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Unité Mixte de Recherche
Laboratoire Microorganismes : Génome Environnement

UMR 6023 CNRS / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
-
100, Rue de l'Egalité
15000 AURILLAC
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Didier DEBROAS
- Directrice Adjointe
- Corinne PETIT
- Gestionnaire d'unité
- Nathalie FRUQUIERE nathalie.fruquiere@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 117 )
- ARCHIMBAUD Christine -
- AUMERAN Claire -
- HENQUELL Cecile -
- LAUTRETTE Alexandre -
- LESENS Olivier -
- MIRAND Audrey -
- ROBIN Claire -
- SOUWEINE Bertrand -
- TRAORE Ousmane -
- AGUER Jean Pierre -
- ARTIGAS ALEJO Joan -
- BAILLY Jean Luc -
- BALESTRINO Damien -
- BATISSON Isabelle -
- BEC Alexandre -
- BELKORCHIA Abdel -
- BLOT Nicolas -
- BONNET Jean Louis -
- BOUCHARD Philippe -
- BRONNER Gisele -
- CARRIAS Jean Francois -
- CHARPIN Marie Francoise -
- CORBARA Bruno -
- DEBROAS Didier -
- DELBAC Frederic -
- DESVILETTES Christian -
- DIOGON Marie -
- DUBUFFET Aurore -
- EL ALAOUI Hicham -
- ENAULT Francois -
- FAURE Catherine -
- FORESTIER Christiane -
- GUEIRARD Pascale -
- JOUAN Isabelle -
- KOUSSOROPLIS Apostolos Manuel -
- LATOUR Delphine -
- LEHOURS Anne Catherine -
- LEPERE Cecile -
- MALLET Clarisse -
- MARY Isabelle -
- MIQUEL Sylvie -
- PEYRETAILLADE Eric -
- POLONAIS Valerie -
- RAVET Viviane -
- TEXIER Catherine -
- VAREILLE DELARBRE Marjolaine -
- VIVARES Christian -
- BREBION Amelie -
- REGAGNON Christel -
- ANGIA SRIRAM Pradeep Ram -
- BRICHEUX Genevieve -
- PETIT Corinne -
- SIME NGANDO Telesphore -
- FADHLAOUI Khaled -
- BARDOT Corinne -
- CHARVY Jean-Christophe -
- CHAUVET Marina -
- COLOMBET Jonathan -
- COURTINE Damien -
- FRUQUIERE Nathalie -
- LAPEYRE Arnaud -
- LE JEUNE Anne Helene -
- MENARD Yoann -
- MONE Anne Isabelle -
- PERRIERE Fanny -
- SANVOISIN Maeva -
- TERZIAN Paul -
- WAWRZYNIAK Ivan -
- DRAME Ibrahima -
- PARIS Laurianne -
- TORTUEL Damien -
- BATISTA Sylvine -
- BILLARD Hermine -
- BISSEUX Maxime -
- CHARBONNEL Nicolas -
- CONNOIS Victorien -
- DONNADIEU BERNARD Florence -
- GUYOT Samuel -
- JUGIE Gwendoline -
- LESOBRE Jerome -
- LYONNET Valerie -
- MALIGE Melodie -
- MARCHAL Gaelle -
- OLLIVIER NAKUSI Laurence -
- PORTELLI Christophe -
- RODDE Nathalie -
- SIMON Isabelle -
- VELLET Agnes -
- AKOSSI Reginald Florian -
- BAKER Lory-Anne -
- BONDARABADI Mahya -
- BOUQUET Clementin -
- CARRIERE Eugenie -
- DHOMMEE Roxane -
- ESCURA Marine -
- FERNANDES Vincent -
- FRIZOT Nathan -
- GAUME Lea -
- GILBERT Juliette -
- KAUR Manjyot -
- LAFFET Lucie -
- LALLOUE Pierre-Louis -
- MATHIEN Clementine -
- MONJOT Arthur -
- NOIRMAIN Fanny -
- OLO NDELA Eric -
- SBAGHDI Thania -
- VAN BAELEN Marine -
- VERGNE Antoine -
- VERLAGUET Julien -
- FRUQUIERE Nathalie -
- LE JEUNE Anne Helene -
- WAWRZYNIAK Ivan -
- CHABROLLES Helene -
- FUSTER Maxime -
- KOUBAR Mohamad -
- MOUMENI Lyes -
Equipes
- BioADAPT, Biodiversité microbienne et adaptations fonctionnelles , Marie Francoise CHARPIN
- CMES, Communautés microbiennes : écotoxicologie-santé , Christiane FORESTIER
- EPIE, Epidémiologie et physiopathologie des infections à enterovirus , Jean Luc BAILLY
- IHP, Interactions hôtes-parasites , Frederic DELBAC
- IRTA, Interactions dans les réseaux trophiques aquatiques , Christian DESVILETTES
- MEB, Génomique environnementale et bioinformatique , Cecile LEPERE
Thèmes de Recherche
Invisibles à l’œil nu, les microorganismes représentent pourtant la plus grande partie de la diversité du monde vivant et des fonctions biologiques qui assurent l’évolution de la vie sur notre planète. Seule la connaissance des relations entre changements environnementaux et changements de la diversité des communautés de microorganismes peut permettre, à terme, la maîtrise des processus microbiens qui gouvernent le fonctionnement et la pérennité de notre environnement. Au sein du laboratoire (UMR CNRS 6023), plus de 110 chercheurs, enseignant-chercheurs, praticiens hospitaliers, ingénieurs, techniciens et contractuels, répartis dans 6 équipes de recherche, travaillent actuellement sur les microorganismes procaryotes et eucaryotes (Archées, Bactéries, Protistes, Champignons), ainsi que sur les virus, depuis les aspects moléculaires et cellulaires jusqu’aux rôles de ces organismes dans les écosystèmes. La spécificité du laboratoire consiste à associer, au sein d’une même structure, des compétences au niveau de la génomique et de la post-génomique d’une part, et au niveau de la biologie des populations et des écosystèmes et de l’écologie, d’autre part. Une autre spécificité de l’unité réside dans son positionnement renforcé à l’interface environnement – santé, ce qui lui permet de mener des recherches liées aux enjeux scientifiques émergents dans le domaine de l’écologie de la santé. Notre démarche vise donc à rapprocher génome, environnement et santé, en mettant les concepts et les outils de génomique et de post-génomique au service de questions scientifiques ayant trait au fonctionnement des écosystèmes et à l’écologie de la santé. La stratégie scientifique de l’unité est construite autour de 3 grands domaines scientifiques : (i) parasitisme et écosystèmes microbiens, (ii) écologie trophique et fonctionnelle, (iii) écologie de la santé et écotoxicologie. Plus précisément, les microorganismes sont étudiés en tant que acteurs essentiels (i) dans le fonctionnement des écosystèmes (notamment aquatiques et terrestres) sous forçage naturel et/ou anthropique, (ii) dans l’analyse des risques liés à l’introduction de contaminants biotiques et abiotiques, et (iii) comme sources de maladies infectieuses en lien avec des problématiques environnementales (nosémoses d’abeilles, maladies émergentes, infections nosocomiales, présence d’entérovirus et autres pathogènes, circulation des gènes de résistance aux antibiotiques,…). Ces recherches, fondamentales, sont porteuses d’enjeux socio-économiques et biotechnologiques, dans les domaines de la gestion des ressources naturelles, des services écosystémiques et de la santé humaine et animale
Publications ( HAL )
- Functional redundancy dampens precipitation change impacts on species‐rich invertebrate communities across the Neotropics
Régis Céréghino , Mark Kurtis Trzcinski , A. Andrew M. Macdonald , Nicholas A. C. Marino , Dimaris Acosta Mercado , Celine Leroy , Bruno Corbara , Gustavo Romero , Vinicius F. Farjalla , Ignacio M. Barberis , Olivier Dézerald , Edd Hammill , Trisha B. Atwood , Gustavo C. E. Piccoli , Fabiola Ospina Bautista , Jean-Francois Carrias , Juliana S. Leal , Guillermo Montero , Pablo A. P. Antiqueira , Rodrigo Freire - The significance of soil microalgae and cyanobacteria to assess pesticide stresses, in agricultural soils
Olivier Crouzet , Christelle Marrauld , Clarisse Mallet , Pierre-Alain Maron , Frédéric Rimet , Christian Mougin , Annette Bérard - Diatom DNA metabarcoding to assess the effect of natural radioactivity in mineral springs on ASV of benthic diatom communities
Lory-Anne Baker , Aude Beauger , Sofia Kolovi , Olivier Voldoire , Elisabeth Allain , Vincent Breton , Patrick Chardon , Didier Miallier , Céline Bailly , Gilles Montavon , Agnès Bouchez , Frédéric Rimet , Cécile Chardon , Valentin Vasselon , Luc Ector , Carlos E Wetzel , David G Biron - Climate change negatively affects Amazonian social wasps
Alain Dejean , Bruno Corbara , Frédéric Azémar , Frédéric Petitclerc , Benoit Burban , Stanislas Talaga , Arthur Compin - High diversity of microsporidian parasites and new planktonic hosts in freshwater and marine ecosystems
Marina Chauvet , Arthur Monjot , Cécile Lepère - Étude de nouveaux facteurs de pathogénicité de Klebsiella pneumoniae : caractérisation du fimbriae de type « chaperone-usher » Kpg et de la pompe à efflux MdtJI
Laura Joseph - Biodiversity and Environmental Factors Structuring Diatom Assemblages of Mineral Saline Springs in the French Massif Central
Aude Beauger , Olivier Voldoire , Elisabeth Allain , Pierre Gosseaume , Christelle Blavignac , Lory-Anne Baker , Carlos E Wetzel - Toxicokinetic of a pesticides cocktail pulse on stream biofilms with different hydrological histories
Lluís Bertrans-Tubau , Meritxell Abril , Isabelle Batisson , Nicolas Creusot , Nicolas Mazzella , Yoann Menard , Débora Millan-Navarro , Aurélie Moreira , Soizic Morin , Sergio Ponsá , Lorenzo Proia , Anna Romaní , Joan Artigas - Exposure of benthic microbial communities to pharmaceuticals and resulting adaptation including tolerance, biodegradation and antibiotic resistance: advances and challenges
Chloé Bonnineau , Joan Artigas , Agnes Bouchez , Christophe Dagot , Marion Devers-Lamrani , Jérôme Labanowski , Emilie Lyautey , Fabrice Martin-Laurent , Cecile Miege , Stéphane Pesce , Leslie Mondamert , Leslie Mondamert - Differential Effects of Viruses on the Growth Efficiency of Freshwater Bacterioplankton in Eutrophic Relative to Non-Eutrophic Lakes
Angia Sriram Pradeep Ram , Télesphore Sime-Ngando
Production scientifique depuis 2019
- Composition pharmaceutique comprenant un gallate d'alkyle et son utilisation dans la prévention et/ou le traitement des infections du tube digestif chez l'animal - 2019
- PROCEDE DE BIOMETHANATION EX-SITU - 2022