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Unité Mixte de Recherche
Laboratoire Microorganismes : Génome Environnement
UMR 6023 CNRS / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
-
100, Rue de l'Egalité
15000 AURILLAC
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Didier DEBROAS
- Directrice Adjointe
- Corinne PETIT
- Gestionnaire d'unité
- Nathalie FRUQUIERE nathalie.fruquiere@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 104 )
- ARCHIMBAUD Christine -
- AUMERAN Claire -
- HENQUELL Cecile -
- LAUTRETTE Alexandre -
- LESENS Olivier -
- MIRAND Audrey -
- ROBIN Claire -
- SOUWEINE Bertrand -
- TRAORE Ousmane -
- AGUER Jean Pierre -
- ARTIGAS ALEJO Joan -
- BAILLY Jean Luc -
- BALESTRINO Damien -
- BATISSON Isabelle -
- BEC Alexandre -
- BELKORCHIA Abdel -
- BLOT Nicolas -
- BONNET Jean Louis -
- BOUCHARD Philippe -
- BRONNER Gisele -
- CARRIAS Jean Francois -
- CHARPIN Marie Francoise -
- CORBARA Bruno -
- DEBROAS Didier -
- DELBAC Frederic -
- DESVILETTES Christian -
- DIOGON Marie -
- DUBUFFET Aurore -
- EL ALAOUI Hicham -
- ENAULT Francois -
- FAURE Catherine -
- FORESTIER Christiane -
- GUEIRARD Pascale -
- JOUAN Isabelle -
- KOUSSOROPLIS Apostolos Manuel -
- LATOUR Delphine -
- LEHOURS Anne Catherine -
- LEPERE Cecile -
- MALLET Clarisse -
- MARY Isabelle -
- MIQUEL Sylvie -
- PEYRETAILLADE Eric -
- POLONAIS Valerie -
- RAVET Viviane -
- TEXIER Catherine -
- VAREILLE DELARBRE Marjolaine -
- VIVARES Christian -
- BREBION Amelie -
- REGAGNON Christel -
- ANGIA SRIRAM Pradeep Ram -
- BRICHEUX Genevieve -
- PETIT Corinne -
- SIME NGANDO Telesphore -
- FADHLAOUI Khaled -
- BARDOT Corinne -
- BILLARD Hermine -
- CHARVY Jean Christophe -
- COLOMBET Jonathan -
- COURTINE Damien -
- FRUQUIERE Nathalie -
- GUERIN Lucie -
- LE JEUNE Anne Helene -
- MENARD Yoann -
- MONE Anne Isabelle -
- PERRIERE Fanny -
- SARRAN SANVOISIN Maeva -
- WAWRZYNIAK Ivan -
- PARIS Laurianne -
- BISSEUX Maxime -
- CHARBONNEL Nicolas -
- DONNADIEU BERNARD Florence -
- GUILLOT Clemence -
- GUYOT Samuel -
- JUGIE Gwendoline -
- KERBRAT Celia -
- LESOBRE Jerome -
- LYONNET Valerie -
- OLLIVIER NAKUSI Laurence -
- PORTELLI Christophe -
- RODDE Nathalie -
- SCHEEPERS Mailysia -
- SIMON Isabelle -
- BAKYONO Belele -
- BONDARABADI Mahya -
- BOUQUET Clementin -
- CARRIERE Eugenie -
- CHEUVART Noemie -
- DHOMMEE Roxane -
- ESCURA Marine -
- FRIZOT Nathan -
- GAUME Lea -
- GILBERT Juliette -
- KAUR Manjyot -
- LALLOUE Pierre-Louis -
- MASSIT Caroline -
- MATHIEN Clementine -
- VAN BAELEN Marine -
- VERLAGUET Julien -
- VIDAL Magali -
- CHABROLLES Helene -
- CREUZET Elisa -
- HABANJAR Ola -
- KAVANAUGH Devon -
- VAN BAELEN Marine -
Equipes
- BioADAPT, Biodiversité microbienne et adaptations fonctionnelles , Marie Francoise CHARPIN
- CMES, Communautés microbiennes : écotoxicologie-santé , Christiane FORESTIER
- EPIE, Epidémiologie et physiopathologie des infections à enterovirus , Jean Luc BAILLY
- IHP, Interactions hôtes-parasites , Frederic DELBAC
- IRTA, Interactions dans les réseaux trophiques aquatiques , Christian DESVILETTES
- MEB, Génomique environnementale et bioinformatique , Cecile LEPERE
Thèmes de Recherche
Invisibles à l’œil nu, les microorganismes représentent pourtant la plus grande partie de la diversité du monde vivant et des fonctions biologiques qui assurent l’évolution de la vie sur notre planète. Seule la connaissance des relations entre changements environnementaux et changements de la diversité des communautés de microorganismes peut permettre, à terme, la maîtrise des processus microbiens qui gouvernent le fonctionnement et la pérennité de notre environnement. Au sein du laboratoire (UMR CNRS 6023), plus de 110 chercheurs, enseignant-chercheurs, praticiens hospitaliers, ingénieurs, techniciens et contractuels, répartis dans 6 équipes de recherche, travaillent actuellement sur les microorganismes procaryotes et eucaryotes (Archées, Bactéries, Protistes, Champignons), ainsi que sur les virus, depuis les aspects moléculaires et cellulaires jusqu’aux rôles de ces organismes dans les écosystèmes. La spécificité du laboratoire consiste à associer, au sein d’une même structure, des compétences au niveau de la génomique et de la post-génomique d’une part, et au niveau de la biologie des populations et des écosystèmes et de l’écologie, d’autre part. Une autre spécificité de l’unité réside dans son positionnement renforcé à l’interface environnement – santé, ce qui lui permet de mener des recherches liées aux enjeux scientifiques émergents dans le domaine de l’écologie de la santé. Notre démarche vise donc à rapprocher génome, environnement et santé, en mettant les concepts et les outils de génomique et de post-génomique au service de questions scientifiques ayant trait au fonctionnement des écosystèmes et à l’écologie de la santé. La stratégie scientifique de l’unité est construite autour de 3 grands domaines scientifiques : (i) parasitisme et écosystèmes microbiens, (ii) écologie trophique et fonctionnelle, (iii) écologie de la santé et écotoxicologie. Plus précisément, les microorganismes sont étudiés en tant que acteurs essentiels (i) dans le fonctionnement des écosystèmes (notamment aquatiques et terrestres) sous forçage naturel et/ou anthropique, (ii) dans l’analyse des risques liés à l’introduction de contaminants biotiques et abiotiques, et (iii) comme sources de maladies infectieuses en lien avec des problématiques environnementales (nosémoses d’abeilles, maladies émergentes, infections nosocomiales, présence d’entérovirus et autres pathogènes, circulation des gènes de résistance aux antibiotiques,…). Ces recherches, fondamentales, sont porteuses d’enjeux socio-économiques et biotechnologiques, dans les domaines de la gestion des ressources naturelles, des services écosystémiques et de la santé humaine et animale
Publications ( HAL )
- Measuring the prevalence of aspiration pneumonia in view of improving the relevance of antibiotic prescription of antibiotics: A retrospective, observational study
Rodrigue Wankap , Lyasmine Azzoug , Florent Rossi , Adrien Chan Sui Ko , Jean-Philippe Lanoix - Ant-plant mutualisms promote functional diversity in phytotelm communities
Regis Cereghino , Celine Leroy , Jean-François Carrias , Laurent Pelozuelo , Caroline Segura , Christopher Bosc , Alain Dejean , Bruno Corbara - Archaea methanogènes autochtones du microbiote intestinal de la personne âgée : Etude in vitro de leurs fonctions métaboliques dans l'écosystème colique
Nadia Gaci - The use of copper as plant protection product contributes to environmental contamination and resulting impacts on terrestrial and aquatic biodiversity and ecosystem functions
Stéphane Pesce , Laure Mamy , Wilfried Sanchez , Joan Artigas , Annette Bérard , Stéphane Betoulle , Arnaud Chaumot , Marie-Agnès Coutellec , Olivier Crouzet , Juliette Faburé , Mickael Hedde , Christophe Leboulanger , Christelle Margoum , Fabrice Martin-Laurent , Soizic Morin , Christian Mougin , Dominique Munaron , Sylvie Nélieu , Céline Pelosi , Sophie Leenhardt - Microsporidian Genomes Harbor a Diverse Array of Transposable Elements that Demonstrate an Ancestry of Horizontal Exchange with Metazoans.
Nicolas Parisot , Adrian Pelin , Cyrielle Gasc , Valérie Polonais , Abdel Belkorchia , Johan Panek , Hicham El Alaoui , David Georges Biron , Emilie Brasset , Chantal Vaury , Pierre Peyret , Nicolas Corradi , Eric Peyretaillade , Emmanuelle Lerat - Identification and localization of polar tube proteins in the extruded polar tube of the microsporidian Anncaliia algerae
Maurine Fayet , Nastasia Prybylski , Marie-Laure Collin , Eric Peyretaillade , Ivan Wawrzyniak , Abdel Belkorchia , Reginald Florian Akossi , Marie Diogon , Hicham El Alaoui , Valérie VP Polonais , Frédéric FD Delbac - Climate change impact on Amazonian ant gardens
Alain Dejean , Frédéric Petitclerc , Arthur Compin , Frédéric Azémar , Stanislas Talaga , Bruno Corbara - Bactericidal and Bacteriostatic Effects of Four Different Parts of 2 Plants Moringa Extracts against the Bacteria Vibrio cholerae and Salmonella typhi, and some Phytochemical Properties
Claire Stéphane Metsopkeng , Geneviève Bricheux , Florence Donnadieu , Paul Alain Nana , Isabelle Ripoche , Nehemie Donfagsiteli Tchinda , Gabriel Agbor , Pierre Chalard , Télesphore Sime-Ngando , Moïse Nola - Hydrocortisone plus fludrocortisone for community acquired pneumonia-related septic shock: a subgroup analysis of the APROCCHSS phase 3 randomised trial
Nicholas Heming , Alain Renault , Emmanuelle Kuperminc , Christian Brun-Buisson , Bruno Megarbane , Jean-Pierre Quenot , Shidasp Siami , Alain Cariou , Xavier Forceville , Carole Schwebel , Marc Leone , Jean-Francois Timsit , Benoît Misset , Mohamed Ali Benali , Gwenhael Colin , Bertrand Souweine , Karim Asehnoune , Emmanuelle Mercier , Loïc Chimot , Claire Charpentier - Metavir 2: new tools for viral metagenome comparison and assembled virome analysis
Simon Roux , Jeremy Tournayre , Antoine Mahul , Didier Debroas , François Enault
Production scientifique depuis 2020
- PROCEDE DE BIOMETHANATION EX-SITU - 2022