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Unité Mixte de Recherche
Laboratoire Microorganismes : Génome Environnement
UMR 6023 CNRS / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
-
100, Rue de l'Egalité
15000 AURILLAC
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Didier DEBROAS
- Directrice Adjointe
- Corinne PETIT
- Gestionnaire d'unité
- Nathalie FRUQUIERE nathalie.fruquiere@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 105 )
- ARCHIMBAUD Christine -
- AUMERAN Claire -
- HENQUELL Cecile -
- MIRAND Audrey -
- ROBIN Claire -
- SOUWEINE Bertrand -
- TRAORE Ousmane -
- AGUER Jean Pierre -
- ARTIGAS ALEJO Joan -
- BAILLY Jean Luc -
- BALESTRINO Damien -
- BATISSON Isabelle -
- BEC Alexandre -
- BEIER Sara -
- BELKORCHIA Abdel -
- BLOT Nicolas -
- BONNET Jean Louis -
- BOUCHARD Philippe -
- BRONNER Gisele -
- CARRIAS Jean Francois -
- CHARPIN Marie Francoise -
- DEBROAS Didier -
- DELBAC Frederic -
- DESVILETTES Christian -
- DIOGON Marie -
- DUBUFFET Aurore -
- EL ALAOUI Hicham -
- ENAULT Francois -
- FAURE Catherine -
- FORESTIER Christiane -
- GUEIRARD Pascale -
- JOUAN Isabelle -
- KOUSSOROPLIS Apostolos Manuel -
- LATOUR Delphine -
- LEHOURS Anne Catherine -
- LEPERE Cecile -
- MALLET Clarisse -
- MARY Isabelle -
- MIQUEL Sylvie -
- PEYRETAILLADE Eric -
- POLONAIS Valerie -
- RAVET Viviane -
- TEXIER Catherine -
- VAREILLE DELARBRE Marjolaine -
- VIVARES Christian -
- BREBION Amelie -
- REGAGNON Christel -
- AMATO Pierre -
- ANGIA SRIRAM Pradeep Ram -
- BRICHEUX Genevieve -
- PETIT Corinne -
- SIME NGANDO Telesphore -
- FADHLAOUI Khaled -
- WAWRZYNIAK Ivan -
- BARDOT Corinne -
- BILLARD Hermine -
- CHARVY Jean Christophe -
- COLOMBET Jonathan -
- COURTINE Damien -
- DONNADIEU BERNARD Florence -
- FRUQUIERE Nathalie -
- LE JEUNE Anne Helene -
- MONE Anne Isabelle -
- PERRIERE Fanny -
- BEAUDONNAT Stephanie -
- BISSEUX Maxime -
- CARRIER Sebastien -
- CHARBONNEL Nicolas -
- GUYOT Samuel -
- HAMEL Khirredine -
- JUGIE Gwendoline -
- LESOBRE Jerome -
- LYONNET Valerie -
- MENARD Yoann -
- OLLIVIER NAKUSI Laurence -
- PORTELLI Christophe -
- SCHEEPERS Mailysia -
- SERRE Floriane -
- SIMON Isabelle -
- ARQUE Maxime -
- BAKYONO Belele -
- BOUQUET Clementin -
- CARRIERE Eugenie -
- CHARRIER Fanny -
- CHEUVART Noemie -
- COMBES Lea -
- CREUZET Elisa -
- DIEUDE Pascaline -
- DONNADIEU Sarah -
- ESCURA Marine -
- FOUREL Laura -
- FRIZOT Nathan -
- KAUR Manjyot -
- LALLOUE Pierre-Louis -
- MASSIT Caroline -
- MATHIEN Clementine -
- MOLLARD Emilie -
- VIDAL Magali -
- BOUQUET Clementin -
- CHABROLLES Helene -
- CHAT Heloise -
- CREUZET Elisa -
- GOSSET Cecile -
- HABANJAR Ola -
- PERRUCHE Ophelie -
Equipes
- BioADAPT, Biodiversité microbienne et adaptations fonctionnelles , Marie Francoise CHARPIN
- CMES, Communautés microbiennes : écotoxicologie-santé , Christiane FORESTIER
- EPIE, Epidémiologie et physiopathologie des infections à enterovirus , Jean Luc BAILLY
- IHP, Interactions hôtes-parasites , Frederic DELBAC
- IRTA, Interactions dans les réseaux trophiques aquatiques , Christian DESVILETTES
- MEB, Génomique environnementale et bioinformatique , Cecile LEPERE
Thèmes de Recherche
Invisibles à l’œil nu, les microorganismes représentent pourtant la plus grande partie de la diversité du monde vivant et des fonctions biologiques qui assurent l’évolution de la vie sur notre planète. Seule la connaissance des relations entre changements environnementaux et changements de la diversité des communautés de microorganismes peut permettre, à terme, la maîtrise des processus microbiens qui gouvernent le fonctionnement et la pérennité de notre environnement. Au sein du laboratoire (UMR CNRS 6023), plus de 110 chercheurs, enseignant-chercheurs, praticiens hospitaliers, ingénieurs, techniciens et contractuels, répartis dans 6 équipes de recherche, travaillent actuellement sur les microorganismes procaryotes et eucaryotes (Archées, Bactéries, Protistes, Champignons), ainsi que sur les virus, depuis les aspects moléculaires et cellulaires jusqu’aux rôles de ces organismes dans les écosystèmes. La spécificité du laboratoire consiste à associer, au sein d’une même structure, des compétences au niveau de la génomique et de la post-génomique d’une part, et au niveau de la biologie des populations et des écosystèmes et de l’écologie, d’autre part. Une autre spécificité de l’unité réside dans son positionnement renforcé à l’interface environnement – santé, ce qui lui permet de mener des recherches liées aux enjeux scientifiques émergents dans le domaine de l’écologie de la santé. Notre démarche vise donc à rapprocher génome, environnement et santé, en mettant les concepts et les outils de génomique et de post-génomique au service de questions scientifiques ayant trait au fonctionnement des écosystèmes et à l’écologie de la santé. La stratégie scientifique de l’unité est construite autour de 3 grands domaines scientifiques : (i) parasitisme et écosystèmes microbiens, (ii) écologie trophique et fonctionnelle, (iii) écologie de la santé et écotoxicologie. Plus précisément, les microorganismes sont étudiés en tant que acteurs essentiels (i) dans le fonctionnement des écosystèmes (notamment aquatiques et terrestres) sous forçage naturel et/ou anthropique, (ii) dans l’analyse des risques liés à l’introduction de contaminants biotiques et abiotiques, et (iii) comme sources de maladies infectieuses en lien avec des problématiques environnementales (nosémoses d’abeilles, maladies émergentes, infections nosocomiales, présence d’entérovirus et autres pathogènes, circulation des gènes de résistance aux antibiotiques,…). Ces recherches, fondamentales, sont porteuses d’enjeux socio-économiques et biotechnologiques, dans les domaines de la gestion des ressources naturelles, des services écosystémiques et de la santé humaine et animale
Publications ( HAL )
- Nutritional context modulates the salinity tolerance of freshwater invertebrates
Thomas Ruiz , Apostolos-Manuel Koussoroplis , Vincent Felten , Alexandre Bec - The energetic cost of facing cyanotoxins: a case study on Daphnia magna
Thomas Ruiz , Apostolos-Manuel Koussoroplis , Delphine Latour , Alexandre Bec - Utilisation de la gélose VCA3 (bioMérieux) pour l'isolement sélectif des Enterococci résistants à la vancomycine à partir de prélèvements fécaux
J. Delmas , F. Robin , J.-P. Romaszko , R. Baraduc , O. Lesens , J. Sirot , R. Bonnet - Biofilms in hospital effluents as a potential crossroads for carbapenemase-encoding strains
J. Ory , G. Bricheux , Frédéric Robin , A. Togola , Christiane Forestier , Ousmane Traoré - The energetic cost of facing cyanotoxins: a case study on Daphnia magna
Thomas Ruiz , Apostolos-Manuel Koussoroplis , Delphine Latour , Alexandre Bec - Objet de curiosité : La lamproie, un vampire tapi dans l'eau
Catherine Faure , Boris B. Fumanal , Chloé Olivier - Roles of Capsule and Lipopolysaccharide O Antigen in Interactions of Human Monocyte-Derived Dendritic Cells and Klebsiella pneumoniae
Bertrand Evrard , D. Balestrino , A. Dosgilbert , J.-L. Bouya-Gachancard , N. Charbonnel , C. Forestier , A. Tridon - Preanalytical, analytical, gestational and pediatric aspects of the S100B immuno-assays
Damien Bouvier , Thomas Duret , Paul Rouzaire , Matthieu Jabaudon , Marion Rouzaire , Céline Nourrisson , Céline Bourgne , Bruno Pereira , Bertrand Evrard , Vincent Sapin - Severe COVID-19 is characterized by the co-occurrence of moderate cytokine inflammation and severe monocyte dysregulation
Benjamin Bonnet , Justine Cosme , Claire Dupuis , Elisabeth Coupez , Mireille Adda , Laure Calvet , Laurie Fabre , Pierre Saint-Sardos , Marine Bereiziat , Magali Vidal , Henri Laurichesse , Bertrand Souweine , Bertrand Evrard - Empathi: Embedding-based Phage Protein Annotation Tool by Hierarchical Assignment
Alexandre Boulay , Audrey Leprince , François Enault , Elsa Rousseau , Clovis Galiez
Production scientifique depuis 2021
- PROCEDE DE BIOMETHANATION EX-SITU - 2022