Laboratoire Microorganismes : Génome Environnement
UMR 6023 CNRS / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
- Adresse :
-
100, Rue de l'Egalité
15000 AURILLAC
- Tél :
- 0473407869
- Sur Internet :
- lmge.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Didier DEBROAS
- Directrice Adjointe
- Corinne PETIT
- Responsable administrative
- Nathalie FRUQUIERE nathalie.fruquiere@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 108 )
- Enseignant-chercheur praticien hosp. (8)
-
- ARCHIMBAUD Christine -
- AUMERAN Claire -
- CHABROLLES Helene -
- HENQUELL Cecile -
- MIRAND Audrey -
- ROBIN Claire -
- SOUWEINE Bertrand -
- TRAORE Ousmane -
- Enseignant-chercheur universitaire (38)
-
- AGUER Jean Pierre -
- ARTIGAS ALEJO Joan -
- BAILLY Jean Luc -
- BALESTRINO Damien -
- BATISSON Isabelle -
- BEC Alexandre -
- BEIER Sara -
- BELKORCHIA Abdel -
- BLOT Nicolas -
- BONNET Jean Louis -
- BOUCHARD Philippe -
- BRONNER Gisele -
- CARRIAS Jean Francois -
- CHARPIN Marie Francoise -
- DEBROAS Didier -
- DELBAC Frederic -
- DESVILETTES Christian -
- DIOGON Marie -
- DUBUFFET Aurore -
- EL ALAOUI Hicham -
- ENAULT Francois -
- FAURE Catherine -
- FORESTIER Christiane -
- GUEIRARD Pascale -
- JOUAN Isabelle -
- KOUSSOROPLIS Apostolos Manuel -
- LATOUR Delphine -
- LEHOURS Anne Catherine -
- LEPERE Cecile -
- MALLET Clarisse -
- MARY Isabelle -
- MIQUEL Sylvie -
- PEYRETAILLADE Eric -
- POLONAIS Valerie -
- RAVET Viviane -
- TEXIER Catherine -
- VAREILLE DELARBRE Marjolaine -
- VIVARES Christian -
- Praticien hospitalier (2)
-
- BREBION Amelie -
- REGAGNON Christel -
- Chercheur (5)
-
- AMATO Pierre -
- ANGIA SRIRAM Pradeep Ram -
- BRICHEUX Genevieve -
- PETIT Corinne -
- SIME NGANDO Telesphore -
- Ingénieur de recherche (titulaires et contractuels) (3)
-
- COLOMBET Jonathan -
- FADHLAOUI Khaled -
- WAWRZYNIAK Ivan -
- Ingénieur d'étude / asi (titulaires et contractuels) (12)
-
- BARDOT Corinne -
- BILLARD Hermine -
- COURTINE Damien -
- DONNADIEU BERNARD Florence -
- FLOQUET Clement -
- FRUQUIERE Nathalie -
- LALLOUE Pierre Louis -
- LE JEUNE Anne Helene -
- MONE Anne Isabelle -
- PERRIERE Fanny -
- PICARD Michael -
- VERGNE Antoine -
- Technicien / administratif (titulaires et contractuels) (15)
-
- BEAUDONNAT Stephanie -
- BISSEUX Maxime -
- CARRIER Sebastien -
- CHARBONNEL Nicolas -
- DAURE Lily -
- DELVAL Marie Patricia -
- GUYOT Samuel -
- JUGIE Gwendoline -
- LESOBRE Jerome -
- LYONNET Valerie -
- OLLIVIER NAKUSI Laurence -
- PORTELLI Christophe -
- SCHEEPERS Mailysia -
- SERRE Floriane -
- SIMON Isabelle -
- Doctorant (22)
-
- ARQUE Maxime -
- BAKYONO Belele -
- CHARBONNIER Hugo -
- CHARRIER Fanny -
- CHEUVART Noemie -
- COMBES Lea -
- CREUZET Elisa -
- DIEUDE Pascaline -
- DONNADIEU Sarah -
- DUMONT Celtill -
- ENSMINGER Lucas -
- FIGUIGUI Karima -
- FOUREL Laura -
- JULIEN Enzo -
- LALLOUE Pierre-Louis -
- LARANT Mylene -
- MASSIT Caroline -
- MOLLARD Emilie -
- PERRUCHE Ophelie -
- PONCHON Thibaut -
- ROCHETTE Lou -
- VIDAL Magali -
- Autre personnel (3)
-
- CARPENTIER Raphaelle -
- CREUZET Elisa -
- PERRUCHE Ophelie -
Equipes
- BioADAPT, Biodiversité microbienne et adaptations fonctionnelles , Marie Francoise CHARPIN
- CMES, Communautés microbiennes : écotoxicologie-santé , Christiane FORESTIER
- EPIE, Epidémiologie et physiopathologie des infections à enterovirus , Jean Luc BAILLY
- IHP, Interactions hôtes-parasites , Frederic DELBAC
- IRTA, Interactions dans les réseaux trophiques aquatiques , Christian DESVILETTES
- MEB, Génomique environnementale et bioinformatique , Cecile LEPERE
Thèmes de Recherche
Invisibles à l’œil nu, les microorganismes représentent pourtant la plus grande partie de la diversité du monde vivant et des fonctions biologiques qui assurent l’évolution de la vie sur notre planète. Seule la connaissance des relations entre changements environnementaux et changements de la diversité des communautés de microorganismes peut permettre, à terme, la maîtrise des processus microbiens qui gouvernent le fonctionnement et la pérennité de notre environnement. Au sein du laboratoire (UMR CNRS 6023), plus de 110 chercheurs, enseignant-chercheurs, praticiens hospitaliers, ingénieurs, techniciens et contractuels, répartis dans 6 équipes de recherche, travaillent actuellement sur les microorganismes procaryotes et eucaryotes (Archées, Bactéries, Protistes, Champignons), ainsi que sur les virus, depuis les aspects moléculaires et cellulaires jusqu’aux rôles de ces organismes dans les écosystèmes. La spécificité du laboratoire consiste à associer, au sein d’une même structure, des compétences au niveau de la génomique et de la post-génomique d’une part, et au niveau de la biologie des populations et des écosystèmes et de l’écologie, d’autre part. Une autre spécificité de l’unité réside dans son positionnement renforcé à l’interface environnement – santé, ce qui lui permet de mener des recherches liées aux enjeux scientifiques émergents dans le domaine de l’écologie de la santé. Notre démarche vise donc à rapprocher génome, environnement et santé, en mettant les concepts et les outils de génomique et de post-génomique au service de questions scientifiques ayant trait au fonctionnement des écosystèmes et à l’écologie de la santé. La stratégie scientifique de l’unité est construite autour de 3 grands domaines scientifiques : (i) parasitisme et écosystèmes microbiens, (ii) écologie trophique et fonctionnelle, (iii) écologie de la santé et écotoxicologie. Plus précisément, les microorganismes sont étudiés en tant que acteurs essentiels (i) dans le fonctionnement des écosystèmes (notamment aquatiques et terrestres) sous forçage naturel et/ou anthropique, (ii) dans l’analyse des risques liés à l’introduction de contaminants biotiques et abiotiques, et (iii) comme sources de maladies infectieuses en lien avec des problématiques environnementales (nosémoses d’abeilles, maladies émergentes, infections nosocomiales, présence d’entérovirus et autres pathogènes, circulation des gènes de résistance aux antibiotiques,…). Ces recherches, fondamentales, sont porteuses d’enjeux socio-économiques et biotechnologiques, dans les domaines de la gestion des ressources naturelles, des services écosystémiques et de la santé humaine et animale
Publications ( HAL )
- The predatory behavior of ants: an impressive panoply of morphological adaptations
Alain Dejean , Xim Cerdá , Jérôme Orivel , Frédéric Azémar , Alexander L Wild , Bruno Corbara , Axel Touchard - Attributable mortality of ICU-acquired bloodstream infections: Impact of the source, causative micro-organism, resistance profile and antimicrobial therapy
Christophe Adrie , Maité Garrouste-Orgeas , Wafa Ibn Essaied , Carole Schwebel , Michael Darmon , Bruno Mourvillier , Stéphane Ruckly , Anne-Sylvie Dumenil , Hatem Kallel , Laurent Argaud , Guillaume Marcotte , Francois Barbier , Virginie Laurent , Dany Goldgran-Toledano , Christophe Clec'H , Elie Azoulay , Bertrand Souweine , Jean-François Timsit , Jean-François Timsit , Elie Azoulay - Metabarcoding and metagenomic data across aquatic environmental gradients along the coasts of France and Chile
Mara Maeke , Christiane Hassenrück , Polette Aguilar-Muñoz , Camila Aravena , Christian Burmeister , Olivier Crispi , Papa Oumar Djibril Diallo , Camila Fernández , Maëlann Gouriou , Alizée Jamont , Emile Laymand , Barbara Marie , Verónica Molina , Eva Ortega-Retuerta , Sophie Rabouille , Mazharul Islam Sajeeb , Maria Sierks , Martha Stevens , Robin Turon , Valentina Valdés-Castro - HR-TEM and EELS nucleation study of nanocrystalline diamond obtained on ultrathin sol-gel TiO2 UDD nanocomposites
Marc Daenen , O.A. Williams , Andrew Hardy , Marine van Baelen , Lujiao Zhang , R. Erni , Gustaaf van Tendeloo , Ken Haenen , Milos Nesladek - Increased incidence of diabetes in people living with HIV treated with first‐line integrase strand transfer inhibitors: A French multicentre retrospective study
Axel Ursenbach , Antoine Sireyjol , Cyrille Delpierre , Claudine Duvivier , Laurent Hocqueloux , David Rey , C Chirouze , K Bouiller , F Bozon , A S Brunel , L Hustache-Mathieu , J Lagoutte , Q Lepiller , S Marty-Quinternet , L Pépin-Puget , B Rosolen , N Tissot , S Jaffuel , S Ansart , Y Quintric - Comparison of the biological activity of different probiotic strains before and after a lyophilization process
Justine Guilbaud , Emmanuelle Lainé , Khaled Fadhlaoui , Sandrine Chalancon , Eric Beyssac , Ghislain Garrait - Characterisation of new classes of antigen 43 (Ag43) in Escherichia coli colonisation process
Ingrid Chafsey , Nelly Caccia , Perrine Bouvard , Sabine Leroy , Panagiotis Sapountzis , Damien Balestrino , Grégory Jubelin , Mickaël Desvaux - Spironolactone in patients on chronic haemodialysis at high risk of adverse cardiovascular outcomes (ALCHEMIST): a multicentre, double-blind, randomised, placebo-controlled trial and updated meta-analysis
Patrick Rossignol , Faiez Zannad , Ziad Massy , Michel Azizi , Fatima Chorfa , Julien Coadic , João Pedro Ferreira , Francisca Saraiva , Dominique Mottier , Francis Guillemin , Willy Ngueyon Sime , Sanae Bouali , Bénédicte Rossignol , Joëlle Nortier , Isabelle Simon , Christophe Robino , Manuela Davin , Pierre Bataille , François Chantrel , Nelly Castin - Comparison of the biological activity of different probiotic strains under aerobic and anaerobic conditions
Justine Guilbaud , Khaled Fadhlaoui , Sandrine Chalancon , Eric Beyssac , Emmanuelle Laine , Ghislain Garrait - SP140 limits type I interferon–driven pathology, preserving T cell motility and promoting resistance in tuberculosis
Maxime Caouaille , Léa Fromont , Tomoyo Shinkawa , Marion Faucher , Aizat Iman Abdul Hamid , Serge Mazères , Yaël Duvergé , Yohan Lorreyte , Emmanuelle Näser , Samuel M Behar , Emma Lefrançais , Olivier Neyrolles , Denis Hudrisier
Production scientifique depuis 2022
- PROCEDE DE BIOMETHANATION EX-SITU - 2022