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Unité Mixte de Recherche
Laboratoire Microorganismes : Génome Environnement

UMR 6023 CNRS / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
-
100, Rue de l'Egalité
15000 AURILLAC
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Didier DEBROAS
- Directrice Adjointe
- Corinne PETIT
- Gestionnaire d'unité
- Nathalie FRUQUIERE nathalie.fruquiere@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 113 )
- ARCHIMBAUD Christine -
- AUMERAN Claire -
- HENQUELL Cecile -
- LAUTRETTE Alexandre -
- LESENS Olivier -
- MIRAND Audrey -
- ROBIN Claire -
- SOUWEINE Bertrand -
- TRAORE Ousmane -
- AGUER Jean Pierre -
- ARTIGAS ALEJO Joan -
- BAILLY Jean Luc -
- BALESTRINO Damien -
- BATISSON Isabelle -
- BEC Alexandre -
- BELKORCHIA Abdel -
- BLOT Nicolas -
- BONNET Jean Louis -
- BOUCHARD Philippe -
- BRONNER Gisele -
- CARRIAS Jean Francois -
- CHARPIN Marie Francoise -
- CORBARA Bruno -
- DEBROAS Didier -
- DELBAC Frederic -
- DESVILETTES Christian -
- DIOGON Marie -
- DUBUFFET Aurore -
- EL ALAOUI Hicham -
- ENAULT Francois -
- FAURE Catherine -
- FORESTIER Christiane -
- GUEIRARD Pascale -
- JOUAN Isabelle -
- KOUSSOROPLIS Apostolos Manuel -
- LATOUR Delphine -
- LEHOURS Anne Catherine -
- LEPERE Cecile -
- MALLET Clarisse -
- MARY Isabelle -
- MIQUEL Sylvie -
- PEYRETAILLADE Eric -
- POLONAIS Valerie -
- RAVET Viviane -
- TEXIER Catherine -
- VAREILLE DELARBRE Marjolaine -
- VIVARES Christian -
- BREBION Amelie -
- REGAGNON Christel -
- ANGIA SRIRAM Pradeep Ram -
- BRICHEUX Genevieve -
- PETIT Corinne -
- SIME NGANDO Telesphore -
- FADHLAOUI Khaled -
- FUSTER Maxime -
- BARDOT Corinne -
- CHARVY Jean-Christophe -
- COLOMBET Jonathan -
- COURTINE Damien -
- FRUQUIERE Nathalie -
- GUERIN Lucie -
- LE JEUNE Anne Helene -
- MENARD Yoann -
- MONE Anne Isabelle -
- PERRIERE Fanny -
- SANVOISIN Maeva -
- TERZIAN Paul -
- WAWRZYNIAK Ivan -
- DRAME Ibrahima -
- PARIS Laurianne -
- TORTUEL Damien -
- BATISTA Sylvine -
- BILLARD Hermine -
- BISSEUX Maxime -
- CHARBONNEL Nicolas -
- CONNOIS Victorien -
- DONNADIEU BERNARD Florence -
- GUYOT Samuel -
- JUGIE Gwendoline -
- KERBRAT Celia -
- LESOBRE Jerome -
- LYONNET Valerie -
- MARCHAL Gaelle -
- OLLIVIER NAKUSI Laurence -
- PORTELLI Christophe -
- RODDE Nathalie -
- SCHEEPERS Mailysia -
- SIMON Isabelle -
- AKOSSI Reginald Florian -
- BAKYONO Belele -
- BONDARABADI Mahya -
- BOUQUET Clementin -
- CARRIERE Eugenie -
- DHOMMEE Roxane -
- ESCURA Marine -
- FERNANDES Vincent -
- FRIZOT Nathan -
- GAUME Lea -
- GILBERT Juliette -
- KAUR Manjyot -
- LAFFET Lucie -
- LALLOUE Pierre-Louis -
- MASSIT Caroline -
- MATHIEN Clementine -
- MONJOT Arthur -
- NOIRMAIN Fanny -
- SBAGHDI Thania -
- VAN BAELEN Marine -
- VERLAGUET Julien -
- VIDAL Magali -
- CHABROLLES Helene -
- CHEUVART Noemie -
- CREUZET Elisa -
Equipes
- BioADAPT, Biodiversité microbienne et adaptations fonctionnelles , Marie Francoise CHARPIN
- CMES, Communautés microbiennes : écotoxicologie-santé , Christiane FORESTIER
- EPIE, Epidémiologie et physiopathologie des infections à enterovirus , Jean Luc BAILLY
- IHP, Interactions hôtes-parasites , Frederic DELBAC
- IRTA, Interactions dans les réseaux trophiques aquatiques , Christian DESVILETTES
- MEB, Génomique environnementale et bioinformatique , Cecile LEPERE
Thèmes de Recherche
Invisibles à l’œil nu, les microorganismes représentent pourtant la plus grande partie de la diversité du monde vivant et des fonctions biologiques qui assurent l’évolution de la vie sur notre planète. Seule la connaissance des relations entre changements environnementaux et changements de la diversité des communautés de microorganismes peut permettre, à terme, la maîtrise des processus microbiens qui gouvernent le fonctionnement et la pérennité de notre environnement. Au sein du laboratoire (UMR CNRS 6023), plus de 110 chercheurs, enseignant-chercheurs, praticiens hospitaliers, ingénieurs, techniciens et contractuels, répartis dans 6 équipes de recherche, travaillent actuellement sur les microorganismes procaryotes et eucaryotes (Archées, Bactéries, Protistes, Champignons), ainsi que sur les virus, depuis les aspects moléculaires et cellulaires jusqu’aux rôles de ces organismes dans les écosystèmes. La spécificité du laboratoire consiste à associer, au sein d’une même structure, des compétences au niveau de la génomique et de la post-génomique d’une part, et au niveau de la biologie des populations et des écosystèmes et de l’écologie, d’autre part. Une autre spécificité de l’unité réside dans son positionnement renforcé à l’interface environnement – santé, ce qui lui permet de mener des recherches liées aux enjeux scientifiques émergents dans le domaine de l’écologie de la santé. Notre démarche vise donc à rapprocher génome, environnement et santé, en mettant les concepts et les outils de génomique et de post-génomique au service de questions scientifiques ayant trait au fonctionnement des écosystèmes et à l’écologie de la santé. La stratégie scientifique de l’unité est construite autour de 3 grands domaines scientifiques : (i) parasitisme et écosystèmes microbiens, (ii) écologie trophique et fonctionnelle, (iii) écologie de la santé et écotoxicologie. Plus précisément, les microorganismes sont étudiés en tant que acteurs essentiels (i) dans le fonctionnement des écosystèmes (notamment aquatiques et terrestres) sous forçage naturel et/ou anthropique, (ii) dans l’analyse des risques liés à l’introduction de contaminants biotiques et abiotiques, et (iii) comme sources de maladies infectieuses en lien avec des problématiques environnementales (nosémoses d’abeilles, maladies émergentes, infections nosocomiales, présence d’entérovirus et autres pathogènes, circulation des gènes de résistance aux antibiotiques,…). Ces recherches, fondamentales, sont porteuses d’enjeux socio-économiques et biotechnologiques, dans les domaines de la gestion des ressources naturelles, des services écosystémiques et de la santé humaine et animale
Publications ( HAL )
- Methanomethylophilus alvi gen. nov., sp. nov., a Novel Hydrogenotrophic Methyl-Reducing Methanogenic Archaea of the Order Methanomassiliicoccales Isolated from the Human Gut and Proposal of the Novel Family Methanomethylophilaceae fam. nov.
Guillaume Borrel , Khaled Fadhlaoui , Wajdi Ben Hania , Nadia Gaci , Gérard Pehau-Arnaudet , Prem Prashant Chaudhary , Pascal Vandekerckove , Nathalie Ballet , Monique Alric , Paul William O’toole , Marie-Laure Fardeau , Bernard Ollivier , Jean-François Brugère - High-quality genome of the basidiomycete yeast Dioszegia hungarica PDD-24b-2 isolated from cloud water
Domitille Jarrige , Sajeet Haridas , Claudine Bleykasten-Grosshans , Muriel Joly , Thierry Nadalig , Martine Sancelme , Stéphane Vuilleumier , Igor Grigoriev , Pierre Amato , Françoise Bringel - Improvement of the knowledge of diatom ecology by coupling geochemistry, radioactivity and taxa inventory in thermo-mineral springs of a volcanic and upland area in south-central France, the Massif Central
Lory-Anne Baker , Hélène Celle , Olivier Voldoire , Carlos Wetzel , Elisabeth Allain , Luc Ector , Vincent Breton , David Biron , Gilles Mailhot , Jean-Luc Devidal , Aude Beauger - FAECALIBACTERIUM PRAUSNITZII STRAINS FOR TREATING AND PREVENTING GASTROINTESTINAL PAIN
Muriel Thomas , Philippe P. Langella , Luis Bermúdez-Humarán , Harry Sokol , Sylvie Miquel , Rebeca MARTIN ROSIQUE , Frédéric Carvalho , Vassilia Théodorou - Environmental determinants of macroinvertebrate diversity in small water bodies: insights from tank-bromeliads
Olivier Dézerald , Stanislas Talaga , Céline Leroy , Jean-François Carrias , Bruno Corbara , Alain Dejean , Régis Céréghino - Understorey environments influence functional diversity in tank-bromeliad ecosystems
Olivier Brouard , Régis Cereghino , Bruno Corbara , Céline Leroy , Laurent Pelozuelo , Alain Dejean , Jean-François Carrias - Archaea, specific genetic traits, and development of improved bacterial live biotherapeutic products: another face of next-generation probiotics
Khaled Fadhlaoui , Marie-Edith Arnal , Matthieu Martineau , Paméla Camponova , Bernard Ollivier , Paul O’toole , Jean-François Brugère - Effect of light on competition between the picocyanobacterium Merismopedia punctata and Microcystis aeruginosa
Noémie Cheuvart , Benjamin Legrand , Fanny Perriere , Apostolos‐manuel Koussoroplis , Anne-Hélène Le Jeune , Delphine Latour , Laurianne Paris - Effect of water temperature on a phycocyanin probe for monitoring cyanobacteria and its effectiveness on biomass estimation of three cyanobacteria morphotypes
Laurianne Paris , Mathilde Dutaut , Sylvain Coly , David Foltier , Benoît Gire , Marianne Coulon , Antoine Thouvenot , Delphine Latour , Benjamin Legrand - The Pharaoh's snakes of the teasel: New insights into F rancis Darwin's observations
Antoine Vergne , Eric Giraud , Alicia Camuel , Corinne Bardot , Hermine Billard , Clémentin Bouquet , Bruno Corbara , Djamel Gully , Frédéric Mathonat , Christian Jeanthon , Isabelle Mary , Jean‐claude Caissard , Anne‐catherine Lehours
Production scientifique depuis 2019
- Composition pharmaceutique comprenant un gallate d'alkyle et son utilisation dans la prévention et/ou le traitement des infections du tube digestif chez l'animal - 2019
- PROCEDE DE BIOMETHANATION EX-SITU - 2022