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Unité Mixte de Recherche
Laboratoire Microorganismes : Génome Environnement
UMR 6023 CNRS / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
-
100, Rue de l'Egalité
15000 AURILLAC
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Didier DEBROAS
- Directrice Adjointe
- Corinne PETIT
- Gestionnaire d'unité
- Nathalie FRUQUIERE nathalie.fruquiere@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 103 )
- ARCHIMBAUD Christine -
- AUMERAN Claire -
- HENQUELL Cecile -
- LAUTRETTE Alexandre -
- LESENS Olivier -
- MIRAND Audrey -
- ROBIN Claire -
- SOUWEINE Bertrand -
- TRAORE Ousmane -
- AGUER Jean Pierre -
- ARTIGAS ALEJO Joan -
- BAILLY Jean Luc -
- BALESTRINO Damien -
- BATISSON Isabelle -
- BEC Alexandre -
- BELKORCHIA Abdel -
- BLOT Nicolas -
- BONNET Jean Louis -
- BOUCHARD Philippe -
- BRONNER Gisele -
- CARRIAS Jean Francois -
- CHARPIN Marie Francoise -
- CORBARA Bruno -
- DEBROAS Didier -
- DELBAC Frederic -
- DESVILETTES Christian -
- DIOGON Marie -
- DUBUFFET Aurore -
- EL ALAOUI Hicham -
- ENAULT Francois -
- FAURE Catherine -
- FORESTIER Christiane -
- GUEIRARD Pascale -
- JOUAN Isabelle -
- KOUSSOROPLIS Apostolos Manuel -
- LATOUR Delphine -
- LEHOURS Anne Catherine -
- LEPERE Cecile -
- MALLET Clarisse -
- MARY Isabelle -
- MIQUEL Sylvie -
- PEYRETAILLADE Eric -
- POLONAIS Valerie -
- RAVET Viviane -
- TEXIER Catherine -
- VAREILLE DELARBRE Marjolaine -
- VIVARES Christian -
- BREBION Amelie -
- REGAGNON Christel -
- ANGIA SRIRAM Pradeep Ram -
- BRICHEUX Genevieve -
- PETIT Corinne -
- SIME NGANDO Telesphore -
- FADHLAOUI Khaled -
- BARDOT Corinne -
- BILLARD Hermine -
- CHARVY Jean Christophe -
- COLOMBET Jonathan -
- COURTINE Damien -
- FRUQUIERE Nathalie -
- GUERIN Lucie -
- LE JEUNE Anne Helene -
- MONE Anne Isabelle -
- MONJOT Arthur -
- PERRIERE Fanny -
- SARRAN SANVOISIN Maeva -
- WAWRZYNIAK Ivan -
- PARIS Laurianne -
- RUIZ Thomas -
- BISSEUX Maxime -
- CHARBONNEL Nicolas -
- DONNADIEU BERNARD Florence -
- GUYOT Samuel -
- JUGIE Gwendoline -
- KERBRAT Celia -
- LESOBRE Jerome -
- LYONNET Valerie -
- OLLIVIER NAKUSI Laurence -
- PORTELLI Christophe -
- RODDE Nathalie -
- SIMON Isabelle -
- ARQUE Maxime -
- BAKYONO Belele -
- BONDARABADI Mahya -
- BOUQUET Clementin -
- CARRIERE Eugenie -
- CHEUVART Noemie -
- COMBES Lea -
- DHOMMEE Roxane -
- ESCURA Marine -
- FRIZOT Nathan -
- GAUME Lea -
- GILBERT Juliette -
- KAUR Manjyot -
- LALLOUE Pierre-Louis -
- MASSIT Caroline -
- MATHIEN Clementine -
- MOLLARD Emilie -
- VAN BAELEN Marine -
- VERLAGUET Julien -
- VIDAL Magali -
- CHABROLLES Helene -
- CREUZET Elisa -
Equipes
- BioADAPT, Biodiversité microbienne et adaptations fonctionnelles , Marie Francoise CHARPIN
- CMES, Communautés microbiennes : écotoxicologie-santé , Christiane FORESTIER
- EPIE, Epidémiologie et physiopathologie des infections à enterovirus , Jean Luc BAILLY
- IHP, Interactions hôtes-parasites , Frederic DELBAC
- IRTA, Interactions dans les réseaux trophiques aquatiques , Christian DESVILETTES
- MEB, Génomique environnementale et bioinformatique , Cecile LEPERE
Thèmes de Recherche
Invisibles à l’œil nu, les microorganismes représentent pourtant la plus grande partie de la diversité du monde vivant et des fonctions biologiques qui assurent l’évolution de la vie sur notre planète. Seule la connaissance des relations entre changements environnementaux et changements de la diversité des communautés de microorganismes peut permettre, à terme, la maîtrise des processus microbiens qui gouvernent le fonctionnement et la pérennité de notre environnement. Au sein du laboratoire (UMR CNRS 6023), plus de 110 chercheurs, enseignant-chercheurs, praticiens hospitaliers, ingénieurs, techniciens et contractuels, répartis dans 6 équipes de recherche, travaillent actuellement sur les microorganismes procaryotes et eucaryotes (Archées, Bactéries, Protistes, Champignons), ainsi que sur les virus, depuis les aspects moléculaires et cellulaires jusqu’aux rôles de ces organismes dans les écosystèmes. La spécificité du laboratoire consiste à associer, au sein d’une même structure, des compétences au niveau de la génomique et de la post-génomique d’une part, et au niveau de la biologie des populations et des écosystèmes et de l’écologie, d’autre part. Une autre spécificité de l’unité réside dans son positionnement renforcé à l’interface environnement – santé, ce qui lui permet de mener des recherches liées aux enjeux scientifiques émergents dans le domaine de l’écologie de la santé. Notre démarche vise donc à rapprocher génome, environnement et santé, en mettant les concepts et les outils de génomique et de post-génomique au service de questions scientifiques ayant trait au fonctionnement des écosystèmes et à l’écologie de la santé. La stratégie scientifique de l’unité est construite autour de 3 grands domaines scientifiques : (i) parasitisme et écosystèmes microbiens, (ii) écologie trophique et fonctionnelle, (iii) écologie de la santé et écotoxicologie. Plus précisément, les microorganismes sont étudiés en tant que acteurs essentiels (i) dans le fonctionnement des écosystèmes (notamment aquatiques et terrestres) sous forçage naturel et/ou anthropique, (ii) dans l’analyse des risques liés à l’introduction de contaminants biotiques et abiotiques, et (iii) comme sources de maladies infectieuses en lien avec des problématiques environnementales (nosémoses d’abeilles, maladies émergentes, infections nosocomiales, présence d’entérovirus et autres pathogènes, circulation des gènes de résistance aux antibiotiques,…). Ces recherches, fondamentales, sont porteuses d’enjeux socio-économiques et biotechnologiques, dans les domaines de la gestion des ressources naturelles, des services écosystémiques et de la santé humaine et animale
Publications ( HAL )
- Influence of tides on the dissemination and related health risks of intestinal helminths along the Kribi beaches (Atlantic Coast, Southern Cameroon)
P A Nana , S Tchakonté , A L Fotseu Kouam , R S Mouchili Palena , G Bricheux , M Nola , T Sime-Ngando - Unveiling the above-ground eukaryotic diversity supported by individual large old trees: the “Life on Trees” integrative protocol
Maurice Leponce , Yves Basset , Ángela Aristizábal-Botero , Noui Baïben , Jérôme Barbut , Bart Buyck , Philip Butterill , Kim Calders , Glenda Cárdenas , Jean-François Carrias , Damien Catchpole , Barbara D’hont , Jacques H.C. Delabie , Jochen Drescher , Damien Ertz , André Heughebaert , Valérie Hofstetter , Celine Leroy , Frédéric Melki , Johan Michaux - Les cyanobactéries benthiques : facteurs de prolifération et risques écologiques dans les eaux continentales
Sylvain Dolédec , Joël Robin , Charlotte Robichon , Delphine Latour , Fanny Perriere - The Honeybee Gut Microbiota Is Altered after Chronic Exposure to Different Families of Insecticides and Infection by <i>Nosema ceranae</i>
Régis Rouzé , Anne Moné , Frédéric Delbac , Luc Belzunces , Nicolas Blot - Parasitic Chytrids sustain zooplankton growth during inedible algal bloom.
Serena Rasconi , Boutheina Grami , Nathalie Niquil , Marlène Jobard , Télesphore Sime-Ngando - Activité antimicrosporidienne de polysaccharides sulfatés provenant d'algues et leur potentiel de lutte contre la nosémose des abeille domestiques
M. Roussel , A. Villay , F. Delbac , P. Michaud , C. Laroche , D. Roriz , H. El Alaoui , M. Diogon - On behalf on the Medicen microbiome drug metabolism working group. Gut microbiome integration in drug discovery and development of small molecules opportunities and recommendations
Patrick Jimonet , Coline Druart , Stéphanie Blanquet-Diot , Luca Boucinha , Stephanie Kourula , Françoise Le Vacon , Sylvie Maubant , Sylvie Rabot , Tom van de Wiele , Frank Schuren , Thomas V , Wlather B , Zimmerman M - First clinical description of letermovir resistance mutation in cytomegalovirus UL51 gene and potential impact on the terminase complex structure
Clotilde Muller , Valentin Tilloy , Emilie Frobert , Linda Feghoul , Isabelle Garrigue , Quentin Lepiller , Audrey Mirand , Egor Sidorov , Sébastien Hantz , Sophie Alain - Enterovirus meningitis in Mayotte French Comoros Island, March-June 2019
Jacques Fourgeaud , Audrey Mirand , Justine Demortier , Laure Kamus , Louis Collet , Sophie Olivier , Cécile Henquell , Christelle Vauloup-Fellous - Tick ecology and Lyme borreliosis prevention: a regional survey of pharmacists’ knowledge in Auvergne-Rhône-Alpes, France
Severine Bord , Sylvain Dernat , Laetitia Ouillon , Magalie René-Martellet , Gwenaël Vourc’h , Olivier Lesens , Christiane Forestier , Isabelle Lebert
Production scientifique depuis 2020
- PROCEDE DE BIOMETHANATION EX-SITU - 2022