Unité Mixte de Recherche

Laboratoire Microorganismes : Génome Environnement

Laboratoire Microorganismes : Genome et Environnement

UMR 6023 CNRS / UCA

Adresse :
UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
Tél :
0473407869
Sur Internet :
lmge.uca.fr
Adresse :
Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
Tél :
0473407869
Sur Internet :
lmge.uca.fr
Adresse :


100, Rue de l'Egalité
15000 AURILLAC
Tél :
0473407869
Sur Internet :
lmge.uca.fr

Responsables

Directeur de laboratoire
Didier DEBROAS
Directrice Adjointe
Corinne PETIT
Gestionnaire d'unité
Nathalie FRUQUIERE nathalie.fruquiere@uca.fr

Composition équipe ( effectif total : 108 )

Enseignant-chercheur praticien hosp. (8)
  • ARCHIMBAUD Christine -
  • AUMERAN Claire -
  • HENQUELL Cecile -
  • LAUTRETTE Alexandre -
  • MIRAND Audrey -
  • ROBIN Claire -
  • SOUWEINE Bertrand -
  • TRAORE Ousmane -
Enseignant-chercheur universitaire (38)
  • AGUER Jean Pierre -
  • ARTIGAS ALEJO Joan -
  • BAILLY Jean Luc -
  • BALESTRINO Damien -
  • BATISSON Isabelle -
  • BEC Alexandre -
  • BEIER Sara -
  • BELKORCHIA Abdel -
  • BLOT Nicolas -
  • BONNET Jean Louis -
  • BOUCHARD Philippe -
  • BRONNER Gisele -
  • CARRIAS Jean Francois -
  • CHARPIN Marie Francoise -
  • DEBROAS Didier -
  • DELBAC Frederic -
  • DESVILETTES Christian -
  • DIOGON Marie -
  • DUBUFFET Aurore -
  • EL ALAOUI Hicham -
  • ENAULT Francois -
  • FAURE Catherine -
  • FORESTIER Christiane -
  • GUEIRARD Pascale -
  • JOUAN Isabelle -
  • KOUSSOROPLIS Apostolos Manuel -
  • LATOUR Delphine -
  • LEHOURS Anne Catherine -
  • LEPERE Cecile -
  • MALLET Clarisse -
  • MARY Isabelle -
  • MIQUEL Sylvie -
  • PEYRETAILLADE Eric -
  • POLONAIS Valerie -
  • RAVET Viviane -
  • TEXIER Catherine -
  • VAREILLE DELARBRE Marjolaine -
  • VIVARES Christian -
Praticien hospitalier (2)
  • BREBION Amelie -
  • REGAGNON Christel -
Chercheur (4)
  • ANGIA SRIRAM Pradeep Ram -
  • BRICHEUX Genevieve -
  • PETIT Corinne -
  • SIME NGANDO Telesphore -
Ingénieur de recherche (titulaires et contractuels) (1)
  • FADHLAOUI Khaled -
Ingénieur d'étude / asi (titulaires et contractuels) (11)
  • BARDOT Corinne -
  • BILLARD Hermine -
  • CHARVY Jean Christophe -
  • COLOMBET Jonathan -
  • COURTINE Damien -
  • FRUQUIERE Nathalie -
  • LE JEUNE Anne Helene -
  • MONE Anne Isabelle -
  • PERRIERE Fanny -
  • SARRAN SANVOISIN Maeva -
  • WAWRZYNIAK Ivan -
Post-doc et chercheurs contractuels (1)
  • RUIZ Thomas -
Technicien / administratif (titulaires et contractuels) (16)
  • BEAUDONNAT Stephanie -
  • BISSEUX Maxime -
  • CARRIER Sebastien -
  • CHARBONNEL Nicolas -
  • DONNADIEU BERNARD Florence -
  • GUYOT Samuel -
  • HAMEL Khirredine -
  • JUGIE Gwendoline -
  • LESOBRE Jerome -
  • LYONNET Valerie -
  • MENARD Yoann -
  • OLLIVIER NAKUSI Laurence -
  • PORTELLI Christophe -
  • RODDE Nathalie -
  • SCHEEPERS Mailysia -
  • SIMON Isabelle -
Doctorant (19)
  • ARQUE Maxime -
  • BAKYONO Belele -
  • BONDARABADI Mahya -
  • BOUQUET Clementin -
  • CARRIERE Eugenie -
  • CHARRIER Fanny -
  • CHEUVART Noemie -
  • COMBES Lea -
  • CREUZET Elisa -
  • DONNADIEU Sarah -
  • ESCURA Marine -
  • FOUREL Laura -
  • FRIZOT Nathan -
  • KAUR Manjyot -
  • LALLOUE Pierre-Louis -
  • MASSIT Caroline -
  • MATHIEN Clementine -
  • MOLLARD Emilie -
  • VIDAL Magali -
Autre personnel (8)
  • BOUQUET Clementin -
  • CHABROLLES Helene -
  • CHAT Heloise -
  • CREUZET Elisa -
  • GOSSET Cecile -
  • HABANJAR Ola -
  • KAVANAUGH Devon -
  • PERRUCHE Ophelie -

Equipes

  • BioADAPT, Biodiversité microbienne et adaptations fonctionnelles , Marie Francoise CHARPIN
  • CMES, Communautés microbiennes : écotoxicologie-santé , Christiane FORESTIER
  • EPIE, Epidémiologie et physiopathologie des infections à enterovirus , Jean Luc BAILLY
  • IHP, Interactions hôtes-parasites , Frederic DELBAC
  • IRTA, Interactions dans les réseaux trophiques aquatiques , Christian DESVILETTES
  • MEB, Génomique environnementale et bioinformatique , Cecile LEPERE

Thèmes de Recherche

Invisibles à l’œil nu, les microorganismes représentent pourtant la plus grande partie de la diversité du monde vivant et des fonctions biologiques qui assurent l’évolution de la vie sur notre planète. Seule la connaissance des relations entre changements environnementaux et changements de la diversité des communautés de microorganismes peut permettre, à terme, la maîtrise des processus microbiens qui gouvernent le fonctionnement et la pérennité de notre environnement. Au sein du laboratoire (UMR CNRS 6023), plus de 110 chercheurs, enseignant-chercheurs, praticiens hospitaliers, ingénieurs, techniciens et contractuels, répartis dans 6 équipes de recherche, travaillent actuellement sur les microorganismes procaryotes et eucaryotes (Archées, Bactéries, Protistes, Champignons), ainsi que sur les virus, depuis les aspects moléculaires et cellulaires jusqu’aux rôles de ces organismes dans les écosystèmes. La spécificité du laboratoire consiste à associer, au sein d’une même structure, des compétences au niveau de la génomique et de la post-génomique d’une part, et au niveau de la biologie des populations et des écosystèmes et de l’écologie, d’autre part. Une autre spécificité de l’unité réside dans son positionnement renforcé à l’interface environnement – santé, ce qui lui permet de mener des recherches liées aux enjeux scientifiques émergents dans le domaine de l’écologie de la santé. Notre démarche vise donc à rapprocher génome, environnement et santé, en mettant les concepts et les outils de génomique et de post-génomique au service de questions scientifiques ayant trait au fonctionnement des écosystèmes et à l’écologie de la santé. La stratégie scientifique de l’unité est construite autour de 3 grands domaines scientifiques : (i) parasitisme et écosystèmes microbiens, (ii) écologie trophique et fonctionnelle, (iii) écologie de la santé et écotoxicologie. Plus précisément, les microorganismes sont étudiés en tant que acteurs essentiels (i) dans le fonctionnement des écosystèmes (notamment aquatiques et terrestres) sous forçage naturel et/ou anthropique, (ii) dans l’analyse des risques liés à l’introduction de contaminants biotiques et abiotiques, et (iii) comme sources de maladies infectieuses en lien avec des problématiques environnementales (nosémoses d’abeilles, maladies émergentes, infections nosocomiales, présence d’entérovirus et autres pathogènes, circulation des gènes de résistance aux antibiotiques,…). Ces recherches, fondamentales, sont porteuses d’enjeux socio-économiques et biotechnologiques, dans les domaines de la gestion des ressources naturelles, des services écosystémiques et de la santé humaine et animale

Publications ( HAL )

Production scientifique depuis 2020

Brevets (1)
  • PROCEDE DE BIOMETHANATION EX-SITU - 2022