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Unité Mixte de Recherche
Laboratoire Microorganismes : Génome Environnement
UMR 6023 CNRS / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
-
100, Rue de l'Egalité
15000 AURILLAC
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Didier DEBROAS
- Directrice Adjointe
- Corinne PETIT
- Gestionnaire d'unité
- Nathalie FRUQUIERE nathalie.fruquiere@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 107 )
- ARCHIMBAUD Christine -
- AUMERAN Claire -
- HENQUELL Cecile -
- LAUTRETTE Alexandre -
- MIRAND Audrey -
- ROBIN Claire -
- SOUWEINE Bertrand -
- TRAORE Ousmane -
- AGUER Jean Pierre -
- ARTIGAS ALEJO Joan -
- BAILLY Jean Luc -
- BALESTRINO Damien -
- BATISSON Isabelle -
- BEC Alexandre -
- BELKORCHIA Abdel -
- BLOT Nicolas -
- BONNET Jean Louis -
- BOUCHARD Philippe -
- BRONNER Gisele -
- CARRIAS Jean Francois -
- CHARPIN Marie Francoise -
- DEBROAS Didier -
- DELBAC Frederic -
- DESVILETTES Christian -
- DIOGON Marie -
- DUBUFFET Aurore -
- EL ALAOUI Hicham -
- ENAULT Francois -
- FAURE Catherine -
- FORESTIER Christiane -
- GUEIRARD Pascale -
- JOUAN Isabelle -
- KOUSSOROPLIS Apostolos Manuel -
- LATOUR Delphine -
- LEHOURS Anne Catherine -
- LEPERE Cecile -
- MALLET Clarisse -
- MARY Isabelle -
- MIQUEL Sylvie -
- PEYRETAILLADE Eric -
- POLONAIS Valerie -
- RAVET Viviane -
- TEXIER Catherine -
- VAREILLE DELARBRE Marjolaine -
- VIVARES Christian -
- BREBION Amelie -
- REGAGNON Christel -
- ANGIA SRIRAM Pradeep Ram -
- BRICHEUX Genevieve -
- PETIT Corinne -
- SIME NGANDO Telesphore -
- FADHLAOUI Khaled -
- BARDOT Corinne -
- BILLARD Hermine -
- CHARVY Jean Christophe -
- COLOMBET Jonathan -
- COURTINE Damien -
- FRUQUIERE Nathalie -
- GUERIN Lucie -
- LE JEUNE Anne Helene -
- MONE Anne Isabelle -
- PERRIERE Fanny -
- SARRAN SANVOISIN Maeva -
- WAWRZYNIAK Ivan -
- RUIZ Thomas -
- BEAUDONNAT Stephanie -
- BISSEUX Maxime -
- CARRIER Sebastien -
- CHARBONNEL Nicolas -
- DONNADIEU BERNARD Florence -
- GUYOT Samuel -
- HAMEL Khirredine -
- JUGIE Gwendoline -
- LESOBRE Jerome -
- LYONNET Valerie -
- MENARD Yoann -
- OLLIVIER NAKUSI Laurence -
- PORTELLI Christophe -
- RODDE Nathalie -
- SCHEEPERS Mailysia -
- SIMON Isabelle -
- ARQUE Maxime -
- BAKYONO Belele -
- BONDARABADI Mahya -
- BOUQUET Clementin -
- CARRIERE Eugenie -
- CHARRIER Fanny -
- CHEUVART Noemie -
- COMBES Lea -
- CREUZET Elisa -
- DONNADIEU Sarah -
- ESCURA Marine -
- FRIZOT Nathan -
- GAUME Lea -
- GILBERT Juliette -
- KAUR Manjyot -
- LALLOUE Pierre-Louis -
- MASSIT Caroline -
- MATHIEN Clementine -
- MOLLARD Emilie -
- VAN BAELEN Marine -
- VERLAGUET Julien -
- VIDAL Magali -
- CHABROLLES Helene -
- CREUZET Elisa -
- GOSSET Cecile -
- PERRUCHE Ophelie -
Equipes
- BioADAPT, Biodiversité microbienne et adaptations fonctionnelles , Marie Francoise CHARPIN
- CMES, Communautés microbiennes : écotoxicologie-santé , Christiane FORESTIER
- EPIE, Epidémiologie et physiopathologie des infections à enterovirus , Jean Luc BAILLY
- IHP, Interactions hôtes-parasites , Frederic DELBAC
- IRTA, Interactions dans les réseaux trophiques aquatiques , Christian DESVILETTES
- MEB, Génomique environnementale et bioinformatique , Cecile LEPERE
Thèmes de Recherche
Invisibles à l’œil nu, les microorganismes représentent pourtant la plus grande partie de la diversité du monde vivant et des fonctions biologiques qui assurent l’évolution de la vie sur notre planète. Seule la connaissance des relations entre changements environnementaux et changements de la diversité des communautés de microorganismes peut permettre, à terme, la maîtrise des processus microbiens qui gouvernent le fonctionnement et la pérennité de notre environnement. Au sein du laboratoire (UMR CNRS 6023), plus de 110 chercheurs, enseignant-chercheurs, praticiens hospitaliers, ingénieurs, techniciens et contractuels, répartis dans 6 équipes de recherche, travaillent actuellement sur les microorganismes procaryotes et eucaryotes (Archées, Bactéries, Protistes, Champignons), ainsi que sur les virus, depuis les aspects moléculaires et cellulaires jusqu’aux rôles de ces organismes dans les écosystèmes. La spécificité du laboratoire consiste à associer, au sein d’une même structure, des compétences au niveau de la génomique et de la post-génomique d’une part, et au niveau de la biologie des populations et des écosystèmes et de l’écologie, d’autre part. Une autre spécificité de l’unité réside dans son positionnement renforcé à l’interface environnement – santé, ce qui lui permet de mener des recherches liées aux enjeux scientifiques émergents dans le domaine de l’écologie de la santé. Notre démarche vise donc à rapprocher génome, environnement et santé, en mettant les concepts et les outils de génomique et de post-génomique au service de questions scientifiques ayant trait au fonctionnement des écosystèmes et à l’écologie de la santé. La stratégie scientifique de l’unité est construite autour de 3 grands domaines scientifiques : (i) parasitisme et écosystèmes microbiens, (ii) écologie trophique et fonctionnelle, (iii) écologie de la santé et écotoxicologie. Plus précisément, les microorganismes sont étudiés en tant que acteurs essentiels (i) dans le fonctionnement des écosystèmes (notamment aquatiques et terrestres) sous forçage naturel et/ou anthropique, (ii) dans l’analyse des risques liés à l’introduction de contaminants biotiques et abiotiques, et (iii) comme sources de maladies infectieuses en lien avec des problématiques environnementales (nosémoses d’abeilles, maladies émergentes, infections nosocomiales, présence d’entérovirus et autres pathogènes, circulation des gènes de résistance aux antibiotiques,…). Ces recherches, fondamentales, sont porteuses d’enjeux socio-économiques et biotechnologiques, dans les domaines de la gestion des ressources naturelles, des services écosystémiques et de la santé humaine et animale
Publications ( HAL )
- Perkinsea: what the hell are they doing in freshwater lake ecosystem
Ivan Wawrzyniak , Gisèle Bronner , Arthur Monjot , Marina Chauvet , Agnès Vellet , Corinne Cruaud , Jean-Marc Aury , Didier Debroas , Cécile Lepère - SARS-CoV2 pneumonia patients admitted to the ICU: Analysis according to clinical and biological parameters and the extent of lung parenchymal lesions on chest CT scan, a monocentric observational study
Abed Al Hadi Krisht , Kévin Grapin , Romain Chauvot de Beauchene , Benjamin Bonnet , Lucie Cassagnes , Bertrand Evrard , Mireille Adda , Bertrand Souweine , Claire Dupuis - La “bioremédiation préventive” pour réduire la diffusion des pesticides.
I. Batisson , L. Carles , P. Besse-Hoggan - Improvement of the knowledge of diatom ecology by coupling geochemistry, radioactivity and taxa inventory in thermo-mineral springs of a volcanic and upland area in south-central France, the Massif Central
Lory-Anne Baker , Hélène Celle , Olivier Voldoire , Carlos Wetzel , Elisabeth Allain , Luc Ector , Vincent Breton , David Biron , Gilles Mailhot , Jean-Luc Devidal , Aude Beauger - Ice nucleation active bacteria and bioprecipitation
Pierre Amato - Benthic Macroinvertebrate Communities as Indicator of the Water Quality of a Suburban Stream in the Littoral Region of Cameroon
Nectaire Lié Nyamsi Tchatcho , Paul Alain Nana , Ernest Koji , Siméon Tchakonté , Yolande Elsa Lando Zangue , Prospère Jeunemi Keu , Geneviève Bricheux , Télesphore Sime-Ngando - Diversity and Antibiotic Susceptibility of Extended-Spectrum Beta-Lactamase-Producing Enterobacteriaceae from the Urine of Human Population Using Bacteria-Contaminated Water in Butembo Urban Area (DR Congo, Central Africa)
Mwanzo Wavindu , Edith Tamnou , Ildephonse Soly Kamwira , Rosanne Ngome , GENEVIEVE BRICHEUX , Paul Alain Nana , Maximilienne Nyegue , Télesphore Sime-Ngando , Moïse Nola - Susceptibility of some Enterobacteriaceae isolated from 4 different aquatic environments in DR Congo (Central Africa), to Amoxicillin/Clavulanic acid and some 3rd generation Cephalosporins
Mwanzo Wavindu , Edith Mouafo Tamnou , Ildephonse Soly Kamwira , Ngome M Rosanne , Paul Alain Nana , Geneviève Bricheux , Maximilienne Ascension Nyegue , Télesphore Sime-Ngando , Moïse Nola - Biological interactions involving the myrmecophyte Hirtella physophora and its associates
Alain Dejean , Celine Leroy , Bruno Corbara , Frédéric Azemar , Jérôme Orivel - Expert Opinion Elicitation for Assisting Deep Learning based Lyme Disease Classifier with Patient Data
Sk Imran Hossain , Jocelyn de Goër de Herve , David Abrial , Richard Emillion , Isabelle Lebert , Yann Frendo , Delphine Martineau , Olivier Lesens , Engelbert Mephu Nguifo
Production scientifique depuis 2020
- PROCEDE DE BIOMETHANATION EX-SITU - 2022