E. Fourn, F. Guiroy, T. Huleux, C. Katlama, C. Lascoux, A. Leplatois, T. Lyavanc, J.-M. Molina, A. Naqvi, G. Nembot, Y. Quertainmont, F. Raffi, A. Samri, L. Schneider, S. Seang, B. Seksik, M. Shoai-Tehrani, L. Slama, A. Valentin, Y. Yazdanpanah, C. Alloui, C. Amiel, P. André, E. André, G. Anies, F. Barin, P. Bellecave, D. Bettinger, M. Bouvier-Alias, F. Brun-Vézinet, A. Calmy, V. Calvez, W. Caveng, A. Chaillon, S. Chapalay, C. Charpentier, D. Costagliola, J. Cottalorda, C. Delamare, C. Delaugerre, J. Dina, G. Santos, V. Ferre, P. Flandre, H. Fleury, S. Fourati, C. Gaille, G. Giraudeau, A. Guigon, S. Haim-Boukobza, E. Lagier, H. Le Guillou-Guillemette, C. Henquell, Jacques Izopet, Lambert Lambert-Niclot, M. Leroux, A. Maillard, I. Malet, Marc Marcelin, S. Marque-Juillet, B. Masquelier, A. Mirand, P. Morand, B Montes, L. Mouna, C. Noel, C. Pallier, G. Peytavin, P. Pinson-Recordon, J. Poveda, S. Raymond, S. Reigadas, A. Roques, A. de Rougemont, C. Roussel, P. Schmitt, V. Schneider, E. Schvoerer, A. Signori-Schmuck, C. Soulié, C. Tamalet, C. Tardy, A. Trabaud, A. Vabret, S. Vallet, S. Yerly

article

Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2015, 70 (7), pp.2084-2089. ⟨10.1093/jac/dkv049⟩

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Differential permissivity of human cerebrovascular endothelial cells to enterovirus infection and specificities of serotype EV-A71 in crossing an in vitro model of the human blood–brain barrier

auteur

Romain Volle, Christine Archimbaud, Pierre-Olivier Couraud, Ignacio Romero, Babette Weksler, Audrey Mirand, Bruno Pereira, Cécile Henquell, Hélène Peigue-Lafeuille, Jean-Luc Bailly

article

Journal of General Virology, Microbiology Society, 2015, 96 (7), pp.1682 - 1695. ⟨10.1099/vir.0.000103⟩

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titre

Cross-talk in host–parasite associations: What do past and recent proteomics approaches tell us?

auteur

Chérif Chetouhi, Johan Panek, Ludovic Bonhomme, Hicham Elalaoui, Catherine Texier, Thierry Langin, Charissa de Bekker, Serge Urbach, Edith Demettre, Dorothée Missé, Philippe Holzmuller, David P. Hughes, Andreas Zanzoni, Christine Brun, David G. Biron

article

Infection, Genetics and Evolution, Elsevier, 2015, 33, pp.84 - 94. ⟨10.1016/j.meegid.2015.04.015⟩

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The hydrological context determines the beta-diversity of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria in European Arctic seas but does not favor endemism

auteur

Anne-Catherine Lehours, Christian Jeanthon

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6, pp.638. ⟨10.3389/fmicb.2015.00638⟩

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Impact of intestinal dysbiosis on mouse models of colonic hypersensitivity

auteur

F. Carvalho, A. Lashermes, S. Miquel, Rebeca Martin Rosique, A. Gelor, N. Barnich, A. Eschalier, D. Ardid, Muriel Thomas, Philippe Langella

article

NeuroGASTRO 2015, Jun 2015, Istanbul, Turkey. John Wiley and Sons, Neurogastroenterology and Motility, 27 (Suppl. S2), 2015, Neurogastroenterology and Motility

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Draft genome sequence of the intestinal parasite Blastocystis subtype 4-isolate WR1

auteur

Ivan Wawrzyniak, Damien Courtine, Marwan Osman, Christine Hubans-Pierlot, Amandine Cian, Céline Nourrisson, Magali Chabe, Philippe Poirier, Aldert Bart, Valérie Polonais, Pilar Delgado-Viscogliosi, Hicham El Alaoui, Abdel Belkorchia, Tom van Gool, Kevin S.W. Tan, Stéphanie Ferreira, Eric Viscogliosi, Frédéric Delbac

article

Genomics-based Drug Data Report, Prous Science Publishers, 2015, 4, ⟨10.1016/j.gdata.2015.01.009⟩

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titre

How territoriality and host-tree taxa determine the structure of ant mosaics

auteur

Alain Dejean, Suzanne Ryder, Barry Bolton, Arthur Compin, Maurice Leponce, Frédéric Azemar, Régis Céréghino, Jérôme Orivel, Bruno Corbara

article

The Science of Nature Naturwissenschaften, Springer Verlag, 2015, 102 (5-6)

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titre

Les communautés microbiennes photosynthétiques (cyanobactéries et micro-algues) comme bioindicateurs de stress phytosanitaires dans les sols agricoles

auteur

Olivier Crouzet, Sylvie Nelieu, Christelle Marrauld, Ghislaine Delarue, Frédéric Rimet, Annette Berard, Clarisse Mallet

article

45e congrès du Groupe Français des Pesticides, May 2015, Versailles, France. 2015

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titre

Les communautés micro-algales et cyanobactériennes comme bioindicateurs de stress phytosanitaires dans les sols agricoles

auteur

Olivier Crouzet, Sylvie Nelieu, Christelle Marrauld, Ghislaine Delarue, Frédéric Rimet, Annette Berard, Clarisse Mallet

article

45e Congrès du Groupe Français des Pesticides Devenir et impact des pesticides : verrous à lever et nouveaux enjeux, May 2015, Versailles, France

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titre

Contribution à l'amélioration du comportement des routes par l'utilisation de laitier

auteur

Hocine Hadidane, Hocine Oucief, Mouloud Merzoud, Zina Djebbari

article

Rencontres Universitaires de Génie Civil, May 2015, Bayonne, France

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Modélisation d'un portique en situation d'incendie

auteur

Nadia Otmani-Benmehidi

article

Rencontres Universitaires de Génie Civil, May 2015, Bayonne, France

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titre

Contribution a l'amélioration du comportement de la couche de roulement par l'utilisation des polymères

auteur

Hocine Hadidane, Hocine Oucief, Mouloud Merzoud

article

Rencontres Universitaires de Génie Civil, May 2015, Bayonne, France

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Failure of Empirical Systemic Antifungal Therapy in Mechanically Ventilated Critically Ill Patients

auteur

Sébastien Bailly, Lila Bouadma, Élie Azoulay, Maité Garrouste Orgeas, Christophe Adrie, Bertrand Souweine, Carole Schwebel, Danièle Maubon, Rebecca Hamidfar-Roy, Michael Darmon, Michel Wolff, Muriel Cornet, Jean-François Timsit

article

American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, American Thoracic Society, 2015, 191 (10), pp.1139 - 1146. ⟨10.1164/rccm.201409-1701OC⟩

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titre

Editorial: Roles and mechanisms of parasitism in aquatic microbial communities

auteur

Télesphore Sime-Ngando, Kevin Lafferty, David Biron

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6

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titre

The MAST® D68C test: an interesting tool for detecting extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae

auteur

C. Nourrisson, R. N. Tan, C. Hennequin, L. Gibold, R. Bonnet, F. Robin

article

European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2015, 34 (5), pp.975-983. ⟨10.1007/s10096-014-2305-6⟩

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Diversity and comparative genomics of Microviridae in Sphagnum-dominated peatlands

auteur

Achim Quaiser, Alexis Dufresne, Flore Ballaud, Simon Roux, Yvan Zivanovic, Jonathan Colombet, Télesphore Sime-Ngando, Andre-Jean Francez

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6, pp.375. ⟨10.3389/fmicb.2015.00375⟩

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titre

Age of Transfused Blood in Critically Ill Adults

auteur

Jacques Lacroix, Paul C. Hébert, Dean A. Fergusson, Alan Tinmouth, Deborah J. Cook, John C. Marshall, Lucy Clayton, Lauralyn Mcintyre, Jeannie Callum, Alexis F. Turgeon, Morris A. Blajchman, Timothy S. Walsh, Simon J. Stanworth, Helen Campbell, Gilles Capellier, Pierre Tiberghien, Laurent Bardiaux, Leo van de Watering, Nardo J. van der Meer, Elham Sabri, Dong Vo, Canadian Critical Care Trials Group Souweine

article

New England Journal of Medicine, Massachusetts Medical Society, 2015, 372 (15), pp.1410 - 1418. ⟨10.1056/NEJMoa1500704⟩

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titre

Reciprocal protection from natural enemies in an ant-wasp association

auteur

Roger Le Guen, Bruno Corbara, Vivien Rossi, Frédéric Azemar, Alain Dejean

article

Comptes Rendus Biologies, Elsevier Masson, 2015, 338 (4), pp.255-259

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titre

Traits allowing some ant species to nest syntopically with the fire ant Solenopsis saevissima in its native range

auteur

Alain Dejean, Bruno Corbara, Régis Céréghino, Maurice Leponce, Olivier Roux, Vivien Rossi, Jacques Delabie, Arthur Compin

article

Insect Science, Wiley, 2015, 22 (2), pp.289-294

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titre

Acute flaccid myelitis and enteroviruses: an ongoing story

auteur

Audrey Mirand, Hélène Peigue-Lafeuille

article

The Lancet, Elsevier, 2015, 385 (9978), pp.1601 - 1602. ⟨10.1016/S0140-6736(15)60121-0⟩

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Seasonal variations of marine protist community structure based on taxon-specific traits using the eastern English Channel as a model coastal system

auteur

Savvas Genitsaris, Sébastien Monchy, Eric Viscogliosi, Télesphore Sime-Ngando, Stéphanie Ferreira, Urania Christaki

article

FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2015, 91 (5), ⟨10.1093/femsec/fiv034⟩

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In Silico Analysis of Usher Encoding Genes in Klebsiella pneumoniae and Characterization of Their Role in Adhesion and Colonization

auteur

Fida Khater, Damien Balestrino, Nicolas Charbonnel, Jean François Dufayard, Sylvain Brisse, Christiane Forestier

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (3), ⟨10.1371/journal.pone.0116215⟩

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Evidence for an active rare biosphere within freshwater protists community

auteur

Didier Debroas, Mylène Hugoni, Isabelle Domaizon

article

Molecular Ecology Resources, Wiley/Blackwell, 2015, 24 (6), pp.1236-1247. ⟨10.1111/mec.13116⟩

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Mini-P-gp and P-gp Co-Expression in Brown Trout Erythrocytes: A Prospective Blood Biomarker of Aquatic Pollution

auteur

Emeline Valton, Christian Amblard, François Desmolles, Bruno Combourieu, Frédérique Penault-Llorca, Mahchid Bamdad

article

Diagnostics, MDPI, 2015, 5 (1), pp.10-26

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Genomic characteristics and environmental distributions of the uncultivated Far-T4 phages

auteur

Simon Roux, François Enault, Viviane Ravet, Olivier Pereira, Matthew B. Sullivan

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6, pp.199. ⟨10.3389/fmicb.2015.00199⟩

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titre

Genetic diversity along the life cycle of the cyanobacterium M icrocystis : highlight on the complexity of benthic and planktonic interactions

auteur

Marion Sabart, Benjamin Misson, Marlène Jobard, Gisèle Bronner, Florence Donnadieu-Bernard, Emilie Duffaud, Marie-José Salençon, Christian Amblard, Delphine Latour

article

Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2015, 17 (3), pp.901 - 911. ⟨10.1111/1462-2920.12555⟩

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titre

Recurrence of cyanobacterial blooms since 6 thousand years in the French Lake Aydat. Aquatic Sciences: global and regional perspectives

auteur

Marion Sabart, B. Legrand, Yannick Miras, Marlène Lavrieux, Delphine Latour

article

Aquatic Sciences: global and regional perspectives. North Meets South, Association for Sciences of Limnology and Oceanography, Feb 2015, Granada, Spain

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titre

Involvement of type VI secretion systems in virulence of adherent-invasive Escherichia coli isolated from patients with Crohn's disease

auteur

Sébastien Massier, Sylvie Miquel, Nicolas Dreux, Allison Agus, S. Bouhours, Jérémy Denizot, Arlette Darfeuille-Michaud, Nicolas Barnich

article

10. Congress of ECCO. Inflammatory Bowel Diseases, ECCO European Crohn's and Colitis Organization., Feb 2015, Barcelona, Spain

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titre

Aeromonas: a book review

auteur

Telesphore Sime-Ngando

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6

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Aquatic hyphomycetes: a potential source of polyunsaturated fatty acids in detritus-based stream food webs

auteur

J. Arce Funck, A. Bec, F. Perrière, V. Felten, M. Danger

article

Fungal Ecology, Elsevier, 2015, 13, pp.205-210. ⟨10.1016/j.funeco.2014.09.004⟩

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titre

Viral and grazer regulation of prokaryotic growth efficiency in temperate freshwater pelagic environments

auteur

A.S. Pradeep Ram, Jonathan Colombet, Fanny Perrière, Antoine Thouvenot, Télesphore Sime-Ngando

article

FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2015, 91 (2), pp.1-12

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titre

Ordering and surface segregation in Co1−cPtc nanoparticles: A theoretical study from surface alloys to nanoalloys

auteur

A. Lopes, G. Tréglia, C. Mottet, B. Legrand

article

Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics (1998-2015), American Physical Society, 2015, 91, pp.035407

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titre

Microbiomes, plausible players or not in alteration of host behavior

auteur

David Georges Biron, Ludovic Bonhomme, Marianne Coulon, Oyvind Overli

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 5, pp.25628614. ⟨10.3389/fmicb.2014.00775⟩

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titre

Evaluation of real-time RT-PCR Rhino&EV/Cc r-gene® (bioMérieux) kit versions 1 and 2 for rhinovirus detection

auteur

Amélie Brebion, Audrey Mirand, Christel Regagnon, Christine Archimbaud, Martine Chambon, Hélène Peigue-Lafeuille, Cécile Henquell

article

Journal of Clinical Virology, Elsevier, 2015, 62, pp.110 - 113. ⟨10.1016/j.jcv.2014.10.019⟩

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titre

Effects of nutrients and warming on Planktothrix dynamics and diversity: a palaeolimnological view based on sedimentary DNA and RNA

auteur

Olga Savichtcheva, Didier Debroas, Marie Elodie Perga, Fabien Arnaud, Clement Villar, Emilie Lyautey, Amy Kirkham, Cècile Chardon, Benjamin Alric, Isabelle Domaizon

article

Freshwater Biology, Wiley, 2015, 60 (1), pp.31-49. ⟨10.1111/fwb.12465⟩

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titre

Responses of Limagne "Clay/Organic matter-rich" soil microbial communities to realistic formulated herbicide mixtures, including S-metolachlor, mesotrione and nicosulfuron

auteur

Pierre Joly, Frédérique Bonnemoy, Pascale Besse-Hoggan, Fanny Perrière, Olivier Crouzet, Nathalie Cheviron, Clarisse Mallet

article

Water, Air, and Soil Pollution, Springer Verlag, 2015, 226 (12), 413, 15 p. ⟨10.1007/s11270-015-2683-0⟩

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Phase II study of bendamustine, bortezomib and dexamethasone as second-line treatment for elderly patients with multiple myeloma: the Intergroupe Francophone du Myelome 2009-01 trial

auteur

P. Rodon, C. Hulin, B. Pegourie, M. Tiab, B. Anglaret, L. Benboubker, H. Jardel, O. Decaux, B. Kolb, M. Roussel, L. Garderet, X. Leleu, O. Fitoussi, C. Chaleteix, P. Casassus, P. Lenain, B. Royer, A. Banos, R. Benramdane, P. Cony-Makhoul, M. Dib, J. Fontan, A.-M. Stoppa, C. Traulle, J.-P. Vilque, M.-O. Petillon, C. Mathiot, T. Dejoie, H. Avet-Loiseau, P. Moreau

article

Haematologica, Ferrata Storti Foundation, 2015, 100 (2), pp.e56-9. ⟨10.3324/haematol.2014.110890⟩

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titre

Open lung biopsy in nonresolving ARDS frequently identifies diffuse alveolar damage regardless of the severity stage and may have implications for patient management

auteur

Claude Guerin, Frédérique Bayle, Véronique Leray, Sophie Debord, Alina Stoian, Hodane Yonis, Jean-Baptiste Roudaut, Gael Bourdin, Mojgan Devouassoux-Shisheboran, Elodie Bucher, Louis Ayzac, Sylvie Lantuejoul, Carole Philipponnet, Jean Louis Kemeny, Bertrand Souweine, Jean-Christophe Richard

article

Intensive Care Medicine, Springer Verlag, 2015, 41 (2), pp.222 - 230. ⟨10.1007/s00134-014-3583-2⟩

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titre

Enterovirus A71 Subgenotype B5, France, 2013

auteur

Audrey Mirand, Lucie Molet, Chervin Hassel, Hélène Peigue-Lafeuille, Flore Rozenberg, Jean-Luc Bailly, Cécile Henquell

article

Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, 2015, 21 (4), pp.707-709. ⟨10.3201/eid2104.141093⟩

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titre

La biodiversité en Auvergne

auteur

Christian Amblard, Pascal Carrère, Philippe Cochet, Boris Fumanal, Stéphane Herbette, Olivier Villepoux

article

Alliance Universitaire d'Auvergne, Société des amis des Universités, 615-616, 466 p., 2015, Revue d'Auvergne

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titre

Microbial Food Webs in Aquatic and Terrestrial Ecosystems

auteur

Behzad Mostajir, Christian Amblard, Evelyne Buffan-Dubau, Rutger de Wit, Robert Lensi, Telesphore Sime-Ngando

article

Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, pp.485-509, 2015, 978-94-017-9117-5

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titre

Ventilator-Associated Events: Prevalence, Outcome, and Relationship With Ventilator-Associated Pneumonia.

auteur

Lila Bouadma, Romain Sonneville, Maité Garrouste-Orgeas, Michael Darmon, Bertrand Souweine, Guillaume Voiriot, Hatem Kallel, Carole Schwebel, Dany Goldgran-Toledano, Anne-Sylvie Dumenil, Laurent Argaud, Stéphane Ruckly, Samir Jamali, Benjamin Planquette, Christophe Adrie, Jean-Christophe Lucet, Elie Azoulay, Jean-François Timsit

article

Critical Care Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2015, 43 (9), pp.1798 - 1806. ⟨10.1097/CCM.0000000000001091⟩

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titre

Ethanol Lock and Risk of Hemodialysis Catheter Infection in Critically Ill Patients. A Randomized Controlled Trial

auteur

Bertrand Souweine, Alexandre Lautrette, Didier Gruson, Emmanuel Canet, Kada Klouche, Laurent Argaud, Julien Bohe, Maïté Garrouste-Orgeas, Christophe Mariat, François Vincent, Sophie Cayot, Olivier Cointault, Alain Lepape, Dominique Guelon, Michael Darmon, Aurélien Vesin, Nicolas Caillot, Carole Schwebel, Alexandre Boyer, Elie Azoulay, Lila Bouadma, Jean-François Timsit

article

American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, American Thoracic Society, 2015, 191 (9), pp.1024 - 1032. ⟨10.1164/rccm.201408-1431OC⟩

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titre

Levels of intracellular HIV-DNA in patients with suppressive antiretroviral therapy

auteur

Lise Cuzin, Pascal Pugliese, Karine Sandres-Sauné, Clotilde Allavena, Jade Ghosn, Jacqueline Cottalorda, Audrey Rodallec, Marie Laure Chaix, Samira Fafi-Kremer, Cathia Soulié, Marlène Ouka, Charlotte Charpentier, Laurence Bocket, Audrey Mirand, Marguerite Guiguet

article

AIDS, Lippincott, Williams & Wilkins, 2015, 29 (13), pp.1665 - 1671. ⟨10.1097/QAD.0000000000000723⟩

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titre

Hand, Foot and Mouth Disease and Kingella kingae Infections

auteur

Nawal El Houmami, Audrey Mirand, Gregory Dubourg, Derek Hung, Philippe Minodier, Jean-Luc Jouve, Rémi Charrel, Didier Raoult, Pierre-Edouard Fournier

article

Pediatric Infectious Disease Journal, Lippincott, Williams & Wilkins, 2015, 34 (5), pp.547 - 548. ⟨10.1097/INF.0000000000000607⟩

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Vingt ans d'études sur les fourmis en Guyane

auteur

Alex Salas-Lopez, Bruno Corbara, Alain Dejean, Jérôme Orivel

article

Nature guyanaise - 50 ans de progrès et de souvenirs, Orphie, 376 p., 2015, 979-1-02980-043-6

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Temperature: Diet Interactions Affect Survival through Foraging Behavior in a Bromeliad-Dwelling Predator

auteur

Olivier Dézerald, Régis Céréghino, Bruno Corbara, Alain Dejean, Céline Leroy

article

Biotropica, Wiley, 2015, 47 (5), pp.569-578. ⟨10.1111/btp.12249⟩

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Environmental Microbiology: fundamentals and Applications

auteur

Jean-Claude Bertrand, Pierre Caumette, Philippe Lebaron, Robert Matheron, Philippe Normand, Télesphore Sime-Ngando

article

Springer, 2015, 978-94-017-9117-5. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2⟩

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